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A centromere map based on super pan-genome highlights the structure and function of rice centromeres

Journal of Integrative Plant Biology 2024年第2期66卷 196-207页

作者： Yang Lv Congcong liu Xiaoxia Li Yueying Wang Huiying He Wenchuang He Wu chen Longbo Yang Xiaofan Dai Xinglan Cao Xiaoman Yu Jiajia liu Bin Zhang Hua Wei Hong Zhang Hongge Qian Chuanlin Shi Yue Leng Xiangpei liu Mingliang Guo Xianmeng Wang Zhipeng Zhang Tianyi Wang Bintao Zhang qiang Xu Yan Cui Qianqian Zhang Qiaoling Yuan Noushin Jahan Jie Ma Xiaoming Zheng Yongfeng Zhou Qian Qian Longbiao Guo Lianguang Shang State Key Laboratory of Rice Biology China National Rice Research InstituteHangzhou 310006China Shenzhen Branch Guangdong Laboratory of Lingnan Modern AgricultureGenome Analysis Laboratory of the Ministry of Agriculture and Rural AffairsAgricultural Genomics Institute at ShenzhenChinese Academy of Agricultural SciencesShenzhen 518120China Yazhouwan National Laboratory No.8 Huanjin RoadYazhou DistrictSanya City 572024China National Key Facility for Crop Gene Resources and Genetic Improvement Institute of Crop ScienceChinese Academy of Agricultural SciencesBeijing 100081China

Rice(Oryza sativa)is a significant crop worldwide with a genome shaped by various evolutionary *** centromeres are crucial for chromosome segregation,and contain some unreported *** to the diverse and complex centromere region,a comprehensive understanding of rice centromere structure and function at the population level is *** constructed a high-quality centromere map based on the rice super pangenome consisting of a 251-accession panel comprising both cultivated and wild species of Asian and African *** showed that rice centromeres have diverse satellite repeat CentO,which vary across chromosomes and subpopulations,reflecting their distinct evolutionary *** also revealed that long terminal repeats(LTRs),especially young Gypsy-type LTRs,are abundant in the peripheral CentO-enriched regions and drive rice centromere expansion and ***,high-quality genome assembly and complete telomere-to-telomere(T2T)reference genome enable us to obtain more centromeric genome information despite mapping and cloning of centromere genes being *** investigated the association between structural variations and gene expression in the rice centromere.A centromere gene,OsMAB,which positively regulates rice tiller number,was further confirmed by expression quantitative trait loci,haplotype analysis and clustered regularly interspaced palindromic repeats(CRISPR)/CRISPR-associated protein9 *** revealing the new insights into the evolutionary patterns and biological roles of rice centromeres,our finding will facilitate future research on centromere biology and crop improvement.

关键词： centromere super pan-genome CentoO satellite repeat rice

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模拟核芯FCM燃料的振荡烧结行为研究

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无机材料学报 2024年第5期39卷 501-508页

作者：何宗倍陈放刘佃光李统业曾强中国核动力研究设计院核燃料元件及材料研究所成都610213 西南交通大学材料科学与工程学院成都610031

全陶瓷微封装弥散(FCM)燃料以其较好的固有安全性而成为核能领域研究的重点。针对SiC基体难以烧结的问题,本研究利用振荡烧结具有加速传质和降低烧结温度的优势,开展了模拟核芯FCM燃料振荡烧结行为研究,重点考察了振荡烧结温度、振荡时... 详细信息

全陶瓷微封装弥散(FCM)燃料以其较好的固有安全性而成为核能领域研究的重点。针对SiC基体难以烧结的问题,本研究利用振荡烧结具有加速传质和降低烧结温度的优势,开展了模拟核芯FCM燃料振荡烧结行为研究,重点考察了振荡烧结温度、振荡时间与振荡压力等参数对基体致密化行为的影响,并与热压烧结结果进行了对比。结果表明,振荡烧结温度、保温时间以及中值压力对基体致密化有重要影响,而振荡压力的振幅对基体致密化影响不大。相比于热压烧结,振荡烧结可以提高材料的致密度,振荡烧结试样的致密度更高,1850℃振荡烧结试样的致密度为99.99%;振荡烧结试样的晶粒尺寸更小,1850℃振荡烧结试样的晶粒尺寸为(284±4)nm,比同等温度下热压烧结试样的晶粒尺寸减小~27%;振荡烧结试样的硬度更高,1850℃振荡烧结试样的硬度为(26.7±0.4)GPa。借助改进的热压烧结本构方程,计算得到试样在致密度为90%时的应力指数n=1,活化能Q=430 kJ/mol,致密化的主导机制为晶界扩散协调的晶界滑移。

