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2020-2021年中国10所教学医院院内感染常见病原菌分布和耐药监测

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中华检验医学杂志 2024年第6期47卷 619-628页

作者：李曙光鲁炳怀褚云卓张嵘曾吉苏丹虹卓超金炎徐修礼廖康胡志东王辉北京大学人民医院检验科北京100044 中日友好医院呼吸与危重症医学科二部临床微生物与感染实验室北京100029 中国医科大学附属第一医院检验科沈阳110001 浙江大学医学院附属第二医院检验科杭州310009 华中科技大学同济医学院附属普爱医院检验科武汉430033 广州医科大学附属第一医院检验科广州510120 广州医科大学附属第一医院呼吸疾病国家重点实验室广州510120 山东省立医院检验科济南250021 空军军医大学西京医院检验科西安710032 中山大学附属第一医院检验科广州510080 天津医科大学总医院医学检验科天津300052

目的监测2020—2021年我国引起院内感染的主要病原菌的病原谱分布和对主要抗菌药物的敏感性。方法回顾性收集来自我国10家教学医院的引起院内血流感染(BSI,670株)、医院获得性肺炎(HAP,394株)和院内腹腔感染(IAI,247株)的病原菌1311株... 详细信息

目的监测2020—2021年我国引起院内感染的主要病原菌的病原谱分布和对主要抗菌药物的敏感性。方法回顾性收集来自我国10家教学医院的引起院内血流感染(BSI,670株)、医院获得性肺炎(HAP,394株)和院内腹腔感染(IAI,247株)的病原菌1311株。经中心实验室复核菌株后,对临床常见菌株进行抗菌药物药敏试验,采用琼脂稀释法或微量肉汤稀释法测定菌株的最低抑菌浓度(MIC),药敏折点采用美国临床和实验室标准协会2023年M100(第33版)标准。使用χ^(2)检验进行率的比较。结果BSI最主要的致病菌是大肠埃希菌(21.2%,142/670)、肺炎克雷伯菌(14.9%,100/670)和金黄色葡萄球菌(11.5%,77/670);HAP最主要致病菌是肺炎克雷伯菌(27.7%,109/394)、鲍曼不动杆菌(22.1%,87/394)和铜绿假单胞菌(18.3%,72/394);IAI最主要的致病菌是大肠埃希菌(24.3%,60/247)、屎肠球菌和肺炎克雷伯菌(均为14.6%,36/247)。金黄色葡萄球菌对替加环素、利奈唑胺、达托霉素和糖肽类抗菌药物均表现为敏感。甲氧西林耐药的金黄色葡萄球菌(MRSA)和凝固酶阴性葡萄球菌(MRCNS)的检出率分别为36.5%(42/115)和74.5%(38/51)。屎肠球菌和粪肠球菌对万古霉素的耐药率分别为3.3%(3/90)和1.9%(1/53)。肺炎克雷伯菌和大肠埃希菌中超广谱β内酰胺酶的检出率分别为23.7%(58/245)和60.5%(130/215),碳青霉烯耐药株的检出率分别为29.8%(73/245)和4.2%(9/215),对替加环素的耐药率分别为1.6%(4/245)和0,对黏菌素的耐药率分别为1.6%(4/245)和2.8%(6/215),对头孢他啶/阿维巴坦的耐药率分别为2.0%(5/245)和2.3%(5/215)。鲍曼不动杆菌除对黏菌素(98.8%,161/163)和替加环素(89.6%,146/163)表现出较高的敏感性,对其他抗菌药物均表现出较高的耐药率,碳青霉烯耐药株的检出率达到76.7%(125/163)。碳青霉烯耐药的铜绿假单胞菌检出率为28.4%(33/116);黏菌素、阿米卡星和头孢他啶/阿维巴坦对铜绿假单胞菌表现出较强的抗菌活性,敏感率分别为99.1%(115/116)、94.0%(109/116)和83.6%(97/116)。结论引起院内感染的主要病原菌是肺炎克雷伯菌、大肠埃希菌、鲍曼不动杆菌、铜绿假单胞菌和金黄色葡萄球菌。替加环素、黏菌素和头孢他啶/阿维巴坦对大部分常见革兰阴性杆菌表现出较强的抗菌活性。鲍曼不动杆菌耐药问题依然严重。碳青霉烯耐药的肠杆菌目细菌检出率继续升高,需继续加强抗菌药物合理应用及医院感染防控。

关键词：医院内感染细菌感染血流感染医院获得性肺炎腹腔感染抗菌药物药敏试验耐药性

mNGS应用背景下的下呼吸道感染病原学检测基础能力

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中华结核和呼吸杂志 2023年第4期46卷 315-318页

