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Dynamic phenotypic heterogeneity and the evolution of multiple RNA subtypes in hepatocellular carcinoma:the PLANET study

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National Science Review 2022年第3期9卷 96-109页

作者： Weiwei Zhai Hannah Lai Neslihan Arife Kaya Jianbin Chen Hechuan Yang Bingxin Lu Jia Qi Lim Siming Ma Sin Chi Chew Khi Pin Chua Jacob Josiah Santiago Alvarez Pauline Jieqi Chen Mei Mei Chang Lingyan Wu Brian K.P.Goh Alexander Yaw-Fui Chung Chung Yip Chan Peng Chung Cheow Ser Yee Lee Juinn Huar Kam Alfred Wei-Chieh Kow Iyer Shridhar Ganpathi Rawisak Chanwat Jidapa Thammasiri Boon Koon Yoong Diana bee-Lan ong Vanessa H.de Villa Rouchelle D.Dela Cruz Tracy Jiezhen Loh Wei Keat Wan Zeng Zeng Anders Jacobsen Skanderup Yin Huei Pang Krishnakumar Madhavan Tony Kiat-Hon Lim Glenn Bonney Wei Qiang Leow Valerie Chew Yock Young Dan Wai Leong Tam Han Chong Toh Roger Sik-Yin Foo Pierce Kah-Hoe Chow Genome Institute of Singapore Agency for Science Technology and Research Key Laboratory of Zoological Systematics and Evolution Institute of Zoology Chinese Academy of Sciences Center for Excellence in Animal Evolution and Genetics Chinese Academy of Sciences School of Biological Sciences Nanyang Technological University Division of Biosciences Faculty of Life Sciences Division of Surgery and Surgical Oncology National Cancer Centre Department of Hepato-Pancreato-Biliary and Transplant Surgery Singapore General Hospital Division of Hepatobiliary and Pancreatic Surgery Department of Surgery University Surgical Cluster National University Health System Hepato-Pancreato-Biliary Surgery Unit Department of Surgery National Cancer Institute Division of Pathology National Cancer Institute Department of Surgery Faculty of Medicine University of Malaya Department of Surgery and Center for Liver Disease Management and Transplantation The Medical City 13. Department of Laboratories The Medical City Department of Pathology Singapore General Hospital Institute for Infocomm Research ASTAR Department of Pathology National University Health System Translational Immunology Institute (TII) Sing Health Duke-NUS Academic Medical Centre Division of Gastroenterology and Hepatology University Medicine Cluster National University Hospital Department of Biochemistry Yong Loo Lin School of Medicine National University of Singapore Cancer Science Institute of Singapore National University of Singapore Division of Medical Oncology National Cancer Center Singapore Cardiovascular Research Institute National University of Singapore National University Healthcare System Singhealth-Duke-NUS Academic Surgery Program Duke-NUS Graduate Medical School Institute of Molecular and Cell Biology Agency for Science Technology and Research

Intra-tumor heterogeneity(ITH) is a key challenge in cancer treatment, but previous studies have focused mainly on the genomic alterations without exploring phenotypic(transcriptomic and immune)heterogeneity. Using one of the largest prospective surgical cohorts for hepatocellular carcinoma(HCC)with multi-region sampling, we sequenced whole genomes and paired transcriptomes from 67 HCC patients(331 samples). We found that while genomic ITH was rather constant across stages, phenotypic ITH had a very different trajectory and quickly diversified in stage Ⅱ patients. Most strikingly, 30% of patients were found to contain more than one transcriptomic subtype within a single tumor. Such phenotypic ITH was found to be much more informative in predicting patient survival than genomic ITH and explains the poor efficacy of single-target systemic therapies in HCC. Taken together, we not only revealed an unprecedentedly dynamic landscape of phenotypic heterogeneity in HCC, but also highlighted the importance of studying phenotypic evolution across cancer types.

关键词： NADH oxidase H2O2 production oxidative phosphorylation

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旋光器及λ/2波片复合退偏效应的研究

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激光杂志 2013年第1期34卷 13-14页

作者：刘前宋连科刘彩彩曲阜师范大学激光研究所

为了探索一种有效的退偏方法,利用密勒矩阵和斯托克斯矢量分析了旋转波片和旋光器对单色光的退偏效应,阐述了退偏机理,推导出了旋转λ/2波片和旋光器的复合退偏的理论表达形式,并用平均密勒矩阵和斯托克斯矢量建立了退偏度和各个参量的... 详细信息

为了探索一种有效的退偏方法,利用密勒矩阵和斯托克斯矢量分析了旋转波片和旋光器对单色光的退偏效应,阐述了退偏机理,推导出了旋转λ/2波片和旋光器的复合退偏的理论表达形式,并用平均密勒矩阵和斯托克斯矢量建立了退偏度和各个参量的关系。结果表明,这种设计对线偏振光的退偏状况较好,对退偏器的设计与研究有一定的参考价值。

