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皮肤黑色素瘤差异表达基因的生物信息学分析及调控中药预测

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中草药 2024年第2期55卷 551-562页

作者：王梓霞黄羽欣谢锦楠王沐瑶王文辉广州中医药大学第二临床医学院广东广州510006 广州中医药大学第一临床医学院广东广州510499 广州中医药大学东莞医院广东东莞523000

目的通过生物信息学技术分析皮肤黑色素瘤患者皮肤组织与非癌皮肤组织的基因表达微阵列数据,筛选出皮肤黑色素瘤的差异表达基因,预测可用于诊断和治疗皮肤黑色素瘤的生物标志物及潜在中药。方法从基因表达数据库(Gene Expression Omni... 详细信息

目的通过生物信息学技术分析皮肤黑色素瘤患者皮肤组织与非癌皮肤组织的基因表达微阵列数据,筛选出皮肤黑色素瘤的差异表达基因,预测可用于诊断和治疗皮肤黑色素瘤的生物标志物及潜在中药。方法从基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)提取GSE31.9、GSE1.4445、GSE4651.基因芯片,使用GEO2R工具筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。利用DAVID数据库对DEGs进行基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析;使用String数据库构蛋白-蛋白互作网络,应用Cytoscape软件及其插件筛选PPI网络中关键基因,应用GSCA数据库进行关键基因的突变分析。通过Gepia 2.0数据库结合癌症基因组图谱数据集(Cancer Genome Atlas,TCGA)对关键基因进行生存分析。根据度(degree)值和生存分析结果综合筛选出核心基因(集),应用GSCA数据库对核心基因(集)进行泛癌分析和免疫浸润分析,并使用TIMER 2.0数据库对核心基因分别进行免疫浸润分析。使用Coremine Medical数据库预测作用于关键基因的潜在中药。结果共筛选出DEGs 1.4个,其中上调基因36个,下调基因78个。上调DEGs主要富集在细胞因子-细胞因子受体相互作用、Toll样受体信号等通路,下调DEGs主要富集在细胞黏附、细胞增殖的正调控等方面。1.个关键基因为EGFR、KPNA2、GATA3、AURKA、TYMS、PKP1.SPP1.MMP1.KLF4、EPCAM、KIF23、DTL、CLDN1.LCP2、FGFR2,其中共3个基因KPNA2、AURKA、DTL被视为核心基因(集)。潜在治疗中药有丹参、人参、构皮、高良姜、甘草、蓖麻子、油桐叶等。结论皮肤黑色素瘤中关键基因的突变以FGFR2的错义突变为主,突变方式多为胞嘧啶(C)向胸腺嘧啶(T)的转换。EGFR、KPNA2、GATA3、AURKA、PKP1.DTL、LCP2对皮肤黑色素瘤的生存预后存在显著影响。核心基因集在多种癌症中显著上调,并与自然调节性T细胞(natural regulatory T-cells,nTreg)细胞、树突状细胞、单核细胞等免疫细胞的浸润有关。潜在调控中药包括补虚药、清热解毒药、拔毒生肌药、消肿拔毒药、温里药、健脾利湿药、利水渗湿药、活血化瘀药、安神药9类,在相关古籍中存在对应的中医内外治经验记载,其中药活性成分亦被证明对皮肤黑色素瘤存在一定的调控和抑制作用。

关键词：皮肤黑色素瘤差异表达基因核心基因中药预测生物信息学丹参人参构皮高良姜甘草蓖麻子油桐叶

复方鱼桔颗粒通过抑制BMDM中NLRP3炎症小体激活发挥抗炎效果的作用机制研究

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中国免疫学杂志 2024年第7期40卷 1467-1473页

作者：马宇慧孟佳磊袁林齐璐瑶欧阳冰清雷鸣上海中医药大学附属第七人民医院上海200137 急救与创伤研究教育部重点实验室急诊创伤学院海南医学院海口571199

目的:研究复方鱼桔颗粒(FFYJ)对脂多糖(LPS)诱导的原代骨髓来源的巨噬细胞(BMDM)炎症模型的影响,及其对巨噬细胞中核苷酸结合寡聚结构域样受体蛋白3(NLRP3)炎症小体信号通路的干预作用。方法:从C57BL/6小鼠腿部骨髓中提取并分离出原代细... 详细信息

