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Seasonal and Genetic Characteristics of Human Metapneumovirus Circulating—Henan Province,China,2017-2023

China CDC weekly 2024年第20期6卷 450-456,I0001页

作者： Zhibo Xie Zhen Zhu Jin Xu Naiying Mao Aili Cui Wenhui Wang Yage Wang Zhibo Zhang baicheng xia Haoran Wang Zhen Sun Yan Zhang National Key Laboratory of Intelligent Tracking and Forecasting for Infectious Diseases NHC Key Laboratory of Medical Virology and Viral DiseaseNational Institute for Viral Disease Control and PreventionChinese Center for Disease Control and PreventionBeijingChina Henan Provincial Center for Disease Control and Prevention Luohe CityHenan ProvinceChina Luohe Center for Disease Control and Prevention Luohe CityHenan ProvinceChina Luohe Central Hospital Luohe CityHenan ProvinceChina

Introduction:This study examines the seasonal and genetic characteristics of human metapneumovirus(HMPV)in Henan from 2017 to ***:Samples from patients with acute respiratory infection(ARI)testing positive for HMPV were subjected to real-time reverse transcription polymerase chain reaction The G gene was amplified and sequenced from these samples for epidemiological and phylogenetic ***:We enrolled 2,707 ARI patients from October 2017 to March 2023,finding an HMPV positivity rate of 6.17%(167/2,707).Children under five exhibited the highest infection rate at 7.78%(138/1,774).The 2018 and 2019 HMPV outbreaks predominantly occurred in spring(March to May),with peak positivity rates of 31.11%in May 2018 and 19.57%in May 2019.A notable increase occurred in November 2020,when positivity reached a historic high of 42.11%,continuing until January *** February 2021 through March 2023,no significant seasonal peaks were observed,with rates ranging from 0%to 8.70%.Out of 81 G gene sequences analyzed,46.91%(38/81)were identified as subtype A(A2c:45.67%,37/81;A2b:1.23%,1/81)and 53.09%(43/81)as subtype B(B1:9.88%,8/81;B2:43.21%,35/81).Notably,an AAABBA switch pattern was observed in HMPV *** dominant strains were A2c111nt-dup in subtype A and B2 in subtype ***:Six years of surveillance in Henan Province has detailed the seasonal and genetic dynamics of HMPV,contributing valuable insights for the control and prevention of HMPV infections in *** findings support the development of targeted HMPV vaccines and immunization strategies.

关键词： prevention finding seasonal

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An outbreak of rhinovirus infection in a primary school in Shenyang City,China,in 2022

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Biosafety and Health 2024年第5期6卷 298-303页

作者： Yage Wang Jiayuan Liang Zhibo Xie Bing Wang Jinhua Song baicheng xia Huiling Wang Yao Zhang Ye Chen Ling Chen Shi Cong Yu Liu Aili Cui Yan Zhang National Key Laboratory of Intlligent Tracking and Forecasting for Infectious Diseases NHC Key Laboratory of Medical Virology and Viral DiseasesNational Institute for Viral Disease Control and PreventionChinese Center for Disease Control and PreventionBeijing 102206China Liaoning Provincial Center for Disease Prevention and Control Shenyang 110000China Shenyang Prefecture Center for Disease Control and Prevention Shenyang 110031China Shenyang Medical Cllege Shenyang 110034China Yuhong District Center for Disease Control and Prevention Shenyang 110146China

Rhinovirus(RV)is a common pathogen that causes respiratory tract infection and can cause outbreaks in hos-pitals and welfare institutions.A cluster of respiratory diseases occurred in a primary school in Shenyang City,Liaoning Province,China,in *** this outbreak,a total of 31 students had symptoms similar to those of upper respiratory tract infection,mainly cough and sore *** them,27 throat swabs were collected and identified for respiratory pathogens by TaqMan low-density array(TLDA),quantitative real-time poly-merase chain reaction(PCR),reverse transcription-nested PCR and whole-genome *** of the 27 specimens,24 tested positive for RV,and 21 RV viral protein 1 sequences were obtained,of which 15(71.43%)were identified as RV-A49,while 2 RV-A20 and 4 sequences from 2 specimens were RV-A30 coin-fected with *** addition,one whole-genome sequence(WGS)of RV-A49 was obtained,and three unique amino acid mutations were found compared to 23 WGS of RV-A49 from *** conclusion,this outbreak of upper respiratory tract infection is caused by RV,mainly RV-A49.

