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基于多尺度卷积神经网络的CRISPR/Cas9脱靶预测方法

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生物工程学报 2024年第3期40卷 858-876页

作者：谢焕增黄凌泽罗烨张桂珊汕头大学工学院广东汕头515063

规律成簇的间隔短回文重复序列/CRISPR相关蛋白9(clustered regularly interspaced palindromic repeats/CRISPR-associated protein 9,CRISPR/Cas9)是新一代基因编辑技术,该技术依靠单向导RNA识别特定基因位点,并引导Cas9核酸酶对特定位点进行编辑。然而,该技术存在脱靶效应限制了其发展。近年来,运用深度学习辅助CRISPR/Cas9脱靶预测研究是一个新兴的思路,有助于研究者实现更高效安全的基因编辑和基因治疗。而现有的深度学习模型对脱靶预测的准确性仍有提高空间。为此,本文基于多尺度卷积神经网络提出CnnCRISPR模型预测CRISPR/Cas9的脱靶情况。首先,将向导RNA和DNA序列分别进行独热编码,再将两个二值矩阵按位进行或运算。其次,将编码后的序列输入基于Inception模块的网络进行训练和验证分析。最后,输出向导RNA和DNA序列对的脱靶情况。在公开数据集上的实验结果表明,CnnCRISPR模型的性能优于现有的深度学习脱靶预测模型,为脱靶问题的研究提供了有效且可行的方法。

关键词： CRISPR/Cas9 脱靶效应多尺度卷积神经网络

“生活实践情境”类试题分析及教学思考--以2023年部分高考试题为例

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教学考试 2024年第18期 37-42页

作者：黄凌广东省深圳市第七高级中学

《中国高考评价体系》明确指出,“在应用性方面表现出色的学生善于观察各种现象,能够主动灵活地应用所学知识分析并解决社会生活实践中的问题,高度关注与国家经济社会发展、科学技术进步、生产生活实际等紧密相关的内容与问题,具备良好... 详细信息

《中国高考评价体系》明确指出,“在应用性方面表现出色的学生善于观察各种现象,能够主动灵活地应用所学知识分析并解决社会生活实践中的问题,高度关注与国家经济社会发展、科学技术进步、生产生活实际等紧密相关的内容与问题,具备良好的实际问题解决能力”。

关键词：生产生活实际科学技术进步实践情境善于观察高考评价体系试题分析高考试题主动灵活

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宁夏第三排水沟底泥氮循环细菌群落结构特征

环境科学与技术 2024年第2期47卷 35-44页

作者：郑兰香赵靖黄凌霄宁夏大学生态环境学院宁夏银川750021 宁夏大学土木与水利工程学院宁夏银川750021 宁夏回族自治区黄河水联网数字治水重点实验室宁夏银川750021 宁夏大学信息工程学院宁夏银川750021

底泥是水体氮循环过程的重要场所。为揭示宁夏第三排水沟底泥氮循环细菌群落结构特征,该文在5个采样点底泥理化性质分析基础上,采用荧光定量PCR法测定硝化和反硝化功能基因丰度,并对细菌群落与环境因子进行相关性分析。研究结果表明:除... 详细信息

底泥是水体氮循环过程的重要场所。为揭示宁夏第三排水沟底泥氮循环细菌群落结构特征,该文在5个采样点底泥理化性质分析基础上,采用荧光定量PCR法测定硝化和反硝化功能基因丰度,并对细菌群落与环境因子进行相关性分析。研究结果表明:除三排起点底泥中pH值为6.96以外,其余点均呈弱碱性。有机碳、铵态氮、硝态氮、全氮和全磷沿沟的空间分布均呈先降低后增高趋势。在硝化菌群落中,AOB amoA基因丰度(3.16×10^(6)~7.95×10^(7)copies/g)远高于AOA amoA(5.62×10^(3)~3.76×10^(5)copies/g);反硝化菌群落中,nirS基因丰度(6.87×10^(7)~9.16×10^(8)copies/g)高于nirK(2.40×10^(7)~3.42×10^(8)copies/g)。泉古菌门是AOA主要优势菌门,变形菌门为AOB、nirK和nirS共有的主要优势菌门。底泥中的氮循环微生物群落结构与环境因素的Spearman相关性分析表明,AOA与铵态氮呈显著正相关(P<0.05),与TOC呈极显著负相关(P<0.001);AOB与pH呈显著正相关;nirS型反硝化菌与pH呈显著负相关;nirK型反硝化菌与TOC呈极显著负相关,三排底泥氮循环功能微生物群落差别较大且受理化因子影响显著。