目的:研究复方鱼桔颗粒(FFYJ)对脂多糖(LPS)诱导的原代骨髓来源的巨噬细胞(BMDM)炎症模型的影响,及其对巨噬细胞中核苷酸结合寡聚结构域样受体蛋白3(NLRP3)炎症小体信号通路的干预作用。方法:从C57BL/6小鼠腿部骨髓中提取并分离出原代细胞,经50 ng/ml M-CSF诱导7 d后得到BMDM。分为对照组(Control)、模型组(LPS+ATP)、FFYJ低剂量组(FFYJ 50μg/ml)、FFYJ中剂量组(FFYJ 1.0μg/ml)、FFYJ高剂量组(FFYJ 200μg/ml)、阳性药地塞米松组(DEX)。FFYJ治疗组和阳性药组预处理BMDM 1.h后开始造模。乳酸脱氢酶(LDH)释放法检测各组细胞上清中LDH的含量;ELISA检测各组细胞上清中炎症因子肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、IL-6和IL-1.的含量;qRT-PCR检测各组细胞中TNF-α、IL-6和IL-1. mRNA水平;Western blot检测各组细胞中NF-κB、p-NF-κB、NLRP3、Caspase-1.p45、Caspase-1.p20和GSDMD-N蛋白水平;倒置荧光显微镜观察各组细胞经Hoechst-PI染色后的细胞焦亡情况。结果:与对照组相比,模型组细胞上清液中LDH、TNF-α、IL-6和IL-1.含量显著升高(P1.;模型组细胞TNF-α、IL-6和IL-1.的mRNA水平显著升高(P1.;p-NF-κB、NLRP3、Caspase-1.20和GSDMD-N的蛋白水平显著升高(P药显著降低了BMDMs上清液中LDH、TNF-α、IL-6和IL-1.的含量(P1.的mRNA水平(P1.p20和GSDMD-N蛋白的表达(P<0.05);显著减少了PI阳性细胞数(P<0.05)。结论:FFYJ通过抑制BMDM原代巨噬细胞中NLRP3炎症小体的激活发挥抗炎效果。

关键词：复方鱼桔颗粒 NLRP3炎症小体 BMDM 炎症因子

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基于指纹图谱及网络药理学探究胃宁散抗胃溃疡药效关联物质及作用机制

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中国现代应用药学 2024年第7期41卷 895-905页

作者：周彤梁艺瑶谢颖苏雪蓉吴杨倩万毅许金国赵晓莉王超南京中医药大学{1. 南京210023 南京中医药大学附属医院南京210029

目的根据指纹图谱及网络药理学探讨胃宁散(Weining San,WNS)抗胃溃疡(gastric ulcer,GU)的药效关联物质及作用机制。方法采用HPLC建立1.批WNS指纹图谱,并进行方法学考察,结合对照品指认特征峰,筛选药效关联物质,进行网络药理学分析。... 详细信息

目的根据指纹图谱及网络药理学探讨胃宁散(Weining San,WNS)抗胃溃疡(gastric ulcer,GU)的药效关联物质及作用机制。方法采用HPLC建立1.批WNS指纹图谱,并进行方法学考察,结合对照品指认特征峰,筛选药效关联物质,进行网络药理学分析。利用TCMIP、Swiss Target Prediction数据库检索成分靶点;利用OMIM、Gene Cards和Drugbank数据库检索GU疾病靶点,取成分与疾病的交集靶点,采用String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络图,并进行拓扑学参数分析;采用Cytoscape 3.8.2软件构建“成分-疾病-靶点”网络图;采用Metascape网站对交集靶点进行GO和KEGG富集分析。随后采用灌胃无水乙醇的方式建立酒精性GU小鼠模型,对网络药理学预测的结果进行验证。结果 HPLC指纹图谱方法学考察的精密度、稳定性、重复性均良好。经对照品比对及综合分析,确定三七皂苷R1.人参皂苷Rg1.1.4-二[4-(葡萄糖氧)苄基]-2-异丁基苹果酸酯、人参皂苷Rb1.五味子醇甲、五味子醇乙、五味子甲素、五味子酯甲为WNS中的药效关联物质,其可能通过调控AKT1.IL-6、STAT3、TNF、IL1.等核心靶点及PI3K-Akt、JAK-STAT等关键信号通路来发挥作用。小鼠胃溃疡指数和溃疡抑制率测定、HE染色观察结果显示,WNS对GU小鼠胃黏膜损伤有良好的改善作用。ELISA、WST-1.TBA测定结果表明,WNS干预后能降低模型小鼠TNF-α、IL-6、IL-1.、MDA水平,升高SOD、PGE2水平,提示WNS抗GU作用与抑制炎症反应与氧化应激机制相关,进一步验证了网络药理学预测的结果。结论本研究结合指纹图谱、网络药理学及动物实验验证,对WNS抗GU药效关联物质及作用机制进行了探讨,为WNS的质量控制及临床研究提供参考。

