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Using an exon microarray to identify a global profile of gene expression and alternative splicing in K562 cellsexposed to sodium valproate

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Using an exon microarray to identify a global profile of gen...

Analyzing gene expression profile in K562 cells exposed to sodium valproate using microarray combined with the connectivity map database

广东省遗传学会第九届代表大会暨学术研讨会

作者： Zhang XZ Yin AH Zhu XY Ding Q Wang CH chen yx Prenatal Diagnosis Centre Guangdong Women and Children Hospital

To investigate the effect of valproate treatment on the K562 cell line,a model for chronic myelogenous leukaemia,the growth and survival of the K562 cell line were investigated using the Annexin-V/PI dual staining method,and global profiles of gene expression and alternative splicing in K562 cellswere assessed using exon microarrays.A significant increase in cell apoptosis was observed in valproate-exposed K562 cells using flow cytometry.A total of 628 transcripts were identified as being significantly differentially *** number of genes demonstrating increased expression levels was greater than the number of genes demonstrating decreased expression levels(445genes vs.183 genes,respectively).The significant enrichment analysis of GO terms for the differentially expressed genes revealed that these genes are involved in many important biological processes such as *** of the genes observed to be differentially expressed that might be involved in apoptosis were selected to undergo qRT-PCR *** total,198 candidates of alternative splicing variants were *** them,three alternative splicing events were selected for validation,and CBLC and TBX1 were confirmed to be alternatively spliced by semi-nested *** conclusion,valproate exposure facilitated cell apoptosis,altered mRNA expression and alternative splicing events in the K562 cell line.

关键词：

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Analyzing gene expression profile in K562 cells exposed to s...

Hydrogen sulfide suppresses endoplasmic reticulum stress-induced endothelial-tomesenchymal transition through Src pathway

广东省遗传学会第九届代表大会暨学术研讨会

作者： Zhang XZ Yin AH Lin DJ Zhu XY Ding Q Wang CH chen yx Prenatal Diagnosis Centre Guangdong Women and Children Hospital

To explore the mechanism underlying antileukaemia effect of sodium valproate,the growth and survival of the K562 cell line were *** profiles of gene expression in K562 cells exposed to sodium valproate were assessed and *** differentially expressed genes identified were further used to query the connectivity map database to retrieve a ranked list of compounds that act on the same intracellular targets as sodiumvalproate.A significant increase in cell apoptosis and a change in gene expression profile were observed in valproate-exposed K562 *** significant enrichment analysis of gene ontology terms for the differentially expressed genes showed that these genes were involved in many important biological *** differentially expressed genes involved in apoptosis were verified by quantitative real-time *** connectivity map analysis showed gene expression profile in K562 cells exposed to sodium valproate was most similar to that of HDACi and PI3 K inhibitors,suggesting that sodium valproate might exert antileukaemic action by inhibiting HDAC as well as inhibiting PI3 K *** conclusion,our data might provide clues to elucidate the molecular and therapeutic potential of VPA in leukaemia treatment,and the connectivity map is a useful tool for exploring the molecular mechanism of drug action.

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Hydrogen sulfide suppresses endoplasmic reticulum stress-ind...

Nuclear transcription factors and lipid homeostasis in liver

中国生理学会基质生物学专业委员会成立大会暨第一次全国基...

作者： Ying R Wang XQ Yang Y Gu ZJ Mai JT Qiu Q chen yx Wang JF Department of Cardiology Sun Yat-sen Memorial Hospital of Sun Yat-sen University Guangdong Province Key Laboratory of Arrhythmia and Electrophysiology Department of Anesthesia The Second Affiliated Hospital of Guangzhou Medical University

＜正＞AIMS:Hydrogen sulfide（H2S）ameliorates cardiac fibrosis in several models by suppressing endoplasmic reticulum（ER）***-to-mesenchymal transition（EndMT）is implicated in the development of cardiac ***,we inves...

