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Proteomics provides individualized options of precision medicine for patients with gastric cancer

Science china(life Sciences) 2021年第8期64卷 1199-1211页

作者： Wenwen Huang Dongdong Zhan Yazhuo li Nairen Zheng xin Wei Bin Bai Kecheng Zhang Mingwei liu Xuefei Zhao xiaotian Ni xia xia Jinwen Shi cheng Zhang Zhihao Lu Jiafu Ji Juan Wang Shiqi Wang Gang Ji Jipeng li Yongzhan Nie Wenquan liang xiaosong Wu Jianxin Cui Yongsheng Meng Feilin Cao Tieliu Shi Weimin Zhu Yi Wang lin chen Qingchuan Zhao Hongwei Wang lin Shen Jun Qin department of Gastrointestinal Oncology Key Laboratory of Carcinogenesis and Translational Research(Ministry of Education/Beijing)Peking University Cancer Hospital and InstituteBeijing 100142China State Key Laboratory of Proteomics Beijing Proteome Research CenterNational Center for Protein Sciences(Beijing)Beijing Institute of LifeomicsBeijing 102206China department of Pathology The Fourth Medical Center of PLA General HospitalBeijing 100048China State Key Laboratory of Cancer Biology National Clinical Research Center for Digestive Diseases and Department of Digestive SurgeryXijing Hospital of Digestive DiseasesFourth Military Medical UniversityXi’an 710032China department of General Surgery&Institute of General Surgery Chinese PLA General Hospital First Medical CenterBeijing 100853China department of Gastrointestinal Surgery Key Laboratory of Carcinogenesis and Translational Research(Ministry of Education/Beijing)Peking University Cancer Hospital and InstituteBeijing 100142China department of tumor biobank Shanxi Cancer HospitalTaiyuan 030013China Center for Bioinformatics and Computational Biology Shanghai Key Laboratory of Regulatory BiologyInstitute ofBiomedical Sciences and School of Life SciencesEast China Normal UniversityShanghai 200241China State Key Laboratory of Genetic engineering and Collaborative Innovation Center for Genetics and Development School of Life SciencesInstitute of Biomedical SciencesFudan UniversityShanghai 200433China life Sciences Institute Zhejiang UniversityHangzhou 310058China

While precision medicine driven by genome sequencing has revolutionized cancer care,such as lung cancer,its impact on gastric cancer(GC)has been *** patients are routinely treated with chemotherapy,but only a fraction of them receive the clinical *** is an urgent need to develop biomarkers or algorithms to select chemo-sensitive patients or apply targeted ***,we carried out retrospective analyses of 1,020 formalin-fixed,paraffin-embedded GC surgical resection samples from 5 hospitals and developed a mass spectrometry-based workflow for proteomic subtyping of *** identified two proteomic subtypes:the chemo-sensitive group(CSG)and the chemo-insensitive group(CIG)in the discovery *** 5-year overall survival of CSG was significantly improved in patients who had received adjuvant chemotherapy after surgery compared with those who received surgery only(64.2%vs.49.6%;Cox P-value=0.002),whereas no such improvement was observed in CIG(50.0%vs.58.6%;Cox P-value=0.495).We validated these results in an independent validation ***,differential proteome analysis uncovered 9 FDA-approved drugs that may be applicable for targeted therapy of GC.A prospective study is warranted to test these findings for future GC patient care.

关键词： patients chemotherapy cancer

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基于GaAs/Al0.45Ga0.55As超晶格芯片自发混沌振荡的8 Gb/s物理真随机数实现

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物理学报 2020年第10期69卷 42-50页

作者：刘延飞陈诚杨东东李修建火箭军工程大学基础部西安710025 国防科技大学文理学院长沙410073

物理真随机数发生器对密码学和保密通信至关重要.现有随机数发生器,或者复杂庞大,或者受限于器件带宽,不能很好地满足现代高速通信系统的需要.本文提出了一种基于超晶格(superlattices,SLs)芯片的全固态实时高速物理真随机数发生器.通... 详细信息