关键词：胃宁散指纹图谱网络药理学胃溃疡

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川西合耳菊中1.新的艾里莫芬烷倍半萜

中草药 2024年第11期55卷 3593-3601页

作者：蔡璐瑶于涵李召辉康钦钊黎坤尹汐赵琳兰小中何小凤吕光华成都中医药大学{1./西南特色中药资源国家重点实验室四川成都611137 成都中医药大学民族{1.院四川成都611137 西藏农牧学院/西藏自治区藏药资源保护与利用重点实验室西藏林芝860000

目的研究川西合耳菊Synotis solidaginea的化学成分。方法采用硅胶、聚酰胺、反相C_(1.)柱色谱及制备高效液相色谱等技术进行分离纯化;根据波谱数据和文献对比进行化合物结构鉴定。结果从川西合耳菊的醋酸乙酯萃取部位共分离得到1.个化... 详细信息

目的研究川西合耳菊Synotis solidaginea的化学成分。方法采用硅胶、聚酰胺、反相C_(1.)柱色谱及制备高效液相色谱等技术进行分离纯化;根据波谱数据和文献对比进行化合物结构鉴定。结果从川西合耳菊的醋酸乙酯萃取部位共分离得到1.个化合物,分别鉴定为(2R,4S,5R,8R,1.S)-2-angeloyloxy-8,1.-dihydroxy-eremophil-7(1.)-en-8,1.-olide(1.、(1.,4S,5S,6S,8R,1.S)-1.1.-epoxy-6,8-dihydroxy-eremophil-7(1.)-en-8,1.-olide(2)、(4S,5R,8S,1.S)-8,1.-dihydroxy-eremophil-7(1.)-en-8,1.-olide(3)、(4S,5R,8R,1.S)-1.-hydroxy-eremophil-7(1.)-en-8,1.-olide(4)、橐吾内酯(5)、4,5-O-二咖啡酰奎宁酸甲酯(6)、异绿原酸C(7)、3,5-O-二咖啡酰基奎宁酸甲酯(8)、异绿原酸A(9)、1.4-O-二咖啡酰奎宁酸甲酯(1.)、绿原酸(1.)、咖啡酰苹果酸(1.)、咖啡酸甲酯(1.)、反式咖啡酸(1.)、山柰酚-3-O-(6''-O-乙酰基)-β-D-吡喃葡萄糖苷(1.)、紫云英苷(1.)、2-苯乙基-β-D-吡喃葡萄糖苷(1.)、桦褐孔菌二糖(1.)。结论化合物1.新的艾里莫芬烷倍半萜类化合物,命名为川西合耳菊内酯A;化合物2、4、5、1.、1.、1.、1.、1.、1.为首次从合耳菊属中分离得到。

关键词：川西合耳菊艾里莫芬烷倍半萜川西合耳菊内酯A 1.4-O-二咖啡酰奎宁酸甲酯咖啡酸甲酯

乳腺康胶囊对乳腺增生大鼠的影响及镇痛实验研究

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中医药导报 2024年第4期30卷 19-22,29页

作者：蔡铭瑶王翼陈甜敖燕飞莫小勤广西中医药大学广西南宁530011 广西中医药大学附属瑞康医院广西南宁530011

目的:研究乳腺康胶囊对乳腺增生大鼠的影响及镇痛作用。方法:运用雌孕激素序贯造模法制备乳腺增生模型鼠,经病理证实模型制备成功后随机分为模型对照组、逍遥丸组(0.93 g/kg)及乳腺康胶囊高、中、低剂量组(0.8 g/kg,0.4 g/kg,0.2 g/kg)... 详细信息