关键词： FCM燃料 SiC基体振荡烧结致密化机理

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基于数字孪生的车间生产数据感知方法设计及实现

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现代制造工程 2024年第7期 49-60页

作者：陈旺马强刘治红西南科技大学信息工程学院绵阳621000 中国兵器装备集团自动化研究所有限公司绵阳621000

针对传统车间在进行数字孪生时,对于生产数据的采集存在着目标单一、信息模型灵活性差以及通用性低等问题,提出了一种面向数字孪生的车间生产数据感知方法。首先,通过分析数字孪生车间生产数据采集与应用需求,提出了一种多层次的生产数... 详细信息

针对传统车间在进行数字孪生时,对于生产数据的采集存在着目标单一、信息模型灵活性差以及通用性低等问题,提出了一种面向数字孪生的车间生产数据感知方法。首先,通过分析数字孪生车间生产数据采集与应用需求,提出了一种多层次的生产数据采集体系架构;其次,围绕该体系架构的处理层,针对基于OPC统一架构(OPC Unified Architecture,OPC UA)的生产资源数字化表征模型构建关键技术进行了重点阐述;最后,基于车间应用实例,结合关键技术以及体系架构开发了数字孪生系统,验证了该方法的可行性,有效支撑了装配车间数字孪生系统的运行。

关键词：数字孪生车间数字化表征模型生产数据采集 OPC统一架构

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Large circuit models: opportunities and challenges

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Science China(Information Sciences) 2024年第10期67卷 25-66页

作者： Lei chen Yiqi chen Zhufei CHU Wenji FANG Tsung-Yi HO Ru HUANG Yu HUANG Sadaf KHAN Min LI Xingquan LI Yu LI Yun LIANG Jinwei liu Yi liu Yibo LIN Guojie LUO Hongyang PAN Zhengyuan SHI Guangyu SUN Dimitrios TSARAS Runsheng WANG Ziyi WANG Xinming WEI Zhiyao XIE qiang XU chenhao XUE Junchi YAN Jun YANG Bei YU Mingxuan YUAN Evangeline F.Y.YOUNG Xuan ZENG Haoyi ZHANG Zuodong ZHANG Yuxiang ZHAO Hui-Ling ZHEN Ziyang ZHENG Binwu ZHU Keren ZHU Sunan ZOU Huawei Noah’s Ark Lab School of Integrated Circuits Peking University Faculty of Electrical Engineering and Computer Science Ningbo University Department of Electronic and Computer Engineering Hong Kong University of Science and Technology Department of Computer Science and Engineering The Chinese University of Hong Kong School of Integrated Circuits Southeast University Huawei HiSilicon Peng cheng Laboratory School of Computer Science Peking University School of Microelectronics State Key Laboratory of Integrated Chips and System Fudan University School of Artificial Intelligence Shanghai Jiao Tong University

Within the electronic design automation(EDA) domain, artificial intelligence(AI)-driven solutions have emerged as formidable tools, yet they typically augment rather than redefine existing methodologies. These solutions often repurpose deep learning models from other domains, such as vision, text, and graph analytics, applying them to circuit design without tailoring to the unique complexities of electronic circuits. Such an “AI4EDA” approach falls short of achieving a holistic design synthesis and understanding,overlooking the intricate interplay of electrical, logical, and physical facets of circuit data. This study argues for a paradigm shift from AI4EDA towards AI-rooted EDA from the ground up, integrating AI at the core of the design process. Pivotal to this vision is the development of a multimodal circuit representation learning technique, poised to provide a comprehensive understanding by harmonizing and extracting insights from varied data sources, such as functional specifications, register-transfer level(RTL) designs, circuit netlists,and physical layouts. We champion the creation of large circuit models(LCMs) that are inherently multimodal, crafted to decode and express the rich semantics and structures of circuit data, thus fostering more resilient, efficient, and inventive design methodologies. Embracing this AI-rooted philosophy, we foresee a trajectory that transcends the current innovation plateau in EDA, igniting a profound “shift-left” in electronic design methodology. The envisioned advancements herald not just an evolution of existing EDA tools but a revolution, giving rise to novel instruments of design-tools that promise to radically enhance design productivity and inaugurate a new epoch where the optimization of circuit performance, power, and area(PPA) is achieved not incrementally, but through leaps that redefine the benchmarks of electronic systems' capabilities.