关键词：底泥氮循环群落结构 AOA AOB nirK nirS

超高热通量下非共沸不互溶混合物在多孔壁面微通道中的快速沸腾传热研究

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工程热物理学报 2024年第1期45卷 263-270页

作者：孙波包雨晨李骥中国科学院大学工程科学学院北京101408

本文提出了一种结构优化的具有大量亚微米成核点位的多孔壁面微通道两相换热器,并在流量50~150 L/h和热通量50~400 W/cm^(2)的工况下,对HFE-7100和HFE-7100/水的非共沸不互溶混合物的过冷流动沸腾特性进行了比较。结果表明,与HFE-7100相... 详细信息

本文提出了一种结构优化的具有大量亚微米成核点位的多孔壁面微通道两相换热器,并在流量50~150 L/h和热通量50~400 W/cm^(2)的工况下,对HFE-7100和HFE-7100/水的非共沸不互溶混合物的过冷流动沸腾特性进行了比较。结果表明,与HFE-7100相比,HFE-7100/水的混合液在多孔微通道中的沸腾换热效率更高,换热器的结温更低,并且沸腾所需的壁面过热度更小。此外,二元混合物组分的体积比对两相传热特性有着显著影响,不同工况对应着一个基于热阻–泵送功率最小化原则的最佳体积比。

关键词：微通道亚微米成核点非共沸不互溶超高热流密度

瓶刷嵌段共聚物聚甲基丙烯酸甲酯-b-聚环氧乙烷的合成与乳液界面自组装制备结构色颜料

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高分子学报 2024年第11期55卷 1504-1517页

作者：黄凌峰宋东坡李悦生天津大学材料科学与工程学院天津300350

针对车漆涂料等应用场景对结构色材料较高的耐候性能要求,本工作利用有序自发乳化机制成功制备了聚甲基丙烯酸甲酯(PMMA)为骨架的有序多孔光子微球,展现了靓丽可调的结构色.通过原子转移自由基聚合(ATRP)合成了窄分子量分布的PMMA,并利... 详细信息

针对车漆涂料等应用场景对结构色材料较高的耐候性能要求,本工作利用有序自发乳化机制成功制备了聚甲基丙烯酸甲酯(PMMA)为骨架的有序多孔光子微球,展现了靓丽可调的结构色.通过原子转移自由基聚合(ATRP)合成了窄分子量分布的PMMA,并利用巯烯反应高效除去了因歧化终止而产生的端末双键,进一步利用酯化反应合成了末端带有降冰片烯单元的PMMA大单体.通过顺序开环易位聚合(ROMP)的合成方法,成功合成了(聚降冰片烯-g-聚甲基丙烯酸甲酯)-b-(聚降冰片烯-g-聚环氧乙烷)(PMMA-b-PEO)嵌段共聚物刷(BBCPs),数均分子量在174 kDa~359 kDa范围内可调,PDI维持在1.2以下.在有序自发乳化制备结构色颜料的过程中,采用生物来源、安全环保的苯甲醚作为油相溶剂替代甲苯,使得材料制备过程更加安全环保,消除了产物中可能的有害残留,有利于规模制备与应用.PMMA材质的结构色颜料预期具有良好的耐候性能,有望用于车漆涂料等应用场景.

关键词：嵌段共聚物自组装环保材料结构色

不同温度作用下砂岩能量演化机制及本构模型研究

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西南交通大学学报 2024年

作者：雷瑞德周林森胡超李梦来黄凌四川轻化工大学桥梁无损检测与工程计算四川省高校重点实验室重庆地质矿产研究院页岩气勘探开发国家地方联合工程研究中心四川轻化工大学土木工程学院

为研究高温对砂岩物理力学性能劣化的影响，本文对不同温度作用下热处理砂岩开展了一系列单轴压缩试验，基于能量理论对整个变形破裂过程进行了阶段划分，并结合Weibull分布函数和损伤力学理论，采用分段函数的方法构建了热-力耦合损伤... 详细信息

