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Robust Clustering with Topological Graph Partition

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Chinese Journal of Electronics 2019年第1期28卷 76-84页

作者： WANG Shuliang LI Qi YUAN Hanning GENG Jing DAI Tianru deng chenwei School of software Beijing Institute of Technology School of Information and Electronics Beijing Institute of Technology

Clustering is fundamental in many fields with big data. In this paper, a novel method based on Topological graph partition(TGP) is proposed to group objects. A topological graph is created for a data set with many objects, in which an object is connected to k nearest neighbors. By computing the weight of each object, a decision graph under probability comes into being. A cut threshold is conveniently selected where the probability of weight anomalously becomes large. With the threshold,the topological graph is cut apart into several sub-graphs after the noise edges are cut off, in which a connected subgraph is treated as a cluster. The compared experiments demonstrate that the proposed method is more robust to cluster the data sets with high dimensions, complex distribution, and hidden noises. It is not sensitive to input parameter, we need not more priori knowledge.

关键词： Clustering Topological graph partition(TGP) Decision graph under probability Noise edge

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花生GATA基因家族鉴定和表达分析

山西农业大学学报（自然科学版） 2024年第2期44卷 10-22页

作者：王伟杰雷亚柯张建航展世杰邓陈威贾朝阳周口市农业科学院河南周口466000

[目的]探究GATA基因家族在花生生长发育和抗旱调控中的作用。[方法]通过生物信息学方法鉴定花生GATA家族成员,分析其系统进化、基因结构、组织表达模式,最后结合转录组数据和实时荧光定量PCR技术筛选花生GATA家族响应干旱胁迫的关键基因... 详细信息

[目的]探究GATA基因家族在花生生长发育和抗旱调控中的作用。[方法]通过生物信息学方法鉴定花生GATA家族成员,分析其系统进化、基因结构、组织表达模式,最后结合转录组数据和实时荧光定量PCR技术筛选花生GATA家族响应干旱胁迫的关键基因。[结果]本文鉴定到47个GATA类转录因子编码基因,它们不均匀地分布在除2号、4号和14号染色体以外的17条染色体上。理化性质分析表明,该家族属于亲水性蛋白,大部分基因呈酸性,只有***9XFC.1具有信号肽。根据拟南芥家族同源基因聚类分析结果,可将花生GATA家族蛋白分为4个亚家族。其中第Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ亚家族成员的锌指结构域特征模体为C_(X2)C_(X18)C_(X2)C,而第Ⅳ亚家族为C_(X2)C_(X20)C_(X2)C类型。大部分成员在A亚基因组和B亚基因组中呈对称分布,组织表达模式分析显示,超过半数的GATA家族成员在22个组织中表现不同程度的特异性表达。其中第Ⅰ亚家族***4M、***8GG1、Arahy.3S8P0L和Arahy.I6JZDT在所有组织中均显示较高的表达水平。然而***7BN7和Arahy.F7WS4I在叶片,Arahy.C6NV9N在花被中表达较高,Arahy.4Y7J59和Arahy.D56WMI在种子中呈现组织特异性高表达特性。转录组数据分析发现,34个GA⁃TA基因响应干旱、低温、ABA和BR激素处理,5个GATA基因在干旱和低温胁迫下表达量发生显著上调,1个基因发生显著下调。进一步RT-qPCR分析表明,Arahy.C6NV9N和Arahy.2SUK7S特异性响应PEG胁迫的基因,尤其前者在叶组织中胁迫早期呈现持续上调表达。[结论]花生中有47个GATA基因,其中Arahy.C6NV9N和Ara⁃hy.2SUK7S可能是花生GATA家族响应干旱胁迫关键基因。

