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THE EFFECT OF COUPLED FEEDBACK ON NOISE FILTERING IN SIGNAL TRANSDUCTION NETWORKS

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Journal of Systems Science & Complexity 2010年第5期23卷 942-950页

作者： dengyu liu Xiao CHANG Zengrong liu Luonan CHEN Ruiqi WANG Institute of Systems Biology Shanghai University Shanghai 200444 China College of Physics and Mathematics Jinggangshan University Ji'an 343009 China Institute of Systems Biology Shanghai University Shanghai 200444 China Key Laboratory of Systems Biology SIBS-Novo Nordisk Translational Research Centre for PreDiabetes Shanghai Institutes for Biological Sciences Chinese Academy of Sciences Shanghai 200031 China

Many interacting biomolecular components in cells form different positive or negative feedback loops. When biological signals transduce through cascades consisting of various loops they will be affected or even distorted. Especially, how to process various signals buried in various intrinsic and extrinsic noises is an important issue. This paper analyzes how the response time influences noise filtering ability and how to enhance the ability by coupling different feedback loops. A parameter to measure the response time of the signal transduction, i.e., τ0.9, and its relationship between the response time and noise filtering will be discussed. The authors show clearly that the longer the response time is, the better the ability to filter noises will be. Therefore, to enhance the ability to filter noises, the authors can prolong the response time by coupling different positive or negative feedback loops. The results provide a possible approach to enhance the ability to filter noises in larger biomolecular networks.

关键词： Coupled feedback filtering noises response time signal cycle.

数字孪生在控制课程虚拟仿真实验教学中的应用

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实验技术与管理 2024年第3期41卷 175-183页

作者：梁广昱庞新宇李硕杰史博兆刘登毓太原理工大学机械与运载工程学院山西太原030024 煤矿综采装备山西省重点实验室山西太原030024

针对控制类课程知识抽象、缺乏可视化展示等问题,该文基于数字孪生的理论基础,以LabVIEW程序为平台,结合SolidWorks和STM32单片机设计开发了应用于机械控制工程教学的虚拟实验室。利用LabVIEW作为主要程序平台完成计算模型与数据处理平... 详细信息

针对控制类课程知识抽象、缺乏可视化展示等问题,该文基于数字孪生的理论基础,以LabVIEW程序为平台,结合SolidWorks和STM32单片机设计开发了应用于机械控制工程教学的虚拟实验室。利用LabVIEW作为主要程序平台完成计算模型与数据处理平台的搭建,运用SolidWorks完成数字模型的搭建,通过STM32单片机与串口协议进行数字模型与物理模型的数据通信,实现了教学、仿真以及数字孪生的有机结合,为创新型人才的培养和虚拟仿真实验室的建设提供了参考。

关键词：数字孪生控制工程 LabVIEW 虚拟实验室单片机

基于有限元和响应面法的U形弹簧结构参数分析

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润滑与密封 2024年第4期49卷 138-146页

作者：刘登宇赵军李双喜闫欣欣程天馥北京化工大学机电工程学院北京100029

液压作动器内部密封件的蓄能性能是衡量其可靠性的关键,而U形弹簧作为蓄能密封圈的弹性元件,其压缩刚度和弹性压缩极限是决定其蓄能性能的主要因素。建立基于材料参数的U形弹簧弹塑性有限元模型,计算U形弹簧的压缩刚度、弹性压缩极限和... 详细信息

液压作动器内部密封件的蓄能性能是衡量其可靠性的关键,而U形弹簧作为蓄能密封圈的弹性元件,其压缩刚度和弹性压缩极限是决定其蓄能性能的主要因素。建立基于材料参数的U形弹簧弹塑性有限元模型,计算U形弹簧的压缩刚度、弹性压缩极限和线性压缩临界值,分析典型结构参数对蓄能特性的影响;基于响应面法构建多因素数学模型,比较各结构参数对弹簧压缩刚度和弹性压缩极限的影响程度;通过多次弹簧压缩试验验证了计算模型的准确性。结果表明:弹簧厚度、截面总长、开槽宽度、周期宽度和根部圆弧半径为压缩刚度的主要影响因素,其影响依次减小;弹簧厚度、截面总长和根部弧半径为弹性压缩极限的主要影响因素,其影响依次减小。重复压缩试验证明,弹簧屈服产生的塑性变形会随着压缩次数累加,导致弹簧开口宽度减小,导致密封圈动态密封性能降低;当蓄能密封圈用于动密封时其压缩量不宜超过弹性压缩极限。

关键词：蓄能密封圈结构参数蓄能特性弹塑性模型响应面法

Preparation of lactic acid bacteria compound starter cultures based on pasting properties and its improvement of glutinous rice flour and dough

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Food Science and Human Wellness 2024年第4期13卷 2090-2101页

