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基于简化基因组测序(Super-GBS)的子午岭黑山羊保种群遗传结构评估

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畜牧兽医学报 2024年第10期55卷 4334-4345页

作者：苟想珍杨军祥赵子惠冯玲霞陈万辉李玉洁张忠钰马克岩蒋东平常嵘文亚洲王珂马友记甘肃省畜牧兽医研究所/农业农村部畜禽资源(羊)评价利用重点实验室平凉744000 华池县畜牧兽医站庆阳745000 甘肃农业大学动物科学技术学院兰州730070 白银市平川区畜牧兽医技术服务中心白银730900 张掖市甘州区动物卫生监督所张掖734000 甘肃省绵羊繁育技术推广站张掖734000

旨在分析子午岭黑山羊的群体遗传多样性和亲缘关系以及家系结构,为子午岭黑山羊的保护和利用提供依据。本研究通过简化基因组测序(super-genotyping by sequencing,Super-GBS)技术对99只(10公/89母)成年子午岭黑山羊进行全基因组SNP检... 详细信息

旨在分析子午岭黑山羊的群体遗传多样性和亲缘关系以及家系结构,为子午岭黑山羊的保护和利用提供依据。本研究通过简化基因组测序(super-genotyping by sequencing,Super-GBS)技术对99只(10公/89母)成年子午岭黑山羊进行全基因组SNP检测。利用Plink软件计算观测杂合度(ho)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)、核苷酸多样性(Pi)、有效等位基因数(Ne)及次要等位基因频率(MAF)等6项遗传多样性指标;GCTA软件进行主成分分析及基因组亲缘关系G矩阵构建;Plink软件构建IBS遗传距离矩阵,R语言绘制热图;PHYLP构建系统发育树;detect RUNS工具检测ROH。结果表明,99只子午岭黑山羊个体共检测到996042个SNPs。子午岭黑山羊群体的PIC、Pi、Ne及MAF值分别是0.161、0.193、1.295、0.130,且ho(0.167)低于He(0.192),说明子午岭黑山羊群体遗传多样性较低。G矩阵和IBS遗传距离结果均表明子午岭黑山羊群体间大部分个体间亲缘关系较远。主成分分析结果揭示子午岭黑山羊群体内部不存在明显分化,系统发育树结果说明子午岭黑山羊群体公羊可大致分为6个家系,所有家系公羊数量较少。子午岭黑山羊群体的近交系数FROH为0.0496,说明子午岭黑山羊群体内部近交程度相对较低。综上所述,子午岭黑山羊群体遗传多样性较低,大部分个体间亲缘关系较远,群体内近交程度较低,后期应注意后代的选育,避免血统流失。

关键词：子午岭黑山羊简化基因组测序群体结构遗传多样性家系结构亲缘关系

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葡萄籽原花青素对糖尿病肾病大鼠肾组织铁死亡和炎症反应的改善作用

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农垦医学 2023年第6期45卷 481-487页

作者：王浩陆恒杨瑞瑞李海燕常保雷苏艳瑜丁玉松石河子大学医学院预防医学系新疆石河子832002

目的:铁死亡和炎症反应在糖尿病肾病(Diabetic Nephropathy,DN)的发病机制中起重要作用,本研究将探讨葡萄籽原花青素提取物(Grape Seed Procyanidin Extracts,GSPE)对糖尿病肾病大鼠铁死亡和炎症反应的影响及机制。方法:选取45只SPF级Sp... 详细信息