关键词： AI-rooted EDA large circuit models (LCMs) multimodal circuit representation learning circuit optimization

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地震液化离心机振动台模型试验与LEAP研究进展

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岩土工程学报 2024年第1期46卷 54-62页

作者：周燕国马强刘凯曹渊陈云敏浙江大学岩土工程研究所浙江大学软弱土与环境土工教育部重点实验室浙江大学超重力研究中心浙江杭州310058 中建丝路建设投资有限公司陕西西安710000

离心机振动台模型试验是研究地震液化问题的重要手段,一方面可重现场地地震响应和揭示液化致灾规律,为发展工程设计方法提供依据;另一方面可以作为特定边值问题的标准模型试验数据,验证数值方法与土体本构模型及其参数选取的合理性。介... 详细信息

离心机振动台模型试验是研究地震液化问题的重要手段,一方面可重现场地地震响应和揭示液化致灾规律,为发展工程设计方法提供依据;另一方面可以作为特定边值问题的标准模型试验数据,验证数值方法与土体本构模型及其参数选取的合理性。介绍了离心机振动台模型试验的试验原理,回顾了离心机振动台模型试验在地震液化领域的主要研究进展。围绕由中国、美国、日本和英国等国家高校与研究所联合开展的国际合作项目“液化试验与分析”(LEAP),重点介绍了若干为提高离心机振动台模型试验可重复性而发展的物理模拟新技术,包括离心机振动台的台面振动控制技术、模型土体弹性波速测试技术和基于图像分析的动态位移监测技术等。最后针对地震液化领域的若干工程和研究需求,探讨了离心机振动台模型试验领域的发展趋势。

关键词：地震液化离心机模型试验物理模拟振动台 VELACS LEAP 相似律

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双波长大口径液晶光弹性测量仪研制

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中国激光 2024年第13期51卷 133-142页

作者：陈昱志邢童璐林强刘诚朱健强中国科学院上海光学精密机械研究所高功率激光物理联合实验室上海201800 中国科学院大学北京100049

提出了一种基于双波长椭圆偏振光测量光弹性应力的方法,采集两种相近波长照明下、特殊液晶旋光角度下透过待测样品的光强分布图像,对其进行一系列计算处理,得到待测样品的应力分布。利用双波长LED和液晶旋光板等先进光源和先进光调控器... 详细信息

提出了一种基于双波长椭圆偏振光测量光弹性应力的方法,采集两种相近波长照明下、特殊液晶旋光角度下透过待测样品的光强分布图像,对其进行一系列计算处理,得到待测样品的应力分布。利用双波长LED和液晶旋光板等先进光源和先进光调控器件,发明了一个可以测量样品中应力分布的光学仪器。进行了相关的实验测量,并与传统的六步相移方法做了实验对比验证了该方法的有效性,相对误差达到2.85%。且所研究的光弹性液晶测量仪结构简单、操作快速,不需要复杂的机械旋转等手动调控。仪器分辨率达到0.25 mm,符合光弹性测量标准。

关键词：光弹性测量应力液晶椭圆偏振光

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宽温度环境下基于迁移模型的锂电池组SOC估计

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中国公路学报 2024年第5期37卷 383-396页

作者：申江卫刘伟强高承志陈峥刘永刚昆明理工大学交通工程学院云南昆明650000 重庆大学机械与运载工程学院重庆400030

锂离子电池组内单体不一致性以及外界环境温度变化给其荷电状态(State of Charge, SOC)精确且高效估计带来挑战,而传统方法往往忽略电池不一致性影响或者计算复杂度高,难以对电池组进行高效且精确的SOC估计。为提升实际使用环境下锂电池... 详细信息

