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CRISPRi screen highlights chromatin regulation to be involved in formic acid tolerance in Saccharomyces cerevisiae

Engineering Microbiology 2023年第2期3卷 57-64页

作者： Vaskar Mukherjee Ibai Lenitz Ulrika Lind anders blomberg Yvonne Nygård Department of Life Sciences Chalmers University of TechnologyGothenburgSweden Department of Chemistry and Molecular Biology University of GothenburgGothenburgSweden Department of Biorefinery and Energy RISE Research Institutes of SwedenÖrnsköldsvikSweden

Formic acid is one of the main weak acids in lignocellulosic hydrolysates that is known to be inhibitory to yeast growth even at low *** this study,we employed a CRISPR interference(CRISPRi)strain library comprising>9000 strains encompassing>98%of all essential and respiratory growth-essential genes,to study formic acid tolerance in Saccharomyces *** provide quantitative growth estimates on formic acid toler-ance,the strains were screened individually on solid medium supplemented with 140 mM formic acid using the Scan-o-Matic *** resistant and sensitive strains were characterized in liquid medium supplemented with formic acid and in synthetic hydrolysate medium containing a combination of *** with gR-NAs targeting genes associated with chromatin remodeling were significantly enriched for strains showing formic acid *** line with earlier findings on acetic acid tolerance,we found genes encoding proteins involved in intracellular vesicle transport enriched among formic acid sensitive *** growth of the strains in syn-thetic hydrolysate medium followed the same trend as when screened in medium supplemented with formic *** sensitive to formic acid had decreased growth in the synthetic hydrolysate and all strains that had im-proved growth in the presence of formic acid also grew better in the hydrolysate *** analysis of CRISPRi strains allowed identification of genes involved in tolerance mechanisms and provided novel engineering targets for bioengineering strains with increased resistance to inhibitors in lignocellulosic hydrolysates.

关键词： Formic acid Lignocellulosic hydrolysates CRISPRi library Screening Tolerance Yeast Chromatin

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受控的空气污染物暴露与心律失常风险

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环境与职业医学 2014年第10期31卷 787-787页

作者： Jeremy P.Langrish Simon J.Watts Amanda J.Hunter Anoop S.V.Shah Jenny A.Bosson Jon Unosson Stefan Barath Magnus Lundbck Flemming R.Cassee Ken Donaldson Thomas Sandstrm anders blomberg David E.Newby Nicholas L.Mills

[背景]流行病学研究报道了空气污染暴露与心血管疾病发病率和死亡率增加之间的关联。空气污染物暴露可以影响心脏自主神经节律并降低心率变异性,可能增加心律失常的风险,特别是在敏感的患者群体中。[目的]研究在可控制的空气污染物暴露... 详细信息

[背景]流行病学研究报道了空气污染暴露与心血管疾病发病率和死亡率增加之间的关联。空气污染物暴露可以影响心脏自主神经节律并降低心率变异性,可能增加心律失常的风险,特别是在敏感的患者群体中。[目的]研究在可控制的空气污染物暴露期间和之后,统计分析了健康志愿者和冠状动脉心脏疾病患者的心律失常发生率。[方法]分析数据来自13个随机双盲交叉研究,包括282名参加者(140名健康志愿者和142例稳定性冠状动脉心脏疾病患者)的连续心电图记录。记录研究人群每次暴露时发生心律失常的情况。[结果]在稀释的柴油车尾气、木材烟雾、臭氧、浓缩的环境颗粒物、工程碳纳米颗粒或空气污染高环境水平的暴露期间或者之后,无论在健康志愿者或冠状动脉心脏疾病患者中,任何形式心律失常的发生均没有增加。[结论]急性、可控制的空气污染物暴露不增加受试者发生心律失常的短期风险。研究中所采用的这些技术,对于确定涉及空气污染不利影响的重要病理生理途径依然至关重要,并且在为环境和公共卫生政策决策提供信息中也起着重要的作用。

关键词：空气污染物心律失常短期风险健康志愿者患者群体摘要心脏自主神经心脏疾病

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