关键词：花生转录因子 GATA 组织表达模式干旱胁迫

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芍药汤对白念珠菌生物膜体外抑制活性研究

江西中医药大学学报 2024年第4期36卷 95-101页

作者：邓晨薇占萍田玉尧鑫丁逸矾邱桂荣江西中医药大学南昌330004 江西中医药大学附属医院南昌330006

目的:观察经方芍药汤对白念珠菌生物膜的体外抑菌效果。方法:应用酵母菌肉汤稀释抗真菌药敏试验方案,测定芍药汤对白念珠菌最小抑菌浓度(MIC_(50))和最小杀菌浓度(MBC),运用扫描电子显微镜(SEM)及激光共聚焦显微镜(CLSM)观察芍药汤干预... 详细信息

目的:观察经方芍药汤对白念珠菌生物膜的体外抑菌效果。方法:应用酵母菌肉汤稀释抗真菌药敏试验方案,测定芍药汤对白念珠菌最小抑菌浓度(MIC_(50))和最小杀菌浓度(MBC),运用扫描电子显微镜(SEM)及激光共聚焦显微镜(CLSM)观察芍药汤干预白念珠菌作用时的形态变化,并采用甲基四氮盐(XTT)减低法及结晶紫染色法测定芍药汤对白念珠菌生物膜的最小抑制浓度(SMIC_(50))、代谢活性及生物膜量的影响。结果:芍药汤对白念珠菌的MIC_(50)和MBC为1.60 mg/mL和20.15 mg/mL;芍药汤对白念珠菌生物膜的SMIC_(50)为5.04 mg/mL;芍药汤可破坏白念珠菌生物膜结构及菌丝的生长;在不同时间点(2、6、12、24、48 h)实验组与空白对照组比较,芍药汤对白念珠菌生物膜生成活性具有抑制作用(P0.05),6、12、24、48 h时间点生物膜生成活性均显著增加(P0.05)。在2~12 h白念珠菌生物膜的整体代谢活性呈下降趋势(P0.05),XTT减低法和结晶紫染色测定法对白念珠菌生物膜测定的结果,差异无统计学意义(P>0.05)。结论:芍药汤对白念珠菌具有良好的体外抑菌活性,芍药汤抑制白念珠菌生物膜具有浓度依赖性,并通过延长芍药汤的药物作用时间达到抑制白念珠菌生物膜的效果。

关键词：芍药汤白念珠菌抗真菌药物敏感试验生物膜

不同栽培措施对豫东地区春播花生农艺性状与生理特性的影响

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贵州农业科学 2024年第3期52卷 15-24页

作者：雷亚柯张建航展世杰邓陈威王伟杰张俊杨亚洲马振威贾朝阳周口市农业科学院河南周口466001 河南省农业科学院经济作物研究所河南郑州450002

【目的】探明豫东地区春播花生适宜的人工播种和机械播种模式,为提升豫东地区花生种植效益、推动花生产业高质量发展提供参考。【方法】采用L8(4×24)正交试验方法,研究播种密度、每穴种子数、包衣剂用量、起垄高度和底肥用量5个因素对... 详细信息

【目的】探明豫东地区春播花生适宜的人工播种和机械播种模式,为提升豫东地区花生种植效益、推动花生产业高质量发展提供参考。【方法】采用L8(4×24)正交试验方法,研究播种密度、每穴种子数、包衣剂用量、起垄高度和底肥用量5个因素对花生株高、总分枝数、倒伏率、单株无效果针数、单株饱果数、单株秕果数、单株饱果率、单株果重、百果重、百仁重、出仁率、荚果产量和叶片SPAD值等方面的影响,并分析不同栽培因素与荚果产量的相关性。【结果】增加花生播种密度可显著促进株高,加重倒伏,显著降低总分枝数、单株饱果数、单株秕果数和单株果重;荚果产量随着种植密度增加呈先升后降趋势,最佳播种密度为21万穴/hm^(2)。与每穴种子数1粒相比,2粒可显著提升株高和荚果产量,但显著降低总分枝数、无效果针数、单株饱果数、单株秕果数、单株果重和百果重。种子包衣可显著提高荚果产量和单株果重。起垄种植可显著提高单株果重和百仁重,但显著降低株高。适当减少底肥用量对花生各农艺性状均无显著影响。每穴种子数、包衣剂用量、种植密度和底肥用量均与荚果产量正相关,其中,每穴种子数与荚果产量的相关性达显著水平;起垄高度与荚果产量呈负相关,未达显著水平。8种种植模式(P1~P8)在株高、总分枝数、无效果针数、单株饱果数、单株秕果数、单株果重、百果重和荚果产量方面存在极显著差异,在倒伏率、百仁重、出仁率和生长后期叶片SPAD值方面存在显著差异。人工播种模式下P4处理和机械播种模式下P5处理的荚果产量均最高,分别达5401.65 kg/hm^(2)和5024.40 kg/hm^(2)。【结论】综合考虑花生产量和投入成本,豫东地区春播花生最佳种植模式:人工播种为密度18万穴/hm^(2),2粒/穴,种子包衣,起垄,底肥复合肥料硫酸钾用量102.0 kg/hm^(2);机器播种为密度21万穴/hm^(2),1粒/穴,种子包衣,起垄,底肥复合肥料硫酸钾用量102.0 kg/hm^(2)。

