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慢性腰痛患者焦虑状态与心率变异相关性的研究

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颈腰痛杂志 2022年第2期43卷 172-175页

作者：徐心怡吴继雄吴月娥王云陈欣然徐锋李菡安徽医科大学第二附属医院心电诊断科安徽合肥230601 安徽医科大学第二附属医院心血管内科安徽合肥230601

目的探讨慢性腰痛伴焦虑患者的心率变异性(heartratevariability,HRV)变化,焦虑严重程度与HRV各指标的相关性,以及心理疏导对HRV的影响。方法筛选76例慢性腰痛伴焦虑患者作为研究对象,与65例健康人群进行HRV各指标比较。采用Pearson相... 详细信息

目的探讨慢性腰痛伴焦虑患者的心率变异性(heartratevariability,HRV)变化,焦虑严重程度与HRV各指标的相关性,以及心理疏导对HRV的影响。方法筛选76例慢性腰痛伴焦虑患者作为研究对象,与65例健康人群进行HRV各指标比较。采用Pearson相关性分析验证病例组汉密顿焦虑评分(hamilton anxiety scale,HAMA)与HRV的各指标相关性;观察病例组患者心理疏导前后HRV各指标的变化。结果与对照组比较,慢性腰痛伴焦虑患者HRV各指标(SDNN、RMSSD、PNN50、HF)显著降低,LF/HF比值显著增高。且该组患者HAMA总分与SDNN、RMSSD、PNN50、HF、LF/HF存在很强的相关性,相关系数r值分别为:-0.57,-0.62,-0.54,-0.73,0.71(P<0.01)。经心理疏导后,SDNN、RMSSD、PNN50、HF显著增加,LF/HF比值显著降低。结论慢性腰痛伴焦虑患者的HRV指标较健康者变化明显,反映其自主神经功能紊乱,且焦虑严重程度与HRV变化程度相关。心理疏导有利于慢性腰痛伴焦虑患者自主神经功能及HRV指标的改善。

关键词：慢性腰痛焦虑心率变异性

基于GC-MS和网络药理学研究南柴胡挥发油抗抑郁作用机制

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特产研究 2023年第1期45卷 32-38页

作者：邴一凡李苏楠刘学琴杨小龙王淇漩邹翔曲中原哈尔滨商业大学药学院中药学专业教研室黑龙江哈尔滨150076 哈尔滨商业大学药学院药物工程技术研究中心黑龙江哈尔滨150076

本研究基于气相色谱制。运用GC-MS技术,结合文献,对南柴胡挥发油化学成分进行分析鉴定;查找SwissADME数据库筛选满足“类药五原则”的成分;通过Swiss TargetPrediction数据库预测成分靶点,利用GeneCards和DrugBank数据库富集抑郁相关靶... 详细信息

本研究基于气相色谱制。运用GC-MS技术,结合文献,对南柴胡挥发油化学成分进行分析鉴定;查找SwissADME数据库筛选满足“类药五原则”的成分;通过Swiss TargetPrediction数据库预测成分靶点,利用GeneCards和DrugBank数据库富集抑郁相关靶点;进一步使用Venny 2.1.0在线工具获取成分和疾病的交集靶点;在Cytoscape软件中构建PPI蛋白相互作用网络,筛选核心靶点;将核心靶点导入david数据库完成GO和KEGG分析,随后使用微生信平台进行可视化分析并利用Cytoscape软件构建成分靶点通路图。结果从南柴胡挥发油中共鉴定出28个主要成分,且均满足“类药五原则”,最终筛选出ESR1、GSK3B、JUN、CXCL8、MMP2、F2R、GNAI3和PRKCA等45个核心靶点,富集分析发现南柴胡挥发油抗抑郁作用主要涉及的通路包括雌激素信号通路、Rap1信号通路、Reaxin信号通路、PI3K-Akt信号通路和cAMP信号通路等。本研究证明南柴胡挥发油抗抑郁作用可能是通过多靶点、多成分起作用,可为南柴胡药材质量标准的制订和提升提供更加可靠的依据。

关键词：南柴胡挥发油 GC-MS 抗抑郁网络药理学

矮地茶治疗骨质疏松症的网络药理学分析及实验研究

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湖南中医药大学学报 2023年第8期43卷 1468-1477页

