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Molecular Docking-Based Research on the Potential Anti-Encephalopathy Effect of Gentianine

World Journal of Traditional Chinese Medicine 2021年第3期7卷 377-382页

作者： awais wahab Jian-Xin Chen Cai-Xia Jia Ghulam Murtaza Chuan-Hong Wu Na Wang School of Traditional Chinese Medicine Beijing University of Chinese MedicineBeijingChina Department of Pharmacy COMSATS University IslamabadLahorePakistan The Biomedical Sciences Institute of Qingdao University(Qingdao Branch of SJTU Bio-X Institutes) Qingdao UniversityQingdaoChina

Objective:Encephalopathy is increasingly threatening human *** is correspondingly one of the concerns of society and medical *** a natural source,traditional Chinese medicine has tremendous beneficial outcomes in various diseases including ***,a Chinese herbal compound,shows effectiveness in many diseases exclusively in ***,this in vitro research was carried out to find its effectiveness in ***:Ligand and proteins were searched and downloaded from ChemDraw and protein database,***-X2.0 docking software and its various functions were used to prepare ligand and ***,gentianine was docked with proteins using Sybyl-X2.0 docking ***:Gentianine was docked with 20 protein *** with C-score of 5 were selected.A total of three kinds of protein docked with gentianine(ABCC1,C-reactive protein[CRP],and NKX5-2)were ***1 was expressed in the brain and was related to seizures and *** was an inflammatory biomarker and related to seizures,epilepsy,stroke,and Parkinson’s ***2–5 was also known as cardiac transcription and related to cerebral palsy,Alzheimer’s disease,and *** these targets were related to ***:Molecular docking findings in this study lead to the suggestion that gentianine might be helpful in treating *** study is expected to provide a solution to find potential anti-encephalopathy compounds.

关键词： Encephalopathy gentianine molecular docking

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基于网络药理学的龙胆碱抗缺血性中风作用机制研究

基于网络药理学的龙胆碱抗缺血性中风作用机制研究

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作者：阿韦斯（awais wahab）北京中医药大学

学位级别：硕士

研究目的:临床中,缺血性中风比出血性中风更为常见,约占所有病例的87%,已成为绝大多数研究的关注热点。缺血性中风是由于血栓或栓塞阻塞了大脑的主要动脉所致。在中国东部城市,约有三分之一的缺血性中风患者接受了中医治疗。中药对缺血... 详细信息

研究目的:临床中,缺血性中风比出血性中风更为常见,约占所有病例的87%,已成为绝大多数研究的关注热点。缺血性中风是由于血栓或栓塞阻塞了大脑的主要动脉所致。在中国东部城市,约有三分之一的缺血性中风患者接受了中医治疗。中药对缺血性中风发挥了良好的保护作用。在缺血性中风中,组织损伤后炎性应答的过程中ECM的转化主要归因于MMPs的表达。龙胆碱是一种MMP抑制化合物,能够有效发挥抗炎与抗氧化作用。本课题运用网络药理学相关技术探讨龙胆碱对脑缺血的作用。研究方法:首先,使用三个在线工具(Protox,Swiss-ADME,Mol inspiration)来查找龙胆碱的生物活性评分,药代动力学特性,毒性和分子特性。采用网络药理学的方法从STITCH数据库中收集药物靶标和药理学信息。使用GO富集分析找出生物学机制和信号传导通路,然后使用Cytoscape将分子水平的通路进行可视化映射。最后,进行分子对接。结果表明,龙胆碱可分别与MMP2及MMP9进行对接。研究结果:药代动力学特性、毒性和生物活性得分结果表明,龙胆碱在人体内安全无毒。网络药理学方法,PPI网络结果显示龙胆碱与缺血性中风相关的的5个蛋白质靶标(IL6,PTGS2,COX5A,PPARA,GLUTAMATE)。GO分析结果揭示了龙胆碱与缺血性中风相关的两条 GO 通路。龙胆碱与 MMP2 在 THR227,ALA220,ILE164,ALA165,GLU202 处产生 6 个氢键的相互作用,对接得分最高为-6.54,Ref rmsd为77.61A,Ki值为-16.11uM。然而,龙胆碱与 MMP9 在 ALA417,ARG424,THR426,PHE107,PRO415 处产生了 5 个氢键相互作用,对接得分最高为-6.43,Ref rmsd为75.28A,Ki值为19.46uM。因此,证实了龙胆碱对MMP2与MMP9的高抑制活性。结论及意义:龙胆碱可能是治疗缺血性中风的有效药物活性成分。

关键词：缺血性中风龙胆碱网络药理学分子对接 MMPs

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