关键词：花生农艺性状生理特性春种栽培模式豫东地区

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视觉信号质量评估

国外科技新书评介 2015年第7期 16-17页

作者： chenwei deng 臧光明不详中国科学院国家空间科学中心

随着计算机与网络技术的快速发展，人们创造了大量的视觉信号——目前生活中随处可见的视频、图形图像、动画等等都属于视觉信号的范畴。随着这些视觉数据的海量涌现，视觉体验质量（QoE）在多媒体技术与服务中也扮演着越来越重要的作... 详细信息

随着计算机与网络技术的快速发展，人们创造了大量的视觉信号——目前生活中随处可见的视频、图形图像、动画等等都属于视觉信号的范畴。随着这些视觉数据的海量涌现，视觉体验质量（QoE）在多媒体技术与服务中也扮演着越来越重要的作用。在过去的20年间，视觉质量评估领域的发展可谓日新月异。这一方面要归功于图形图像识别设备的快速发展，另一方面，人类在精神物理学以及神经学方面的发现又让我们对人类视觉系统有了更加清晰的认识。

关键词：视觉信号质量评估人类视觉系统图形图像多媒体技术网络技术体验质量识别设备

Recent Advances and Challenges of Visual Signal Quality Assessment

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China Communications 2013年第5期10卷 62-78页

作者：马林邓宸伟颜庆义林维斯 Department of Electronic Engineering Chinese University of Hong Kong Lenovo Corporate Research Hong Kong Branch School of Information and Electronics Beijing Institute of Technology School of Computer Engineering Nanyang Technological University

While quality assessment is essential for testing, optimizing, benchmarking, monitoring, and inspecting related systems and services, it also plays an essential role in the design of virtually all visual signal processing and communication algorithms, as well as various related decision-making processes. In this paper, we first provide an overview of recently derived quality assessment approaches for traditional visual signals (i.e., 2D images/videos), with highlights for new trends (such as machine learning approaches). On the other hand, with the ongoing development of devices and multimedia services, newly emerged visual signals (e.g., mobile/3D videos) are becoming more and more popular. This work focuses on recent progresses of quality metrics, which have been reviewed for the newly emerged forms of visual signals, which include scalable and mobile videos, High Dynamic Range (HDR) images, image segmentation results, 3D images/videos, and retargeted images.

关键词： objective quality assessment 2D images and videos human perception newly emerged visual signals Human Visual System

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实时信息处理系统多线程框架的高效设计方法

高技术通讯 2013年第1期23卷 42-48页

作者：蔡雨辰赵保军邓宸伟北京理工大学信息与电子学院北京100081 卡内基梅隆大学计算机科学学院宾夕法尼亚州15213

针对目前的多线程编程模型不能快速有效地解决实时信息处理系统（RIPS）设计的问题，通过对以流水线方式工作的多线程系统进行建模，分析了两种适用于RIPS的多线程模型的时间开销与线程数量、缓冲区数量之间的关系，并基于这两种多线程... 详细信息