目的:研究乳腺康胶囊对乳腺增生大鼠的影响及镇痛作用。方法:运用雌孕激素序贯造模法制备乳腺增生模型鼠,经病理证实模型制备成功后随机分为模型对照组、逍遥丸组(0.93 g/kg)及乳腺康胶囊高、中、低剂量组(0.8 g/kg,0.4 g/kg,0.2 g/kg)。给药组予相应药物灌胃,空白组和模型对照组予等体积蒸馏水灌胃,连续给药45 d后,测量大鼠第1.2对乳头的直径和高度,运用ELISA测定大鼠血清雌二醇(E_(2))、催乳素(PRL)、孕激素(P)水平,光学显微镜下观察大鼠乳腺病理组织变化。采用冰醋酸扭体致痛模型,观察空白组、阿司匹林组及乳腺康胶囊高、中、低剂量组实验小鼠出现扭体反应的次数、第1.扭体反应的时间(潜伏期)、镇痛率。结果:与空白组比较,模型对照组E_(2)含量增多、P含量降低、E_(2)/P比例降低、PRL含量升高(P1.,大鼠第1.2对乳头高度和直径显著增高(P1.;与模型对照组比较,逍遥丸组、乳腺康胶囊各剂量组E_(2)含量降低、P含量升高、E_(2)/P比例降低、PRL含量降低,其中逍遥丸组、乳腺康胶囊高、中剂量组差异有统计学意义(P1.,大鼠第1.2对乳头高度和直径显著缩小(P1.;乳腺康胶囊各剂量组大鼠的乳腺组织增生情况均有改善,导管上皮细胞排列整齐,腺泡数量明显减少,腺小叶体积明显变小。与空白组比较,阿司匹林组、乳腺康胶囊各剂量组的扭体次数明显减少、潜伏时间显著延长(P1.,镇痛率均高于空白组。乳腺康胶囊各剂量组镇痛率分别为59.55%、57.57%、53.35%。结论:乳腺康胶囊具有良好的抗乳腺增生作用及镇痛作用。

关键词：乳腺康胶囊雌二醇孕酮泌乳素镇痛实验大鼠小鼠

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多花黄精水提物成分分析及抗肿瘤活性研究

中药新药与临床药理 2024年第7期35卷 952-962页

作者：宋露耿春叶邢陈昱王倩郭瑶瑶陈艳君王芳李国四王威高雷雷刘东韩邦兴安徽中医药大学{1. 皖西学院安徽省现代中药产业共性技术研究中心安徽省中药生态农业工程研究中心安徽省大别山中医药研究院

目的分析多花黄精水提物成分，并对其体内外抗肿瘤活性进行评价，为进一步开发利用多花黄精提供理论基础。方法（1.通过水提法制备多花黄精水提物，利用UPLC-Q-TOF/MS、苯酚硫酸法等方法分析多花黄精水提物化学成分，并通过CCK-8法... 详细信息

