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FP-Zernike:An Open-source structural Database Construction Toolkit for Fast structure Retrieval

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Genomics, Proteomics & Bioinformatics 2024年第1期22卷 111-119页

作者： Junhai Qi Chenjie Feng Yulin shi Jianyi Yang Fa Zhang Guojun Li renmin Han Research Center for Mathematics and Interdisciplinary sciences Shandong UniversityQingdao 266237China BioMap Research Menlo ParkCA 94025USA college of Medical Information and Engineering Ningxia Medical UniversityYinchuan 750004China Institute of Engineering Medicine Beijing Institute of TechnologyBeijing 100081China

The release of AlphaFold2 has sparked a rapid expansion in protein model *** protein structure retrieval is crucial for the analysis of structure models,while measuring the similarity between structures is the key challenge in structural *** existing structure alignment algorithms can address this challenge,they are often ***,the state-of-the-art approach involves converting protein structures into three-dimensional(3D)Zernike descriptors and assessing similarity using Euclidean ***,the methods for computing 3D Zernike descriptors mainly rely on structural surfaces and are predominantly web-based,thus limiting their application in studying custom *** overcome this limitation,we developed FP-Zernike,a user-friendly toolkit for computing different types of Zernike descriptors based on feature *** simply need to enter a single line of command to calculate the Zernike descriptors of all structures in customized ***-Zernike outperforms the leading method in terms of retrieval accuracy and binary classification accuracy across diverse benchmark *** addition,we showed the application of FP-Zernike in the construction of the descriptor database and the protocol used for the Protein Data Bank(PDB)dataset to facilitate the local deployment of this tool for interested *** demonstration contained 590,685 structures,and at this scale,our system required only 4-9 s to complete a *** experiments confirmed that it achieved the state-of-the-art accuracy ***-Zernike is an open-source toolkit,with the source code and related data accessible at https://***/biocode/tools/BT007365/releases/0.1,as well as through a webserver at http://***/.

关键词： Zernike descriptor structure alignment PDB dataset Open-source Retrieval system

融合教育的价值意蕴与实践路径——基于卢曼社会系统理论的分析

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教育科学 2024年第2期40卷 52-59页

作者：史仁民王吉渤海大学教育科学学院辽宁锦州121013

融合教育是保证教育公平而有质量的关键要素,是解决教育发展中不平衡、不充分问题的有效路径。随着社会的进步与多元化发展,学者们日益关注如何有效实施融合教育以更好地满足不同学生的需求。融合教育的发展经历了隔离教育时期、部分融... 详细信息

融合教育是保证教育公平而有质量的关键要素,是解决教育发展中不平衡、不充分问题的有效路径。随着社会的进步与多元化发展,学者们日益关注如何有效实施融合教育以更好地满足不同学生的需求。融合教育的发展经历了隔离教育时期、部分融合时期和完全融合时期的演变过程,体现出社会对融合教育的理解与认可是逐渐深化的。融合教育涉及多样性、平等、质量、权利等相关概念,具有追求教育公平切实实现、尊重个体差异多元发展、促进社会发展深度融合的价值意蕴。卢曼的社会系统理论,从社会结构和功能分化角度出发,将教育作为现代社会系统的重要子系统,为融合教育提供了三方面实践路径,即增强共通性价值认同、建立包容性学习环境和提供个性化学习支持。

关键词：融合教育价值意蕴实践路径社会系统理论

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On Human Rights Norms

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学术界 2011年第2期 254-256页

作者： Qin Qiang Xie Yongzhao renmin university of China shandong Police college

Human Rights are the eternal topic of the *** rights as a core value of constitutionalism,is often reflected in the constitutional text and constitutional *** natures of the norms of human rights are the standardization to express the value of human rights and the legal existence *** development of major human rights norms goes through three stages:first,the Universal Declaration of Human Rights from the doctrine to the stage;second,from the stage of the Bill of Rights to the human rights legislation;third,from the stage of domestic legislation to international *** rights norms are often in the text of the Constitution which is specifically expressed in human rights ***'s human rights provisions in the constitutional text generally refer to the clauses of the new constitutional amendment in 2004,which is "the state respects and safeguards human rights" clause.

关键词： human rights human rights norms human rights clause

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经济伦理关于“经济人”概念的再审视

中国人民大学学报 2001年第6期15卷 35-41页

作者：龚群中国人民大学哲学系北京100872

作为经济伦理逻辑起点的“经济人”概念是对于传统主流经济学理论中“经济人”概念的移用。但是 ,这一作为逻辑起点的概念在经济伦理的理论推演以及社会实践中都遇到了难以克服的困难 ,陷入了困境。“囚徒困境”表达了“经济人”概念基... 详细信息

作为经济伦理逻辑起点的“经济人”概念是对于传统主流经济学理论中“经济人”概念的移用。但是 ,这一作为逻辑起点的概念在经济伦理的理论推演以及社会实践中都遇到了难以克服的困难 ,陷入了困境。“囚徒困境”表达了“经济人”概念基础上的集体理性与个人理性的内在困境。必须重新审视“经济人”的概念 ,将个人对好生活的全面理解与个人作为社会责任、义务的承担者的观念引进经济伦理的讨论。