关键词：旋转波片退偏器旋光器密勒矩阵

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超启发式人工蜂群算法求解多场景鲁棒分布式置换流水车间调度问题

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控制理论与应用 2023年第4期40卷 713-723页

作者：连戈朱荣钱斌吴绍云胡蓉昆明理工大学信息工程与自动化学院云南昆明650500 昆明理工大学、云南省人工智能重点实验室云南昆明650500 昆明理工大学城市学院云南昆明650051 云南玉溪水松纸厂云南玉溪653100

本文考虑现实中广泛存在的加工时间不确定的分布式置换流水车间调度问题(DPFSP),研究如何建立问题模型和设计求解算法,方可确保算法最终获得的解在多个典型DPFSP场景下,均具有能满足客户期望的较小优化目标值(即makespan值).在问题建模... 详细信息

本文考虑现实中广泛存在的加工时间不确定的分布式置换流水车间调度问题(DPFSP),研究如何建立问题模型和设计求解算法,方可确保算法最终获得的解在多个典型DPFSP场景下,均具有能满足客户期望的较小优化目标值(即makespan值).在问题建模方面,首先,采用场景法构建多个不同典型场景以组成场景集(每个场景对应1个具有不同加工时间的DPFSP),并设定合适的makespan值作为场景阈值,用于在评价问题解时从场景集中动态筛选出“坏”场景子集;其次,在常规优化目标makespan的基础上,结合“坏”场景子集概念提出可实现鲁棒调度的新型优化目标,用于引导算法每代加强对当前“坏”场景子集中每个DPFSP场景对应解空间的搜索;然后,结合所提的新型优化目标,建立基于多场景的鲁棒DPFSP(MSRDPFSP).在算法设计方面,提出一种超启发式人工蜂群算法(HHABC)对MSRDPFSP进行求解.HHABC分为高、低两层结构,其中低层设计6种启发式操作(HO),高层采用人工蜂群算法控制和选择低层HOs来不断生成新的混合启发式算法,从而实现在不同场景对应解空间中的较深入搜索.在不同规模测试问题上的仿真实验与算法对比,验证了HHABC的有效性.

关键词：分布式置换流水车间调度问题多场景鲁棒调度人工蜂群算法超启发式算法

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鉴别蜂蜜真实属性实时荧光PCR法的建立

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蜜蜂杂志 2022年第7期42卷 1-7页

作者：林碧莲福建省产品质量检验研究院国家加工食品质量监督检验中心(福州)

通过建立能够鉴别完全掺假蜂蜜的实时荧光PCR检测方法，为打击掺假蜂蜜的不良市场风气提供技术储备。筛选显花基因NADH、油菜基因和龙眼基因的引物探针；通过验证这三对引物探针的特异性、灵敏度来确定其可行性；提取蜂蜜的DNA进行这三... 详细信息

通过建立能够鉴别完全掺假蜂蜜的实时荧光PCR检测方法，为打击掺假蜂蜜的不良市场风气提供技术储备。筛选显花基因NADH、油菜基因和龙眼基因的引物探针；通过验证这三对引物探针的特异性、灵敏度来确定其可行性；提取蜂蜜的DNA进行这三组实时荧光PCR法的测试，同时采用传统蜂蜜感官检测法辨别真假蜂蜜，比较两者方法。结果显示三组引物探针的特异性强，灵敏度分别为0.0001ng/μL、0.01 ng/μL和0.1 ng/μL；蜂蜜的DNA浓度与花粉粒数目呈正相关；NADH基因对15份蜂蜜样品的检测结果与传统检测法结果一致，一份样品镜检未见到花粉粒，其实时荧光PCR结果为阴性，掺假率达6.67%;6份油菜蜂蜜均检出油菜源性成分；6份龙眼蜂蜜中只有有3份检出龙眼源性成分。结论认为相对传统方法，该方法安全性好、操作简单、灵敏度高、结果直观，能够鉴别完全掺假蜂蜜，为蜂蜜掺假检测提供技术支持。

关键词：蜂蜜实时荧光PCR NADH 油菜、龙眼、掺假

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宋元时期中日绘画的传播与交流

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西北大学学报（哲学社会科学版） 2012年第3期42卷 168-170页

作者：王莲扬州大学艺术学院江苏扬州225000

宋元时期中日绘画的传播与交流对两国绘画的发展意义十分重大。日本从中国学得绘画艺术并进一步发展成为自己民族的绘画风格,而中国从中得到是经验和教训。"吸养和寻根"是中国绘画发展的最好途径,日本绘画发展的成功经验给了我们很多的... 详细信息

