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Neuroendocrine carcinoma of the stomach:A case report

World Journal of Gastrointestinal Surgery 2014年第4期6卷 77-79页

作者： Sang hyun Kang Kwang hee kim Sang hyuk Seo Min Sung An Tae Kwun ha ha Kyung Park Ki beom Bae Chang Soo Choi Sang hun Oh Young Kil Choi Department of Surgery Busan Paik HospitalInje University College of Medicine

Neuroendocrine carcinoma(NEC)is a rare tumor,comprising<1%of stomach cancers.A 55-year-old woman was referred to our hospital with biopsy-proven gastric cancer.A shallow ulcerative lesion was detected in the lesser curvature of the lower *** was suspected to be early gastric cancerⅡA+ⅡC ***,endoscopic submucosal dissection was *** was subsequently diagnosed with NEC,which is aggressive and carries a poor *** conducted a radical resection and a laparoscopic-assisted distal *** tumor had infiltrated the subserosal layer and6/42 lymph nodes were *** mitotic index was16/10 high power fields and the Ki-67 labeling index was 26%-50%.The final diagnosis of NEC was made according to the World health Organization 2010 *** was suspected of having jumping metastasis to the proximal *** patient was treated with an oral anticancer drug(5-flurouracil based drug)for2 *** patient has been followed up for 3 years without recurrence.

关键词： Neuroendocrine carcinoma Mitosis Ki-67 Gastrectomy Prognosis

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小型的末端重复反转录转座子(Terminal-Repeat Retrotransposon In Miniature,TRIM)元件和作为芸薹属DNA分子标记的潜在用途(英文)

小型的末端重复反转录转座子(Terminal-Repeat Retrotransposon I...

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第十二届国际油菜大会

作者： Tae-Jin Yang Soo-Jin Kwon Jung Sun kim beom-Soon Choi Yong Pyo Lim beom-Seok Park Department of Plant Science College of Agriculture and Life SciencesSeoul National UniversitySan 56-1Sillim-dongGwanak-gu Seoul151-744 Korea Brassica Genomics Team National Institute of Agricultural Biotechnology (NIAB)RDASuwon441-707Korea Department of Horticulture Chungnam National UniversityDaejeon305-764 Korea

基于对基因组中的末端重复反转录转座子元件广泛搜索和分离,我们分析了八个TRIM家族的特性:十字花科中四个来自甘蓝,四个来自拟南芥(包括以前分离的三个家族)。这些元件包括10057bp的末端重复序列(TR)和10000bp的内部序列。插入位点的... 详细信息

基于对基因组中的末端重复反转录转座子元件广泛搜索和分离,我们分析了八个TRIM家族的特性:十字花科中四个来自甘蓝,四个来自拟南芥(包括以前分离的三个家族)。这些元件包括10057bp的末端重复序列(TR)和10000bp的内部序列。插入位点的多态性可与十字花科的分类和每个元件插入的时间相关联。TRIM展示实验显示十字花科不同的属间和中国大白菜与萝卜F1代存在大量的多态性,这些结果表明TRIM元件可以作为DNA标记来研究芸薹属作物的基因组进化、基因组作图和品种保护。TRIM元件的其它优点包括序列短、优先插入常染色质,而且在拟南芥基因组中发布广泛。

关键词： Brassica Arabidopsis TRIM Retrotransposon DNA Markers

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韩国海岸防灾林发展趋势以及管理政策

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世界林业研究 2014年第3期27卷 67-71页

作者：金赞范朴起亨万勤琴全槿雨尹豪重金景河韩国国立山林科学院山林保全部韩国江原大学山林环境科学学院

韩国位于东北亚朝鲜半岛南部,3面环海,受海洋性气候影响。韩国海岸及周边区域内常年受到海风、海浪侵蚀,同时受盐害和海啸等灾害的侵袭。特别是2011年3月日本发生的特大海啸让韩国政府开始重新审视韩国的海岸防灾体系。文中简述了韩国... 详细信息

韩国位于东北亚朝鲜半岛南部,3面环海,受海洋性气候影响。韩国海岸及周边区域内常年受到海风、海浪侵蚀,同时受盐害和海啸等灾害的侵袭。特别是2011年3月日本发生的特大海啸让韩国政府开始重新审视韩国的海岸防灾体系。文中简述了韩国海岸防灾林建设及科学研究现状,着重介绍韩国2012—2050年海岸防灾林建设与管理中长期规划,通过实施该规划以期达到减少台风和海啸等自然灾害引起的生命与财产损失,增加生物多样性、扩大碳汇源、改善海岸景观的目标,并探讨韩国未来海岸防灾林政策方向及未来海岸防灾林战略。

