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Multiomics analysis reveals metabolic subtypes and identifies diacylglycerol kinase α (DGKA) as a potential therapeutic target for intrahepatic cholangiocarcinoma

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Cancer Communications 2024年第2期44卷 226-250页

作者： Weiren Liu Huqiang Wang Qianfu Zhao chenyang tao Weifeng Qu Yushan Hou Run Huang Zimei Sun Guiqi Zhu Xifei Jiang Yuan Fang Jun Gao Xiaoling Wu Zhixiang Yang Rongyu Ping Jiafeng Chen Rui Yang Tianhao Chu Jian Zhou Jia Fan Zheng Tang Dong Yang Yinghong Shi Department of Liver Surgery and Transplantation Liver Cancer InstituteZhongshan HospitalFudan UniversityKey Laboratory of Carcinogenesis and Cancer Invasion of Ministry of EducationShanghaiP.R.China Research Unit of Liver cancer Recurrence and Metastasis Chinese Academy of Medical SciencesBeijingP.R.China State Key Laboratory of Medical Proteomics Beijing Proteome Research CenterNational Center for Protein Sciences(Beijing)Beijing Institute of LifeomicsBeijingP.R.China

Background:Intrahepatic cholangiocarcinoma(iCCA)is a highly heteroge-neous and lethal hepatobiliary tumor with few therapeutic *** metabolic reprogramming of tumor cells plays an essential role in the develop-ment of tumors,while the metabolic molecular classification of iCCA is largely ***,we performed an integrated multiomics analysis and metabolic classification to depict differences in metabolic characteristics of iCCA patients,hoping to provide a novel perspective to understand and treat ***:We performed integrated multiomics analysis in 116 iCCA samples,including whole-exome sequencing,bulk RNA-sequencing and proteome *** on the non-negative matrix factorization method and the protein abundance of metabolic genes in human genome-scale metabolic models,the metabolic subtype of iCCA was *** and prognostic gene analy-ses were used to compare overall survival(OS)differences between metabolic *** proliferation analysis,5-ethynyl-2’-deoxyuridine(EdU)assay,colony formation assay,RNA-sequencing and Western blotting were performed to investigate the molecular mechanisms of diacylglycerol kinaseα(DGKA)in iCCA ***:Three metabolic subtypes(S1-S3)with subtype-specific biomarkers of iCCA were *** metabolic subtypes presented with distinct prog-noses,metabolic features,immune microenvironments,and genetic *** S2 subtype with the worst survival showed the activation of some special metabolic processes,immune-suppressed microenvironment and Kirsten ratsar-coma viral oncogene homolog(KRAS)/AT-rich interactive domain 1A(ARID1A)*** the S2 subtype-specific upregulated proteins,DGKA was further identified as a potential drug target for iCCA,which promoted cell proliferation by enhancing phosphatidic acid(PA)metabolism and activating mitogen-activated protein kinase(MAPK)***:Viamultiomics analyses,we identified three metabolic subtypes of iCCA,revealing

关键词： diacylglycerol kinaseα intrahepatic cholangiocarcinoma MAPK signaling metabolic classifi-cation multiomics analysis phosphatidic acid metabolism

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开放政府数据质量评估研究进展及启示

图书馆 2018年第12期 74-79页

作者：翟军陶晨阳李晓彤大连海事大学航运经济与管理学院辽宁大连116026

梳理开放政府数据质量评估研究的进展情况,为构建适合我国国情的质量评估体系提供借鉴和启示。通过文献调研和分析,从两个方面(元数据和数据集)和两个层次(模式层和实例层)归纳质量评估的维度与指标。国际上在元数据质量的自动评估等领... 详细信息

梳理开放政府数据质量评估研究的进展情况,为构建适合我国国情的质量评估体系提供借鉴和启示。通过文献调研和分析,从两个方面(元数据和数据集)和两个层次(模式层和实例层)归纳质量评估的维度与指标。国际上在元数据质量的自动评估等领域开展了深入的研究和应用,但对数据模式的质量评估还刚刚起步。我国目前的工作偏向于对数据平台质量的整体评价,应在评估对象的多元化、依据元数据标准构建评估指标上借鉴先进经验。

关键词：开放政府数据数据质量元数据质量质量评估指标体系

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考虑碳排放的煤矿掘进系统仿真探析

现代工业经济和信息化 2024年第1期14卷 150-154页

作者：陶晨阳安徽理工大学经济与管理学院安徽淮南232001

利用Anylogic仿真软件,应用系统动力学模型方法(System Dynamics,SD)综合考量碳排放等因素,建立了掘进效率模型。以某煤矿为例,根据该矿实际情况,通过调整掘进各工序的人员数量与人均支出,进行掘进效率优化。仿真结果表明,支护效率与平... 详细信息