目的:铁死亡和炎症反应在糖尿病肾病(Diabetic Nephropathy,DN)的发病机制中起重要作用,本研究将探讨葡萄籽原花青素提取物(Grape Seed Procyanidin Extracts,GSPE)对糖尿病肾病大鼠铁死亡和炎症反应的影响及机制。方法:选取45只SPF级Sprague Dawley(SD)大鼠,随机选取10只作为对照组,剩余35只高糖高脂饲料喂养并联合链脲佐菌素建立糖尿病肾病模型。将造模成功的大鼠随机分为DN模型组、GSPE(250mg/kg)干预组、Fer-1(2.5μmol/kg)干预组进行干预。全自动生化分析仪检测各组大鼠肾功能指标,试剂盒检测肾组织抗氧化能力。HE染色、PAS染色观察各组大鼠肾组织病理变化;Western Blot检测铁死亡、炎症因子和Nrf2通路相关蛋白表达水平。结果:与正常组比,DN组大鼠肾组织结构破坏,肾小球变大,肾功能指标尿素氮、血清肌酐和尿白蛋白上调,氧化损伤指标MDA和ACSL4水平升高,GSH和SOD水平下调,铁死亡标志蛋白GPX4下降,TfR1水平升高,促炎介质和炎症因子PTGS2、HMGB1、IL-1β、IL-6和TNF-α蛋白表达上调,Nrf2通路蛋白表达下调。与DN组比较,GSPE和Fer-1干预后,Nrf2信号通路被激活,铁死亡和炎症反应均显著改善。结论:GSPE抑制铁死亡和炎症反应从而改善DN大鼠肾损伤,其机制可能与激活Nrf2/ho-1信号通路有关。

关键词：糖尿病肾损伤铁死亡炎症反应葡萄籽原花青素核转录因子E2相关因子2

Fungal diversity notes 111-252-taxonomic and phylogenetic contributions to fungal taxa

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Fungal Diversity 2015年第6期75卷 27-274页

作者： Hiran A.Ariyawansa Kevin D.Hyde Subashini C.Jayasiri Bart Buyck K.W.Thilini Chethana Dong Qin Dai Yu Cheng Dai Dinushani A.Daranagama Ruvishika S.Jayawardena Robert Lücking Masoomeh Ghobad-Nejhad Tuula Niskanen Kasun M.Thambugala Kerstin Voigt Rui Lin Zhao Guo-Jie Li Mingkwan Doilom Saranyaphat Boonmee Zhu L.Yang Qing Cai Yang-Yang Cui Ali H.Bahkali Jie Chen Bao Kai Cui Jia Jia Chen Monika C.Dayarathne Asha J.Dissanayake Anusha H.Ekanayaka Akira Hashimoto Sinang hongsanan E.B.Gareth Jones Ellen Larsson Wen Jing Li Qi-Rui Li Jian Kui Liu Zong Long Luo Sajeewa S.N.Maharachchikumbura Ausana Mapook Eric H.C.McKenzie Chada Norphanphoun Sirinapa Konta Ka Lai Pang Rekhani H.Perera Rungtiwa Phookamsak Chayanard Phukhamsakda Umpava Pinruan Emile Randrianjohany Chonticha Singtripop Kazuaki Tanaka Cheng Ming Tian Saowaluck Tibpromma Mohamed A.Abdel-Wahab Dhanushka N.Wanasinghe Nalin N.Wijayawardene Jin-Feng Zhang Huang Zhang Faten A.Abdel-Aziz Mats Wedin Martin Westberg Joseph F.Ammirati Timur S.Bulgakov Diogo X.Lima Tony M.Callaghan Philipp Callac Cheng-Hao chang Luis F.Coca Manuela Dal-Forno Veronika Dollhofer Kateřina Fliegerová Katrin Greiner Gareth W.Griffith Hsiao-Man ho Valerie hofstetter Rajesh Jeewon Ji Chuan Kang Ting-Chi Wen Paul M.Kirk Ilkka Kytövuori James D.Lawrey Jia Xing hong Li Zou Yi Liu Xing Zhong Liu Kare Liimatainen H.Thorsten Lumbsch Misato Matsumura Bibiana Moncada Salilaporn Nuankaew Sittiporn Parnmen AndréL.C.M.de Azevedo Santiago Sujinda Sommai Yu Song Carlos A.F.de Souza Cristina M.de Souza-Motta hong Yan Su Satinee Suetrong Yong Wang Syuan-Fong Wei Ting Chi Wen Hai Sheng Yuan Li Wei Zhou Martina Réblová Jacques Fournier Erio Camporesi J.Jennifer Luangsa-ard Kanoksri Tasanathai Artit Khonsanit Donnaya Thanakitpipattana Sayanh Somrithipol Paul Diederich Ana M.Millanes Ralph S.Common Marc Stadler Ji Ye Yan Xinghong Li Hye Won Lee Thi T.T.Nguyen Hyang Burm Lee Eliseo Battistin Orlando Marsico Alfredo Vizzini Jordi Vila Enrico Ercole Ursula Eberhardt Giampaolo Simonini Hua-An Wen Xin-Hua Chen Otto Mie Guizhou Key Laboratory of Agricultural Biotechnology Guizhou Academy of Agricultural SciencesGuiyang 550006GuizhouChina Key Laboratory for Plant Diversity and Biogeography of East Asia Kunming Institute of BotanyChinese Academy of ScienceKunming 650201YunnanChina Centre of Excellence in Fungal Research Mae Fah Luang UniversityChiang Rai 57100Thailan Département Systématique et Evolution CP 39ISYEBUMR 7205 CNRS MNHN UPMC EPHEMuséum National d’Histoire Naturelle12 Rue BuffonF-75005 ParisFrance Institute of Plant and Environment Protection Beijing Academy of Agriculture and Forestry SciencesNo.9 of Shu Guang Hua Yuan Zhong LuHaidian DistrictBeijing 10097China Microbial Drugs Helmholtz-Centre for Infection Research Inhoffenstrasse 738124 BraunschweigGermany Staatliches Museum für Naturkunde Stuttgart Rosenstein 1D-70191StuttgartGermany Institute of Microbiology Beijing Forestry UniversityPO Box 61Beijing 100083China State Key Laboratory of Mycology Institute of MicrobiologyChinese Academy of SciencesNo 31st West Beichen RoadChaoyang DistrictBeijing 100101China The Herbarium(ANDA) Universitas AndalasPadangSumatera Barat 25163Indonesia Botanischer Garten&Botanisches Museum Berlin Freie Universität BerlinKönigin-Luise-Straße 6-814195 BerlinGermany Department of Biotechnology Iranian Research Organization for Science and Technology(IROST)P.O.Box 3353-5111Tehran ***Iran Jodrell Laboratory Royal Botanic GardensKew TW93DSUK Leibniz Institute for Natural Product Research and Infection Biology Jena Microbial Resource CollectionAdolf-Reichwein-Strasse 2307745 JenaGermany Department of Botany and Microbiology College of ScienceKing Saud UniversityP.O.Box:2455Riyadh 1145Saudi Arabia The United Graduate School of Agricultural Sciences Iwate University18-8 Ueda 3 ChomeMorioka 020-8550Japan Faculty of Agriculture and Life Sciences Hirosaki University3 Bunkyo-choHirosakiAomori 036-8561Japan Department of Biological and Environmental Sciences University of GothenburgBox 461SE

