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弹性波模拟的最优吸收边界条件

国外油气勘探 1996年第1期8卷 79-84页

作者： chengbin peng 胥帆石油大学(北京)地科系

引言吸收边界条件广泛地用于无边界介质中波传播的数值模拟,以便减少来自人工边界的反射(Lindman,1975;Clayton和Engquist,1977;Reynolds,1978;Liao等,1984;Cerian等,1985;Randall,1988;Higdon,1991)。我们对一种特殊的吸收边界条件感兴趣,它有最大吸收力且所需之计算量和内存最小。对于用有限差分法进行弹性波传播的3-D模拟来说这是可行的。

关键词：弹性波模拟吸收边界条件地震勘探地震波

The application of reflection tomography to prestack depth migration, case studies

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The application of reflection tomography to prestack depth m...

各向异性介质中的3D叠前深度偏移——北达科他州Lodgepole礁远景区的实例研究

CPS/SEG 2004 International Geophysical Conference

作者： chengbin peng 3431 Amphora Circle Sugar Land Texas USA

＜正＞ This paper documents two case studies where the residual reflection tomography, together with good understanding of subsurface geology, can yield superior subsurface images that make a lot of geological sense, leading to optimal drilling decisions and discoveries. The first case study is an example from a redevelopment project onshore Texas coast. In this example the residual reflection tomography helps identify a compartmentalized fault block, across which large velocity change occurs. The second case study is from offshore Gulf of Mexico, where detailed 3D velocity updating has not only improved subsurface imaging but also resulted in a change of well path in the midst of drilling.

关键词：

来源： cnki会议评论

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石油物探译丛 2001年第5期 32-37页

作者： chengbin peng 朱海龙中国石化石油勘探开发研究院南京石油物探研究所南京210014

深度偏移剖面(叠前或叠后)解释中的一个关键问题是地震层位几乎总是不和井口一致.通常情况下,地震波至大约要深1000ft.造成这种差异的原因主要归咎于地震各向异性.在本文中,我们将给出美国北达科他州Lodgepole礁远景区的一个实例,通过... 详细信息

深度偏移剖面(叠前或叠后)解释中的一个关键问题是地震层位几乎总是不和井口一致.通常情况下,地震波至大约要深1000ft.造成这种差异的原因主要归咎于地震各向异性.在本文中,我们将给出美国北达科他州Lodgepole礁远景区的一个实例,通过在3D速度模型中加入强地震各向异性,我们得到了良好的深度偏移结果,且与井闭合极佳(小于50ft).估计出的各向异性参数与岩样的实验室测量一致.

关键词：各向异性介质叠前深度偏移地震勘探速度模型深度偏移剖面

一种高效体数据压缩算法及其在地震数据处理中的应用

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计算机辅助设计与图形学学报 2009年第11期21卷 1606-1611页

作者：赵利平肖德贵李肯立乐光学彭成斌嘉兴学院数学与信息工程学院嘉兴314000 湖南大学计算机与通信学院长沙410082 Royal Dutch Shell HustonTX 77478 USA

采用可编程图形硬件对大规模体数据进行直接体绘制时常常受到图形卡容量的限制,导致数据在内存与显存之间频繁交换,从而成为绘制的瓶颈.为此,提出一种大规模体数据矢量量化压缩算法.首先对体数据分块,并依据块内数据平均梯度值是否为0... 详细信息

采用可编程图形硬件对大规模体数据进行直接体绘制时常常受到图形卡容量的限制,导致数据在内存与显存之间频繁交换,从而成为绘制的瓶颈.为此,提出一种大规模体数据矢量量化压缩算法.首先对体数据分块,并依据块内数据平均梯度值是否为0对该块进行分类;然后用3层结构表示梯度值非0的块,对其中次高层和最高层采用基于主分量分析分裂法产生初始码书,用LBG算法进行码书优化和量化,而对最低层以及梯度值为0的块采用定比特量化.实验结果表明,在保证较好图像重构质量的前提下,该算法可获得50倍以上的压缩比和更快的解压速度.