作者：鲁炳怀中日友好医院呼吸与危重症医学科、临床微生物与感染实验室北京100029

除临床表现、病史、影像学外,下呼吸道感染(LRTI)的诊断水平主要依赖于临床微生物学实验室病原学检测能力,但常规培养耗时长,显微镜检的敏感度低,PCR等分子生物学检测方案覆盖的病原类别有限。近年来宏基因组测序(mNGS)技术的应用提高了... 详细信息

除临床表现、病史、影像学外,下呼吸道感染(LRTI)的诊断水平主要依赖于临床微生物学实验室病原学检测能力,但常规培养耗时长,显微镜检的敏感度低,PCR等分子生物学检测方案覆盖的病原类别有限。近年来宏基因组测序(mNGS)技术的应用提高了LRTI的诊断率,从而也出现对常规微生物检测能力不重视的现象。本文对如何适当使用上述检测方法加以评述,并建议在mNGS背景下,进一步加强临床微生物检测能力的建设。

关键词：下呼吸道感染显微镜检微生物检测分子生物学检测诊断水平宏基因组测序病原学检测影像学

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肺炎克雷伯菌多黏菌素耐药机制的研究进展

中华检验医学杂志 2023年第6期46卷 628-633页

作者：武永莉鲁炳怀中日友好医院、中国医学科学院、北京协和医学院研究生院中日友好医院北京100029

近年来,碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌临床分离率不断增加,导致多黏菌素成为治疗多重耐药肺炎克雷伯菌感染的重要防线,但随着多黏菌素的使用增多,其耐药率也逐渐升高。肺炎克雷伯菌多黏菌素耐药机制多种多样,以外膜修饰脂多糖为主。参与这... 详细信息

近年来,碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌临床分离率不断增加,导致多黏菌素成为治疗多重耐药肺炎克雷伯菌感染的重要防线,但随着多黏菌素的使用增多,其耐药率也逐渐升高。肺炎克雷伯菌多黏菌素耐药机制多种多样,以外膜修饰脂多糖为主。参与这一过程的基因除位于染色体上的双组份系统phoPQ、pmrAB、crrAB及负性调控跨膜蛋白mgrB基因外,质粒携带的移动性多黏菌素耐药基因mcr也能介导外膜修饰。其中,mgrB基因变异对多黏菌素耐药起关键作用。本文主要阐述肺炎克雷伯菌多黏菌素耐药机制,以更好遏制肺炎克雷伯菌多黏菌素耐药发生。

关键词：多黏菌素类克雷伯菌,肺炎抗药性,细菌

实验室传统检测与宏基因组二代测序在肺部真菌感染诊断中的应用价值

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华西医学 2022年第8期37卷 1128-1133页

作者：武永莉鲁炳怀中国医学科学院北京协和医学院研究生院北京100730 中日友好医院呼吸与危重症医学科临床微生物与感染实验室北京100029

近年来,由于免疫抑制剂的广泛使用,肿瘤、器官移植患者的增多,侵袭性真菌病,特别是肺真菌病的发病率逐年升高。除临床表现、病史、影像学资料外,肺真菌病的诊断主要依赖实验室病原学检测。但真菌培养耗时长、灵敏度低,需要更多的检测手... 详细信息

近年来,由于免疫抑制剂的广泛使用,肿瘤、器官移植患者的增多,侵袭性真菌病,特别是肺真菌病的发病率逐年升高。除临床表现、病史、影像学资料外,肺真菌病的诊断主要依赖实验室病原学检测。但真菌培养耗时长、灵敏度低,需要更多的检测手段。近年来宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)的出现极大提高了肺部真菌感染的诊断率。相比之下,mNGS能直接从各种临床标本中快速、准确、全面识别真菌,尤其在鉴定非典型真菌的类群方面明显优于传统检测方法,但在样本留取、报告解读及与传统检测方法相结合等方面也存在一些问题。值得肯定的是,随着以上问题不断深入探讨和解决,mNGS必将为肺部真菌感染的病原学诊断提供更有价值的信息。

关键词：肺真菌病宏基因组二代测序曲霉属隐球菌属

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耶氏肺孢子菌肺炎临床特征分析

中华检验医学杂志 2022年第9期45卷 930-935页

作者：韩嘉静赵建康刘鑫梦范艳艳王春雷黎斌斌鲁炳怀中日友好医院呼吸中心临床微生物与感染实验室北京100029

目的分析耶氏肺孢子菌肺炎(PJP)患者的临床特征、实验室指标与影像学特点,为该病的临床诊治提供依据。方法纳入2017年5月至2020年8月中日友好医院就诊的154例PJP患者。收集患者的临床症状、实验室检查和预后情况,并将患者分为死亡组(51... 详细信息