关键词： Rhinoviruses(RV) Rhinoviruses-A49 type Outbreak Primary school Respiratory tract infection

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Epidemiological Characteristics of Human Parainfluenza Viruses Infections-China,2019-2023

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China CDC weekly 2024年第12期6卷 235-241,I0003,I0004页

作者： Yixuan Gao Yingwei Ma Daxing Feng Feng Zhang Biao Wang xiaoqing Liu Bing Zhu Hui Xie Linqing Zhao xiaoru Long Ying Chen Bing Wang Jie Jiang Zhen Zhu Yan Zhang Aili Cui baicheng xia Naiying Mao National Key Laboratory of Intelligent Tracking and Forecasting for Infectious Diseases National Institute for Viral Disease Control and PreventionChinese Center for Disease Control and PreventionBeijingChina Precision Medicine Research Center Children’s Hospital of ChangchunChangchun CityJilin ProvinceChina Henan Provincial Center for Disease Control and Prevention Zhengzhou CityHenan ProvinceChina Laboratory of Viral Diseases Qingdao Municipal Centre for Disease Control and PreventionQingdao CityShandong ProvinceChina Virus Laboratory Gansu Provincial Center for Disease Control and PreventionLanzhou CityGansu ProvinceChina Jiangxi Provincial Center for Disease Control and Prevention Nanchang CityGansu ProvinceChina Virus Laboratory Guangzhou Women and Children’s Medical CenterGuangzhou Medical UniversityGuangzhou CityGuangdong ProvinceChina Institute for Immunization and Prevention Beijing Center for Disease Prevention and ControlAcademy for Preventive MedicineInstitute of Tuberculosis Control Research and PreventionBeijingChina Laboratory of Virology Beijing Key Laboratory of Etiology of Viral Diseases in ChildrenCapital Institute of PediatricsBeijingChina Department of Infection Children’s Hospital of Chongqing Medical UniversityChongqingChina Inner Mongolia Autonomous Region Comprehensive Center for Disease Control and Prevention Hohhot CityInner Mongolia Autonomous RegionChina Shenyang Prefecture Center for Disease Control and Prevention Shenyang CityLiaoning ProvinceChina

Introduction:A retrospective study based on sentinel surveillance was conducted in 10 provinciallevel administrative divisions(PLADs)in China to enhance the understanding of the epidemiological characteristics of human parainfluenza viruses(HPIVs).Methods:From January 2019 to June 2023,respiratory specimens were collected from individuals with acute respiratory infections(ARIs)and screened for four HPIVs serotypes and other common respiratory viruses using multiplex real-time polymerase chain reaction(PCR).This study analyzed the association of HPIVs infections with seasonal patterns,geographical distribution,demographic profiles,clinical features,and co-infection ***:During the study period,a total of 12,866 ARIs were *** overall detection rate of HPIVs was 6.15%,varying from 5.04%in 2022 to 9.70%in *** median age of HPIVs-infected patients was 3 ***2 was more prevalent among individuals aged 5–17 years(42.57%),while HPIV4 was more common in those over 65 years(12.24%).HPIV3(54.16%)and HPIV1(27.18%)were the predominant serotypes,and their prevalence exhibited significant seasonal fluctuations postcoronavirus disease 2019(COVID-19)*** peak of HPIV3 shifted three months later in 2020 compared to 2019 and returned to a summer peak *** peaks of HPIV1 were observed in 2021 following the peak of ***,coinfections were frequent in HPIVs cases(overall rate:22.12%),with human rhinovirus being the most common co-infecting ***:The prevalence of HPIVs in China was predominantly due to HPIV3 and HPIV1,and their seasonal patterns were altered by pandemic ***,continuous surveillance of HPIVs is essential.