关键词：海岸防灾林森林管理森林政策韩国

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基于辣椒基因组测序探究辣味在种群中的进化

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辣椒杂志 2014年第2期12卷 40-50页

作者： Seungill kim Minkyu Park Seon-In Yeom Yong-Min kim Je Min Lee Hyun-Ah Lee Eunyoung Seo Jaeyoung Choi Kyeongchae Cheong Ki-Tae kim Kyongyong Jung Gir-Won Lee Sang-Keun Oh Chungyun Bae Saet-Byul kim Hye-Young Lee Shin-Young kim Myung-Shin kim Byoung-Cheorl Kang Yeong Deuk Jo Hee-Bum Yang Hee-Jin Jeong Won-Hee Kang Jin-Kyung Kwon Chanseok Shin Jae Yun Lim June Hyun Park Jin Hoe Huh June-Sik kim Byung-Dong kim Oded Cohen Ilan Paran Mi Chung Suh Saet Buyl Lee Yeon-Ki kim Younhee Shin Seung-Jae Noh Junhyung Park Young Sam Seo Suk-Yoon Kwon Hyun A kim Jeong Mee Park Hyun-Jin kim Sang-Bong Choi Paul W Bosland Gregory Reeves Sung-Hwan Jo Bong-Woo Lee Hyung-Taeg Cho Hee-Seung Choi Min-Soo Lee Yeisoo Yu Yang Do Choi beom-Seok Park Allen van Deynze Hamid Ashrafi Theresa Hill Woo Taek kim Hyun-Sook Pai Hee Kyung Ahn Inhwa Yeam James J Giovannoni Jocelyn K C Rose Iben Sφrensen Sang-Jik Lee Ryan W kim Ik-Young Choi beom-Soon Choi Jong-Sung Lim Yong-Hwan Lee Doil Choi 刘峰张西露 Department of Plant Science Seoul National University Plant Genomics and Breeding Institute Seoul National University Department of Agricultural Biotechnology Seoul National University Department of Bioinformatics and Life Science Soongsil University Vegetable Breeding Research Center Seoul National University Agricultural Research Organization Institute of Plant Science Volcani Center Bet DaganIsrael. Agricultural Research Organization Institute of Plant Science Volcani Center Bet DaganIsrael Department of Bioenergy Science and Technology Chonnam National University Genomics Genetics Institute GreenGene BioTech Inc. Codes Division Insilicogen Inc. Ginseng Resources Research Laboratory Korea Ginseng Corporation Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology Division of Bioscience and Bioinformatics Myongji University Department of Plant and Environmental Sciences New Mexico State University Chile Pepper Institute New Mexico State University Seeders Inc. Department of Biological Sciences Seoul National University Arizona Genomics Institute University of Arizona Agricultural Genome Center National Academy of Agricultural Science Rural Development Administration Seed Biotechnology Center University of California Davis Davis California USA Department of Systems Biology Yonsei University Department of Horticulture and Breeding Andong National University US Department of Agriculture-Agricultural Research Service Robert W. Holley Center Ithaca New York USA Boyce Thompson Institute for Plant Research Cornell University Ithaca New York USA Department of Plant Biology Cornell University Ithaca New York USA Biotechnology Institute Nongwoo Bio Yeoju Korea Genome Center University of California Davis Davis California USA National Instrumentation Center for Environmental Management Seoul National University Seoul Korea 湖南省蔬菜研究所

辣椒(Capsicum annuum)是美洲最古老的驯化作物之一,在全世界被广泛种植。本研究对CM334(墨西哥地方品种)进行了全基因组测序和组装(覆盖度为186.6×),同时还对另外两个栽培种和一个野生种分别进行了重测序和从头(de novo)测序。结果表... 详细信息

辣椒(Capsicum annuum)是美洲最古老的驯化作物之一,在全世界被广泛种植。本研究对CM334(墨西哥地方品种)进行了全基因组测序和组装(覆盖度为186.6×),同时还对另外两个栽培种和一个野生种分别进行了重测序和从头(de novo)测序。结果表明辣椒基因组大小约为番茄的4倍,辣椒基因组上存在大量gypsy转座子和花椰菜病毒家族元件的积累。结合转录组综合分析认为,辣椒素合成酶基因表达模式的改变及新功能化是导致辣椒素生物合成的原因,研究还发现辣椒与番茄在乙烯合成及果实成熟调控方面存在明显不同的分子模式。辣椒参考基因组的发布为辣椒营养品质和药用价值的改善提供了重要平台。

