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FungalTraits:a user-friendly traits database of fungi and fungus-like stramenopiles

Fungal Diversity 2020年第2期107卷 I0001-I0016页

作者： Sergei Põlme Kessy Abarenkov RHenrik Nilsson Björn D.Lindahl Karina Engelbrecht Clemmensen Havard Kauserud Nhu Nguyen Rasmus Kjøller Scott T.Bates Petr Baldrian Tobias Guldberg Frøslev Kristjan Adojaan Alfredo Vizzini Ave Suija Donald Pfister Hans-Otto Baral Helle Järv Hugo Madrid Jenni Nordén Jian-Kui Liu Julia Pawlowska Kadri Põldmaa Kadri Pärtel Kadri Runnel Karen Hansen Karl-Henrik Larsson Kevin David Hyde Marcelo Sandoval-Denis Matthew E.Smith Merje Toome-Heller Nalin N.Wijayawardene Nelson Menolli Jr Nicole K.Reynolds Rein Drenkhan Sajeewa S.N.Maharachchikumbura Tatiana B.Gibertoni Thomas Læssøe William Davis Yuri Tokarev Adriana Corrales Adriene Mayra Soares Ahto Agan Alexandre Reis Machado Andrés Argüelles-Moyao Andrew Detheridge Angelina de Meiras-Ottoni Annemieke Verbeken Arun Kumar Dutta Bao-Kai Cui C.K.Pradeep César Marín Daniel Stanton Daniyal Gohar Dhanushka N.Wanasinghe Eveli Otsing Farzad Aslani Gareth W.Griffith Thorsten H.Lumbsch Hans-Peter Grossart Hossein Masigol Ina Timling Inga Hiiesalu Jane Oja John Y.Kupagme József Geml Julieta Alvarez-Manjarrez Kai Ilves Kaire Loit Kalev Adamson Kazuhide Nara Kati Küngas Keilor Rojas-Jimenez Krišs Bitenieks Laszlo Irinyi LászlóGNagy Liina Soonvald Li-Wei Zhou Lysett Wagner M.Catherine Aime MaarjaÖpik María Isabel Mujica Martin Metsoja Martin Ryberg Martti Vasar Masao Murata Matthew PNelsen Michelle Cleary Milan C.Samarakoon Mingkwan Doilom Mohammad Bahram Niloufar Hagh-Doust Olesya Dulya Peter johnston Petr Kohout Qian Chen Qing Tian Rajasree Nandi Rasekh Amiri Rekhani Hansika Perera Renata dos Santos Chikowski Renato L.Mendes-Alvarenga Roberto Garibay-Orijel Robin Gielen Rungtiwa Phookamsak Ruvishika S.Jayawardena Saleh Rahimlou Samantha C.Karunarathna Saowaluck Tibpromma Shawn P.Brown Siim-Kaarel Sepp Sunil Mundra Zhu-Hua Luo Tanay Bose Tanel Vahter Tarquin Netherway Teng Yang Tom May Torda Varga Wei Li Victor Rafael Matos Coimbra Virton Rodrigo Targino de Oliveira Vitor Xavier de Lima Vladimir S.Mikryukov Yongzhong Lu Yosuke Matsuda Yumiko Miyamoto Urm Institute of Ecology and Earth Sciences University of Tartu14A Ravila50411 TartuEstonia Natural History Museum University of Tartu46 Vanemuise Str51003 TartuEstonia Gothenburg Global Biodiversity Centre Box 46140530 GothenburgSweden Department of Biological and Environmental Sciences University of GothenburgGothenburgSweden Department of Soil and Environment Swedish University of Agricultural SciencesBox 701475007 UppsalaSweden Department of Forest Mycology and Plant Pathology Swedish University of Agricultural SciencesBox 702675007 UppsalaSweden Section for Genetics and Evolutionary Biology(EvoGene) Department of BiosciencesUniversity of OsloP.O.Box 1066BlindernNO-0316 OsloNorway University of Hawaiʻi at Mānoa 3190 Maile WaySt.John 102HonoluluHIUSA Department of Biology University of CopenhagenUniversitetsparken 152100 CopenhagenØDenmark Purdue University Northwest WestvilleIN 46391USA Institute of Microbiology Czech Academy of SciencesVidenska 108314220 Praha 4Czech Republic GLOBE Institute University of CopenhagenØster Farimagsgade 5KH7.2.321353 CopenhagenDenmark Dipartimento di Scienze della Vita e Biologia dei Sistemi Universitàdi TorinoViale Mattioli 2510125 TorinoItaly Department of Organismic and Evolutionary Biology and Farlow Library and Herbarium Harvard University22 Divinity AveCambridgeMA 02138USA Blaihofstr.42 72074 TübingenGermany SYNLAB Estonia Veerenni 53aTallinn 11313Estonia Escuela de Tecnología Médica Universidad Santo TomásLos Carreras 753OsornoChile Centro de Genómica y Bioinformática Universidad MayorCamino La Pirámide 5750HuechurabaSantiagoChile Norwegian Institute for Nature Research(NINA) Sognsveien 680855 OsloNorway School of Life Science and Technology University of Electronic Science and Technology of ChinaChengdu 611731People’s Republic of China Evolutionary Biology Faculty of BiologyBiological and Chemical Research CentreUniversity of Warsawul.Zwirki i Wigury 10102-089 WarsawPoland Department of Botany Swedish Museum of

