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Comparison of DUS testing and SNP fingerprinting for variety identification in cucumber

Horticultural Plant Journal 2022年第5期8卷 575-582页

作者： Jian Zhang Jingjing Yang Shenzao Fu Jun Ren xiaoFei Zhang changxuan xia Hong Zhao Kun Yang Changlong Wen Beijing Vegetable Research Center(BVRC) Beijing Academy of Agricultural and Forestry SciencesNational Engineering Research Center for VegetablesBeijing 100097China Beijing Key Laboratory of Vegetable Germplasms Improvement Beijing 100097China Institute of Vegetables and Flowers Chinese Academy of Agricultural SciencesBeijing 100081China State Key Laboratory of Vegetable Germplasm Innovation Tianjin 300192China

Variety identification plays an important role in protecting the intellectual property of varieties,ensuring seed quality,and encouraging breeding innovation.Currently,morphological evaluation in the field,such as distinctness,uniformity,and stability(DUS)testing,and DNA fingerprinting in the laboratory using molecular markers are two dominant methods used for variety identification.Few studies have compared the results of these approaches,and the relationship between the two methods is obscure.In this study,134 dominant cucumber varieties were evaluated using 50 DUS testing traits and genotyped by 40 single nucleotide polymorphisms(SNPs).The 40 SNPs were developed in our previous study and arewell suited for variety identification.In the DUS testing,significant positive or negative correlations among 50 DUS traits were observed,and 20 core traits,including 15 fruit traits,were further selected to increase field inspection efficiency.This suggested that fruit shape plays an important role in variety identification.The ratio of fruit length/diameter was themost important trait,explaining 9.2%of the phenotypic variation.In the DNA fingerprinting test,the 40 SNPs were highly polymorphic and could distinguish all of the 134 cucumber varieties,and 14 core SNPs were selected to improve the identification rate.Interestingly,the population structure analysis of 134 cucumber varieties by phenotypic data in the DUS test was in accordance with the genotypic data from the DNA fingerprinting,indicating that all varieties could be divided into the same four subgroups:European type,North China type,South China type,and hybrids of the North China and South China types.Moreover,linear correlativity of distinguishment for each pair of varieties was observed between the DUS test and the DNA fingerprinting.These results indicated that these two methods have good application in future research,especially for the scaled-up analysis of hundreds of varieties.

关键词： Cucumber DUS test SNP fingerprinting Variety identification

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水稻编码SAND结构域基因的序列与功能初步分析

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华北农学报 2016年第2期31卷 1-6页

作者：陈志雄戴双凤夏昌选谢海媚李亚娟华南农业大学农学院广东广州510642 华南农业大学公共基础课实验教学中心广东广州510642

为研究水稻SAND结构域蛋白的序列和功能,利用Blast在水稻基因组中搜索编码SAND结构域的基因,然后构建增强表达载体并通过遗传转化研究基因功能。结果表明,水稻基因LOC_Os01g57240（命名为OsULT1）编码的氨基酸序列含有SAND结构域和ULTB-... 详细信息

为研究水稻SAND结构域蛋白的序列和功能,利用Blast在水稻基因组中搜索编码SAND结构域的基因,然后构建增强表达载体并通过遗传转化研究基因功能。结果表明,水稻基因LOC_Os01g57240（命名为OsULT1）编码的氨基酸序列含有SAND结构域和ULTB-box共有序列,与其他植物ULT氨基酸序列相似性为49.3%~92.3%,具有较好的保守性;35S：：OsULT1转基因株系部分颖花发育异常,出现内稃发育滞缓或退化、浆片过度发育或数目变多、雄蕊数目3~7枚、雌蕊2枚的现象;颖花内产生多余的小花,表明OsULT1对水稻花分生组织正常分化具有重要的调控作用。

关键词：水稻花发育 SAND结构域基因序列

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一种实时数据库系统的基于时间戳的多版本并发控制协议

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计算机工程与应用 2001年第15期37卷 22-24,95页

作者：万常选刘云生夏家莉华中科技大学计算机科学与技术学院武汉430074

实时数据库系统的定时限制包括数据的定时限制和事务的定时限制，一个好的并发控制协议必须要较好地满足这些定时限制。文章详细讨论了与并发控制有关的实时数据和实时事务的各种特征以及分类。并根据这些特点对传统数据库系统的多版本... 详细信息