物理真随机数发生器对密码学和保密通信至关重要.现有随机数发生器,或者复杂庞大,或者受限于器件带宽,不能很好地满足现代高速通信系统的需要.本文提出了一种基于超晶格(superlattices,SLs)芯片的全固态实时高速物理真随机数发生器.通过选取合适直流偏置电压对SLs芯片进行激发,从而产生高频混沌振荡信号作为物理熵源,利用采样频率为2 GHz的多位模数转换器(analog-to-digital converter,ADC)进行量化,生成12位的二进制随机比特,然后使用现场可编程逻辑门阵列(field programmable gate array,FPGA)抽取最低4位为有效位并进行比特反转以改善其随机性,最终获得了实时速率为8 Gbit/s的随机数.经验证,该发生器产生的随机数通过了随机数行业标准(NIST SP 800-22)的测试,具备优良的统计特性,有望小型化集成到高速通信设备之上.

关键词：超晶格自发混沌振荡物理真随机数多位采样

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城市道路交通事故形态影响因素分析与预测

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长安大学学报（自然科学版） 2022年第4期42卷 98-107页

作者：陈荔李聪颖詹立谭倩田欣妹成华李坤长安大学信息与网络管理处陕西西安710064 西安建筑科技大学土木工程学院陕西西安710055 中国城市规划设计研究院北京100044 西安市政设陕西西安710068

为探究不同形态城市道路交通事故的发生原因,将事故形态的影响因素进行筛选和约简,选取3种不同算法对事故形态进行分析与预测,对比预测模型的准确性。采用粗糙集理论对原始交通事故形态影响因素变量进行转换和约简,获得满足建模要求的... 详细信息

为探究不同形态城市道路交通事故的发生原因,将事故形态的影响因素进行筛选和约简,选取3种不同算法对事故形态进行分析与预测,对比预测模型的准确性。采用粗糙集理论对原始交通事故形态影响因素变量进行转换和约简,获得满足建模要求的试验数据,并按照总体一致原则把数据等分为训练集和测试集。基于C5.0决策树算法,构建交通事故形态预测决策树模型并进行模型准确性验证,生成交通事故形态规则集;另外,采用似然比检验筛选自变量构建交通事故形态多元Logistic回归预测模型;构建多层感知器(MLP)神经网络预测模型,检验模型训练集与测试集的准确率并进行对比分析。结果表明:3种模型中,C5.0决策树算法对交通事故形态在训练集和测试集中的预测准确率分别为80.39%与79.63%,高于多元Logistic回归模型和MLP神经网络模型。采用C5.0决策树算法得到交通事故形态主要影响因素为交通方式的选取,行驶在道路横断面位置,违法行为与行驶状态等,解释性良好。研究可为分析及预测城市道路交通事故形态,分析事故产生原因提供方法参考,还可为交通管理部门提供决策依据。

关键词：交通工程事故形态预测模型 C5.0决策树规则集

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新冠肺炎疫情加速高校财务核算模式转型

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价值工程 2020年第24期39卷 183-184页

作者：李娟李晨溪程钰茹成都医学院计划财务处成都610050 西北大学经济管理学院西安710000

2019年12月,新型冠状病毒肺炎(COVID-19)在湖北省武汉市爆发,继而蔓延至全国,由于病毒自身的传染特性,高校作为人群聚集密度大、学生来源地域广的部门,防疫面临巨大挑战。传统报销模式下,高校财务部门每天与大量师生“面对面接触”,财... 详细信息

2019年12月,新型冠状病毒肺炎(COVID-19)在湖北省武汉市爆发,继而蔓延至全国,由于病毒自身的传染特性,高校作为人群聚集密度大、学生来源地域广的部门,防疫面临巨大挑战。传统报销模式下,高校财务部门每天与大量师生“面对面接触”,财务报销效率低下,也带来疫情传播的风险。文章分析了高校财务核算模式的发展历程,以及在此次疫情的契机下加速高校财务核算模式转变的重要性。