目的分析多花黄精水提物成分，并对其体内外抗肿瘤活性进行评价，为进一步开发利用多花黄精提供理论基础。方法（1.通过水提法制备多花黄精水提物，利用UPLC-Q-TOF/MS、苯酚硫酸法等方法分析多花黄精水提物化学成分，并通过CCK-8法检测多花黄精水提物对多种肿瘤细胞增殖抑制活性，采用流式细胞术检测细胞周期和凋亡情况，用Western Blot法检测凋亡相关蛋白Bcl-2和Bax的表达情况，利用多花黄精水提物含药血清检测入血成分对细胞增殖抑制活性。（2）构建荷瘤小鼠模型，随机分为模型组（予以生理盐水）、阳性药环磷酰胺组(50 mg·kg-1.以及多花黄精水提物低、中、高剂量组(55.9、1.1.8、223.6 mg·kg-1.，灌胃治疗7 d。治疗期间，观察小鼠体质量及肿瘤体积变化情况。治疗结束后处死小鼠，采用苏木素-伊红（HE）染色观察心、肝、脾、肺、肾以及肿瘤组织病理学变化；免疫组化（IHC）检测肿瘤组织Bcl-2及Bax蛋白表达情况。结果多花黄精水提物多糖含量达到（1..07±1.3）%，黄酮含量为（0.044±0.004）%，并且通过UPLC-Q-TOF/MS检测出39种成分，包含黄酮类的黄芩素、槲皮素、木犀草素、芦丁，有机酸类的阿魏酸及多酚类的没食子酸等抗肿瘤成分。多花黄精水提物对Hela、A549、4T1.B1.、MFC和HepG2细胞均有抑制作用（P1.，其中对B1.细胞抑制作用最为明显，且多花黄精水提物可诱导B1.细胞周期阻滞于G0/G1.（P1.。流式双染和Western Blot结果显示多花黄精水提物明显促进B1.细胞凋亡，降低Bcl-2的表达，且促进Bax的表达（P1.P1.。多花黄精水提物入血成分对B1.细胞也具有抑制作用（P1.。此外，多花黄精水提物体内活性实验结果显示，与模型组比较，不同剂量的多花黄精水提物能够抑制肿瘤生长，诱导肿瘤细胞坏死，降低Bcl-2表达，提高Bax的表达。结论多花黄精水提物成分丰富，含有多种抗肿瘤活性成分，能抑制肿瘤生长，诱导肿瘤细胞凋亡，显示较强的抗肿瘤作用，值得深入研究。

关键词：多花黄精水提物抗肿瘤黑色素瘤B1.细胞凋亡小鼠大鼠

转铁蛋白修饰雷公藤甲素脂质体的制备与体外评价

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中草药 2022年第3期53卷 687-695页

作者：杨一帆梁艺瑶刘保保苏雪蓉乔萍狄留庆赵晓莉南京中医药大学{1. 江苏省中药高效给药系统工程技术研究中心江苏南京210023

目的制备转铁蛋白(transferrin,Tf)修饰的雷公藤甲素(triptolide,TP)脂质体(Tf-TP@Lip),并对其进行质量评价和体外靶向性研究。方法采用薄膜分散法制备Tf-TP@Lip,以包封率和载药量为考察指标,通过单因素考察和星点设计-效应面优化法筛... 详细信息

目的制备转铁蛋白(transferrin,Tf)修饰的雷公藤甲素(triptolide,TP)脂质体(Tf-TP@Lip),并对其进行质量评价和体外靶向性研究。方法采用薄膜分散法制备Tf-TP@Lip,以包封率和载药量为考察指标,通过单因素考察和星点设计-效应面优化法筛选处方和最佳制备工艺;采用超滤离心法测定药物包封率;透射电子显微镜(TEM)观察脂质体微观形态;激光粒度仪测定脂质体的粒径、多分散指数(polydispersity index,PDI)和Zeta电位;并对其体外释放情况进行考察;采用流式细胞仪和荧光显微镜探究细胞摄取情况。结果优化后Tf-TP@Lip的处方和工艺:脂药比为5.72∶1.脂胆比为8.1.∶1.磷脂与DSPE-PEG2000的质量比为6∶1.成膜溶剂为无水乙醇,成膜温度60℃。制得的Tf-TP@Lip平均粒径为(1.0.33±1.89)nm,PDI为0.1.±0.03,Zeta电位为(-23.20±0.64)m V,包封率和载药量分别为(85.33±0.41.%和(9.96±0.21.%,TEM下呈球形,大小均匀、圆整。体外释放研究表明,Tf-TP@Lip相比游离TP具有一定缓释效果。与非靶向雷公藤甲素脂质体(TP@Lip)相比,转铁蛋白的修饰明显增加了SMMC-7721.脂质体的摄取效率。结论制备Tf-TP@Lip稳定、可行,粒径小、外观圆整且具备较高的包封率和载药量,可用于进一步的实验研究。

关键词：雷公藤甲素转铁蛋白修饰脂质体星点设计-效应面法质量评价细胞摄取体外靶向性薄膜分散法超滤离心法

基于UDP-半乳糖变异酶靶标的肉桂酰氨基酸衍生物的合成及生物活性

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化学通报 2023年第2期86卷 216-221页

作者：王青青傅建何梓瑶娄华勇潘卫东张永萍吴静澜贵州中医药大学{1./国家苗药工程技术研究中心/贵州中药炮制与制剂工程技术研究中心贵阳5550025 贵州医科大学药学院/省部共建药用植物功效与利用国家{1. 贵阳550014