This paper is a compilation of notes on 142 fungal taxa,including five new families,20 new genera,and 100 new species,representing a wide taxonomic and geographic *** new families,Ascocylindricaceae,Caryosporaceae and Wicklowiaceae(Ascomycota)are introduced based on their distinct lineages and unique *** new Dothideomycete genera Pseudomassariosphaeria(Amniculicolaceae),Heracleicola,Neodidymella and Pseudomicrosphaeriopsis(Didymellaceae),Pseudopithomyces(Didymosphaeriaceae),Brunneoclavispora,Neolophiostoma and Sulcosporium(Halotthiaceae),Lophiohelichrysum(Lophiostomataceae),Galliicola,Populocrescentia and Vagicola(Phaeosphaeriaceae),Ascocylindrica(Ascocylindricaceae),Elongatopedicellata(Roussoellaceae),Pseudoasteromassaria(Latoruaceae)and Pseudomonodictys(Macrodiplodiopsidaceae)are *** newly described species of Dothideomycetes(Ascomycota)are Pseudomassariosphaeria bromicola(Amniculicolaceae),Flammeascoma lignicola(Anteagloniaceae),Ascocylindrica marina(Ascocylindricaceae),Lembosia xyliae(Asterinaceae),Diplodia crataegicola and Diplodia galiicola(Botryosphaeriaceae),Caryospora aquatica(Caryosporaceae),Heracleicola premilcurensis and Neodidymella thailandicum(Didymellaceae),Pseudopithomyces palmicola(Didymosphaeriaceae),Floricola viticola(Floricolaceae),Brunneoclavispora bambusae,Neolophiostoma pigmentatum and Sulcosporium thailandica(Halotthiaceae),Pseudoasteromassaria fagi(Latoruaceae),Keissleriella dactylidicola(Lentitheciaceae),Lophiohelichrysum helichrysi(Lophiostomataceae),Aquasubmersa japonica(Lophiotremataceae),Pseudomonodictys tectonae(Macrodiplodiopsidaceae),Microthyrium buxicola and Tumidispora shoreae(Microthyriaceae),Alloleptosphaeria clematidis,Allophaeosphaeria cytisi,Allophaeosphaeria subcylindrospora,Dematiopleospora luzulae,Entodesmium artemisiae,Galiicola pseudophaeosphaeria,Loratospora luzulae,Nodulosphaeria senecionis,Ophiosphaerella aquaticus,Populocrescentia forlicesenensis and Vagicola vagans(Phaeosphaeriaceae),Elon

