检索结果-南通市图书馆

作者： abdullah ibne omar 华中农业大学

学位级别：硕士

捻转血矛线虫(***)是在中国、孟加拉以及世界其他各地广泛感染山羊的一种主要的胃肠道线虫。控制其流行的方式之一是选育对线虫侵染有着天然抗性和良好遗传背景的山羊品种。单核苷酸多态性(SNP)为检测群体内抗性基因的存在给出了可行方... 详细信息

捻转血矛线虫(***)是在中国、孟加拉以及世界其他各地广泛感染山羊的一种主要的胃肠道线虫。控制其流行的方式之一是选育对线虫侵染有着天然抗性和良好遗传背景的山羊品种。单核苷酸多态性(SNP)为检测群体内抗性基因的存在给出了可行方法。本次研究旨在从遗传上评估自然放牧状态下中国和孟加拉的山羊群体内外捻转血矛线虫感染的抗性或易感性,并鉴定与FEC性状相关的功能候选基因的单核苷酸多态性(SNPs)。本研究中,使用了 507头无亲缘关系的山羊,分别来自中国和孟加拉的6个不同品种/群体。从每头山羊上采血用来提取基因组DNA和检测血液指标,例如血红蛋白和红细胞比积,并且收集粪便用于捻转血矛线虫的粪便虫卵计数。使用改进的酚仿法来提取全血的基因组DNA,利用改良的麦克马斯特技术确定粪便虫卵数并借助光学显微镜来鉴别孵化的寄生虫卵。PCR产物通过基于荧光能量共振转移化学过程的竞争性等位基因特异性PCR来分离SNP位点的基因型,并使用R软件包以及统计程序进行关联分析。目前的研究结果总结如下:1.全群总体的捻转血矛线虫感染率为46.75%,在中国和孟加拉的山羊群体中观察到的总感染率分别为68.9%和19.4%。其中,中国的ESB山羊品种(88.89%)感染率最高,最低的是孟加拉的BBH群体(0%)。2.在粪便虫卵计数方面,基于对数转化后的数据,在中国的杂交山羊和BBH山羊品种中分别观察到了最高的寄生负荷(2.58±0.05epg)和最低的寄生负荷(1.40±0.15epg)。当前的研究表明,所有的中国山羊品种和孟加拉的BBW群体均表现出对捻转血矛线虫易感,但孟加拉BBH群体则显示出不敏感。血红蛋白和红细胞比积在群体中的差异显著(pG基因座位上,除了 ESB山羊(AA型:0.14,AG型:0.58,GG 型:0.28)之外,其他所有山羊群体 AA 型(0.42,0.43,0.27,0.93 和 0.74)和 AG 型(0.35,0.35,0.45,0.07 和 0.25)的基因型频率均高于 GG 型(0.23,0.22,0.27,0.0和0.01)。例外的是BBH群体中没有发现GG基因型。在NLRP93>G基因座中,所有山羊群体的GG型(0.65,0.62,0.69,0.55,0.57和0.60)基因型频率高于其他两种基因型(AA型和AG型)。AA型的(0.03,0.09,0.03,0.11,0.0和0.03)基因型频率在所有山羊中均很低,尤其是在BBH群体中,AA型频率为0。在所有山羊群体中,AG型的(0.32,0.29,0.29,0.34,0.43和0.37)基因型频率分布中等。4.一共鉴定出了 10个单核苷酸多态性位点(SNPs),其中2个SNPs(NOD146>G和NLRP93>G)与FEC性状相关显著相关。在关联分析中,NOD146>G(pG(pG基因上,GG-AA(pG基因上,AG-AA(pG基因座上,GG(399.12±106.4)基因型山羊群体的中观察到最小的FEC均值,比其他两者基因型AA(1129.57±196.5)和AG(462.99±113.1)更低。NOD146>G 基因上,GG(904.43±140.65)基因型的山羊的 FEC 平均值高于其他两种基因型:AA(396.68±67.22)和AG(353.19±105.11).6.在中国山羊群体中,NOD146>G上GG(1216.16±231.09)基因型山羊和NLRP93>G上AA(1619.07±263.6)基因型山羊的FEC平均值较高。在孟加拉山羊中,NOD146>G基因和NLRP93>G基因上所有基因型的山羊的FEC平均值均很低。本研究在山羊中首次鉴定了 NOD1和NLRP9这两个基因与捻转血矛线虫的FEC显著相关。因此,这两个基因在遗传上影响线虫的感染性状(FEC),可能与抵抗捻转血茅线虫感染有关以及与山羊的抗病性密切相关。未来在山羊免疫遗传学方面的深入研究可能有助于找出这种差异的真正原因并发展抗病的山羊品种。

关键词：山羊捻转血茅线虫粪便虫卵计数抗性单核苷酸多态性

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Single nucleotide polymorphisms in candidate genes are significantly associated with resistance to Haemonchus contortus infection in goats

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Journal of Animal Science and Biotechnology 2019年第2期10卷 293-306页