宋元时期中日绘画的传播与交流对两国绘画的发展意义十分重大。日本从中国学得绘画艺术并进一步发展成为自己民族的绘画风格,而中国从中得到是经验和教训。"吸养和寻根"是中国绘画发展的最好途径,日本绘画发展的成功经验给了我们很多的启示、增强了我们勇往的信心。

关键词：宋元时期中日绘画传播与交流

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基于改进果蝇算法优化BP神经网络的接地网腐蚀速率预测模型

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电测与仪表 2022年第11期59卷 71-78页

作者：程宏伟高莲于虹李鹏云南大学信息学院昆明650500 云南电网有限责任公司电力科学研究院昆明650500

为进一步提高接地网腐蚀速率的预测精度,解决传统模型易陷入局部最优且随机初始化模型参数影响预测准确性和稳定性的问题。文中首先将混沌映射、动态搜索半径策略和优化气味浓度判定公式引入果蝇优化算法(Fruit Fly Optimization Algori... 详细信息

为进一步提高接地网腐蚀速率的预测精度,解决传统模型易陷入局部最优且随机初始化模型参数影响预测准确性和稳定性的问题。文中首先将混沌映射、动态搜索半径策略和优化气味浓度判定公式引入果蝇优化算法(Fruit Fly Optimization Algorithm,FOA)得到改进后的果蝇优化算法(Update Fruit Fly Optimization Algorithm,UFOA);然后利用UFOA优化BP神经网络的初始权值和阈值,建立基于UFOA优化的BP神经网络接地网腐蚀速率预测模型(UFOA-BP);最后以重庆24座变电站的接地网数据进行实验验证。结果表明相对FOA优化的BP神经网络模型、BP神经网络模型、人工蜂群算法优化的支持向量机模型和广义回归神经网络模型,文中提出的UFOA-BP模型在预测精度和模型稳定性方面均优于其他四种模型,验证了该模型的有效性和可行性,为运维人员提前发现接地网安全隐患,并安排检修,进而保障电网安全稳定运行提供帮助。

关键词：接地网果蝇算法腐蚀速率混沌映射动态半径

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Basal Energy Expenditure of Chinese Healthy Adults:Comparison of Measured and Predicted Values

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Biomedical and Environmental Sciences 2020年第8期33卷 566-572页

作者： MAO De Qian WU Jing Huan HUANG Cheng Yu LI Ke Ji LIU Xiao Li ZHANG Shi lian WANG Yan Ling CHEN Wei LI Ming YANG Xiao Guang PIAO Jian Hua Key Laboratory of Trace Element Nutrition of National Health Commission of the People’s Republic of China Department of Trace Element NutritionNational Institute for Nutrition and HealthChinese Center for Disease Control and PreventionBeijing 100050China West China School of Public Health Sichuan UniversityChengdu 610041SichuanChina School of Public Health Peking UniversityBeijing 100191China Shenzhen Center for Chronic Disease Control Shenzhen 518055GuangdongChina Hebei Province Center for Disease Prevention and Control Shijiazhuang 050021HebeiChina Mudanjiang Center for Disease Prevention and Control Mudanjiang 157020HeilongjiangChina Peking Union Medical College Hospital Beijing 100730China

Objective This study aimed to measure the basal energy expenditure(bee)of Chinese healthy adults and establish an accurate predictive equation for this *** In total,470 Chinese healthy adults had their bee measured using the Cosmed K4b2 portable metabolic *** linear regression analysis was applied to develop new optimal equations for predicting *** bias,accuracy rate,concordance correlation coefficient(CCC),and root mean square error(RMSE)were used to evaluate the accuracy of the predictive *** There was a significant difference in bee between males and females,with 5,954 kJ/d and 5,089 kJ/d,*** living in rural areas expended significantly higher bee(5,885 kJ/d)than those in urban areas(5,279 kJ/d).Previous equations developed by Henry,Schofield,Harris-Benedict(HB),and Liu overestimated the bee of Chinese healthy *** new equations derived from the present study displayed the smallest average bias and RMSE from the measured basal energy expenditure(mbee).The CCC of the new equations was higher than other predictive equations,but it was lower than *** was no significant difference in the accuracy rate among all predictive *** Sex and regional differences in bee were observed in Chinese healthy *** the widely used previous predictive equations nor the one derived in the present study were accurate enough for estimating the bee of Chinese healthy *** study is required to develop more accurate equations for predicting the bee of Chinese healthy adults aged between 20–45 years.

