检索结果-南通市图书馆

Tools for Protein Structure Prediction at the *** Web Portal

Journal of Life Sciences 2012年第10期6卷 1174-1179页

作者： Sergey Feranchuk Ulyana Potapova Vladimir Potapov dmitry mukha Vladimir Nikolaev Sergei Belikov Met. Ltd. Minsk Kiseliova 20 Belarus Limnological Instiute SB RAS Irkutsk 664033 Russia Institute of Bioorganic Chemistry NAS Belarus Minsk 220141 Belarus Belozersky Institute of Physico-Chemical Biology Moscow 119992 Russia

lntemet services on bioinformatics still remain a popular tool for the researchers. Here the authors present a recently developed web-site http：//*** where several tools and pipelines for protein structure prediction are implemented. The prediction of a structure for a particular protein often requires a sensitive and iterative approach, and the web-site provides an environment for this kind of work. Software that is used in the services includes both free programs available in the Internet and newly developed algorithms. The service on homology screening in PDB for a structure template is implemented using an approach that is alternative to well-known BLAST algorithm and it has some advantages over BLAST. The service on homology modeling uses well-known Nest program. The service on protein energy estimate allows selecting a best template in the set of homologs and adds a functionality of fold recognition to the environment. The design of the site simplifies several of the most useful bioinformatics routines, thus making them available to a large community of researchers. Services are provided free of charge without registration, and the user＇s privacy is taken care of.

关键词： Web-service SOAP homology modeling homology screening protein folding.

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