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非等声速信道下的循环神经网络机动目标跟踪模型

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声学学报 2021年第6期46卷 1013-1027页

作者：李悦马晓川刘宇王磊李璇魏润宇中国科学院声学研究所北京100190 中国科学院水下航行器信息技术重点实验室北京100190 中国科学院大学北京100049

针对水下非等声速信道声线弯曲导致传统滤波跟踪轨迹偏差的问题,提出一种循环神经网络的目标跟踪模型。该模型在缺乏声速剖面信息的情况下,通过数据驱动迭代训练,学习输入观测值与输出状态值之间的映射关系,实现目标位置和瞬态特征变化... 详细信息

针对水下非等声速信道声线弯曲导致传统滤波跟踪轨迹偏差的问题,提出一种循环神经网络的目标跟踪模型。该模型在缺乏声速剖面信息的情况下,通过数据驱动迭代训练,学习输入观测值与输出状态值之间的映射关系,实现目标位置和瞬态特征变化的精确获知。蒙特卡洛仿真实验结果表明,本文模型在非等声速信道下复杂机动场景中相较传统单模型滤波算法以及交互式多模型算法,水平距离跟踪精度分别提升4.06%,1.57%,深度估计精度分别提升0.87%,0.85%。本文模型相较于传统滤波方法具有更高的跟踪精度,并且能够在失配声速分布信道下进行迁移学习,提升模型在失配声场环境下的泛化性。

关键词：交互式多模型算法循环神经网络失配声速分布蒙特卡洛仿真迁移学习数据驱动轨迹偏差

4株新出现的Ⅰ类新城疫病毒F基因的变异分析

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畜牧兽医学报 2018年第8期49卷 1781-1788页

作者：魏润宇罗瑶瑶吕艳王静静郑东霞赵云玲刘文博刘华雷王志亮扬州大学兽医学院扬州225009 中国动物卫生与流行病中心青岛266032 江苏高校动物重要疫病与人畜共患病防控协同创新中心扬州225009 青岛农业大学青岛266109

为了分析我国新出现的Ⅰ类新城疫病毒的分布和分子特性,对2016年分离到的4株Ⅰ类新城疫病毒进行F基因序列分析和遗传进化分析。结果显示:4株Ⅰ类新城疫病毒F基因编码长度均为1 662nt,共编码553个氨基酸,分离株之间氨基酸相似性为97.9%~1... 详细信息

为了分析我国新出现的Ⅰ类新城疫病毒的分布和分子特性,对2016年分离到的4株Ⅰ类新城疫病毒进行F基因序列分析和遗传进化分析。结果显示:4株Ⅰ类新城疫病毒F基因编码长度均为1 662nt,共编码553个氨基酸,分离株之间氨基酸相似性为97.9%~100%。4株分离株F蛋白裂解位点的氨基酸组成均为112 ERQERL117,符合新城疫病毒弱毒株的分子特征。F基因高变区(47—420nt)遗传进化分析结果显示这4株病毒为国内新出现的基因型,利用F基因编码区全长序列构建系统进化树显示4株病毒属于基因1c亚型,与北美分离株高度同源,而与国内基因1c亚型分离株(Duck/Guangxi/1261/2015)相似性仅为95.5%~97%。监测数据表明这种新出现的Ⅰ类新城疫病毒具有在国内进一步流行和扩散的风险。

关键词： Ⅰ类新城疫病毒分子特征遗传进化分析

我国新出现的基因Ⅻ型新城疫病毒(NDV)的基因组特性

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中国兽医学报 2018年第12期38卷 2296-2300页

作者：王静静吕艳郑东霞赵云玲戈胜强罗瑶瑶魏润宇刘华雷王志亮中国动物卫生与流行病学中心

为了解我国新出现的基因Ⅻ型新城疫病毒(NDV)的分子特性,分析其基因组遗传演化特征,对2010―2012年我国首次分离到的3株基因Ⅻ型新城疫代表株进行基因组测序和生物信息学分析。结果显示,3株病毒F蛋白裂解位点相同为112 RRQKR/F117,符合... 详细信息