关键词： Basal energy expenditure Chinese healthy adults Indirect calorimetry Predictive equations

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基于CNN-ABC-BiGRU的火电厂数据分析与应用研究

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电子设计工程 2023年第22期31卷 11-15,20页

作者：李萌宗学军连莲何戡杨忠君沈阳化工大学信息工程学院辽宁沈阳110142

在大数据环境下,现代企业生产数据的挖掘与利用对提升企业经济效益与提质增效尤为重要。目前企业工艺数据的利用与维护,多依赖专家经验与传统数据分析方法,针对这些企业数据处理与分析存在的局限性和共性问题,以大数据环境下火电厂锅炉... 详细信息

在大数据环境下,现代企业生产数据的挖掘与利用对提升企业经济效益与提质增效尤为重要。目前企业工艺数据的利用与维护,多依赖专家经验与传统数据分析方法,针对这些企业数据处理与分析存在的局限性和共性问题,以大数据环境下火电厂锅炉系统运行状态预测为例,提出了一种基于Hadoop框架的卷积神经网络(Convolutional Neural Networks,CNN)-人工蜂群算法(Artificial bee Colony,ABC)-双向门控循环网络(Bidirectional Gate Recurrent Unit,BiGRU)模型的主蒸汽流量预测方法。基于分布式预测模型对辽宁某电厂监测数据进行分析,结果表明,在预测波动较大的主蒸汽流量时,该方法在提升速度的同时,相较于传统BP、LSTM、GRU、BiGRU、CNN-BiGRU等模型,MAE值分别降低了61.188%、51.348%、46.342%、38.005%和20.560%,预测精度有所提高。

关键词：数据挖掘火电厂锅炉系统 CNN-ABC-BiGRU Hadoop框架

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一种蜜蜂交配优化聚类算法

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电子学报 2014年第12期42卷 2435-2441页

作者：罗可李莲周博翔长沙理工大学计算机与通信工程学院湖南长沙410114

K-means算法因简单、高速等特点而被广泛应用,但该算法仍然存在依赖于初始聚类中心、易陷入局部最优等缺陷.为此,提出了一种蜜蜂交配优化聚类算法.该算法利用密度和距离初始化蜂群,并将局部搜索能力较强的粗糙集聚类算法作为工蜂的一种... 详细信息

K-means算法因简单、高速等特点而被广泛应用,但该算法仍然存在依赖于初始聚类中心、易陷入局部最优等缺陷.为此,提出了一种蜜蜂交配优化聚类算法.该算法利用密度和距离初始化蜂群,并将局部搜索能力较强的粗糙集聚类算法作为工蜂的一种编码,以增强算法的局部搜索能力,最后在迭代过程中不断引入随机种群,增加种群的多样性,提高算法的全局寻优能力.实验结果表明,该算法不仅能有效抑制早熟收敛,而且具有较强的稳定性,较好的聚类效果.

关键词：聚类蜜蜂交配优化粗糙集 K-means

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In Vitro Study of Influence of Mimic Cardiac Rate on Hydrodynamics of the Different Mechanical Cardiac Valve Prostheses

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Chinese Journal of Biomedical Engineering(English Edition) 2005年第1期14卷 17-21页

作者： CHUYin-ping CHENGJin-lian CHENRu-kun FANYu-bo PUFang DepartmentofThoracic＆CardiovascularSurgery SecondHospitalAffiliatedShanxiMedicalUniversityTaiynan030001China DepartmentofNursingResearch FirstHospitalAffiliatedShanxiMedicalUniversityTaiyuan030001China DepartmentofThoracic＆CardiovascularSurgery SecondHospitalofZhejiangUniversityMedicalCollegeHangzhou310009China BiomedicalEngineeringCenter SichnanUniversityChengdu610065China

Objective:To assess the influe nce of mimic cardiac rate on hydrodynamics of the different mechanical prostheti c cardiac ***:US-made CarboMedics bile aflet valve and China-made Jiuling bileafle t valve and C-L tilting disc valve have been tested in a pulsatile flow simulat or in the aortic position. The testing condition was set at the mimic cardiac r ate of 55 beats/min,75 beats/min,100beats/min and a constant mimic cardiac out put of 4L/min. The mean pressure differences(ΔP),leakage volumes (LEV) and closi ng volumes(CLV) across each valve,and the effective orifice areas(EOA) have bee n ***:Within the range of physiology, the ΔP,LEV and CLV were falling as the increasing of mimic cardiac rate,and the extent of variance was larger. The EOA was increasing with the increase of the mimic cardiac rate. It is a differe nt response as the altering of the cardiac rate for the different type of the me chanical prosthetic cardiac ***:The change of the mimic cardiac rate can affect the hydrodynamics of the mechanical prosthetic cardiac valves. The hydrodynamics of the bileaflet valve prosthesis is better than the tilting disc valve.

关键词：心率流体力学心脏导管生物医学工程

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