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A Plant SMALL RNA-BINDING PROTEIN 1 Family Mediates Cell-to-Cell Trafficking of RNAi Signals

Molecular Plant 2020年第2期13卷 321-335页

作者： Yan Yan byung-kook ham Yee Hang Chong Shyi-Dong Yeh William J.Lucas Department of Plant Biology College of Biological SciencesUniversity of CaliforniaDavisCA 95616USA Department of Plant Pathology National Chung-Hsing UniversityTaichung Present address:Global Institute for Food Security University of SaskatchewanSaskatoonSK S7N 4J8Canada Present address:Department of Biology University of Saskatchewan112 Science PlaceSaskatoonSK S7N 5E2Canada

In plants,RNA interference(RNAi)plays a pivotal role in growth and development,and responses to environmental inputs,including pathogen *** intercellular and systemic trafficking of small interfering RNA(siRNA)/microRNA(miRNA)is a central component in this regulatory ***,little is known with regards to the molecular agents involved in the movement of these si/*** address this situation,we employed a biochemical approach to identify and characterize a conserved SMALL RNA-BINDING PROTEIN 1(SRBP1)family that mediates non-cell-autonomous small RNA(sRNA)*** Arabidopsis,AtSRBP1 is a glycine-rich(GR)RNA-binding protein,also known as AtGRP7,which we show binds single-stranded siRNA.A viral vector,Zucchini yellow mosaic virus(ZYMV),was employed to functionally characterized the AtSRBP1-4(AtGRP7/2/4/8)RNA recognition motif and GR ***-based studies revealed the GR domain as being necessary and sufficient for SRBP1 cell-to-cell *** together,our findings provide a foundation for future research into the mechanism and function of mobile sRNA signaling agents in plants.

关键词： RNAi small RNA-binding protein family small RNA movement non-cell-autonomous protein glycinerich protein

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Plant lncRNAs are enriched in and move systemically through the phloem in response to phosphate deficiency

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Journal of Integrative Plant Biology 2019年第4期61卷 492-508页

作者： Zhaoliang Zhang Yi Zheng byung-kook ham Shupei Zhang Zhangjun Fei William J.Lucas State Key Laboratory of Tea Biology and Utilization Anhui Agricultural University Boyce Thompson Institute for Plant Research Cornell University Global Institute for Food Security Department of Biology University of Saskatchewan Department of Plant Biology College of Biological Sciences University of California

In response to phosphate(Pi) deficiency, it has been shown that micro-RNAs(miRNAs) and mRNAs are transported through the phloem for delivery to sink tissues. Growing evidence also indicates that long noncoding RNAs(lncRNAs) are critical regulators of Pi homeostasis in plants. However, whether lncRNAs are present in and move through the phloem, in response to Pi deficiency, remains to be established. Here, using cucumber as a model plant, we show that lncRNAs are enriched in the phloem translocation stream and respond,systemically, to an imposed Pi-stress. A well-known lncRNA, IPS1, the target mimic(TM) of miRNA399,accumulates to a high level in the phloem, but is not responsive to early Pi deficiency. An additional 24 miRNA TMs were also detected in the phloem translocation stream; among them miRNA171 TMs and miR166 TMs were induced in response to an imposed Pi *** studies identified 22 lncRNAs which move systemically into developing leaves and root tips. A CU-rich PTB motif was further identified in these mobile lncRNAs. Our findings revealed that lncRNAs respond to Pi deficiency, non-cell-autonomously, and may act as systemic signaling agents to coordinate early Pi deficiency signaling, at the whole-plant level.

关键词： Plant lncRNAs enriched phloem phosphate deficiency

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西瓜基因组框架图谱绘制与20份代表性资源重测序研究

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中国瓜菜 2019年第8期32卷 193-195页

作者：郭绍贵(编译) 许勇(编译) 张建国孙宏贺 Jerome Salse William JLucas 张海英 Yi Zheng 毛林勇任毅王志文闵久梦郭晓森 Florent Murat byung-kook ham 张召亮高山黄明云徐益民钟思林 Aureliano Bombarely Lukas A Mueller 赵泓何洪巨张岩张忠华黄三文谭涛庞尔丽林魁胡群匡汉辉倪培相王博刘景安孔秋生侯文菊邹小花江姣宫国义 Kathrin Klee Heiko Schoof 黄莹胡雪松董珊珊梁德全王娟吴奎夏阳赵翔郑泽群邢淼梁新明黄邦清吕添王军一尹烨伊鸿平李瑞强吴明珠 Amnon Levil 张兴平 James J Giovannoni 王俊李云伏费章君北京市农林科学院蔬菜研究中心国家蔬菜工程技术研究中心·北京市农林科学院·农业部华北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室康奈尔大学博伊斯汤普逊研究所农业部基因组学重点实验室·深圳华大基因研究院北京农学院植物科学技术学院法国农业科学研究院联合研究中心谷类遗传学多样性和生态生理研究所加州大学生物科学学院植物生物学系(戴维斯) 中国农业科学院蔬菜花卉研究所北京师范大学生命科学学院华中农业大学园林学院波恩大学植物科学与资源保护研究所作物生物信息研究室新疆农业科学院北京诺禾致源生物信息科技有限公司美国农业部农业科学研究院蔬菜研究室美国农业部农业与健康罗伯特霍利研究中心哥本哈根大学生物系复旦大学理论生命科学研究中心

目的与意义:西瓜是一种重要的葫芦科作物,占全世界蔬菜生产面积的7%.经过长期人工选育,西瓜遗传多样性变的十分狭窄,已成为西瓜品种改良的瓶颈.本研究以东亚类型高品质西瓜品种‘97103’为材料进行西瓜全基因组序列分析,并开展20份代表... 详细信息

目的与意义:西瓜是一种重要的葫芦科作物,占全世界蔬菜生产面积的7%.经过长期人工选育,西瓜遗传多样性变的十分狭窄,已成为西瓜品种改良的瓶颈.本研究以东亚类型高品质西瓜品种‘97103’为材料进行西瓜全基因组序列分析,并开展20份代表性西瓜资源的基因组重测序分析,以明确西瓜基因组结构和进化历程,阐明果实品质和维管束信号传导等重要生物学过程的分子机制.

关键词：全基因组测序分析西瓜资源图谱框架品种改良果实品质

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