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Chinese Medical Journal 2007年第24期120卷 2290-2296页

作者： chen Ya-xi HUANG Ai-long RUAN Xiong-zhong Centre for Lipid Research,Key Laboratory of Molecular Biology on Infectious Diseases,Ministry of Education Second Affiliated Hospital,Chongqing Medical University,Chongqing 400010,China(chen yx,Huang AL and Ruan XZ) Centre for Lipid Research Key Laboratory of Molecular Biology on Infectious DiseasesMinistry of Education

The liver plays a major role in the regulation , glucose, lipid and energy metabolism. Increasd hepatic fat deposit is a very common feature in obese, insulin-resistant patients, in metabolic syndrome, alcoholic steatohepatitis （ASH） and nonalchoholic fatty liver disaseas （NAFLD）. As a central organ for whole body lipid metabolism, disruption of the normal mechanisms for synthesis, transport and removal/ metabolism of long-chain fatty acids and triglycerides are the basis for the development of fatty liver. The exact mechanisms that link hepatic lipid accumulation, impaired glucose metabolism, and insulin resistance are unknown, but increasing evidence suggest that nuclear transcription factors play important roles. Members of the nuclear receptor superfamily, especially the peroxisome proliferator-activated receptors （PPARs） and the liver X receptor （LXR）, other factors such as sterol regulatory element binding proteins （SREBPs）, carbohydrate- response element-binding protein （ChREBP）, and nuclear transcription fator-κB （NF-κB） have emerged as dominant regulators of these processes, but the relative role of each of these factors in fatty liver disease is still undefined.

关键词： nuclear transcription factors lipid homeostasis fatty liver

中华医学会第二十次全国消化系病学术会议纪要

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中华消化杂志 2020年第11期40卷 782-783页

作者：陈萦晅时永全刘玉兰上海交通大学医学院附属仁济医院消化内科 200001 空军军医大学西京医院消化内科西安710032 北京大学人民医院消化内科 100044

中华医学会第二十次全国消化系病学术会议在珠海召开。本次大会共设置1个主会场,12个分会场;设立院士论坛、主委论坛和专家论坛,共有9个大会主旨报告、20个专家报告、235个专题报告、12场病例讨论、32个青年英文演讲。今年恰逢中华医学... 详细信息

中华医学会第二十次全国消化系病学术会议在珠海召开。本次大会共设置1个主会场,12个分会场;设立院士论坛、主委论坛和专家论坛,共有9个大会主旨报告、20个专家报告、235个专题报告、12场病例讨论、32个青年英文演讲。今年恰逢中华医学会消化病学分会成立40周年,回首消化病学分会艰辛而光辉的历程,展望我国消化事业发展的未来,愿消化同仁们不忘初心整行装,奋楫扬帆再起航!

关键词：消化系病学术会议消化病学分会专题报告

大学生静态平衡能力与运动及性别的关系:定量对比分析

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中国组织工程研究与临床康复 2007年第49期11卷 9941-9945页

作者：陈佑学尤桂杰杨少峰首都体育学院理论学科部保健康复教研室北京市100088

目的:采用定量分析方法比较体育与非体育专业大学生静态平衡能力,分析运动及性别对大学生静态平衡功能的影响。方法:于2007-01/03选取首都体育学院在校大学生共78名为受试对象,其中体育(武术)专业学生40名,非体育(康复)专业学生38名。... 详细信息

目的:采用定量分析方法比较体育与非体育专业大学生静态平衡能力,分析运动及性别对大学生静态平衡功能的影响。方法:于2007-01/03选取首都体育学院在校大学生共78名为受试对象,其中体育(武术)专业学生40名,非体育(康复)专业学生38名。所有选取对象了解试验目的,并同意参与本实验。采用意大利PosturalEqua平静分析系统,对实验对象分别在睁眼60s、闭眼60s两种状态下测试其静态平衡的各项指标,包括压力中心,线形图总长度,最大摆幅,线形图面积,LFS指数,压力分布,稳定性图及隆伯格值。结果:78名为受试对象均进入结果分析。①两专业学生压力中心X轴短于Y轴、压力分布前(%)高于后(%)(P<0.01)。②在闭眼状态下,体育专业男大学生在指标LFS指数和额状面上大于非体育专业(P<0.05)。③非体育业大学生在睁眼状态下,Y值女性小于男性,额状面值女性大于男性。男、女生睁闭眼差值进行比较时,女性在线形图总长度、额状面和LFT指数均大于男性(P<0.01),而线形图面积小于男性(P<0.05)。④体育专业大学生在睁眼状态下,指标参数Y值女性小于男性,额状面值女性大于男性;闭眼状态下,指标参数Y值女性小于男性,额状面值和LFS值女性大于男性。男、女生睁闭眼差值比较,女性在线形图总长度、额状面和LFT指数均大于男性(P<0.05,P<0.01),而线形图面积小于男性(P<0.05)。结论:①运动训练对大学生静态平衡影响不大,但对男性大学生的某些平衡指标却有显著影响。②性别对大学生的静态平衡均产生影响,表现为男性平衡的微控制能力优于女性。