关键词：经济人囚徒困境个人理性集体理性

Mozi: No Aggression,But Universal Love

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China Today 2011年第7期60卷 74-75页

作者： WEN HAIMING is an associate professor at the school of philosophy of renmin university of China. He has a doctorate from the university of Hawaii and specializes in Chinese and Comparative philosophy Associate professor at the school of philosophy of renmin university of China. university of Hawaii

MOZI (ca.475-395 BC) was one of many philosophers in the volatile Pre-Qin Period (before BC 221 when the state of Qin annexed other six kingdoms and unified China) who were committed to restoring and overhauling the social *** was a commoner born in the state of Lü (in today’s shandong Province),but spent most of his life in the state of song (in present day Henan Province).He studied Confucian theory in his early years,and later established his own school of thought Mohism,which challenges Confucianism on many *** traveled around the states to sell his political ideas to the rulers,who gave him the cold shoulder *** great thinker never held any high official position in his lifetime.

关键词：墨子通用先秦时期社会秩序哲学家

知识和信仰的分途:近代社会变革中儒学的宗教化和知识化的争论

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中国人民大学学报 2010年第6期24卷 12-20页

作者：干春松中国人民大学哲学院

在西方文化进入之前,儒学在中国社会中是一种信仰和知识的混合体,但在对应西方的冲击、完成民族国家建构的过程中,需要一种坚强的价值支持。因此,儒学的改变便成为时代的要求。作为一个19世纪末期的改革家,康有为对儒家思想的重整具有... 详细信息

在西方文化进入之前,儒学在中国社会中是一种信仰和知识的混合体,但在对应西方的冲击、完成民族国家建构的过程中,需要一种坚强的价值支持。因此,儒学的改变便成为时代的要求。作为一个19世纪末期的改革家,康有为对儒家思想的重整具有典范性的意义。他对儒学的改造从两个方向入手:一是教会化;二是知识化。就儒学本身而言,一方面由于过于理性化而难以真正信仰化;另一方面又由于其价值特性而与现代科学难以兼容。因此,康有为的改革并没有使儒学走出困境,反而促使儒学失去了属于自己的存在方式。

关键词：知识信仰康有为儒学

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马基雅弗利的政治伦理思想

南昌大学学报（人文社会科学版） 2014年第1期45卷 1-6页

作者：龚群中国人民大学哲学院北京100872

在西方伦理思想史上,马基雅弗利是一位重要的转折性人物。他终生都在追求自由和国家的强盛。同时,他把取得权力和统治权的维护看成是高于道德的考虑,从而使他成为政治与道德分野的先声。然而,他所持的是双重道德标准,即政治的成功可以... 详细信息

在西方伦理思想史上,马基雅弗利是一位重要的转折性人物。他终生都在追求自由和国家的强盛。同时,他把取得权力和统治权的维护看成是高于道德的考虑,从而使他成为政治与道德分野的先声。然而,他所持的是双重道德标准,即政治的成功可以不考虑道德,但对于国民而言,则必须重视其德性。他的政治非道德的后果论是建立在他的人性恶的基础上。他的道德观反映了一个利己主义和个人主义的自由市场经济时代的到来。

关键词：马基雅弗利政治自由道德

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王国维与中国哲学学科的建构

中国人民大学学报 2004年第4期18卷 77-83页

作者：干春松中国人民大学哲学系北京 100872

王国维对于现代中国哲学学科建构做出了开创性的贡献。通过对于康德和叔本华哲学的介绍,他提出了自己的哲学观,认为哲学是追求真理的学问。他还对中国哲学的核心概念进行了分析,并试图根据西方哲学的范式来整理中国哲学的资料,从而对20... 详细信息

王国维对于现代中国哲学学科建构做出了开创性的贡献。通过对于康德和叔本华哲学的介绍,他提出了自己的哲学观,认为哲学是追求真理的学问。他还对中国哲学的核心概念进行了分析,并试图根据西方哲学的范式来整理中国哲学的资料,从而对20世纪的中国哲学研究具有重大影响。

关键词：王国维学科体系中国哲学建构

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罗斯的自明义务论

齐鲁学刊 2009年第6期 90-95页

作者：龚群中国人民大学哲学院

罗斯在批评康德的绝对义务论的前提下,提出自明的义务论。自明的义务论是一个直觉主义的义务论。自明的义务论强调人们的行动所依据的是内在直觉,而不是动机。同时,自明的责任是一类人们应当承担的责任。然而,由于自明的责任是一批责任... 详细信息

罗斯在批评康德的绝对义务论的前提下,提出自明的义务论。自明的义务论是一个直觉主义的义务论。自明的义务论强调人们的行动所依据的是内在直觉,而不是动机。同时,自明的责任是一类人们应当承担的责任。然而,由于自明的责任是一批责任,对于哪一个是当下情形中的实际责任或绝对责任,这仍然需要在具体情形中的具体判断。罗斯把义务重新确立在义务的自明性上,同时又不归结为其自明性。

关键词：罗斯自明责任实际责任