关键词：新型冠状病毒肺炎传染性强高校财务核算模式无接触式报销

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基于上位机的铜热电阻传感器数据测试与分析

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实验室科学 2018年第4期21卷 1-3,7页

作者：陈虹丽李成蹊李强哈尔滨工程大学自动化学院黑龙江哈尔滨150001 香港科技大学电子与计算机工程系

针对检测与转换技术实验中核心内容之一传感器制作及特性测试,设计了符合实验教学要求的铜热电阻传感器的制作、基本参数测试及基于上位机的铜热电阻温度测量及误差分析。电压以串口通讯的方式发送至上位机,由上位机LabView软件进行分析... 详细信息

针对检测与转换技术实验中核心内容之一传感器制作及特性测试,设计了符合实验教学要求的铜热电阻传感器的制作、基本参数测试及基于上位机的铜热电阻温度测量及误差分析。电压以串口通讯的方式发送至上位机,由上位机LabView软件进行分析,生成报表。通过设计一个模拟加热炉系统提供不同温度给铜热电阻,进行基本参数测试。通过软、硬件设计与测试,实现了对铜热电阻的温度、阻值变化实时监控以及对铜热电阻测量阻值进行误差分析。

关键词：铜热电阻传感器单片机模拟加热炉 LabView

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Measurement of the neutron total cross section of carbon at the Back-n white neutron beam of CSNS

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Nuclear Science and Techniques 2019年第9期30卷 73-82页

作者： xing-Yan liu Yi-Wei Yang Rong liu Jie Wen Zhong-Wei Wen Zi-Jie Han Zhi-Zhou Ren Qi An Huai-Yong Bai Jie Bao Ping Cao Qi-Ping chen Yong-Hao chen Pin-Jing cheng Zeng-Qi Cui Rui-Rui Fan chang-Qing Feng Min-Hao Gu Feng-Qin Guo chang-Cai Han Guo-Zhu He Yong-cheng He Yue-Feng He Han-xiong Huang Wei-ling Huang xi-Ru Huang xiao-Lu Ji Xu-Yang Ji Hao-Yu Jiang Wei Jiang Han-Tao Jing ling Kang Ming-Tao Kang Bo li Lun li Qiang li xiao li Yang li Yang li Shu-Bin liu Guang-Yuan Luan Ying-lin Ma chang-Jun Ning Bin-Bin Qi Jie Ren xi-Chao Ruan Zhao-Hui Song Hong Sun xiao-Yang Sun Zhi-Jia Sun Zhi-xin Tan Hong-Qing Tang Jing-Yu Tang Peng-cheng Wang Qi Wang Tao-Feng Wang Yan-Feng Wang Zhao-Hui Wang Zheng Wang Qing-Biao Wu xiao-Guang Wu Xuan Wu li-Kun xie Han Yi li Yu Tao Yu Yong-Ji Yu Guo-Hui Zhang Jing Zhang lin-Hao Zhang li-Ying Zhang Qing-Min Zhang Qi-Wei Zhang xian-Peng Zhang Yu-liang Zhang Zhi-Yong Zhang Ying-Tan Zhao liang Zhou Zu-Ying Zhou Dan-Yang Zhu Ke-Jun Zhu Peng Zhu Institute of Nuclear Physics and Chemistry China Academy of Engineering Physics State Key Laboratory of Particle Detection and Electronics Chinese Academy of Sciences(CAS) department of Modern Physics University of Science and Technology of China State Key Laboratory of Nuclear Physics and Technology School of PhysicsPeking University Key Laboratory of Nuclear Data China Institute of Atomic Energy Institute of High Energy Physics Chinese Academy of Sciences(CAS) Spallation Neutron Source Science Center university of South china Northwest Institute of Nuclear Technology department of engineering and Applied Physics University of Science and Technology of China Beihang university xi’an Jiaotong university

To verify the performance of the neutron total cross-sectional spectrometer, the neutron total cross section of carbon is initially measured in the energy range of 1 eV to 20 MeV using the time-of-flight method. The measurement is performed at the Back-n white neutron source with a 76-m time-of-flight path using the china Spallation Neutron Source. A multilayer fast fission chamber with 235U and 238U is employed as the neutron detector. The diameter and thickness of the natural graphite sample are 70 mm and 40 mm, respectively. Signal waveforms are collected using a data acquisition system. Off-line data processing was used to obtain the neutron time-of-flight spectra and transmissions. The uncertainty of the counting statistics is generally approximately 3% for each bin in the energy range of 1–20 MeV. It is determined that the results for the neutron total cross section of carbon obtained using ^235U cells are in good agreement with the results obtained using 238U cells within limits of statistical uncertainty. Moreover, the measured total cross sections show good agreement with the broadening evaluated data.