作者： dengyu Wang Linlin liu Bing Wang Wenjian Xie Yanguo Shi Na Zhang Hongchen Fan Key Laboratory of Food Science and Engineering of Heilongjiang Ordinary Higher Colleges Key Laboratory of Grain Food and Comprehensive Processing of Heilongjiang ProvinceCollege of Food EngineeringHarbin University of CommerceHarbin 150076China

The effects of 5 lactic acid bacteria(LAB)fermentation on the pasting properties of glutinous rice flour were compared,and suitable fermentation strains were selected based on the changes of viscosity,setback value,and breakdown value to prepare LAB compound starter *** results revealed that Latilactobacillus sakei HSD004 and Lacticaseibacillus rhamnosus HSD005 had apparent advantages in increasing the viscosity and reducing the setback and breakdown values of glutinous rice *** particular,the compound starter created using the two abovementioned LAB in the ratio of 3:1 had better performance than that using a single LAB in improving the pasting properties and increasing the water and oil absorption capacity of glutinous rice ***,the gelatinization enthalpy of the fermented samples increased *** frozen glutinous rice dough stored for 28 days,the viscoelasticity of frozen dough prepared by compound starter was better than that of control dough,and the freezable water content was lower than that of control *** results indicate that compound LAB fermentation is a promising technology in the glutinous rice-based food processing industry,which has significance for its application.

关键词： Glutinous rice flour Glutinous rice dough Lactic acid bacteria compound starter cultures Pasting properties Viscoelasticity

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粪类圆线虫合并其他病原体感染研究进展

中国血吸虫病防治杂志 2023年第2期35卷 206-212页

作者：温晴傅晓茵刘登宇广西医科大学基础医学院广西南宁530021

粪类圆线虫是一种机会性致病寄生虫,在免疫低下人群可引起严重的粪类圆线虫病,甚至导致死亡。既往临床研究报道了粪类圆线虫病患者合并其他寄生虫、病毒、细菌和真菌等病原体感染的病例。本文就粪类圆线虫病合并其他病原体感染进行综述... 详细信息

粪类圆线虫是一种机会性致病寄生虫,在免疫低下人群可引起严重的粪类圆线虫病,甚至导致死亡。既往临床研究报道了粪类圆线虫病患者合并其他寄生虫、病毒、细菌和真菌等病原体感染的病例。本文就粪类圆线虫病合并其他病原体感染进行综述,分析合并感染对粪类圆线虫病的影响,从而为降低与粪类圆线虫感染相关疾病发病率和死亡率提供参考。

关键词：粪类圆线虫合并感染流行病学

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异盘并殖吸虫发育过程同工酶谱分析

基因组学与应用生物学 2015年第4期34卷 718-722页

作者：毛玮刘登宇胡文庆广西医科大学基础医学院寄生虫学教研室南宁530021 广西疾病预防控制中心南宁530021 广西医科大学基础医学研究重点实验室南宁530021

肺吸虫病是感染并殖吸虫属肺吸虫引起的一种食源性人畜共患寄生虫病。异盘并殖吸虫是在中国南方、东南亚和印度人群中引起肺吸虫病的主要病原体。通过同工酶谱分析了解异盘并殖吸虫在宿主体内不同发育阶段生物化学代谢变化变化规律,可... 详细信息

肺吸虫病是感染并殖吸虫属肺吸虫引起的一种食源性人畜共患寄生虫病。异盘并殖吸虫是在中国南方、东南亚和印度人群中引起肺吸虫病的主要病原体。通过同工酶谱分析了解异盘并殖吸虫在宿主体内不同发育阶段生物化学代谢变化变化规律,可为防治肺吸虫病提供科学依据。本研究采用浓度梯度聚丙烯酰胺凝胶垂直板状电泳(CG-PAGSE)分析了异盘并殖吸虫五个虫龄期同工酶谱。结果表明在不同的发育时期,同工酶谱存在一定程度的变异,呈现生长发育的多态性。

关键词：异盘并殖吸虫发育过程同工酶谱

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高温动压涨圈密封结构参数多目标优化分析

化工学报 2023年第6期74卷 2565-2579页

作者：毕恩哲李双喜沙廉翔刘登宇陈凯放北京化工大学机电工程学院北京100029

针对航空发动机涨圈密封在高温工况下磨损严重的特性,提出一种动环端面开设螺旋槽的动压涨圈密封。综合考虑切口对主密封端面流动的相互影响,建立流固热耦合数值分析模型,分析动压涨圈密封的密封性能,采用响应面法对静环结构参数进行多... 详细信息

针对航空发动机涨圈密封在高温工况下磨损严重的特性,提出一种动环端面开设螺旋槽的动压涨圈密封。综合考虑切口对主密封端面流动的相互影响,建立流固热耦合数值分析模型,分析动压涨圈密封的密封性能,采用响应面法对静环结构参数进行多目标优化分析,试验验证模型的准确性。研究结果表明:动压涨圈的密封性能主要受切口间隙影响,而减磨性能主要受轴向厚度和径向宽度影响;切口间隙的增大将导致密封性能和减磨性能的下降,但轴向厚度和径向宽度的增加可有效减弱切口间隙的不利影响。优化参数组合为切口间隙0.2 mm、轴向厚度13 mm、径向宽度6.5 mm,优化后泄漏率降低26.73%,密封性能、减磨性能得到明显提升。