关键词： Fungi Taxonomy New genus New species Phylogeny

血红素氧化酶1调控巨噬细胞极化对动脉粥样硬化的影响

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徐州医科大学学报 2020年第4期40卷 255-260页

作者：毕颖超鲜雪梅王珍珍门燕娟常佳佳陈全刚韩旭峰陈仁金郑葵阳徐州医科大学生命科学学院江苏徐州221004 徐州医科大学肿瘤生物治疗研究所徐州医科大学基础医学院

目的探讨血红素氧化酶1(ho-1)调节巨噬细胞对动脉粥样硬化的作用。方法100 mg/L脂多糖(LPS)和20 mg/L白介素4(IL-4)分别诱导RAW264.7细胞24 h,提取信使核糖核酸(mRNA)和蛋白,实时定量聚合酶链式反应法(RT-qPCR)检测LPS和IL-4诱导后巨噬... 详细信息

目的探讨血红素氧化酶1(ho-1)调节巨噬细胞对动脉粥样硬化的作用。方法100 mg/L脂多糖(LPS)和20 mg/L白介素4(IL-4)分别诱导RAW264.7细胞24 h,提取信使核糖核酸(mRNA)和蛋白,实时定量聚合酶链式反应法(RT-qPCR)检测LPS和IL-4诱导后巨噬细胞中ho-1、CD163和诱导型一氧化氮合酶(iNOS)mRNA表达,蛋白质印迹法(Western blot)检测LPS和IL-4诱导巨噬细胞后ho-1蛋白表达。大体油红O染色检测载脂蛋白E敲除(ApoE-/-)小鼠喂食高脂饮食后主动脉斑块面积变化,RT-qPCR和Western blot检测主动脉中ho-1 mRNA和蛋白表达。组织免疫荧光检测ho-1在主动脉窦部斑块中与促炎型(M1)和抑炎型(M2)巨噬细胞的共定位表达。结果LPS和IL-4成功诱导巨噬细胞分化为M1型与M2型巨噬细胞;IL-4诱导巨噬细胞中ho-1表达显著高于LPS及对照组(Pho-1在ApoE-/-小鼠中表达显著高于C57BL/6对照组(Pho-1与CD206的共定位表达显著高于ho-1与CD86。结论ho-1在M2型巨噬细胞中的表达显著高于M1型巨噬细胞,在动脉硬化发展中起保护作用。

关键词：血红素氧化酶1 巨噬细胞极化动脉粥样硬化小鼠

基于Nrf2/ho-1信号通路研究白藜芦醇在小鼠卵巢冷冻复苏中的保护作用及机制

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广州中医药大学学报 2023年第5期40卷 1221-1227页

作者：张珦李惠章宜芬郑燕影孙怡陈劼储乐乐应葳李长印郑艳莉南京中医药大学附属医院病理科江苏南京210000

【目的】探讨白藜芦醇在新生小鼠卵巢冷冻复苏中的保护作用及其作用机制。【方法】行冷冻复苏操作,在冷冻复苏前使用白藜芦醇预处理新生小鼠卵巢,在冷冻复苏液中加入白藜芦醇。末端脱氧核苷酸转移酶介导的dUTP缺口末端标记(TUNEL)法检... 详细信息