作者：谭雅文原茵吴紫璇郭亚萍王瑾源彭雁飞郑纺天津中医药大学中西医结合学院天津301617

目的基于网络药理学及体外实验探究矮地茶治疗骨质疏松症(osteoporosis,OP)的作用机制。方法使用TCMSP、GeneCards数据库筛选矮地茶治疗骨质疏松症的有效成分及关键靶点(疾病靶点与药物活性成分靶点的交集);使用Cytoscape 3.7.1软件构... 详细信息

目的基于网络药理学及体外实验探究矮地茶治疗骨质疏松症(osteoporosis,OP)的作用机制。方法使用TCMSP、GeneCards数据库筛选矮地茶治疗骨质疏松症的有效成分及关键靶点(疾病靶点与药物活性成分靶点的交集);使用Cytoscape 3.7.1软件构建“中药-活性成分-交集靶点-疾病”网络;使用STRING数据库构建关键靶点蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络;通过david数据库对关键靶点进行GO分析和KEGG信号通路富集分析。体外实验使用矮地茶醇提物干预成骨诱导的ST-2细胞,通过碱性磷酸酶染色(alkaline phosphatase,ALP)、RT-qPCR、Western blot等检测其对成骨分化的影响并验证网络药理学信号通路预测结果。结果共获得槲皮苷、山柰酚、射干醇A、丹皮酚、肉桂醛等193个矮地茶主要活性成分;预测出82个矮地茶与OP的关键靶点,这些关键靶点主要参与调控雌激素信号通路、凋亡、Wnt/β-catenin信号通路等。体外实验显示,矮地茶能有效提高ST-2细胞成骨转录因子表达(P<0.05),同时上调Wnt/β-catenin信号通路关键蛋白β-catenin的表达(P<0.05),并下调通路抑制因子Sfrp1的mRNA水平(P<0.05)。结论矮地茶可通过多靶点、多通路治疗OP,主要与Wnt/β-catenin信号通路有关。

关键词：骨质疏松症矮地茶成骨分化网络药理学 Wnt/β-catenin信号通路

基于网络药理学和分子对接技术探讨独活寄生汤治疗退行性腰椎管狭窄症的分子作用机制

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辽宁中医杂志 2023年第4期50卷 129-136,I0002,I0003页

作者：卜献忠卜保献吕挺秦百君麦威王微微杨汉立钟远鸣广西中医药大学研究生院广西南宁530001 河南省洛阳正骨医院河南省骨科医院河南洛阳471002 湖北民族大学医学部湖北恩施445000 广西中医药大学第一附属医院广西南宁530023

目的运用网络药理学的研究方法,初步分析独活寄生汤治疗退行性腰椎管狭窄症(DLSS)的作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索和筛选独活寄生汤方药物的活性成分,同时在GeneCards、OMIM数据库中检索DLSS的靶点。利... 详细信息

目的运用网络药理学的研究方法,初步分析独活寄生汤治疗退行性腰椎管狭窄症(DLSS)的作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索和筛选独活寄生汤方药物的活性成分,同时在GeneCards、OMIM数据库中检索DLSS的靶点。利用Venny平台得到独活寄生汤治疗DLSS的潜在作用靶点。利用STRING数据库和Cytoscape软件构建独活寄生汤治疗DLSS的“单味药—活性成分—作用靶点”网络和蛋白质相互作用网络(PPI),并通过david数据库对独活寄生汤治疗DLSS的作用靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,研究独活寄生汤治疗DLSS的作用机制,并通过分子对接来模拟活性成分作用于靶蛋白的结合情况。结果共探索出独活寄生汤主要涉及1939个有效活性成分及对应292个潜在靶点,DLSS靶点1258个,筛选出共同靶点122个。经PPI互作图显示蛋白ALB、AKT1、IL-6、IL-1B、CASP3等存在较多连线。药物-活性成分-靶点网络图显示,度值较高的活性成分主要涉及柚皮素、芒柄花黄素、甘草查尔酮A、黄芩素等,被影响较多的靶点为PTGS2、ESR1、HSP90AA1等。GO功能分析提示,关键靶点基因在生物过程(BP)主要参与了对氧化应激的反应、对脂多糖的反应、细胞对化学应激的反应等,在分子功能(MF)主要参与了脱氧核糖核酸-结合转录因子结合、信号受体激活剂活性、肽结合等,在细胞成分(CC)主要参与了膜筏、膜微区、囊腔等细胞结构,由此推测,治疗作用机制可能与信号转导蛋白、活性酶调节、炎症反应等有关。KEGG通路富集分析提示,关键通路主要涉及AGE-RAGE、IL-17、TNF等信号通路。结论借助网络药理学的研究方法,发现独活寄生汤治疗DLSS具有多靶点、多通路的特点,从抗炎、抗氧化、抗纤维化、抑制破骨细胞活性、促进成骨细胞活性等多个机制发挥治疗作用。