目的分析耶氏肺孢子菌肺炎(PJP)患者的临床特征、实验室指标与影像学特点,为该病的临床诊治提供依据。方法纳入2017年5月至2020年8月中日友好医院就诊的154例PJP患者。收集患者的临床症状、实验室检查和预后情况,并将患者分为死亡组(51例)与存活组(103例),采用t检验、非参数检验、卡方检验等统计学方法比较死亡组与存活组实验室检查结果的差异。结果154例PJP患者中男性89例,女性65例,年龄(53.7±14.8)岁。其中,1个月内使用免疫抑制剂的患者占85.7%(132/154),肾脏疾病患者27.9%(43/154),结缔组织病患者33.1%(51/154)。临床症状方面,发热81.8%(126/154),咳嗽59.7%(92/154),呼吸困难52.6%(81/154)。实验室检查,乳酸脱氢酶(LDH)561.0(434.3,749.0)IU/L,91.3%(95/104)患者LDH升高;CD4+T淋巴细胞100.0 ng/L。影像学检查,CT检查90%(117/130)患者可见双肺弥漫性磨玻璃/网格影。死亡组患者LDH 690.5(528.8,932.3)IU/L,高于存活组502.5(381.8,657.0)IU/L(Z=-3.375,P=0.001);死亡组的白细胞计数9.8(5.8,12.6)×109/L高于存活组的7.3(5.0,10.1)×109/L(Z=-2.392,P=0.017);死亡组淋巴细胞比例5.3(3.2,9.3)%,低于存活组9.6(5.6,17.2)%(Z=-3.262,P=0.001);死亡组年龄(69.8±14.5)岁,高于存活组(50.6±14.0)岁(t=-3.756,P=0.001);死亡组患者动脉氧分压均值(64.8±17.7)mmHg(1 mmHg=0.133 kPa),低于存活组(73.2±20.5)mmHg(t=2.345,P=0.021);死亡组患者合并细菌/曲霉菌感染为55.1%(27/51),高于存活组21.5%(22/103)(χ^(2)=15.372,P=0.001)。结论长期使用免疫抑制剂/糖皮质激素者易发生PJP;CD4+T淋巴细胞、LDH、BG可作为辅助临床诊断PJP的重要参考指标;年龄、LDH、白细胞计数、淋巴细胞比率、动脉氧分压及是否合并细菌和/或曲霉感染与PJP患者预后关系密切。

关键词：乳酸脱氢酶类耶氏肺孢子菌肺炎耶氏肺孢子菌 (1,3)-β-D葡聚糖试验

下呼吸道诺卡菌病诺卡菌菌种分布和耐药情况分析

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国际检验医学杂志 2023年第12期44卷 1435-1441页

作者：胡晏宁王利君鲁炳怀北京大学中日友好临床医学院北京100029 中日友好医院临床微生物感染实验室北京100029 清华大学临床医学院北京清华长庚医院检验科北京102218

目的收集中日友好医院106例诺卡菌病患者的108株非重复性诺卡菌,并分析其菌种分布及抗菌药物敏感耐药情况。方法通过基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱或16S rRNA靶向测序鉴定诺卡菌菌属,采用微量肉汤稀释法测定诺卡菌对15种抗菌药... 详细信息

目的收集中日友好医院106例诺卡菌病患者的108株非重复性诺卡菌,并分析其菌种分布及抗菌药物敏感耐药情况。方法通过基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱或16S rRNA靶向测序鉴定诺卡菌菌属,采用微量肉汤稀释法测定诺卡菌对15种抗菌药物的敏感耐药情况,总结2例同时感染2种诺卡菌的肺诺卡菌病患者和3例肺移植后肺诺卡菌病患者的临床特征。结果在108株诺卡菌菌株中,从痰液和支气管肺泡灌洗液分别分离出诺卡菌67株(62.0%)、32株(29.6%)。皮疽诺卡菌(35.2%)、盖尔森基兴诺卡菌(32.4%)和脓肿诺卡菌(11.1%)是分离数居前3位的诺卡菌菌种。所有诺卡菌菌株均未对利奈唑胺耐药,仅有2.6%的皮疽诺卡菌对甲氧苄啶-磺胺甲噁唑(TMP-SMZ)耐药。结论诺卡菌菌株对TMP-SMZ和利奈唑胺均高度敏感,但不同诺卡菌菌种对抗菌药物的耐药性特征不同。

关键词：下呼吸道感染诺卡菌诺卡菌病肺移植甲氧苄啶-磺胺甲噁唑

477例孕晚期妇女宫颈分泌物携带细菌的分布和耐药分析

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临床检验杂志 2011年第2期29卷 155-156页

作者：鲁炳怀李雪清时琰丽民航总医院检验科北京100123

目的研究孕晚期妇女生殖系统携带细菌的分布与耐药性特征,为临床预防、治疗围产期母、婴相关的细菌感染性疾病提供实验室依据。方法回顾性分析本院产科2007～20082年间1968例门诊及住院孕晚期妇女宫颈分泌物中分离细菌的微生物学资料。... 详细信息