关键词： CSNS Back-n white neutron source NTOX Neutron total cross section Carbon Multilayer fast fission chamber

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荷叶离褶伞子实体化学成分

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菌物学报 2020年第9期39卷 1774-1782页

作者：郑中庸韩俊杰米鹏程陈保送宝丽席亚丽王政迪谢丽萍郭长彬魏生龙刘宏伟中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室北京100101 中国科学院大学存济医学院北京100049 河西学院甘肃省应用真菌工程实验室甘肃张掖730400 首都师范大学化学系北京100048

本文对祁连山野生荷叶离褶伞Lyophyllumdecastes子实体的化学成分和生物活性进行研究。采用硅胶色谱、高效液相色谱等多种方法进行分离纯化得到8个化合物,通过MS、NMR和电子圆二色谱(ECD)等方法确定了化学结构,其中有4个为聚炔类化合物... 详细信息

本文对祁连山野生荷叶离褶伞Lyophyllumdecastes子实体的化学成分和生物活性进行研究。采用硅胶色谱、高效液相色谱等多种方法进行分离纯化得到8个化合物,通过MS、NMR和电子圆二色谱(ECD)等方法确定了化学结构,其中有4个为聚炔类化合物。化合物1作为天然产物系首次报道,其相绝对构型是通过比较ECD的方法确定。对所得聚炔类化合物应用细胞模型进行抗氧化活性(CAA)指标检测,化合物1–4均呈现一定抗氧化活性,其中化合物1的抗氧化活性最强,其EC50为(24.73±6.12)μmol/L。聚炔类化合物1–4为荷叶离褶伞首次报道成分,可作为祁连山野生荷叶离褶伞HPLC-DAD化学表征参考化合物。

关键词：荷叶离褶伞次级代谢产物聚炔细胞内抗氧化

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人脂肪干细胞及其外泌体的分离与鉴定

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中国组织工程研究 2018年第13期22卷 2033-2038页

作者：李洪超金银鹏王皙李莉王晓今周荣陈成伟傅青春程明亮贵州医科大学临床医学院贵州省贵阳市550004 解放军第八五医院上海肝病研究中心上海市200235 贵州医科大学附属医院感染科贵州省贵阳市550004

背景:间充质干细胞如今在科研领域被广泛地研究和应用,许多研究认为其发挥作用的机制很大程度上依赖于其旁分泌的外泌体。目的:分离纯化人脂肪干细胞来源的外泌体,并鉴定其生物学特性。方法:采用胶原酶消化法获得人脂肪干细胞,进行细胞... 详细信息

背景:间充质干细胞如今在科研领域被广泛地研究和应用,许多研究认为其发挥作用的机制很大程度上依赖于其旁分泌的外泌体。目的:分离纯化人脂肪干细胞来源的外泌体,并鉴定其生物学特性。方法:采用胶原酶消化法获得人脂肪干细胞,进行细胞表面分子标志和成骨、成脂分化能力鉴定。运用超滤法从人脂肪干细胞条件培养基中提取外泌体,应用扫描电子显微镜、粒度仪观察所获外泌体的形态和大小,采用抗体芯片检测外泌体所含蛋白质表达。结果与结论:(1)人脂肪干细胞呈梭形、漩涡状生长,细胞表面表达CD73、CD44、CD90、CD105分子,具备成脂、成骨等多向分化潜能,可证实为人脂肪干细胞;(2)大多数外泌体直径均在30-150 nm范围内;扫描电镜显示外泌体呈均一大小的圆杯形态;(3)抗体芯片显示外泌体含FLOT1、ICAM、AliX、CD81、CD63、ANXA5、TSG101等多种特殊蛋白;(4)以上结果表明实验成功分离得到人脂肪干细胞外泌体。