关键词：独活寄生汤退行性腰椎管狭窄症分子对接网络药理学靶点预测

灯盏花乙素治疗高脂血症的潜在分子生物学机制分析

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山东医药 2020年第32期60卷 13-17页

作者：刘思莹任蓁凌爽牛文颖王雨晴郭婉琴肖洪彬黑龙江中医药大学附属第一医院哈尔滨150040 黑龙江中医药大学黑龙江中医药大学佳木斯学院

目的通过网络药理学和分子对接探讨灯盏花乙素治疗高脂血症的潜在分子生物学机制。方法通过Pharmmapper平台寻找灯盏花乙素药效团作用靶点基因,通过Genecard和OMIM数据库筛选高脂血症相关靶点基因,构建化合物-靶点基因-疾病网络,获取共... 详细信息

目的通过网络药理学和分子对接探讨灯盏花乙素治疗高脂血症的潜在分子生物学机制。方法通过Pharmmapper平台寻找灯盏花乙素药效团作用靶点基因,通过Genecard和OMIM数据库筛选高脂血症相关靶点基因,构建化合物-靶点基因-疾病网络,获取共同作用靶点基因。将共同作用靶点基因上传至String平台,建立蛋白相互作用(PPI)网络,筛选核心靶点基因。利用david数据库对核心靶点蛋白进行GO生物过程及KEGG通路富集分析。通过AutoDock Vina软件对灯盏花乙素与核心靶点蛋白进行分子对接验证。结果灯盏花乙素潜在作用靶点基因366个,高脂血症相关靶点基因1280个,筛选出共有靶点基因39个,PPI网络中degree前6位的靶点基因有过氧化氢酶(CAT)、血红素加氧酶1(HMOX1)、髓过氧化物酶(MPO)、前列腺素-内过氧化物合酶2(PTGS2)、血管紧张素Ⅰ转换酶(ACE)、C反应蛋白(CRP),为核心靶点基因。主要参与的生物过程包括氧化应激反应、氧气水平的反应、抗生素反应、缺氧的反应、营养水平的反应、细胞排毒反应等;涉及的信号通路主要有PPAR信号通路、脂肪的消化吸收、花生四烯酸代谢、TNF信号通路、AMPK信号通路、FoxO信号通路、胆固醇代谢、调节脂肪细胞中的脂肪分解等。灯盏花乙素与CAT、MPO、PTGS2、ACE、HMXO1、CRP的活性位点均能够形成2个以上的氢键,结合能分别为-11.4、-10.8、-10.6、-9.8、-9.5、-8.9 kJ/mol。结论灯盏花乙素可能通过CAT、HMOX-1、MPO、PTGS2、ACE、CRP等靶点调控PPAR信号通路、脂肪酸氧化和吸收、胆固醇代谢等多条途径治疗高脂血症。

关键词：灯盏花乙素高脂血症生物信息学分析网络药理学分子对接

基于网络药理学探讨清痰化瘀方治疗冠心病痰热瘀结证的作用机制

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中西医结合心脑血管病杂志 2022年第1期20卷 28-36页

作者：杨志华毕颖斐毛静远王贤良李金哲任晓宇天津中医药大学第一附属医院天津300381

目的运用网络药理学探讨清痰化瘀方治疗冠心病痰热瘀结证的作用机制。方法从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选出清痰化瘀方的化学成分和潜在靶点,利用DrugBank、治疗靶点数据库(TTD)、DisGeNET、美国国家生物技术信息中心(NC... 详细信息