关键词：动压涨圈密封响应面法密封特性流固热耦合分析模型

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马铃薯抗性淀粉对高脂血症大鼠的降血糖血脂作用

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现代食品科技 2022年第3期38卷 8-14页

作者：尉迟邈吴建美高璐刘登宇曲琳内蒙古科技大学包头医学院内蒙古包头014000 内蒙古综合疾病预防控制中心内蒙古呼和浩特010000 内蒙古医科大学公共卫生学院内蒙古呼和浩特010000

探究马铃薯抗性淀粉对高脂血症大鼠的降血糖血脂作用,48只大鼠,按体重随机分成空白对照组和模型对照组,高脂饲料饲喂2周后按总胆固醇(TC)水平随机分为5组:高脂模型组,阳性对照组,马铃薯抗性淀粉高、中、低剂量组。干预6周,测定各组大鼠... 详细信息

探究马铃薯抗性淀粉对高脂血症大鼠的降血糖血脂作用,48只大鼠,按体重随机分成空白对照组和模型对照组,高脂饲料饲喂2周后按总胆固醇(TC)水平随机分为5组:高脂模型组,阳性对照组,马铃薯抗性淀粉高、中、低剂量组。干预6周,测定各组大鼠的体质量、肝脏系数、血脂水平等指标,并观察大鼠肝脏组织病理切片。结果发现,与空白组比较,高脂组体重增加2.21%;心脏、肝脏、肝脏系数、附睾周脂重均有所增加,分别为23.70%、85.84%、63.88%、23.74%;TC、TG、LDL-C及血糖水平升高;高脂模型建立成功。与高脂组比较,实验组体重、肝脏重量、肝脏系数、附睾周脂重降低,降低最大幅度分别为2.50%、14.18%、9.18%、19.46%;TC、TG、LDL-C、AI及血糖水平显著降低,最大幅度分别为29.84%、49.33%、59.21%、43.89%、11.33%,HDL-C无显著差异。HE染色结果显示,与高脂组比较,高、中剂量组大鼠肝脏脂肪变性程度明显改善。表明马铃薯抗性淀粉能降低血糖血脂水平,对高脂血症的预防及治疗具有积极作用。

关键词：马铃薯抗性淀粉降血糖血脂高脂血症

高通量测序分析不同浓度的白鲜碱对须癣毛癣菌转录组的影响

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微生物学通报 2022年第2期49卷 702-712页

作者：吴建美高璐刘登宇尉迟邈曲琳内蒙古综合疾病预防控制中心内蒙古呼和浩特010031 内蒙古医科大学内蒙古呼和浩特010000 内蒙古科技大学包头医学院内蒙古包头014000

[背景]目前,由皮肤浅部真菌引起的皮肤病逐年增加,已经成为影响人类健康的重大问题之一。[目的]探究白鲜碱(dictamnine,DIC)单体对须癣毛癣菌的抑菌作用及作用机制。[方法]通过高通量测序技术对须癣毛癣菌及白鲜碱作用后的须癣毛癣菌进... 详细信息

[背景]目前,由皮肤浅部真菌引起的皮肤病逐年增加,已经成为影响人类健康的重大问题之一。[目的]探究白鲜碱(dictamnine,DIC)单体对须癣毛癣菌的抑菌作用及作用机制。[方法]通过高通量测序技术对须癣毛癣菌及白鲜碱作用后的须癣毛癣菌进行转录组测序,对测序序列进行处理和生物信息学分析,以及测序质量评价和序列注释。通过与对照组比较,鉴别出差异表达基因,然后进行GO功能显著性分析和KEGG代谢途径分析等。[结果]白鲜碱对须癣毛癣菌的MIC值为50μg/mL。DIC高剂量组与对照组比较,共360个差异基因;其中上调表达265个,下调表达95个。MFS1、KU70、KU80、L2、cpaT、MFS2、VdtG、patC等基因表达有显著差异。GO功能富集表明,差异基因主要集中于核糖体、线粒体膜、抗氧化活性、毒素代谢过程、单一生物代谢过程、次生代谢过程、初级活性跨膜转运蛋白活性和活跃的跨膜转运蛋白活性等。KEGG代谢途径的改变主要集中在ABC转运、膜运输障碍、谷胱甘肽代谢、DNA的复制与修复变化、减数分裂、氧化磷酸化和丙酮酸代谢障碍等富集通路上,并且相关基因均有显著性改变(P<0.05)。[结论]白鲜碱对须癣毛癣菌的抑菌机制可能与影响须癣毛癣菌DNA复制表达、能量代谢、DNA修复、ABC转运等途径有关。

关键词：白鲜碱须癣毛癣菌高通量测序技术作用机制