关键词：基因组测序辣椒素参考基因 Capsicum 转座子辣椒果实分子模式生物合成基因表达模式基因组大小

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国际白菜基因组测序项目中的参考遗传图

国际白菜基因组测序项目中的参考遗传图

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第十二届国际油菜大会

作者： Su Ryun Choi Graham R.Teakle Prikshit Plaha Jeong Hee kim Charlotte J.Allender Elena Beynon Zhong Yun Piao Tae Ho Han Graham J.King Guy C.Barker Paul Hand Derek J.Lydiate Jacqui Batley Dave Edwards Thomas C.Osborn Dal Hoe Koo Jae Wook Bang beom-Seok Park Yong Pyo Lim Department of Horticulture Genome Research CenterChungnam National UniversityDaejeon 305-764Korea Warwick HRI University of WarwickWellesbourneWarwickCV35 9EFUK Department of Horticulture Genome Research CenterChungnam National UniversityDaejeon 305-764Korea Department of Horticulture Genome Research CenterChungnam National UniversityDaejeon 305-764Korea Warwick HRI University of WarwickWellesbourneWarwickCV35 9EFUK Saskatoon Research Centre Agriculture and Agri-Food Canada107 Science PlaceSaskatoonSKS7N3V3Canada Department of Horticulture Genome Research CenterChungnam National UniversityDaejeon 305-764Korea Department of Applied Plant Science Chonnam National UniversityGwangju 500-757Korea Warwick HRI University of WarwickWellesbourneWarwickCV35 9EFUK Warwick HRI University of WarwickWellesbourneWarwickCV35 9EFUK Warwick HRI University of WarwickWellesbourneWarwickCV35 9EFUK Saskatoon Research Centre Agriculture and Agri-Food Canada107 Science PlaceSaskatoonSKS7N3V3Canada Plant Biotechnology Centre Primary Industries Research VictoriaLa Trobe UniversityBundooraVictoria 3086Australia Plant Biotechnology Centre Primary Industries Research VictoriaLa Trobe UniversityBundooraVictoria 3086Australia Seminis Vegetable Seeds Inc. 37437 State Highway 16woodlandCA 95695USA Department of Biology Chungnam National UniversityDaejeon 305-764Korea Department of Biology Chungnam National UniversityDaejeon 305-764Korea Brassica Genomics Team National Institute of Agricultural BiotechnologySuwon 441-707Korea Department of Horticulture Genome Research CenterChungnam National UniversityDaejeon 305-764Korea

我们目前正在构建的大白菜遗传连锁图是国际白菜基因组测序项目作为骨架图,将用来序列重叠群的锚定工作。图谱是基于以遗传差异大的两个中国大白菜品种---“Chiifu”和”Kenshin”杂交得到的F1经花药培养而得到78个DH系构建的。目前,图...

我们目前正在构建的大白菜遗传连锁图是国际白菜基因组测序项目作为骨架图,将用来序列重叠群的锚定工作。图谱是基于以遗传差异大的两个中国大白菜品种---“Chiifu”和”Kenshin”杂交得到的F1经花药培养而得到78个DH系构建的。目前,图谱上一共定位了556个标记,其中包括278个AFLP、235个SSR、25个RAPD和18个ESTP、STS、CAPS标记。对本遗传图谱和甘蓝型油菜遗传图谱中的通用SSR标记进行了位置和方向比较,从而把确定的10个连锁群分别记为R1-R10,并与甘蓝型油菜的N1-N10相对应。同时,通过定位的235个通用SSR标记,我们还可以对来自白菜的A基因组和来自甘蓝型油菜的A基因组进行比较分析。通过与拟南芥基因组序列进行比较,选出了500个BAC克隆,作为部分最小跨度克隆。对这些BAC的测序工作已完成,并成为设计和发展SSR引物的一个重要序列来源。用这些BAC序列发展而来的SSR标记已被定位到了参考遗传图上——CKDH图谱。这些做为锚定用的SSR标记,将在遗传图和物理图的整合中起重要作用,同时也为随后BAC-BY-BAC的测序策略中构建重叠群提供种子BAC。这样一个参考图谱的成功构建将对国际社会中改良白菜以及其它芸薹属作物起重要作用。

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