目的运用网络药理学探讨清痰化瘀方治疗冠心病痰热瘀结证的作用机制。方法从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选出清痰化瘀方的化学成分和潜在靶点,利用DrugBank、治疗靶点数据库(TTD)、DisGeNET、美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库筛选冠心病靶点,将疾病靶点与药物靶点进行Venn分析,筛选二者共同靶点,应用String数据库构建蛋白-蛋白相互作用网络,并通过david(6.8)数据库对共同靶点进行基因本体(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,运用Cytoscape 3.5.1构建“中药-化合物-共同靶点-疾病”网络,预测其作用机制。结果通过筛选获得清痰化瘀方101种化学成分和253个作用靶点,共同靶点112个,获得640条生物学过程和108条信号通路。通过对112个靶蛋白进行PPI分析发现,肿瘤坏死因子(TNF)、蛋白激酶(AKT1)、白介素-6(IL-6)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)3、MAPK8、血管内皮生长因子A(VEGFA)、原癌基因蛋白(FOS)等靶蛋白度值较大,KEGG通路富集结果显示,清痰化瘀方治疗冠心病的较多靶点被富集在TNF、低氧诱导因子-1(HIF-1)、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)-蛋白激酶B(Akt)、Toll样受体、环磷酸鸟苷(cGMP)-蛋白激酶G(PKG)等信号通路上。结论清痰化瘀方中的槲皮素、丹参酮ⅡA、β-谷甾醇、木犀草素、柚皮素等活性成分可能通过作用于TNF、AKT1、IL-6、MAPK3、MAPK8、VEGFA、FOS等关键靶点,进而调节PI3K-Akt、cGMP-PKG等信号通路治疗冠心病。

关键词：冠心病清痰化瘀方痰热瘀结证网络药理学作用机制

基于网络药理学预测畲药小香勾治疗痛风性关节炎相关潜在作用靶点和信号通路

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福建医科大学学报 2022年第2期56卷 119-125页

作者：林小惠汪余嘉聂雪坤张立林敏华艾克拜尔·热合曼陈子春宁德师范学院附属宁德市医院药学部宁德352100 宁德师范学院闽东畲药有效成分研究协同创新中心宁德352100 宁德师范学院医学院宁德352100

目的基于网络药理学探讨畲药小香勾治疗痛风性关节炎的作用机制。方法采用Pubchem数据库检索小香勾活性化合物的三维结构信息,并将结构文件上传至Pharmmapper数据库进行药效团模型靶点预测。通过GeneCards、OMIM、TTD、Drugbank、Pharm... 详细信息

目的基于网络药理学探讨畲药小香勾治疗痛风性关节炎的作用机制。方法采用Pubchem数据库检索小香勾活性化合物的三维结构信息,并将结构文件上传至Pharmmapper数据库进行药效团模型靶点预测。通过GeneCards、OMIM、TTD、Drugbank、PharmGBK数据库将疾病靶点与药效团模型靶点取交集,获得小香勾治疗痛风性关节炎的潜在作用靶点。利用Cytoscape软件及STRING数据库进行“药物-靶点”的可视化网络拓扑分析和PPI网络图谱的绘制,并筛选出药物作用的核心靶点。利用david数据库对潜在作用靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果共得到小香勾6个活性化合物的50个潜在作用靶点。GO功能富集分析共得到181个条目,其中细胞组成20条(11.0%),分子功能43条(23.8%),生物过程118条(65.2%)。KEGG提示小香勾主要通过能量代谢途径、花生四烯酸代谢、亚油酸代谢、蛋白聚糖途径等通路发挥抗炎镇痛的功效,涉及的核心蛋白包括:MAPK1、SRC、MMP9、PTGS2、MAPK14、MMP3、NOS2、ADAM17、PPARG、PLAU。结论初步阐明小香勾可能通过影响代谢途径相关靶点和生物过程发挥治疗痛风性关节炎的作用,为下一步进行科学验证提供了基本方向。

关键词：畲药网络药理学痛风性关节炎小香勾代谢途径

二十二碳六烯酸介导MAPK途径抗房颤的作用及机制研究

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蚌埠医学院学报 2021年第1期46卷 1-5页

作者：徐庆梅莫辰朱飞宇张恒王洪巨高琴康品方唐碧蚌埠医学院第一附属医院心血管科安徽蚌埠233004 蚌埠医学院生理学教研室安徽蚌埠233030 蚌埠医学院心脑血管研究中心安徽蚌埠233030