关键词：静态平衡大学生体育运动性别定量分析

外周血单个核细胞来源树突状细胞分泌细胞因子在过敏性紫癜急性期的变化

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中国组织工程研究与临床康复 2007年第37期11卷 7417-7420页

作者：王娟张秋业陈永兴董增义青岛大学医学院附属医院儿科山东省青岛市266003

目的:观察外周血单个核细胞来源的树突状细胞分泌白细胞介素水平在过敏性紫癜急性期的变化,分析其与Th亚群平衡的相关性。方法:实验于2006-10/2007-12在青岛大学医学院附属医院儿科研究所完成。①实验对象:取急性期过敏性紫癜患儿外周... 详细信息

目的:观察外周血单个核细胞来源的树突状细胞分泌白细胞介素水平在过敏性紫癜急性期的变化,分析其与Th亚群平衡的相关性。方法:实验于2006-10/2007-12在青岛大学医学院附属医院儿科研究所完成。①实验对象:取急性期过敏性紫癜患儿外周静脉血28份作为过敏性紫癜组,平均年龄7.53岁;以门诊体检的健康同龄儿童外周静脉血18份作为对照组。儿童家属均知情同意。②实验方法:采血2.0～3.0mL/份,肝素抗凝,离心移取血浆1mL冻存备测。采用密度梯度离心法获取外周血单个核细胞,调整细胞悬液浓度为2×109L-1,接种于24孔板向树突状细胞进行诱导培养。每孔加入含终浓度1000u/mL重组人粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子、500u/mL重组人白细胞介素4的RPMI-1640完全培养液1mL,隔日添加1/2首次浓度的上述两种细胞因子,半量换液。培养至第6天,每孔加入重组人肿瘤坏死因子α至终浓度200u/mL。③实验评估:倒置显微镜观察树突状细胞的生长情况,以流式细胞仪检测成熟树突状细胞特异性表面分子CD83的表达率。采用ELISA法检测血浆干扰素γ、白细胞介素4的水平及培养上清中的白细胞介素10,12,18水平。结果:①树突状细胞体外诱导培养过程的形态学观察:外周血单个核细胞贴壁3h后获得黏附细胞,加入细胞因子24h后可见悬浮细胞增多,并呈细胞聚集现象,培养至第8天可见到大量具有毛刺状或根须状突起的悬浮细胞,即为树突状细胞。②树突状细胞的表型鉴定:过敏性紫癜组及对照组树突状细胞表面分子CD83均呈高表达,表达率分别为(69.29±16.20)%,(69.26±18.77)%。③Th亚群变化:与对照组比较,过敏性紫癜组白细胞介素4水平明显升高(t’=5.09,P<0.01),干扰素γ、干扰素γ/白细胞介素4水平均明显降低(t=4.26,P<0.01;t’=7.98,P<0.01)。④树突状细胞分泌细胞因子的水平:与对照组比较,过敏性紫癜组树突状细胞白细胞介素12水平明显降低(t=2.53,P<0.05),白细胞介素10,18水平均明显升高(t=2.07,P<0.05;t=2.10,P<0.05)。⑤树突状细胞分泌细胞因子水平与Th亚群平衡相关性分析:两组树突状细胞分泌白细胞介素12水平均与干扰素γ水平呈显著正相关(r=0.56～0.62,P均<0.01),与干扰素γ/白细胞介素4值呈正相关(r=0.51～0.52,P<0.01或0.05)。两组白细胞介素10,18水平均与白细胞介素4水平呈显著正相关(r=0.85～0.68,P均<0.01),与干扰素γ/白细胞介素4值呈负相关(r=-0.75～-0.49,P<0.01或0.05)。结论:过敏性紫癜患儿分泌白细胞介素12水平不足,而分泌白细胞介素10,18水平升高,提示过敏性紫癜患儿存在树突状细胞功能紊乱,且与Th1/Th2失衡关系密切。