关键词：外泌体干细胞间充质干细胞脂肪干细胞

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生物柴油-柴油-乙醇混合燃料的燃烧与排放特性

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中国公路学报 2018年第11期31卷 236-243页

作者：耿莉敏程清波陈阳魏有涛李慧梅长安大学陕西省交通新能源开发应用与汽车节能重点实验室陕西西安710064 长城汽车股份有限公司河北保定071000 军事交通学院汽车工程系天津300161

为了改善发动机燃用高比例生物质混合燃料的性能,在中等比例的生物柴油-柴油混合燃料中分别添加5%、10%和20%体积比的乙醇(分别用BD50E5,BD50E10和BD50E20表示),在一台6缸增压共轨柴油机上,将发动机的转速稳定在1 600 r·min^(-1),选择... 详细信息

为了改善发动机燃用高比例生物质混合燃料的性能,在中等比例的生物柴油-柴油混合燃料中分别添加5%、10%和20%体积比的乙醇(分别用BD50E5,BD50E10和BD50E20表示),在一台6缸增压共轨柴油机上,将发动机的转速稳定在1 600 r·min^(-1),选择7个不同的负荷点测定不同掺混比生物柴油-柴油-乙醇混合燃料的燃烧与排放性能,并将其与柴油进行对比。结果表明:在平均有效压力为0.322 MPa的低负荷条件下,发动机为预喷加主喷喷油策略,在预喷的低温反应阶段生物柴油-柴油-乙醇混合燃料产生了大量羟基自由基,因此混合燃料的缸内最大压力和最大瞬时放热率均高于柴油;随着负荷的增大,当平均有效压力为0.805 MPa时,发动机的喷油策略转变为单段喷射,乙醇的热值较低导致生物柴油-柴油-乙醇混合燃料的缸内最大压力和最大瞬时放热率低于柴油;随着乙醇掺混比的增大,受乙醇低十六烷值和高汽化潜热的影响,生物柴油-柴油-乙醇混合燃料的滞燃期明显延长;强烈的预混燃烧和乙醇的高含氧量使混合燃料的燃烧速度明显加快,乙醇的添加有利于燃料集中放热从而缩短燃烧持续期;与纯柴油相比,BD50E5,BD50E10和BD50E20的NO_x排放量分别升高了10.46%、12.59%和17.52%,碳烟排放量分别降低了37.91%、45.85%和49.25%,CO排放量分别降低了20.24%、36.43%和46.43%,HC排放量分别降低了12.53%、4.40%和0.76%。

关键词：汽车工程排放特性燃烧特性试验高压共轨柴油机生物柴油乙醇

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一种改进的装备质量监督领域本体建模策略

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兵器装备工程学报 2019年第8期40卷 69-73页

作者：李泽西孟晨王成陆军工程大学石家庄校区石家庄050003 陆军装备部驻西安地区军事代表局西安710000

将本体技术引入装备质量监督领域,通过改进基于质量环的领域本体建模策略,提出一种基于核心本体循环扩展的装备质量监督领域本体建模策略,描述了该建模策略的基本步骤。以生产过程质量监督子本体中的检验验收类为例,利用protégé软件... 详细信息

将本体技术引入装备质量监督领域,通过改进基于质量环的领域本体建模策略,提出一种基于核心本体循环扩展的装备质量监督领域本体建模策略,描述了该建模策略的基本步骤。以生产过程质量监督子本体中的检验验收类为例,利用protégé软件实现了该模块的建模和检测;其次,分别从本体建模基础能力和本体评价标准两个角度出发,对上述两种建模策略进行对比分析,验证了基于核心本体循环扩展的装备质量监督领域本体建模策略的可行性和优越性,为后续开发装备质量监督领域知识库奠定了理论基础。

关键词：本体装备质量监督领域本体检验验收建模

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