关键词：矢量量化分类体压缩地震数据

基于图像八叉树的三维比例边界有限元多面体网格生成算法

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河海大学学报（自然科学版） 2024年第1期52卷 46-54页

作者：章鹏杜成斌赵文虎南京工程学院土木工程与智慧管理研究所江苏南京211167 河海大学力学与材料学院江苏南京211100 南昌大学工程建设学院江西南昌330031

基于图像八叉树方法,提出了平衡八叉树和多面体网格修剪相结合的三维比例边界有限元多面体网格算法,该算法根据结构尺寸建立恰好完全包含整个结构的立方体网格,再建立结构图像像素信息,根据像素信息,按照2∶1的平衡分割原则递归地进行等... 详细信息

基于图像八叉树方法,提出了平衡八叉树和多面体网格修剪相结合的三维比例边界有限元多面体网格算法,该算法根据结构尺寸建立恰好完全包含整个结构的立方体网格,再建立结构图像像素信息,根据像素信息,按照2∶1的平衡分割原则递归地进行等分,完成平衡八叉树网格生成。结构内单元网格完全保留,结构外单元网格删除,对于结构边界单元网格,提出采用面-立方体相交判断方法进行边界单元与结构边界相交面的筛选,搜寻结构单元与结构边界表面相交点,通过有序连接相交点形成边界单元切割面,再结合边界单元其他几个面,构成裁剪后的多面体单元。数值算例结果表明,基于本文算法生成的比例边界有限元网格计算结果具有较好的精度和边界适应性。

关键词：平衡八叉树多面体网格修剪三维比例边界有限元网格生成算法图像像素

利用cDNA-AFLP技术分析炭疽菌危害诱导茶树的差异表达基因

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茶叶科学 2020年第1期40卷 26-38页

作者：魏日凤赖建东彭成彬张承康连玲丽刘伟福建农林大学园艺学院福建福州350002 宁德师范学院生命科学学院福建宁德352100 福建农林大学生命科学学院福建福州350002 湖北科技学院湖北咸宁437100

应用cDNA-AFLP技术筛选炭疽菌(Colletotrichum sp.1)危害诱导茶树毛蟹品种(Camellia sinensis cv. Maoxie)的差异表达基因,为探究茶树抗炭疽菌的分子机制奠定基础。利用256对选择性扩增引物组合分析病菌接种后0 h和48 h的叶片cDNA,经筛... 详细信息

应用cDNA-AFLP技术筛选炭疽菌(Colletotrichum sp.1)危害诱导茶树毛蟹品种(Camellia sinensis cv. Maoxie)的差异表达基因,为探究茶树抗炭疽菌的分子机制奠定基础。利用256对选择性扩增引物组合分析病菌接种后0 h和48 h的叶片cDNA,经筛选、测序和BLAST比对获得136条差异表达片段(TDFs)。同源基因功能分析结果表明,128条TDFs与Nr数据库已有基因同源,其功能以胁迫响应、生物调控与信号转导为主;其中51条TDFs与TPIA数据库中冷害、干旱、盐碱条件下的差异表达基因高度同源。进一步对27条TDFs进行qRT-PCR验证,结果显示,有24条TDFs的表达情况与cDNA-AFLP的结果一致,WRKY转录因子、乙烯响应转录因子、过氧化物酶和超氧化物歧化酶等抗逆相关基因的表达显著上调。本试验通过筛选获得差异表达的抗逆相关基因,为后续的基因功能研究奠定基础。

关键词：茶树炭疽菌 cDNA-AFLP 差异表达基因

基于人工智能的药物研发:目前的进展和未来的挑战

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中国药科大学学报 2023年第3期54卷 282-293页

作者：余泽浩张雷明张梦娜戴智琦彭成斌郑四鸣宁波大学医学部宁波315211 宁波大学附属第一医院宁波315000 宁波大学信息科学与工程学院宁波315211

近年来,人工智能在药物研发领域得到了广泛的应用。特别是自然语言处理技术在预训练模型的出现后有了非常显著的提高,在此基础上,图神经网络的引入也使得药物研发变得更加准确和高效。为了使药物研发者更加系统全面地了解人工智能在药... 详细信息

近年来,人工智能在药物研发领域得到了广泛的应用。特别是自然语言处理技术在预训练模型的出现后有了非常显著的提高,在此基础上,图神经网络的引入也使得药物研发变得更加准确和高效。为了使药物研发者更加系统全面地了解人工智能在药物研发中的应用,本文介绍了人工智能中的前沿算法,同时阐述了人工智能在药物小分子设计、虚拟筛选、药物再利用以及药物性质预测等多方面的应用场景,最后探讨它在未来药物研发中的机遇与挑战。