关键词： prevalence seasonal Human

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Genomic Surveillance for SARS-CoV-2 Variants: Dominance of XBB Replacement — China, January–June 2023

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China CDC weekly 2024年第15期6卷 324-331页

作者： Yenan Feng Qiudong Su Lili Li xiaozhou He Peihua Niu xiaojuan Guo xiang Zhao Jing Tang Zhiyuan Jia Ji Wang Changcheng Wu baicheng xia Zhixiao Chen Yuchao Wu Jing Yang Songqi Chen Cao Chen Shiwen Wang xiaoping Dong National Key Laboratory of Intelligent Tracking and Forecasting for Infectious Diseases National Institute for Viral Disease Control and PreventionChinese Center for Disease Control and PreventionBeijingChina NHC Key Laboratory of Medical Virology and Viral Diseases National Institute for Viral Disease Control and PreventionChinese Center for Disease Control and PreventionBeijingChina

Introduction:In the first half of 2023,a global shift was observed towards the predominance of XBB *** faced a significant epidemic between late 2022 and early 2023 due to Omicron subvariants BA.5.2 and *** study aims to depict the evolving variant distribution among provincial-level administrative divisions(PLADs)in China and explore the factors driving the predominance of XBB ***:Sequences from local and imported coronavirus disease 2019(COVID-19)cases recorded between January 1 and June 30,2023,were *** study analyzed the changing distribution of viral variants and assessed how the prior dominance of specific variants,XBB subvariants,and imported cases influenced the prevalence of the XBB replacement ***:A total of 56,486 sequences were obtained from local cases,and 8,669 sequences were from imported *** in April,there was a shift in the prevalence of XBB from imported to local cases,with varying dominance among *** PLADs previously high in BF.7,the rise of XBB was delayed.A positive correlation was found between XBB proportions in imported cases from January to March and local cases in *** distribution pattern of XBB subvariants differed between local and imported cases within the same *** significant differences were noted in the replacement rates of XBB ***:The timing of XBB dominance differed among various PLADs in China in the first half of 2023,correlating closely with the prevalence of XBB variants among imported cases.

关键词： dominance imported distribution

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小麦胁迫相关基因TaSF3B2的克隆及表达特性分析

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西北植物学报 2016年第8期36卷 1528-1533页

作者：黄鑫夏百成龙翔宇海南大学农学院海口570228 中国热带农业科学院橡胶研究所海南儋州571737

为研究小麦剪接因子在逆境胁迫中的作用,通过分析小麦抗性相关EST数据库,筛选并克隆获得1条2 327bp的核苷酸序列。该序列包含了一个1 854bp的开放阅读框,编码一个由617个氨基酸残基组成的蛋白,氨基酸同源比对发现,该蛋白含有GUS1结构域(... 详细信息

为研究小麦剪接因子在逆境胁迫中的作用,通过分析小麦抗性相关EST数据库,筛选并克隆获得1条2 327bp的核苷酸序列。该序列包含了一个1 854bp的开放阅读框,编码一个由617个氨基酸残基组成的蛋白,氨基酸同源比对发现,该蛋白含有GUS1结构域(Splicing Factor 3B,Subunit 2),属于剪接因子3b亚基中的一员,将该蛋白命名为TaSF3B2。生物信息学分析显示,TaSF3B2平均亲水系数(GRAVY)为-0.895,不稳定系数为43.92,且在细胞核中发挥作用的可能性最大。实时荧光定量PCR分析表明,TaSF3B2基因在不同组织中存在差异表达,不同发育时期其表达也存在差异;在幼苗叶片中,该基因表达受高盐、低温、条锈菌、干旱及ABA激素胁迫明显下调表达,而在幼苗根中变化不明显。推测TaSF3B2基因参与了小麦正常条件下的生长发育,同时在小麦应对逆境胁迫的过程中具有重要的作用。

关键词：小麦 TaSF3B2 基因克隆生物信息学基因表达

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重庆水电流域夏季降水模态分析及其水汽输送特征

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高原气象 2024年第2期43卷 421-433页

作者：刘祥何军庞玥孔德璇夏佰成中国气象局气候资源经济转化重点开放实验室重庆市气象服务中心重庆401147 中国气象局气候资源经济转化重点开放实验室重庆市气象台重庆401147 贵州省黔西南布依族苗族自治州气象局贵州兴义562400

水电是重庆重要的产电形式之一,研究重庆水电流域夏季降水的强弱和分布对做好夏季电力气象保障服务具有重要意义,目前的研究主要聚焦于西南地区或四川盆地,较少以水电流域为单位进行研究,对做好精细化的电力气象服务参考作用有限。本文... 详细信息