锂离子电池组内单体不一致性以及外界环境温度变化给其荷电状态(State of Charge, SOC)精确且高效估计带来挑战,而传统方法往往忽略电池不一致性影响或者计算复杂度高,难以对电池组进行高效且精确的SOC估计。为提升实际使用环境下锂电池组SOC估计精度和效率,开发了一种基于迁移模型的锂电池组SOC估计方法。首先,在传统二阶RC等效电路模型的基础上通过参数辨识、SOC与模型参数关系曲线拟合等工作完成迁移模型搭建,以此来应对温度变化对模型参数的影响并降低重复建模所需的工作量;之后,结合V_(min)+V_(max)模型(V_(min)+V_(max) Model, VVM)对电池组SOC进行了表征,充分考虑电池不一致性影响并且减少了电池组SOC估计的复杂程度。同时在电池组SOC估计的过程中融入权重因子,调整电池组输出SOC,防止电池组出现过充过放现象,保证电池组的使用安全;最后,设计开展了不同温度以及变温状态下的电池组试验测试,对电池组中单体级及模组级SOC估计精度进行了验证,并与传统的电池组SOC估计方法进行对比分析。验证结果表明:所提方法在几种不同温度下的单体及模组SOC估计结果均保持较好的计算精度;在变温状态下,电池组SOC估计方法仍然具有较高的精度。其中,单体电池SOC估计结果平均绝对误差最大为1.30%;在恒温状态下,电池组SOC估计结果的最大平均绝对误差为1.49%;而电池组SOC估计结果在变温状态下的最大平均绝对误差为1.21%。证明了所提方法具有计算精度高、计算复杂程度低以及安全可靠的优点。

关键词：汽车工程荷电状态估计迁移模型电池组温度

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局部强冷作用下厚板铝合金/镁合金搅拌摩擦焊界面金属间化合物的析出行为

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金属学报 2024年第6期60卷 777-788页

作者：徐洋柯黎明聂浩夏春刘强陈书锦南昌航空大学轻合金加工科学与技术国防重点学科实验室南昌330063 江苏科技大学材料科学与工程学院镇江212003

厚板铝合金/镁合金在搅拌摩擦焊(FSW)时接头界面沿板厚方向存在严重的温度分布差异问题,导致接头界面组织分布极不均匀,接头成形较为困难。减小接头界面沿板厚方向温差成为改善厚板铝合金/镁合金FSW接头成形的关键之一。本工作选取15 m... 详细信息

厚板铝合金/镁合金在搅拌摩擦焊(FSW)时接头界面沿板厚方向存在严重的温度分布差异问题,导致接头界面组织分布极不均匀,接头成形较为困难。减小接头界面沿板厚方向温差成为改善厚板铝合金/镁合金FSW接头成形的关键之一。本工作选取15 mm厚的5A06-H112铝合金和AZ31B-O镁合金板材进行异种材料FSW,采用液氮喷洒于焊缝上表面进行局部强冷,利用EBSD和TEM获得焊接接头物相分布和晶粒取向散布,研究了铝合金/镁合金接头搅拌区(SZ)两侧界面处金属间化合物(IMCs)的析出行为。结果表明,在空冷和液氮冷却2种条件下SZ的铝合金侧主要析出Al_(3)Mg_(2)相;镁合金侧主要析出Al_(12)Mg_(17)相,且在上部界面处与Mg发生了共晶反应;焊缝表面局部强冷,降低了接头各位置的峰值温度和高温停留时间,有效抑制了IMCs的析出和低熔点共晶的形成。不施加表面冷却时,铝合金侧界面上部和中部附近的SZ中主要析出Al_(3)Mg_(2)相,底部SZ中则为细小的等轴铝合金晶粒;镁合金侧界面上部的SZ中则主要析出了Al_(12)Mg_(17)相,并与Mg形成低熔点共晶,且在共晶区与SZ中的铝合金之间析出Al_(3)Mg_(2)薄层,中部和下部SZ与镁合金之间析出了界线分明、由Al_(3)Mg_(2)层和Al_(12)Mg_(17)层组成的IMCs叠层,且中部的IMCs叠层总厚度远大于峰值温度较低的底部处IMCs叠层厚度,其中Al_(3)Mg_(2)层厚度减薄更为明显。当在焊缝表面施加液氮冷却时,铝合金侧界面上部的SZ中除了析出Al_(3)Mg_(2)相外,还有少部分Al_(12)Mg_(17)和铝合金晶粒,而界面中部和底部SZ中均为等轴状的铝合金晶粒;在镁合金侧界面处,各部位IMCs析出行为与不施加表面冷却时相似,但界面上部析出的Mg+Al_(12)Mg_(17)共晶层和Al_(3)Mg_(2)层、中部和下部SZ界面IMCs叠层总厚度明显减小,Al_(3)Mg_(2)薄层厚度降低更为显著。应变速率对IMCs的析出有显著影响,表现为界面层实际厚度远大于由扩散定律计算的理论厚度。