利用Anylogic仿真软件,应用系统动力学模型方法(System Dynamics,SD)综合考量碳排放等因素,建立了掘进效率模型。以某煤矿为例,根据该矿实际情况,通过调整掘进各工序的人员数量与人均支出,进行掘进效率优化。仿真结果表明,支护效率与平均无故障时间比较低,是影响煤矿巷道掘进的最主要因素;对于提升支护工序效率,增加人员数量的效果比对员工进行激励效果更好;对于提升巷道掘进效率,单一地增加员工数量与进行激励均无法满足要求,需要两种手段相结合。

关键词：采掘接替系统动力学碳排放仿真

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细胞外囊泡在肝纤维化疾病中的研究进展

中华肝脏病杂志 2019年第6期27卷 407-410页

作者：陶晨阳郭津生史颖弘复旦大学附属中山医院肝外科上海200032 复旦大学附属中山医院消化科上海市肝病研究所上海200032

肝纤维化是一种由慢性肝损伤导致的肝内结缔组织异常增生为主的病理生理学过程,而肝星状细胞的活化和迁移起主要作用。细胞外囊泡是一类由几乎所有细胞均能分泌的纳米级、双层脂质被膜小泡,主要介导细胞间的信息交流以及细胞微环境调控... 详细信息

肝纤维化是一种由慢性肝损伤导致的肝内结缔组织异常增生为主的病理生理学过程,而肝星状细胞的活化和迁移起主要作用。细胞外囊泡是一类由几乎所有细胞均能分泌的纳米级、双层脂质被膜小泡,主要介导细胞间的信息交流以及细胞微环境调控。近年来,越来越多的研究结果显示细胞外囊泡携带蛋白质、脂质与RNA分子等生物活性物质参与了肝纤维化中肝星状细胞的活化、迁移等纤维化发生过程。

关键词：肝硬化外泌体外囊泡

DCP/TAIC用量及老化行为对NBR/EVM共混胶性能的影响

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橡塑技术与装备 2016年第21期42卷 66-71页

作者：易杰李旭衣晨阳邓涛青岛科技大学高分子科学与工程学院山东青岛266042

课题研究了DCP/TAIC用量及不同老化行为对NBR/EVM共混胶的硫化特性、总交联密度、两项交联密度、物理机械性能、压缩永久变形及压缩蠕变等性能的影响;结果表明共混胶随着DCP/TAIC用量增大,其总交联密度、两项交联密度、拉伸强度、100%... 详细信息

课题研究了DCP/TAIC用量及不同老化行为对NBR/EVM共混胶的硫化特性、总交联密度、两项交联密度、物理机械性能、压缩永久变形及压缩蠕变等性能的影响;结果表明共混胶随着DCP/TAIC用量增大,其总交联密度、两项交联密度、拉伸强度、100%定伸应力、硬度和压缩蠕变呈上升趋势,扯断伸长率和压缩永久变形呈上升趋势;老化后总交联密度、两相交联密度、100%定伸应力、硬度和老化前相比都增大,拉伸强度和扯断伸长率都减小,老化前后扯断永久变形基本不变。

关键词：丁腈橡胶乙烯-醋酸乙烯脂橡胶交联密度物理机械性能压缩永久变形压缩蠕变

基于MODIS数据的地面颗粒物浓度估算方法

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南京师大学报（自然科学版） 2016年第3期39卷 135-140页

作者：戴燃坡宿慧丹陶晨阳郭各朴马青玉谢勇南京师范大学物理科学与技术学院江苏南京210023 中国科学院遥感与数字地球研究所北京100094

提出了一种基于卫星遥感数据的近地面颗粒物质量浓度(PM值)估计方法 .采用Terra/MODIS卫星数据和基于连续两天MODIS数据的气溶胶光学厚度反演算法,反演出无锡地区的气溶胶光学厚度;再利用所反演的气溶胶光学厚度与地面实测颗粒物质量浓... 详细信息

提出了一种基于卫星遥感数据的近地面颗粒物质量浓度(PM值)估计方法 .采用Terra/MODIS卫星数据和基于连续两天MODIS数据的气溶胶光学厚度反演算法,反演出无锡地区的气溶胶光学厚度;再利用所反演的气溶胶光学厚度与地面实测颗粒物质量浓度数据进行分析,得出颗粒物质量浓度的大小分布范围与气溶胶光学厚度的关系模型;进一步利用研究区域中地面站点监测到的颗粒质量浓度数据对估算结果进行评估.结果表明该方法所估算的PM值与地面实测数据具有较好的相关性,且地面监测的颗粒物质量浓度均分布在卫星遥感数据所估算的范围之内.本研究证明了MODIS卫星数据监测地面颗粒物质量浓度的可行性,为近地面PM值的估算提供了有效手段.