【目的】探讨白藜芦醇在新生小鼠卵巢冷冻复苏中的保护作用及其作用机制。【方法】行冷冻复苏操作,在冷冻复苏前使用白藜芦醇预处理新生小鼠卵巢,在冷冻复苏液中加入白藜芦醇。末端脱氧核苷酸转移酶介导的dUTP缺口末端标记(TUNEL)法检测卵巢组织中细胞凋亡情况,免疫组织化学法观察卵巢组织中Cleaved-Caspase-3表达水平,采用苏木素-伊红(HE)染色法观察移植卵巢卵泡数量及病理情况,蛋白免疫印迹(Western Blot)法检测核因子E2相关因子2(Nrf2)、血红素加氧酶1(ho-1)、多聚ADP核糖多聚糖(PARP)、剪切型PARP(Cleaved-PARP)蛋白表达水平。【结果】白藜芦醇组冷冻复苏后卵巢组织中细胞凋亡减少,移植卵巢卵泡数目显著升高,卵巢组织中Cleaved-Caspase-3表达水平显著降低,抗氧化蛋白Nrf2蛋白表达水平明显升高,凋亡蛋白Cleaved-PARP/PARP比值明显降低,与模型对照组比较,差异均有统计学意义(Pho-1表达水平升高,但与模型对照组比较,差异无统计学意义(P>0.05)。【结论】白藜芦醇在小鼠卵巢冷冻复苏移植过程中可减轻卵巢氧化应激、抑制卵巢细胞凋亡,对卵巢起保护作用。

关键词：白藜芦醇卵巢冷冻复苏异体移植生育力 Nrf2/ho-1信号通路氧化应激细胞凋亡小鼠

BaP通过AhR和Nrf2信号通路对HepG2细胞中GSTP1的影响

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内蒙古医科大学学报 2023年第3期45卷 235-239,256页

作者：王蕾张梦迪苏敏王朝杰胡玉霞白图雅吕晓丽李君常福厚内蒙古医科大学药学院内蒙古呼和浩特010059 内蒙古自治区新药筛选工程研究中心内蒙古呼和浩特010100

目的探究苯并芘(benzo[a]pyrene,BaP)通过芳香烃受体(aryl hydrocarbon receptor,AhR)和核因子E2相关因子(subcellular localization of nuclear factor E2-related factor 2,Nrf2)信号通路对HepG2细胞中谷胱甘肽-S-转移酶P1(glutathione s-transferase P1,GSTP1)的影响。方法将体外培养HepG2细胞分为Control组、BaP(10μmol/L)组、BaP(10μmol/L)+AhR抑制剂(1μmol/L)组和BaP(10μmol/L)+Nrf2抑制剂(1μmol/L)组。BaP组给予10μmol/L BaP培养24 h,抑制剂组给予1μmol/L抑制剂0.5 h后,加入10μmol/L BaP培养24 h,采用Western Blot和qPCR实验方法检测各组AhR、Nrf2、细胞色素P450s(cytochrome P450s,CYPs)、血红素加氧酶-1(heme oxygenase-1,ho-1)及GSTP1基因和蛋白的表达。结果与Control组相比,BaP组中AhR、Nrf2、GSTP1、CYP1A1及ho-1的mRNA和蛋白表达均升高(Pho-1的表达均降低(P<0.05);与BaP+AhR抑制剂组相比,BaP+Nrf2抑制剂组GSTP1 mRNA和蛋白的表达降低,差异有统计学意义(P<0.05)。结论BaP通过AhR和Nrf2两条信号通路增加GSTP1的表达,以Nrf2信号通路为主导影响GSTP1的表达。

关键词：苯并芘芳香烃受体核因子E2相关因子2 谷胱甘肽-S-转移酶P1 药物代谢酶

烧伤性异位骨化早期跟腱局部巨噬细胞募集及极化研究

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临床军医杂志 2023年第4期51卷 340-345,353页

作者：高长河闫舰飞万千千卢伟诚秦雯贾帅林焦凯牛丽娜新乡医学院第三附属医院口腔科河南新乡453000 军事口腔医学国家重点实验室国家口腔疾病临床医学研究中心第四军医大学口腔医院陕西西安710032