为研究高温对砂岩物理力学性能劣化的影响，本文对不同温度作用下热处理砂岩开展了一系列单轴压缩试验，基于能量理论对整个变形破裂过程进行了阶段划分，并结合Weibull分布函数和损伤力学理论，采用分段函数的方法构建了热-力耦合损伤本构模型。研究结果表明：随着温度的增加，砂岩峰值强度和弹性模量呈现出先增加后减小的变化趋势；破断模式由斜向剪切破坏向“Y”型共轭拉-剪混合破坏转变，脆-延性转变的临界温度阈值为400 ℃。根据耗散能演化特征将整个加载过程划分为裂纹闭合阶段、弹性阶段和宏观裂纹扩展阶段和峰后阶段；弹性能耗比（K）的拐点可作为砂岩由弹性向塑性转变的突变点。基于温度和荷载损伤因子，建立了考虑裂纹闭合阶段的热-力耦合损伤本构模型，模型中Weibull参数在一定程度上可以反映砂岩的强度和塑性特征，理论模型与室内试验结果吻合度较高，量化反演了热-力耦合条件下砂岩损伤演化全过程。

关键词：岩石力学高温处理耗散能本构模型

利益衡量视角下对赌协议可履行性判断的规则设计

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清华法学 2024年第5期18卷 150-163页

作者：包康赟清华大学法学院

对赌协议的可履行性是当下对赌纠纷的争议焦点，可履行性判断的标准和主体也成为理论和实务界的核心关切。基于利益衡量的视角，相关规则设计在微观上应妥善调和对赌股东、债权人和公司等主体的利益冲突；在宏观上应重视对赌履行作为资... 详细信息

对赌协议的可履行性是当下对赌纠纷的争议焦点，可履行性判断的标准和主体也成为理论和实务界的核心关切。基于利益衡量的视角，相关规则设计在微观上应妥善调和对赌股东、债权人和公司等主体的利益冲突；在宏观上应重视对赌履行作为资本退出渠道的作用，进而兼顾创投市场良性循环和创新经济发展等社会公共利益。就判断标准而言，资本维持原则会导致微观利益失衡和宏观利益缺位，应转向将公司利益纳入考量的偿债能力测试。对于判断主体，对赌纠纷的利益冲突构造有别于常规公司分配场景，董事会在利益衡量时固有的立场偏颇难以被信义义务制度有效约束。为弥补董事会判断的缺陷，法官作为纠纷裁判者应实质审查董事会的判断结果，并通过证明责任的合理配置实现对各类利益的均衡保护。

关键词：对赌协议利益衡量偿债能力测试信义义务股权回购

深刻把握高校社会主义核心价值观铸魂育人的基本规律

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中国高等教育 2024年第11期 12-17页

作者：柏路包崇庆东北师范大学

把握高校社会主义核心价值观铸魂育人基本规律的根本途径,在于揭示“价值观”“铸育过程”“人”三个关键范畴的对立统一关系,即把握“价值的理想性规定”与“群体的现实性需要”的关系、“价值的整体性统摄”与“铸魂育人的层次性结构... 详细信息

把握高校社会主义核心价值观铸魂育人基本规律的根本途径,在于揭示“价值观”“铸育过程”“人”三个关键范畴的对立统一关系,即把握“价值的理想性规定”与“群体的现实性需要”的关系、“价值的整体性统摄”与“铸魂育人的层次性结构”的关系、“铸魂育人的形塑性本质”与“群体的能动性实践”的关系。以此为基础,阐释高校社会主义核心价值观铸魂育人的三大基本规律:价值理想的群体感召律、铸育过程的循序贯通律、灵魂铸塑的实践生成律。

关键词：社会主义核心价值观铸魂育人人的现代化立德树人

从“钙帮” 到“钙联天下”——人才工作如何“点石成金”

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中国人才 2024年第8期 78-79页

作者：黄凌广西贺州市委组织部广西贺州市委人才办

“中国重钙之都”“中国岗石之都”——广西贺州,地处桂粤湘三省(区)交汇处,矿产资源得天独厚,特别是大理石初步探明储量达26亿立方米,约占全国大理石资源总量的八分之一,是华南地区最大的白色大理石资源产地。作为一名地地道道的贺州人... 详细信息

“中国重钙之都”“中国岗石之都”——广西贺州,地处桂粤湘三省(区)交汇处,矿产资源得天独厚,特别是大理石初步探明储量达26亿立方米,约占全国大理石资源总量的八分之一,是华南地区最大的白色大理石资源产地。作为一名地地道道的贺州人,我亲身感受了上世纪“贺州白”的声名鹊起,也亲眼目赌了家乡“石头经济”的跌落之砀。

关键词：矿产资源探明储量广西贺州大理石省(区) 华南地区