作者： Mahmuda Bilkis Bintee Alam abdullah ibne omar Md.omar Faruque David Russell Notter Kathiravan Periasamy Md.Motahar Hussain Mondal Md.Jalal Uddin Sarder Md.Shamsuddin Jianhua Cao Xiaoyong Du Zhenyang Wu Shuhong Zhao Key Lab of Agricultural Animal Genetics Breeding and ReproductionMinistry of EducationCollege of Animal Science and TechnologyHuazhong Agricultural UniversityWuhan 430070People’s Republic of China National Engineering Laboratory for Animal Breeding Key Lab of Agricultural Animal GeneticsBreeding and ReproductionMinistry of AgricultureCollege of Animal Science and TechnologyChina Agricultural UniversityBeijing 100193People’s Republic of China Department of Animal and Poultry Sciences Virginia TechBlacksburgVA 24061USA Animal Production and Health Laboratory Join FAO/IAEA Division of Nuclear Techniques in Food and AgricultureInternational Atomic Energy AgencyViennaAustria Department of Parasitology Bangladesh Agricultural UniversityMymensingh 2202Bangladesh.7Department of Veterinary and Animal ScienceUniversity of RajshahiRajshahi 6205Bangladesh Agricultural Bioinformatics Key Laboratory of Hubei Province College of InformaticsHuazhong Agricultural UniversityWuhan 430070People’s Republic of China College of Agroforestry Engineering and Planning Tongren UnivesityTongrenGuizhou 554300People’s Republic of China.

Background: Haemonchosis is a major economic problem in goat production in humid, tropical and subtropical regions. The disease is caused by an abomasal nematode, Haemonchus contortus, which is highly pathogenic in small ruminants. The aim of this study was to identifying single-nucleotide polymorphisms(SNP) that were associated with fecal egg counts(FEC) and could be used as markers to identify resistance to H. contortus in ***: Ten novel variants in the CI TA, ATP2 A3, HSPA8, STAT5 B, ESYT1, and SERPING1 genes were associated with FEC in goats with a nominal significance level of P G SNP locus in al goat breeds. Pairwise coefficients of linkage disequilibrium(D′, r2)revealed complete LD(r2= 1) between significant SNP polymorphisms in CI TA and SERPING1 and strong LD(r2= 0.93 and0.98) between polymorphisms in HSPA8 and ATP2 A3, respectively. Correlation coefficient(r) between FEC and body weight(BW) was significantly positive(r = 0.56***, P < 0.001) but that between FEC and packed cel volume(PCV) was negatively significant(r =-0.47**, P < 0.01) in the total population of goats. On the other hand, correlation coefficient(r)between BW and PCV was not significant in total population of goats. Association analysis revealed that haplotypes within ATP2 A3, HSPA8, and SERPING1 were significantly associated with FEC. Quantitative real-time PCR revealed that the relative expression of m RNA was higher(P < 0.001) for resistant, compared to susceptible, groups of goats for al candidate genes except CI ***

关键词： Fecal egg count Goat Haemonchus contortus Parasite resistance SNP markers

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北京地区奶牛HH6遗传缺陷基因分布初探

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中国奶牛 2021年第6期 13-17页

作者：和玉伟 abdullah ibne omar 陈绍祜吕小青刘林张胜利肖炜张毅中国农业大学动物科技学院北京100193 中国奶业协会北京100193 北京奶牛中心北京100192 北京市畜牧总站北京100107

随着人们对奶牛选育程度的加强,奶牛遗传缺陷问题逐渐凸显。HH6是新近发现的一种荷斯坦牛遗传缺陷,其致病机理为16号染色体上SDE2基因编码区内发生了一个从A到G的突变,SDE2是真核生物中维持基因组稳定必需的蛋白质,突变使得该蛋白的功... 详细信息

随着人们对奶牛选育程度的加强,奶牛遗传缺陷问题逐渐凸显。HH6是新近发现的一种荷斯坦牛遗传缺陷,其致病机理为16号染色体上SDE2基因编码区内发生了一个从A到G的突变,SDE2是真核生物中维持基因组稳定必需的蛋白质,突变使得该蛋白的功能受到抑制,进而导致了胚胎在几次细胞分裂之后便死亡,即造成母牛流产。这一突变最初来源于一头1987年出生的美国公牛,该公牛及其后代的冻精在世界范围内被广泛的使用。为了分析HH6在北京地区荷斯坦牛中的分布情况,本研究利用KASP SNP分型技术和微流控芯片技术结合的新型检测技术,研发出可准确检测HH6的方法,可实现在2.5h内对96个样本分型。随后对100头公牛和466头母牛随机样本检测,结果在公牛中未检出携带者,而母牛群携带率为1.93%。尽管HH6在当前牛群中分布并不广泛,但仍需将其纳入常规种牛遗传检测当中并实施科学选配,以免该缺陷在国内牛群中传播,造成更大的损失。

关键词： SDE2 遗传缺陷胚胎早期死亡 KASP 微流控芯片荷斯坦牛

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Single nucleotide polymorphisms in candidate genes are significantly associated with resistance to Haemonchus contortus infection in goats.

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畜牧与生物技术杂志(英文版) 2019年第2期

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