目的研究孕晚期妇女生殖系统携带细菌的分布与耐药性特征,为临床预防、治疗围产期母、婴相关的细菌感染性疾病提供实验室依据。方法回顾性分析本院产科2007～20082年间1968例门诊及住院孕晚期妇女宫颈分泌物中分离细菌的微生物学资料。结果 2年间孕晚期妇女宫颈分泌物细菌携带率为24.2%(477/1968),分离的常见菌依次为金黄色葡萄球菌(24.7%)、大肠埃希菌(19.7%)、凝固酶阴性葡萄球菌(CNS,17.0%)、肺炎克雷伯菌(10.1%)、肠球菌属(9.0%)、B族链球菌(GBS,7.1%);其中大肠埃希菌与肺炎克雷伯菌的超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)检出率分别为12.8%与14.5%;金黄色葡萄球菌与CNS中耐甲氧西林葡萄球菌(MRS)的检出率分别为33.1%与43.2%;GBS对青霉素的敏感率91.2%。结论孕晚期妇女生殖系统携带细菌中葡萄球菌的耐药率较高,可能与抗生素的不规范使用有关,临床应引起重视。GBS感染率比例较低,对青霉素类的敏感性较好。

关键词：孕晚期宫颈分泌物细菌分布耐药性 B族链球菌

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用全自动血培养仪进行体液病原菌培养

临床检验杂志 2011年第5期29卷 373-374页

作者：鲁炳怀时琰丽朱凤霞民航总医院检验科北京100123

全自动血培养仪广泛用于临床，为血液感染提供了方便快速的检测方法。而脑膜炎、关节炎、心包炎等诊断有赖采用传统培养方法（固体培养基如血平板或巧克力平板培养，或使用脑心浸液增菌）作体液培养，病原菌检出率较低。有作者推荐使用... 详细信息

全自动血培养仪广泛用于临床，为血液感染提供了方便快速的检测方法。而脑膜炎、关节炎、心包炎等诊断有赖采用传统培养方法（固体培养基如血平板或巧克力平板培养，或使用脑心浸液增菌）作体液培养，病原菌检出率较低。有作者推荐使用血培养仪进行体液的病原菌培养，对此本文作总结和讨论。

关键词：体液病原菌培养全自动血培养仪

近5年肺移植科及呼吸科患者细菌碳青霉烯酶分布及耐药调查

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中日友好医院学报 2023年第6期37卷 323-327页

作者：李梦雪李子尧鲁炳怀中日友好医院呼吸中心中国医学科学院呼吸病学研究所国家呼吸医学中心北京100029

目的:调查肺移植及呼吸病患者中分离的耐碳青霉烯肠杆菌目(CRE)的碳青霉烯酶分布及耐药情况。方法:收集北京某医院2017年6月—2021年5月肺移植科、呼吸科及重症呼吸科患者中分离的非重复CRE细菌(VITEK-2全自动分析鉴定仪检测),并用纸片... 详细信息

目的:调查肺移植及呼吸病患者中分离的耐碳青霉烯肠杆菌目(CRE)的碳青霉烯酶分布及耐药情况。方法:收集北京某医院2017年6月—2021年5月肺移植科、呼吸科及重症呼吸科患者中分离的非重复CRE细菌(VITEK-2全自动分析鉴定仪检测),并用纸片扩散法复核药敏。采用碳青霉烯酶抑制增强试验及多重实时荧光PCR检测碳青霉烯酶基因及VITEK-2中的药敏结果。结果:本研究共纳入了肺移植科58株、呼吸科69株及重症呼吸科32株CRE菌株共3组标本。标本类型均以呼吸道来源为主(77.59%,78.26%,84.38%),分离的菌株中以肺炎克雷伯菌最为多见(72.41%,86.96%,84.38%),阴沟肠杆菌(10.34%,5.80%,6.25%)次之。肺移植科与呼吸科患者中碳青霉烯酶分布差异具有统计学意义,肺移植科金属酶检出比率高(27.59%vs11.59%,P<0.05);呼吸科患者中检出的丝氨酸酶较多(86.96%vs68.97%,P<0.05)。丝氨酸酶在3组患者标本的肺炎克雷伯菌中分布最为广泛(78.57%,91.67%,100%)。结论:呼吸道标本是分离CRE菌株的主要来源。菌株中均以产丝氨酸酶的肺炎克雷伯菌为主,且金属酶集中分布在大肠埃希菌及阴沟肠杆菌中。妥布霉素、阿米卡星及复方新诺明的敏感率稍高。

关键词：耐碳青霉烯肺移植碳青霉烯酶分布