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Co-occurrence of germline pathogenic variants for different hereditary cancer syndromes in patients with Lynch syndrome

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Cancer Communications 2021年第3期41卷 218-228页

作者： Rosario Ferrer-Avargues Maria Isabel Castillejo Estela Damaso Virginia Diez-Obrero Noemi Garrigos Tatiana Molina alan codoner-alejos Angel Segura Ana Beatriz Sanchez-Heras Adela Castillejo Jose Luis Soto Foundation for the Promotion of Health and Biomedical Research of Valencia Region(FISABIO) FISABIO-Elche Health DepartmentElche 032303Spain Molecular Genetics Unit.Elche University Hospital Elche 032303Spain Department of Molecular Biopathology Immunological Center of AlicanteSan Juan-Alicante 03550Spain Medical Oncology Department Cancer Genetic Counseling Unit.La Fe University HospitalValencia 46026Spain Medical Oncology Department Cancer Genetic Counseling Unit.Elche University HospitalElche 03203Spain

Background:Lynch syndrome(LS)is a hereditary condition characterized by a high risk of colorectal cancer,endometrial cancer,and other neoplasia associated with germline alterations in DNA mismatch repair *** classical genetic diagnostic strategy for LS consists of the Sanger sequencing of genes associated with the suspected ***-generation sequencing(NGS)enables the simultaneous sequencing of a large number of hereditary cancer ***,we aimed to study whether other germline pathogenic variants of hereditary cancer genes are present in patients with ***:A cohort of 84 probands with a previous genetic diagnosis of LS by Sanger sequencing was reanalyzed using NGS via a commercial panel of 94 hereditary cancer genes by hybrid *** American College of Medical Genetics and Genomics criteria were used to classify the clinical significance of the *** findings of NGS were confirmed by Sanger *** possible,genetic analyses of the new findings in the proband’s relativeswere also performed by Sanger ***:We identified five families(6%),out of 84,with at least two germline pathogenic variants conferring to high or moderate risk in different dominant cancer-predisposing genes:[MLH1-BRCA2-NBN],[MLH1-BRCA1],[MSH2-ATM],[MSH6-NF1],and[MLH1-FANCA].Interestingly,only one out of these five families exhibited a clinical phenotype associated with the new pathogenic *** family with three pathogenic variants of the[MLH1-BRCA2-NBN]genes showed a high aggregation of tumors associated with LS and breast and ovarian cancer ***:Our results showed that the co-occurrence of more than one pathogenic variant in cancer-predisposing genes was remarkable among cases of *** cases,no clinicial manifestations were associated with the secondary pathogenic *** studies are needed to confirm these findings and elucidate their clinical *** of LS families should be considered only in fa

关键词： cancer panel hereditary cancer lynch syndrome moderate penetrance genes multilocus inherited neoplasia alleles syndrome next-generation sequencing secondary findings

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林奇综合征患者中同时具有不同遗传性肿瘤综合征的种系变异

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癌症 2022年第5期41卷 215-225页

作者： Rosario Ferrer-Avargues María Isabel Castillejo Estela Dámaso Virginia Díez-Obrero NoemíGarrigos Tatiana Molina alan Codoñer-alejos Ángel Segura Ana Beatriz Sánchez-Heras Adela Castillejo JoséLuis Soto Foundation for the Promotion of Health and Biomedical Research of Valencia Region(FISABIO) FISABIO-Elche Health DepartmentElche 032303Spain Molecular Genetics Unit.Elche University Hospital Elche 032303Spain Department of Molecular Biopathology Immunological Center of AlicanteSan Juan-Alicante 03550Spain Medical Oncology Department Cancer Genetic Counseling Unit.La Fe University HospitalValencia 46026Spain Medical Oncology Department Cancer Genetic Counseling Unit.Elche University HospitalElche 03203Spain

背景与目的林奇综合征(lynch syndrome,LS)是一种遗传性疾病,LS患者罹患结直肠癌、子宫内膜癌和其他与DNA错配修复基因发生种系突变相关肿瘤的风险较高。LS的传统遗传诊断方法为对与疑似综合征相关的基因进行桑格测序。二代测序技术(nex... 详细信息

背景与目的林奇综合征(lynch syndrome,LS)是一种遗传性疾病,LS患者罹患结直肠癌、子宫内膜癌和其他与DNA错配修复基因发生种系突变相关肿瘤的风险较高。LS的传统遗传诊断方法为对与疑似综合征相关的基因进行桑格测序。二代测序技术(next-generation sequencing,NGS)可同时对大量遗传性癌基因进行测序。本研究旨在探究林奇综合征患者中是否存在其他遗传性种系病理癌基因变异。方法我们选取先前已利用桑格测序遗传诊断法确诊的84例LS先证者作为研究对象,通过杂交捕获一组94个商业化的遗传癌基因,随后对这些捕获的样本进行NGS测序。按照美国医学遗传学和基因组学标准,对这些变异的临床意义进行分类。利用桑格测序验证NGS的结果。在可能的情况下,利用桑格测序进一步在先证者的亲属中进行新发现种系变异基因的遗传分析。结果我们从84个家族中鉴定出5(6%)个至少含有2个种系致病变异的家族,这些变异具有高或中等的诱发不同显性癌症的风险,这些家族的种系致病变异如下:[MLH1-BRCA2-NBN]、[MLH1-BRCA1]、[MSH2-ATM]、[MSH6-NF1]和[MLH1-FANCA]。有趣的是,这5个家族中只有1个家族表现出与新的致病变异相关的临床表型。含有3个致病变异基因[MLH1-BRCA2-NBN]的家族显示出LS、乳腺和卵巢癌综合征相关肿瘤的高度聚集特性。结论我们的研究表明,癌症易感基因中,同时发生多个致病变异是LS病例的显著特点。在大部分的病例中,继发性致病变异与临床表型不相关。将来需要进一步验证这些结论并阐明其临床影响。只有表现出复杂的临床表型家族才有必要重新对LS进行分析。

关键词：癌症组遗传性癌症林奇综合征中度外显基因多位点遗传性肿瘤等位基因综合征二代测序次要发现

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