关键词：卫星遥感 MODIS数据近地面颗粒物浓度气溶胶光学厚度

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芯片厂房洁净空调系统节能运行影响因素研究

暖通空调 2022年第10期52卷 161-167页

作者：蒋梦奇李楠陶辰阳赵宇陈怡伶重庆大学重庆科技部低碳绿色建筑国际联合研究中心重庆

从芯片厂房洁净空调系统的运行特点出发,通过理论分析得到了芯片厂房洁净空调系统的能耗影响因素,通过实测梳理了芯片厂房洁净空调系统的能耗现状及节能潜力。DesignBuilder软件模拟结果表明,冷水机组COP、换气次数、风机效率、新风量... 详细信息

从芯片厂房洁净空调系统的运行特点出发,通过理论分析得到了芯片厂房洁净空调系统的能耗影响因素,通过实测梳理了芯片厂房洁净空调系统的能耗现状及节能潜力。DesignBuilder软件模拟结果表明,冷水机组COP、换气次数、风机效率、新风量、水泵效率、室内设计温度的空调电耗最大节能率分别为39.7%、23.0%、15.4%、11.2%、10.8%、6.0%。SPSS偏相关分析表明,显著性影响因素为冷水机组COP、换气次数和新风量。研究成果可为预期节能量的预测提供依据。

关键词：芯片厂房洁净空调节能运行影响因素能耗模拟偏相关分析

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Flow and magnetic structures in a kinematic ABC-dynamo

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Science China(Physics,Mechanics & Astronomy) 2020年第8期63卷 95-100页

作者： tao Zhang ZhiLiang Lin chenyang Huang Alistair G.L.Borthwick State Key Laboratory of Ocean Engineering School of Naval ArchitectureOcean and Civil EngineeringShanghai Jiao Tong UniversityShanghai 200240China Collaborative Innovation Center for Advanced Ship and Deep-Sea Exploration Shanghai 200240China School of Engineering The University of EdinburghEdinburgh EH93JLUK

Dynamo theory describes the magnetic field induced by the rotating,convecting and electrically conducting fluid in a celestial *** classical ABC-flow model represents fast dynamo action,required to sustain such a magnetic *** this letter,Lagrangian coherent structures(LCSs)in the ABC-flow are detected through Finite-time Lyapunov exponents(FTLE).The flow skeleton is identified by extracting intersections between repelling and attracting *** the case A=B=C=1,the skeleton structures are made up from lines connecting two different types of stagnation points in the *** corresponding kinematic ABC-dynamo problem is solved using a spectral method,and the distribution of cigar-like magnetic structures *** links are found to exist between LCSs in the ABC-flow and induced magnetic structures,which provides insight into the mechanism behind the ABC-dynamo.

关键词： kinematic dynamo theory ABC-flow Lagrangian coherent structure

基于单个花状银纳米颗粒的表面增强拉曼散射效应研究

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光散射学报 2020年第1期32卷 46-51页

作者：陶晨阳宁欢陈海艺范天瑜詹依婷杨硕温州大学电气与电子工程学院温州325035

在室温下,以硝酸银为银源,抗坏血酸为还原剂,通过调节表面活性剂聚乙烯吡络烷酮的浓度,实现对花状银纳米颗粒的可控制备。利用扫描电子显微镜、原子力显微镜、X射线衍射和X射线能谱等手段检测并分析了材料的形貌结构和成分组成。实验结... 详细信息

在室温下,以硝酸银为银源,抗坏血酸为还原剂,通过调节表面活性剂聚乙烯吡络烷酮的浓度,实现对花状银纳米颗粒的可控制备。利用扫描电子显微镜、原子力显微镜、X射线衍射和X射线能谱等手段检测并分析了材料的形貌结构和成分组成。实验结果表明,当聚乙烯吡络烷酮的浓度为0.1 mol/L时,所制备花状银纳米颗粒的表面结构达到最精细的状态且颗粒的尺寸达到微米量级,适合对单颗粒进行定位与光学性质研究。以结构最优化的花状银纳米颗粒为表面增强拉曼散射基底材料,以羟基苯甲酸为探针,对单个和少数颗粒的表面增强拉曼散射效应进行了研究,并借助暗场散射光谱分析了基底的表面增强拉曼散射机理。结果显示,该花状银纳米颗粒因其独特的表面结构为拉曼信号增强提供了大量“热点”。良好的拉曼性能以及较低的制备成本表明,该新型表面增强拉曼散射基底具有很大的应用前景。

关键词：银纳米颗粒花状结构单个粒子局域表面等离子体共振表面增强拉曼散射