目的:探讨二十二碳六烯酸(DHA)通过影响P38 MAPK途径调控胶原表达发挥抗房颤作用可能的机制。方法:将80只对乙酰胆碱(66μg/mL)-氯化钙(50 mg/mL)混合液敏感的SD大鼠随机分为对照组(CON组)、对照DHA处理组(DHA组)、房颤组(AF组)和房颤DH... 详细信息

目的:探讨二十二碳六烯酸(DHA)通过影响P38 MAPK途径调控胶原表达发挥抗房颤作用可能的机制。方法:将80只对乙酰胆碱(66μg/mL)-氯化钙(50 mg/mL)混合液敏感的SD大鼠随机分为对照组(CON组)、对照DHA处理组(DHA组)、房颤组(AF组)和房颤DHA处理组(DHA+AF组),每组20只复制大鼠房颤模型。BL-420F描记心电图、连续双刺激法测定心房有效不应期(effective refractory period,ERP)、全细胞膜片钳技术记录心房肌细胞动作电位时程(action potential duration,APD)变化,酶免疫吸附法(ELISA)检测大鼠心房肌组织Ⅰ型、Ⅲ型胶原表达情况,蛋白印迹检测P38、P-P38及MKP-1表达情况。结果:大鼠房颤持续时间随实验时间增加而逐渐延长,而DHA可以缩短房颤持续时间(P<0.05~P<0.01)。AF组大鼠心房ERP、APD明显缩短、DHA可明显延长大鼠心房ERP、APD(P<0.01);各组P38表达无明显变化,与CON组相比,AF组大鼠P-P38表达水平明显升高,MKP-1表达明显下降(P<0.01);与AF组相比,DHA+AF组P-P38表达水平明显降低,MKP-1表达明显增加(P<0.01)。ELISA结果证实,DHA可明显下调大鼠心房肌组织Ⅰ型、Ⅲ型胶原表达(P<0.01)。结论:DHA可能通过调控P38 MAPK信号转导通路介导胶原表达发挥抗房颤作用。

关键词：心房颤动心房纤维化二十二碳六烯酸细胞外基质 MAPK途径

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脊髓损伤后痉挛相关基因的生物信息学分析

神经损伤与功能重建 2023年第6期18卷 320-324页

作者：王彬吴炼铧刘小平刘垚周娅邓俊勇邓发伟胡东霞南昌大学第二附属医院康复医学科南昌330000 昆明医科大学康复学院昆明650000

目的:对大鼠脊髓损伤(SCI)后痉挛相关基因进行生物信息学分析,探索SCI后痉挛发生的分子机制。方法:在GEO数据库下载SCI后痉挛的基因表达谱芯片数据GSE16710,采用在线工具GEO 2R筛选差异表达基因(DEG),筛选标准为P<0.05及|log2FC|≥1,通... 详细信息

目的:对大鼠脊髓损伤(SCI)后痉挛相关基因进行生物信息学分析,探索SCI后痉挛发生的分子机制。方法:在GEO数据库下载SCI后痉挛的基因表达谱芯片数据GSE16710,采用在线工具GEO 2R筛选差异表达基因(DEG),筛选标准为Pdavid数据库对筛选的DEG进行GO功能富集和KEGG通路分析,使用ImageGP可视化;通过STRING数据库构建DEGs的蛋白-蛋白互作(PPI)网络分析,利用Cytoscape软件进行可视化,并运用CytoHubba插件和DEPs的degree值筛选PPI网络中前10位的关键基因。结果:总共筛选得到313个DEGs,其中有92个上调基因和221个下调基因;GO富集分析结果发现DEGs主要集中在谷氨酸能突触传递的调节、突触传递的正向调节、神经元投射发展的调节及磷脂酰肌醇-3激酶信号等生物学过程上;KEGG通路分析表明,DEGs主要富集在长时程增强、谷氨酸能突触、MAPK信号途径及cAMP信号途径等通路上;PPI分析发现,Mapt、Gad1、Gria2、Fmr1、Reln、Mbp及Cav1等前10位是关键基因。结论:通过生信工具分析了SCI后痉挛中的关键DEGs和通路,帮助理解其分子机制及在痉挛发生、发展过程中的作用,为该病的治疗提供了理论依据。

关键词：脊髓损伤痉挛生物信息学机制