目的模拟临床烧伤性异位骨化(ho)的发生,探索该疾病的发生机制。方法将24只C57BL/6小鼠随机分为对照(ho)组(n=12)与研究(ho+Burn)组(n=12)。ho组建立ho模型,ho+Burn组建立ho+烫伤模型。记录两组小鼠存活率及跟腱部位手术伤口愈合情况,以... 详细信息

目的模拟临床烧伤性异位骨化(ho)的发生,探索该疾病的发生机制。方法将24只C57BL/6小鼠随机分为对照(ho)组(n=12)与研究(ho+Burn)组(n=12)。ho组建立ho模型,ho+Burn组建立ho+烫伤模型。记录两组小鼠存活率及跟腱部位手术伤口愈合情况,以及ho+Burn组小鼠背部烫伤皮肤恢复情况。术后1周和3周,Micro-CT检测手术部位ho的生成情况;HE染色观察组织学特点;茜素红染色观察钙结节的生成情况;免疫荧光染色观察巨噬细胞浸润特征及极化特点。结果术后3周,各组小鼠跟腱部位均出现创伤性ho,跟腱部位可见明显的片状高密度影;ho组骨密度、骨体积分数、ho面积低于ho+Burn组,差异均有统计学意义(Pho+Burn组茜素红免疫荧光染色荧光信号强度均高于ho组,差异均有统计学意义(Pho+Burn组M1型巨噬细胞和M2型巨噬细胞表达均高于ho组,差异均有统计学意义(Pho+Burn组成骨细胞标志物OCN荧光信号强度高于ho组,差异有统计学意义(Pho的生成,其机制可能与跟腱受损部位免疫活动的增强及巨噬细胞的募集和极化有关。

关键词：异位骨化皮肤烫伤炎症巨噬细胞极化

导电高聚物的EXAFS研究(Ⅱ)FeCl3掺杂的聚噻吩

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物理化学学报 1986年第1期 59-62页

作者：赵雅琴陆坤权常龙存白春礼曹镛傅亨唐有祺中国科学院化学研究所中国科学院物理研究所中国科学院化学研究所北京

聚噻吩是一种共轭有机高聚物,其结构如图1所示。类似于聚乙炔,经电子受体掺杂后的聚噻吩,呈现出较高的电导率。为了阐明导电高聚物的电导机制,必须搞清掺杂后掺杂剂的化学结构和高分子链与掺杂剂之间的相互作用。前文我们报道了用扩展X... 详细信息

聚噻吩是一种共轭有机高聚物,其结构如图1所示。类似于聚乙炔,经电子受体掺杂后的聚噻吩,呈现出较高的电导率。为了阐明导电高聚物的电导机制,必须搞清掺杂后掺杂剂的化学结构和高分子链与掺杂剂之间的相互作用。前文我们报道了用扩展X射线吸收精细结构(EXAFS)谱对HPtCl·6ho掺杂聚乙炔的研究,本文报道对FeCl掺杂聚噻吩的研究结果。

关键词： EXAFS FeCl3 掺杂剂导电高聚物聚噻吩

针刺穴位对人脑体感诱发电位影响的进一步观察

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复旦学报(自然科学版) 1980年第2期 140-147页

作者：李盛昌江澄川陈公白姜德鸣杨伯仪王伯扬颜杰张镜如上海第一医学院华山医院神经病学研究所上海第一医学院基础部生理教研组

我们曾经研究过针刺穴位对人头顶诱发电位的影响,然而应用普通脑电图仪,只能在30～49%的人头上记录到可测的诱发电位,并且即使在诱发电位波幅较大的个体上,由于每次刺激引起的诱发电位有变异,也只能粗略地测定其慢成分中 N-P 波的峰峰值... 详细信息

我们曾经研究过针刺穴位对人头顶诱发电位的影响,然而应用普通脑电图仪,只能在30～49%的人头上记录到可测的诱发电位,并且即使在诱发电位波幅较大的个体上,由于每次刺激引起的诱发电位有变异,也只能粗略地测定其慢成分中 N-P 波的峰峰值,而无法测定早成分的变化.自采用电子计算机迭加平均技术后,就有可能将它的各种成分作更深入的观察和分析.本工作就是用迭加平均法,观察和记录人脑体感诱发电位,在前文的基础上,进一步探讨针刺对它的影响.

关键词：体感诱发电位针刺穴位人脑