针对目前的多线程编程模型不能快速有效地解决实时信息处理系统（RIPS）设计的问题，通过对以流水线方式工作的多线程系统进行建模，分析了两种适用于RIPS的多线程模型的时间开销与线程数量、缓冲区数量之间的关系，并基于这两种多线程模型，提出了一种高效的RIPS多线程设计方法。该方法无需过多考虑各线程的设计细节，从而能有效提高多线程RIPS的开发效率，同时保证系统的高效与稳定。在x86通用PC机平台上对该方法进行的仿真验证的结果表明，该方法能够保证RIPS的可靠性和稳定性。与基于MPI搭建的系统的对比测试结果表明，基于该方法搭建的系统具有更高的效率和鲁棒性。

关键词：实时信息处理系统(RIPS) 多线程线程同步流水线

基于深度学习的无人机载平台多目标检测和跟踪算法研究

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信号处理 2022年第1期38卷 157-163页

作者：王旭辰韩煜祺唐林波邓宸伟北京理工大学信息与电子学院雷达技术研究所北京100081

无人机技术和计算机视觉技术相结合,在民用和军用领域都有着广泛的需求,然而当前算法不能很好的适应无人机视角旋转、障碍物遮挡、目标尺度变化等特殊情况。根据实际的难点和挑战,提出了基于深度学习的无人机载平台多目标检测和跟踪算... 详细信息

无人机技术和计算机视觉技术相结合,在民用和军用领域都有着广泛的需求,然而当前算法不能很好的适应无人机视角旋转、障碍物遮挡、目标尺度变化等特殊情况。根据实际的难点和挑战,提出了基于深度学习的无人机载平台多目标检测和跟踪算法。主要工作有:在检测方面,通过公开数据集和实际采集的大量数据,训练了基于Darknet53的检测网络作为检测器;在跟踪方面,使用Car-Reid数据集训练了一个残差网络提取目标外观信息,使用卡尔曼滤波提取目标运动信息,并通过一个融合公式将两个信息进行整合得到成本矩阵,最后由匈牙利匹配算法得到跟踪结果。在UAV123数据集和实测采集数据集上分别进行多组实验验证,得到本算法在视角旋转、目标尺度变化、障碍物遮挡情况下均能进行稳定检测跟踪的结论。

关键词：深度学习无人机载平台多目标跟踪数据关联

基于低复杂度卷积神经网络的星载SAR舰船检测

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北京交通大学学报 2017年第6期41卷 1-7页

作者：赵保军李珍珍赵博雅冯帆邓宸伟北京理工大学信息与电子学院北京100081 北京理工大学嵌入式实时信息处理技术北京市重点实验室北京100081

星载SAR(合成孔径雷达)舰船检测广泛应用于海上救援和国土安全防护等领域.鉴于传统的检测方法仍存在虚警率高等缺点,本文将具有强大表征能力的卷积神经网络(CNN)引入到星载SAR舰船检测中,面向SAR舰船检测的精准快速的需求,提出了基于低... 详细信息

星载SAR(合成孔径雷达)舰船检测广泛应用于海上救援和国土安全防护等领域.鉴于传统的检测方法仍存在虚警率高等缺点,本文将具有强大表征能力的卷积神经网络(CNN)引入到星载SAR舰船检测中,面向SAR舰船检测的精准快速的需求,提出了基于低复杂度CNN的星载SAR舰船检测算法.算法结合星载SAR图像的特点,利用ROI提取方法实现目标粗提取,得到可疑目标切片及其对应的位置信息;通过构建的低复杂度CNN对所有的可疑目标切片进行精确分类,确定舰船目标,从而实现舰船目标检测.实验测试结果表明:本文提出的算法可以实现精准的星载SAR舰船检测;与传统双参数CFAR目标检测和基于现有深度网络框架(LeNet、GoogLeNet)的检测算法相比,该算法检测性能更好、检测时间更短,可有效降低检测漏检率和虚警率.

关键词：图像处理目标检测星载SAR舰船卷积神经网络低复杂度