为改善前期发现的UDP-半乳糖变异酶(UGM)抑制剂迷迭香酸的稳定性,通过生物电子等排策略,引入稳定性较好的酰胺键来重新构建该化合物。本文设计合成了8个新的肉桂酰氨基酸衍生物,并进行酶水平和菌株水平的活性评价。酶活性测定结果表明,... 详细信息

为改善前期发现的UDP-半乳糖变异酶(UGM)抑制剂迷迭香酸的稳定性,通过生物电子等排策略,引入稳定性较好的酰胺键来重新构建该化合物。本文设计合成了8个新的肉桂酰氨基酸衍生物,并进行酶水平和菌株水平的活性评价。酶活性测定结果表明,化合物5a~5h对UGM具有不同程度的抑制活性,其中化合物5e、5g和5h表现出显著的抑制活性,Kd值均达到了微摩尔级,与目前文献报道的最好抑制剂活性相当。化合物5e对UGM的亲和力比母体化合物迷迭香酸提高了1.倍,Kd分别为4±2μmol/L(KpUGM)和38±5μmol/L(MtUGM)。5e和5h体外对牛型结核分枝杆菌的MIC分别为50和1.0μg/mL。结果表明,目标化合物对UGM具有较强的抑制作用,值得进一步的结构修饰,其也可为开发具有较好前景的抗结核候选药物提供参考。

关键词： UDP-半乳糖变异酶肉桂酰氨基酸衍生物抗结核分子对接

系统性硬化症合并肺动脉高压中医证型分布及中药用药规律研究

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广州中医药大学学报 2023年第1期40卷 15-21页

作者：李淑瑶王馨玉何家颖关彤广州中医药大学第一临床医学院广东广州510405 广州中医药大学第一附属医院风湿病科广东广州510405

【目的】探讨系统性硬化症(systemic sclerosis,SSc)合并肺动脉高压(pulmonary hypertension,PH)的临床特征、中医证型分布及中药用药规律。【方法】收录201.年1.1.至2021.1.月31.广州中医药大学第一附属医院收治的67例SSc患者,根... 详细信息

【目的】探讨系统性硬化症(systemic sclerosis,SSc)合并肺动脉高压(pulmonary hypertension,PH)的临床特征、中医证型分布及中药用药规律。【方法】收录201.年1.1.至2021.1.月31.广州中医药大学第一附属医院收治的67例SSc患者,根据超声心动图测定的肺动脉收缩压(PASP)是否≥37 mmHg,将患者分为系统性硬化症合并肺动脉高压组(SSc-PH组)34例和系统性硬化症不合并肺动脉高压组(SSc-nPH组)33例。收集患者的一般情况、临床症状、{1.指标等资料,分析SSc-PH的危险因素和中医证型分布,并运用中医传承辅助平台V2.5分析中药的用药规律。【结果】(1.SSc-PH患者常伴有心脏受累,尤其是心脏瓣膜病变、肺动脉内径的增宽及右房面积的增大;更容易出现血红蛋白下降、糖类抗原1.-3(CA1.-3)升高及抗Ro-52抗体阳性,组间比较,差异均有统计学意义(P1.。(2)多因素Logistic回归分析提示,抗Ro-52抗体阳性及右房面积增大的患者,更容易出现SSc-PH。(3)SSc-PH患者辨证为虚证为主,以肺脾气虚证(44.1.%)及脾肾阳虚证(29.41.)多见;SSc-nPH患者以实证为主,以寒湿痹阻证(36.36%)多见。组间比较,差异有统计学意义(P药用药频次最多的单药为桂枝,用药频次最多的药物组合为“黄芪,当归”。【结论】抗Ro-52阳性、右房面积增大是SSc-PH的危险因素;SSc-PH中药用药以益气健脾为法,兼以活血祛瘀。

关键词：系统性硬化症肺动脉高压临床特征危险因素中医证型中药用药规律益气健脾