The cryptic lifestyle of most fungi necessitates molecular identification of the guild in environmental *** the past decades,rapid development and affordability of molecular tools have tremendously improved insights of the fungal diversity in all ecosystems and ***,in spite of the progress of molecular methods,knowledge about functional properties of the fungal taxa is vague and interpretation of environmental studies in an ecologically meaningful manner remains *** order to facilitate functional assignments and ecological interpretation of environmental studies we introduce a user friendly traits and character database FungalTraits operating at genus and species hypothesis *** the information from previous efforts such as FUNGuild and FunFun together with involvement of expert knowledge,we reannotated 10,210 and 151 fungal and Stramenopila genera,*** resulted in a stand-alone spreadsheet dataset covering 17 lifestyle related traits of fungal and Stramenopila genera,designed for rapid functional assignments of environmental *** order to assign the trait states to fungal species hypotheses,the scientific community of experts manually categorised and assigned available trait information to 697,413 fungal ITS *** the basis of those sequences we were able to summarise trait and host information into 92,623 fungal species hypotheses at 1%dissimilarity threshold.

关键词： Fungal traits Trophic modes Function Guild Bioinformatics High-throughput sequencing Community ecology

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综合性卒中中心医疗质量的度量标准：对脑卒中联盟综合性卒中中心推荐意见的详细随访美国心脏协会／美国卒中协会对医疗专业人员的声明

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国际脑血管病杂志 2011年第3期19卷 169-194页

作者：何晟(译) 蔡可夫(译) 张元媛(译) 胡旻婧(译) 倪耀辉(译) 芮瑛(译) 柯开富(译) Dana Leifer Dawn M. Bravata J.J. (Buddy) Connors Ⅲ Judith A. Hinchey Edward C. Jauch S. Claibome johnston Richard Latchaw William kikosky Christopher Ogilvy Adrian I. Qureshi Debbie Summers Gene Y. Sung Linda S. Williams Richard Zorowitz 南通大学附属医院神经内科 226001 代表美国心脏协会卒中委员会特别写作组、周围动脉粥样硬化性疾病工作组、心血管外科和麻醉委员会以及心血管护理委员会

背景卒中是一种主要的残疾和死亡原因。脑卒巾联盟提议，建立初级卒中中心（primary stroke center，PSC）和综合性卒中中心（comprehensive stroke center，csc）以分别为需要基本或高级下预的卒中患者提供适当的医疗服务。从2003年开... 详细信息

背景卒中是一种主要的残疾和死亡原因。脑卒巾联盟提议，建立初级卒中中心（primary stroke center，PSC）和综合性卒中中心（comprehensive stroke center，csc）以分别为需要基本或高级下预的卒中患者提供适当的医疗服务。从2003年开始，美国医疗卫生机构认证联合委员会和各州已指定了一些PSC，目前正在考虑CSC的指定工作。为了推进该过程，我们提出了一套CSC应追踪监测医疗质量并促进质量改进的标准和相关数据。方法和结果我们分析了现有指南、综述和其他文献，以识别区分CSC与PSC的主要特征；起草了一套标准和相关数据元素，以评价这些卒中医疗方面的关键部分；然后通过反复修改达成共识。我们提出的这套标准和相关数据元素，涵盖了CSC内缺血性脯血管病、非外伤性蛛网膜下腔出血和腩出血患者专、№医疗的主要方面。结论我们提出这套标准，旨在为CSC的标准化数据采集提供一个框架，以促进当地医疗质量改进，并允许对来自不同CSC的数据进行合并分析。这将有助于将来CSC国家执行标准的制定。

关键词：美国心脏协会科学声明脑血管病脑出血缺血性卒中医疗卫生系统患者医疗大学医疗中心

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