实时数据库系统的定时限制包括数据的定时限制和事务的定时限制，一个好的并发控制协议必须要较好地满足这些定时限制。文章详细讨论了与并发控制有关的实时数据和实时事务的各种特征以及分类。并根据这些特点对传统数据库系统的多版本并发控制机制进行了扩展，提出了一种基于时间戳的多版本实时数据库系统的并发控制协议。该协议对硬实时事务不产生任何延迟，能够很好地保证实时事务和实时数据的定时限制，缺点是该并发控制协议仅是一个准一致性的协议。

关键词：实时数据库系统多版本并发控制协议实时事务数据对象

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基于适配体识别-杂交链式反应可视化检测金黄色葡萄球菌

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食品与发酵工业 2022年第2期48卷 274-279页

作者：卢春霞王昌烜黄巧陈霞李红敏付家莉张云红王双慧长江师范学院现代农业与生物工程学院重庆408100 苏州赛飞福德检测科技有限公司江苏苏州215100 新疆农垦科学院分析测试中心新疆石河子832000

该研究以金黄色葡萄球菌核酸适配体为识别分子,结合杂交链式反应和酶催化双重信号放大策略,建立了一种金黄色葡萄球菌高灵敏可视化检测方法。结果显示,在适配体包被浓度60 nmol/L、检测探针浓度80 nmol/L、发夹DNA浓度80 nmol/L、10 g/... 详细信息

该研究以金黄色葡萄球菌核酸适配体为识别分子,结合杂交链式反应和酶催化双重信号放大策略,建立了一种金黄色葡萄球菌高灵敏可视化检测方法。结果显示,在适配体包被浓度60 nmol/L、检测探针浓度80 nmol/L、发夹DNA浓度80 nmol/L、10 g/L牛血清白蛋白封闭4 h、链霉亲和素-辣根过氧化物酶稀释体积比1∶40 000、靶标与适配体反应时间30 min、发夹DNA杂交时间60 min等优化条件下,金黄色葡萄球菌在10~10^(5)CFU/mL呈良好线性(R=0.992),可视化检测限为10 CFU/mL,与其余食源性致病菌无交叉反应。将建立的方法应用于食品中金黄色葡萄球菌检测,并与国标法对比验证,两种方法的检测结果无明显差异(P>0.05),加标回收率为91.8%~98.2%,相对标准偏差<6%。该研究所建方法前处理简单、灵敏度高、检测成本低、准确性好,适用于批量样品中金黄色葡萄球菌的快速筛查。

关键词：金黄色葡萄球菌核酸适配体杂交链式反应比色分析

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移动Ad Hoc网络混合检查点策略

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计算机研究与发展 2014年第6期51卷 1176-1184页

作者：廖国琼熊安晋狄国强万常选夏家莉江西财经大学信息管理学院南昌330013 江西省高校数据与知识工程重点实验室南昌330013 江西财经大学计算机实践教学中心南昌330013

考虑到移动Ad Hoc网络无固定中心节点、多跳路由和资源有限等特点,基于分簇移动Ad Hoc网络结构,提出了一种结合同步和异步检查点技术的混合检查点策略,即同簇终端检查点必须保持同步,而异簇终端检查点保持独立.首先讨论了混合检查点模... 详细信息

考虑到移动Ad Hoc网络无固定中心节点、多跳路由和资源有限等特点,基于分簇移动Ad Hoc网络结构,提出了一种结合同步和异步检查点技术的混合检查点策略,即同簇终端检查点必须保持同步,而异簇终端检查点保持独立.首先讨论了混合检查点模型及其正确性准则.然后,基于簇内及簇间检查点依赖图,讨论了不同类型检查点清除规则.最后,给出了相应的检查点及回滚恢复算法,并证明了回滚恢复的正确性.所提出的混合检查点策略既能避免同簇进程级联回滚所引起的资源浪费、又能避免异簇终端之间过多跨簇消息传递及减少无线通信延迟.实验结果表明,与单纯的同步及异步检查点策略相比,所提出的检查点策略是一种综合考虑移动Ad Hoc网络各种资源约束的较好折中方案,且具有恢复时间短、对簇头依赖小、灵活性好等优点.