水电是重庆重要的产电形式之一,研究重庆水电流域夏季降水的强弱和分布对做好夏季电力气象保障服务具有重要意义,目前的研究主要聚焦于西南地区或四川盆地,较少以水电流域为单位进行研究,对做好精细化的电力气象服务参考作用有限。本文利用1981-2022年重庆水电流域115个气象观测站点降水数据、ERA5再分析资料,通过EOF分析、回归分析、合成分析等方法,对重庆水电流域夏季降水模态和成因进行了分析,并进一步探究了各模态水汽输送特征。结果表明:重庆水电流域夏季降水主要有全区一致型和南北反向型两个模态,全区一致型中一致偏多型环流特征主要表现为中高纬高度场波动振幅较大,中纬度西风急流偏强、偏南,中低纬南亚高压偏强、偏南,西太平洋副热带高压偏西,同时流域内配合有异常的西南水汽输送和水汽辐合,一致偏少型则与之相反,此外,影响全区一致型的水汽通道共有4条,分别为孟加拉湾西部南风通道、中南半岛北部的南风通道、高原东侧的西风通道、菲律宾以西的东风通道,其中以菲律宾以西的东风通道影响最为显著;南北反向型中北多南少型环流特征主要表现为中高纬高度场西高东低,中纬度西风急流偏北,中低纬南亚高压表现为东部型,西太平洋副热带高压容易西伸、北跳,同时流域内配合有较强的向北输送的水汽通量,且北部有水汽辐合、南部有水汽辐散,南多北少型则与之相反,此外,影响南北反向型的水汽通道共有2条,分别为流域中部南风通道和菲律宾东部南风通道,且二者表现出一致变化的特征。

关键词：水电流域降水模态水汽输送环流

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DNA发夹在拉力作用下的热力学性质（英文）

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中国科学技术大学学报 2017年第12期47卷 996-1001,1028页

作者：张冬华王佳军夏佰成昱万程中国科学技术大学高分子科学与工程系安徽合肥230026

利用二维朗之万动力学模拟方法研究了DNA发夹在拉力作用下的相转变行为.研究发现DNA发夹处于展开状态的概率与所施加的拉力大小存在定量关系,并且可以通过统计力学的角度进行解释.通过选取不同的参数组合,并进行大量的模拟实验,分别得到... 详细信息

利用二维朗之万动力学模拟方法研究了DNA发夹在拉力作用下的相转变行为.研究发现DNA发夹处于展开状态的概率与所施加的拉力大小存在定量关系,并且可以通过统计力学的角度进行解释.通过选取不同的参数组合,并进行大量的模拟实验,分别得到了DNA发夹的拉力-碱基配对强度和拉力-温度相图.所得相图表明碱基配对强度增强或温度降低都有利于DNA发夹处于折叠状态.这些相图非常有益于加深人们对DNA发夹在拉力作用下的热力学性质的理解.

关键词： DNA发夹拉力相图朗之万动力学模拟

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利用Gibson DNA组装技术构建人5型腺病毒感染性克隆

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病毒学报 2018年第3期34卷 349-355页

作者：邹小辉夏百成郭小娟王敏鲁茁壮洪涛中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所、传染病预防控制国家重点实验室北京100052 潍坊医学院公共卫生与管理学院潍坊261053

为了构建人5型腺病毒（HAdV-5）的感染性克隆,我们使用了Gibson DNA组装技术。设计1对引物用于扩增质粒骨架（包含卡那霉素抗性基因和质粒的复制起点,KAN-ORI）,在引物的5’端添加HAdV-5基因组末端序列（约30NT）和Pac I位点,以携带卡... 详细信息

为了构建人5型腺病毒（HAdV-5）的感染性克隆,我们使用了Gibson DNA组装技术。设计1对引物用于扩增质粒骨架（包含卡那霉素抗性基因和质粒的复制起点,KAN-ORI）,在引物的5’端添加HAdV-5基因组末端序列（约30NT）和Pac I位点,以携带卡那霉素抗性基因的pShuttle-CMV质粒为模板,PCR扩增得到KAN-ORI片段,该片段的两端均含有约30bp的HAdV-5基因组序列。将KAN-ORI片段与利用野毒扩增纯化的HAdV-5基因组混合,进行Gibson DNA组装反应;反应产物直接转化***感受态细胞,涂布含卡那霉素的LB琼脂平板。挑取菌落,提取质粒,命名为pKAd5。限制性酶切鉴定的结果显示,所鉴定的质粒均含有完整的HAdV-5基因组。使用Pac I酶切线性化pKAd5,利用脂质体转染293细胞,转染4d后单层细胞出现病毒噬斑。拯救的病毒能够在HEp-2细胞扩增;电子显微镜观察呈现典型的腺病毒形态;提取病毒DNA,酶切鉴定的结果与预期的HAdV-5基因组相同,证实HAdV-5得到成功拯救。上述研究结果说明使用Gibson DNA组装技术构建HAdV-5感染性克隆简便易行,为其他DNA病毒基因组的克隆提供了新思路。