关键词：过敏性紫癜树突状细胞白细胞介素干扰素γ 儿童

碱性成纤维细胞生长因子和转化生长因子β1诱导大鼠骨髓间质干细胞分化为心肌细胞的作用比较

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中国组织工程研究与临床康复 2007年第20期11卷 3968-3971页

作者：罗伟琼刘建华张祥忠陈嘉榆陈运贤深圳宝安区血站广东省深圳市518101 中山大学干细胞与组织工程中心广东省广州市510080 中山大学附属第一医院血液内科广东省广州市510080 广东省广州市十二人民医院内科广东省广州市510620

目的:对比观察碱性成纤维细胞生长因子和转化生长因子β1促进大鼠骨髓间质干细胞分化为心肌细胞的作用。方法:实验于2005-12/2006-07在中山大学干细胞与组织工程中心实验室进行。实验材料:清洁级大鼠由中山大学实验动物中心提供(SCXR(粤... 详细信息

目的:对比观察碱性成纤维细胞生长因子和转化生长因子β1促进大鼠骨髓间质干细胞分化为心肌细胞的作用。方法:实验于2005-12/2006-07在中山大学干细胞与组织工程中心实验室进行。实验材料:清洁级大鼠由中山大学实验动物中心提供(SCXR(粤)2004-0011,粤监证字2004A089),三四周,大约50g。实验方法:①分离培养大鼠骨髓间质干细胞,并采用流式细胞仪鉴定。②取第3代骨髓间质干细胞,以1×107L-1接种于24孔培养板和六孔板中,24h后换液并分组:对照组:仅仅更换培养液;5-氮胞苷诱导组:10μmol/L5-氮胞苷孵育24h后更换新鲜培养液;5-氮胞苷+碱性成纤维生长因子诱导组:10μmol/L5-氮胞苷孵育24h后更换含10μg/L碱性成纤维生长因子的新鲜培养液;5-氮胞苷+转化生长因子β1诱导组:10μmol/L5-氮胞苷孵育24h后更换含10μg/L转化生长因子β1的新鲜培养液。以后每3d换液1次,前2组换完全培养基,后2组分别换含10μg/L碱性成纤维生长因子和10μg/L转化生长因子β1的完全培养基。③30d后应用RT-PCR法检测心肌细胞转录因子GATA-4、结蛋白表达,免疫细胞化学染色法检测细胞心肌肌钙蛋白,并在倒置显微镜下观察细胞跳动情况。结果:①骨髓间质干细胞的生长特性及鉴定:原代培养大鼠骨髓质干细胞3d后镜下可见有细胞贴壁,形成克隆,七八天长满,随着换液和传代,细胞逐渐纯化,第3代细胞形成均一的长梭形,流式细胞仪检测发现CD44、CD29表达阳性,CD45、CD11b表达阴性。②骨髓间质干细胞向心肌细胞的分化:大鼠骨髓间质干细胞经5-氮胞苷、5-氮胞苷+碱性成纤维生长因子或5-氮胞苷+转化生长因子β1诱导30d后,有部分细胞心肌肌钙蛋白表达阳性,GATA-4和结蛋白表达明显增强。镜下观察5-氮胞苷+碱性成纤维生长因子诱导组所诱导细胞变细、胞体伸长,呈心肌样细胞跳动,并较其他两组明显,心肌肌钙蛋白阳性细胞的比率较高(P<0.05)。结论:碱性成纤维生长因子在体外有协同5-氮胞苷促进大鼠骨髓间质干细胞分化为心肌细胞的作用,而转化生长因子β1无此作用。

关键词：骨髓间质干细胞碱性成纤维细胞生长因子转化生长因子β1 细胞分化大鼠

Age distribution of the fauna 5.3 Ma B. P. and climatic deterioration events in North China

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Chinese Science Bulletin 1997年第21期42卷 1826-1829页

作者： Zhang, yx chen, DL Xue, XX NW Univ Xian Dept Geol Inst Cenozoic Geol & Environm Xian 710069 Peoples R China

THE climatic deterioration is an important event in the geological history and generally recog-nized by composition of strata and variation in some elements. However, the study on the cli-matic deterioration events in terms of age distribution of animals has been rarely *** note reports the study on a climatic deterioration event and its affected area during theMiocene Epoch based on thousands of fossils of Hipparion fauna from Longjiagou in Wudu,

关键词： Hipparion fauna taphonomy climatic event.