关键词： Ad Hoc网络移动通信混合检查点同步检查点异步检查点

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抗肿瘤药外渗性皮肤损伤的防治进展

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癌症进展 2007年第4期5卷 346-351页

作者：朱其聪缪景霞尤长宣罗荣城南方医科大学南方医院肿瘤科广东广州510515

抗肿瘤药外渗是化疗过程中的常见并发症之一。药物渗漏到皮下组织,可引起局部红肿、疼痛,甚至造成皮肤组织坏死,给患者带来巨大的痛苦,应引起广泛重视。应以预防为主,一旦发生药物外渗,根据不同外渗药物,立即采取相应处理,减少炎症和组... 详细信息

抗肿瘤药外渗是化疗过程中的常见并发症之一。药物渗漏到皮下组织,可引起局部红肿、疼痛,甚至造成皮肤组织坏死,给患者带来巨大的痛苦,应引起广泛重视。应以预防为主,一旦发生药物外渗,根据不同外渗药物,立即采取相应处理,减少炎症和组织坏死。近年来,随着大量研究和临床实践不断深入,抗肿瘤药外渗的防治有了一定提高。

关键词：抗肿瘤药外渗防治

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应用CT观察直刺背俞穴的安全深度

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中国中医药现代远程教育 2017年第22期15卷 123-124页

作者：石刚柴进华阮昌选苏捷夏德尧杨贤海湖北省荆门市中医医院针灸科荆门448000 湖北省荆门市中医医院放射科荆门448000 湖北中医药大学中医临床学院武汉430065

目的观察直刺12胸椎以上背俞穴的安全针刺深度以指导临床。方法选择适合背俞穴针罐疗法的患者,进行辨敏探穴、在背俞穴敏感点采用直刺法针刺得气后,以卡尺测量得气后皮肤外的针体长度,以mm表示,然后以针体长度减去留在皮肤外的针体长度... 详细信息

目的观察直刺12胸椎以上背俞穴的安全针刺深度以指导临床。方法选择适合背俞穴针罐疗法的患者,进行辨敏探穴、在背俞穴敏感点采用直刺法针刺得气后,以卡尺测量得气后皮肤外的针体长度,以mm表示,然后以针体长度减去留在皮肤外的针体长度,即得出针刺深度,进行CT定位下验证针刺安全性。结果 12胸椎以上的肺、心、肝、脾俞穴以及膈俞、胃俞的针刺深度与标准的穴位危险深度相比,有极显著意义。结论背俞穴直刺法是安全的针刺技术。

关键词：背俞穴针罐疗法直刺法针刺安全性 CT

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温敏核不育系培矮64S及其eui突变体长选3S最上节间蛋白质组差异分析

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热带亚热带植物学报 2016年第5期24卷 524-534页

作者：肖辉海郝小花李荣杨友伟陈春霞湖南文理学院生命科学系湖南常德415000

为从蛋白质表达水平了解长穗颈温敏核不育水稻(Oryza sativa)最上节间伸长机理,采用双向凝胶电泳方法对温敏核不育系培矮64S及其eui突变体长选3S抽穗前2 d的最上节间蛋白质进行了分离,并获得了分辨率和重复性较好的双向凝胶电泳图谱。选... 详细信息

为从蛋白质表达水平了解长穗颈温敏核不育水稻(Oryza sativa)最上节间伸长机理,采用双向凝胶电泳方法对温敏核不育系培矮64S及其eui突变体长选3S抽穗前2 d的最上节间蛋白质进行了分离,并获得了分辨率和重复性较好的双向凝胶电泳图谱。选取50个差异蛋白质点进行MALDI-TOF-TOF-MS肽质谱指纹图谱分析,从中鉴定出31个已知蛋白质,相对于培矮64S,在长选3S中上调表达的11个蛋白质和下调表达的20个蛋白质。这些差异蛋白质按照其功能可分为7类。这些差异蛋白质可能与长选3S抽穗期最上节间剧烈伸长生长有关,水稻eui基因可能是通过调节抽穗期最上节间这些蛋白质的表达,从而控制最上节间细胞分裂,尤其是细胞的伸长生长。

关键词：温敏核不育水稻长穗颈突变体蛋白质组学半定量RT-PCR

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