关键词：人5型腺病毒(HAdV-5) Gibson DNA组装感染性克隆病毒拯救透射电子显微镜

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人呼吸道合胞病毒监测体系的研究现状

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中华预防医学杂志 2024年第7期58卷 967-982页

作者：夏百成从兵兵王慧玲马士豪宋金华王娜张燕李有传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所麻疹室北京102206 南京医科大学公共卫生学院国家疫苗研发创新平台南京211166

为实时监测我国不同地理区域流行的HRSV流行特征和疾病负担,进一步制定更加精准有效的预防干预策略,中国迫切需要建立覆盖全国的HRSV实时监测系统。本研究结合国内外HRSV监测研究及其体系现状和我国现有的监测框架,根据监测目的不同,并... 详细信息

为实时监测我国不同地理区域流行的HRSV流行特征和疾病负担,进一步制定更加精准有效的预防干预策略,中国迫切需要建立覆盖全国的HRSV实时监测系统。本研究结合国内外HRSV监测研究及其体系现状和我国现有的监测框架,根据监测目的不同,并考虑到实施的可行性,提出适用于我国的HRSV监测模式,为实时监测HRSV流行动态变化,及时开展风险研判和预测预警,进一步了解我国HRSV的疾病负担,也为我国HRSV感染相关疾病的诊断、防控,以及疫苗和药物的研发、使用和评价提供重要的科学技术支撑。

关键词：呼吸道合胞病毒监测预防控制

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2019—2023年吉林省长春市儿童急性呼吸道感染住院病例中人偏肺病毒的基因型别和流行特征分析

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中华预防医学杂志 2024年第6期58卷 862-868页

作者：谢智博崔爱利孙立伟王雅各张瑶王利武夏百成孙馨张燕传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室国家卫生健康委医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 长春市儿童医院精准医学研究中心长春130061

目的了解吉林省长春市儿童急性呼吸道感染(ARI)住院病例中人偏肺病毒(HMPV)的基因型别和流行特征。方法采集2019年6月至2023年6月长春市儿童医院ARI住院病例的咽拭子标本,收集病例的流行病学和临床信息。采用荧光定量RT-PCR方法鉴定HMP... 详细信息

目的了解吉林省长春市儿童急性呼吸道感染(ARI)住院病例中人偏肺病毒(HMPV)的基因型别和流行特征。方法采集2019年6月至2023年6月长春市儿童医院ARI住院病例的咽拭子标本,收集病例的流行病学和临床信息。采用荧光定量RT-PCR方法鉴定HMPV阳性病例,并对阳性病例的病毒核酸进行G基因扩增及亲缘关系分析。结果共纳入儿童ARI住院病例3311例,年龄范围为0~17岁,年龄M(Q_(1),Q_(3))为2(1,3)岁;男性患儿1811例(54.70%)。共检出HMPV阳性病例167例,检出率为5.04%,其中<5岁病例占92.81%(155/167)。2019年HMPV检出率为6.37%(30/471),2020年降至最低(2.31%,10/432),2021、2022年有所回升,检出率分别为4.70%(60/1277)和4.56%(21/461),2023年HMPV检出率升高至6.87%(46/670),不同年份间的检出率差异具有统计学意义(P<0.05)。不同年份HMPV的流行高峰也存在差异,表现为单峰或双峰流行。共获得79条HMPV的G基因序列,A亚型和B亚型分别占48.10%和51.90%,其中A亚型均为A2c重复插入变异株,B亚型以B2基因型为主。HMPV在不同年份中可表现为A、B亚型的单独流行或共流行,存在亚型更替模式。结论2019—2023年不同年份间长春市ARI儿童住院病例中HMPV检出率差异较大,且存在HMPV的A、B基因亚型更替模式。

关键词：呼吸道感染儿童人偏肺病毒流行病学特征

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