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CDS:A Fold-change Based Statistical Test for Concomitant Identification of Distinctness and Similarity in Gene Expression Analysis

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Genomics,Proteomics & Bioinformatics 2012年第3期10卷 127-135页

作者： Nicolas Tchitchek José Felipe Golib Dzib brice targat Sebastian Noth Arndt Benecke Annick Lesne Institut des Hautes Etudes Scientifiques Bures-sur-Yvette 91440France Centre National de la Recherche Scientifique USR3078Bures-sur-Yvette 91440France Laboratoire de Physique Théorique de la Matière Condensée CNRS UMR7600Université Pierre et Marie Curie-Paris 6Paris 75005France

The problem of identifying differential activity such as in gene expression is a major defeat in biostatistics and *** important,however much less frequently studied,is the question of similar activity from one biological condition to *** foldchange,or ratio,is usually considered a relevant criterion for stating difference and similarity between ***,no statistical method for concomitant evaluation of similarity and distinctness currently exists for biological *** microarray,digital PCR(dPCR),and Next-Generation Sequencing(NGS) technologies frequently provide a means of coefficient of variation estimation for individual *** fold-change,and by making the assumption that measurements are normally distributed with known variances,we designed a novel statistical test that allows us to detect concomitantly,thus using the same formalism,differentially and similarly expressed genes(http://***).Given two sets of gene measurements in different biological conditions,the probabilities of making type I and type II errors in stating that a gene is differentially or similarly expressed from one condition to the other can be ***,a confidence interval for the fold-change can be ***,we demonstrate that the assumption of normality can be relaxed to consider arbitrary distributions *** Concomitant evaluation of Distinctness and Similarity(CDS) statistical test correctly estimates similarities and differences between measurements of gene *** implementation,being time and memory efficient,allows the use of the CDS test in high-throughput data analysis such as microarray,dPCR,and NGS ***,the CDS test can be applied to the comparison of single measurements(N:1) provided the variance(or coefficient of variation) of the signals is known,making CDS a valuable tool also in biomedical analysis where typically a single measurement per

关键词： Statistical test Fold-change Distinctness Similarity Gene expression Single measurement Patient study

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包浩斯的岁月

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艺苑（美术版） 1992年第3期 33-37页

作者： FRANCOIS LE targat KENNETH LYONS 苏为

差不多是紧接着日尔曼帝国的衰落,1919年春,刚成立的共和国委任建筑师瓦尔特·格罗皮斯在魏玛建立包浩斯学院,又叫国立建筑大楼,意思是要将建筑,艺术与工艺的教学揉合在一起。在这学院里康定斯基找到了一个差不多是为他而设的位置,因为... 详细信息

差不多是紧接着日尔曼帝国的衰落,1919年春,刚成立的共和国委任建筑师瓦尔特·格罗皮斯在魏玛建立包浩斯学院,又叫国立建筑大楼,意思是要将建筑,艺术与工艺的教学揉合在一起。在这学院里康定斯基找到了一个差不多是为他而设的位置,因为教学是基于综合造型艺术对理论与实践两方面的要求之上的。这一主张并不是新的,但在此之前许多同样的尝试都失败了。在十九世纪下半叶,这些运动受了社会美学的激励,

关键词：包浩斯康定斯基皮斯社会美学瓦尔特日尔曼格罗理论与实践克利野兽派

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