关键词：搅拌摩擦焊厚板铝合金/镁合金接头金属间化合物局部强冷

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Milestone progress of the HEPS booster commissioning

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Nuclear Science and Techniques 2024年第1期35卷 170-177页

作者： Yue-Mei Peng Jian-She Cao Jin-Hui chen Hai-Yi Dong Ping He Yi Jiao Ling Kang Wen Kang Jian Li Jing-Yi Li Guo-Ping Lin Fang liu Feng-Li Long Cai Meng Xin Qi Hua-Min Qu Yan-Feng Sui Sheng Wang Gang Xu qiang Ye Jing Zhang Pei Zhang Wei-Min Pan Key Laboratory of Particle Acceleration Physics and Technology Institute of High Energy PhysicsChinese Academy of Sciences19B Yuquan RoadShijingshan DistrictBeijing 100049China University of the Chinese Academy of Sciences 19A Yuquan RoadShijingshan DistrictBeijing 100049China

The high-energy photon source(HEPS)is the first fourth-generation synchrotron light source facility in *** HEPS injector consists of a linear accelerator(Linac)and a full energy *** booster captures the electron beam from the Linac and increases its energy to the value required for the storage *** full-energy beam could be injected to the storage ring directly or after“high-energy accumulation.”On November 17,2023,the key booster parameters successfully reached their corresponding target *** milestone results were achieved based on numerous contributions,including nearly a decade of physical design,years of equipment development and installation,and months of beam *** measured at the extraction energy of 6 GeV,the averaged beam current and emittance reached 8.57 mA with 5 bunches and 30.37 nm rad with a single-bunch charge of 5.58 nC,compared with the corresponding target values of 6.6 mA and 35 nm rad,*** paper presents the physical design,equipment development,installation,and commissioning process of the HEPS booster.

关键词： High energy photon source Booster Beam commissioning

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金属间化合物Pt_(7)Sb投影Berry相位与析氢催化关联的第一性原理计算

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金属学报 2024年第6期60卷 837-847页

作者：周彦余李江旭刘晨赖俊文高强马会孙岩陈星秋中国科学院金属研究所沈阳材料科学国家研究中心沈阳110016 中国科学技术大学材料科学与工程学院沈阳110016

高效催化材料的设计是能源材料领域的重要任务之一。本工作根据寻找具有低Pt负载量的高效析氢反应(HER)催化剂的指导原则,结合投影Berry相位描述符,设计发现了性能优异的HER催化剂立方Pt_(7)Sb,其氢吸附Gibbs自由能(ΔG_(H^(*)))甚至小... 详细信息

高效催化材料的设计是能源材料领域的重要任务之一。本工作根据寻找具有低Pt负载量的高效析氢反应(HER)催化剂的指导原则,结合投影Berry相位描述符,设计发现了性能优异的HER催化剂立方Pt_(7)Sb,其氢吸附Gibbs自由能(ΔG_(H^(*)))甚至小于Pt元素。因此,在降低Pt负载量的情况下,其HER催化活性有望提高。从电子结构分析来看,2个描述符ΔG_(H^(*))和投影Berry相位之间有很好的一致性。由于投影Berry相位完全由体态(波函数相位)决定,这种一致性意味着良好的催化性能与本征电子结构的拓扑性质之间存在着密切的关系。该结果提供了一个很好的HER催化剂候选材料,降低了Pt的负载量,并为展示催化剂本征拓扑性质的作用提供了参考。

关键词：析氢反应催化剂投影Berry相位第一性原理计算

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