关键词：人工智能专家系统机器学习自然语言处理图神经网络药物设计药物研发

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茶树炭疽菌N425全基因组测序与基因功能注释

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福建农业学报 2023年第12期38卷 1437-1444页

作者：张承康周子文郭田龙彭成彬陈美霞刘伟宁德师范学院生命科学学院省级产学研合作示范基地福建宁德352100 福建农林大学生物农药与化学生物学教育部重点实验室福建福州350002

【目的】对茶树炭疽菌N425进行全基因组测序和基因功能注释并从中初筛出致病相关基因。【方法】通过Illumina HiSeq2500 PE150平台对N425菌株进行全基因组测序和组装,并利用NR、KEGG、KOG等功能基因数据库进行基因预测和功能注释。【结... 详细信息

【目的】对茶树炭疽菌N425进行全基因组测序和基因功能注释并从中初筛出致病相关基因。【方法】通过Illumina HiSeq2500 PE150平台对N425菌株进行全基因组测序和组装,并利用NR、KEGG、KOG等功能基因数据库进行基因预测和功能注释。【结果】茶树炭疽菌N425基因组全长约56.3 Mbp,G+C含量为53.2%,共预测出10 157个蛋白编码基因和若干各类非蛋白编码序列。其中,1 356个基因在病原与宿主互作数据库(PHI)中得到注释,包括140个注释为致病力丧失的基因;720个基因在碳水化合物酶数据库(CAZy)中得到注释;302个基因被预测为次生代谢物相关基因。这些基因中有涉及cAMP-PKA、MAPK等信号通路以及降解宿主细胞壁等致病相关过程,是潜在的致病相关基因。【结论】本研究成功获得茶树炭疽菌N425全基因组序列和基因功能注释,并从中挖掘出潜在致病相关基因,为后续展开对茶树炭疽菌侵染茶树的致病分子机制研究奠定基础。

关键词：茶树炭疽病基因组测序基因注释致病相关基因

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柳叶蜡梅真菌病害分离鉴定及生物学特性

福建农业学报 2021年第4期36卷 457-463页

作者：彭成彬王泽榕阮俊峰魏日凤薛岚陈美霞刘伟宁德师范学院生命科学学院福建宁德352100 福建农林大学园艺学院福建福州350002 福建省产学研合作示范基地福建宁德352100 宁德师范学院化学与材料学院福建宁德352100

【目的】为明确柳叶蜡梅(Chimonanthus Salicifolius)的叶部病害的病原种类,进行病叶病原分离鉴定并研究病原菌株生物学特性。【方法】对福建省寿宁县福瑞泰生物技术有限责任公司种植基地的柳叶腊梅叶斑病病叶采用离体组织分离法进行分... 详细信息

【目的】为明确柳叶蜡梅(Chimonanthus Salicifolius)的叶部病害的病原种类,进行病叶病原分离鉴定并研究病原菌株生物学特性。【方法】对福建省寿宁县福瑞泰生物技术有限责任公司种植基地的柳叶腊梅叶斑病病叶采用离体组织分离法进行分离,对分离的病原菌采用形态学结合分子方法(rDNA-ITS和TUB序列)进行鉴定,并对该致病菌菌丝体在不同温度、pH值、光照、碳源、氮源及致死温度等条件下的生物学特性进行研究。【结果】病原菌分离株经形态特征观测及rDNA-ITS和TUB序列在NCBI数据库的分析比对,将寿宁县柳叶腊梅叶斑病病原菌鉴定为子囊菌门,格孢腔目,附球真菌属,高粱附球菌(Epicoccum Sorghinum)。生物学特性结果表明:在5~30℃均可生长,最适生长温度25℃;菌丝体生长最适pH值范围为5~9,在供试的11种碳源上均可生长,最佳碳源为蔗糖;在8种氮源培养基中最适菌丝生长的氮源为蛋白胨;光暗交替不影响菌丝生长,菌丝体致死温度为52℃。【结论】分离鉴定了福建省寿宁县柳叶腊梅叶斑病病害的病原菌为高粱附球菌(***),生物学测定结果显示其对环境适应性强。

关键词：柳叶蜡梅病原菌分离鉴定多基因序列分析生物学特性