为了解我国新出现的基因Ⅻ型新城疫病毒(NDV)的分子特性,分析其基因组遗传演化特征,对2010―2012年我国首次分离到的3株基因Ⅻ型新城疫代表株进行基因组测序和生物信息学分析。结果显示,3株病毒F蛋白裂解位点相同为112 RRQKR/F117,符合强毒株特征。病毒基因组长度均为15 192nt,与早期基因型(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ型)毒株相比,其在NP基因5′端非编码区有6个核苷酸插入。3株病毒在F蛋白信号肽、七肽重复区和跨膜区,以及HN蛋白跨膜区、中和抗原表位等功能区有多处氨基酸变异。病毒基因组遗传进化分析结果显示,3株病毒均属于基因Ⅻ型,但与南美地区分离株不同(基因Ⅻa亚型),我国分离株为基因Ⅻb亚型。

关键词：基因Ⅻ型NDV 氨基酸变异遗传进化分析

1株Ⅰ类新基因型新城疫病毒的基因组特性分析

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中国兽医学报 2019年第1期39卷 46-51页

作者：魏润宇王静静吕艳罗瑶瑶郑东霞赵云玲李金明刘文博刘华雷王志亮中国动物卫生与流行病中心山东青岛266032 扬州大学兽医学院江苏扬州225009

为了研究我国新型新城疫病毒的分子流行病学特性,对2016年从主动监测中分离到的1株新出现的鸭源新城疫病毒(duck/China/NX2209/2016)进行了基因组测序和遗传进化分析。序列分析结果显示该分离株全长15 198nt,F基因ORF全长为1 662bp,共编... 详细信息

为了研究我国新型新城疫病毒的分子流行病学特性,对2016年从主动监测中分离到的1株新出现的鸭源新城疫病毒(duck/China/NX2209/2016)进行了基因组测序和遗传进化分析。序列分析结果显示该分离株全长15 198nt,F基因ORF全长为1 662bp,共编码553个氨基酸,裂解位点处的氨基酸为:^(112) ERQERL^(117),符合低致病性新城疫病毒特征。同源性分析表明该新型毒株同北美分离株具有较高的同源性。F基因高变区进化分析结果显示,该病毒属于ClassⅠ,但不属于基因型1～10,为新型毒株。完整F基因进化树结果显示,该病毒属于基因1c亚型,与北美分离株高度同源。

关键词：新城疫病毒 Ⅰ类新基因型分子特征

新城疫强毒株荧光定量RT-PCR检测技术的建立及应用

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病毒学报 2018年第4期34卷 541-549页

作者：罗瑶瑶王静静吕艳赵云玲郑东霞魏润宇于松梅左媛媛张乐萃单虎刘华雷王志亮中国动物卫生与流行病学中心青岛266032 青岛农业大学动物医学院青岛266109 扬州大学扬州225009

基于国内流行的新城疫病毒强毒株F蛋白裂解位点分子特征设计特异性引物及Taqman探针,建立了一种可检测新城疫强毒株的一步法实时荧光定量RT-PCR方法。通过体外转录法制备cRNA标准品作为阳性模板制作标准曲线以及临床样品的检测绘制出RO... 详细信息

基于国内流行的新城疫病毒强毒株F蛋白裂解位点分子特征设计特异性引物及Taqman探针,建立了一种可检测新城疫强毒株的一步法实时荧光定量RT-PCR方法。通过体外转录法制备cRNA标准品作为阳性模板制作标准曲线以及临床样品的检测绘制出ROC曲线,对诊断指标进行系统评价。结果显示：该方法的标准曲线为Y=-3.390X＋38.23,相关系数R2为0.9999;灵敏度试验显示,该方法的最低检测限为2拷贝/μL,比常规RTPCR高10倍;特异性试验显示该方法与常见禽病病毒无交叉反应;重复性试验的组内和组间的变异系数分别低于1%和1.5%。通过检测1 974份临床样品绘制ROC曲线显示,ROC曲线下面积为0.9861,当Youden Index为93.12时,cutoff值设为35,诊断的敏感性和特异性分别为94.82%、98.3%,与病毒分离方法的Kappa系数为0.919。本研究建立的方法敏感性高、特异性强、重复性好、诊断准确性极好,给实验室提供一种快速、实用的检测临床样品的方法。

关键词：新城疫病毒(NDV) 强毒荧光定量RT-PCR ROC曲线

病原微生物实验室压力蒸汽灭菌器的规范化使用

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中国标准化 2021年第22期 238-243页

作者：孙世雄孙翔翔樊晓旭魏润宇张培培王毓秀孙淑芳中国动物卫生与流行病学中心

压力蒸汽灭菌器属压力容器,是病原微生物实验室常用的消毒灭菌设备。本文结合病原微生物实验室的特点,从特种设备管理、灭菌效果监测、排气口生物安全性等方面,探讨压力蒸汽灭菌器的规范使用和安全管理。

关键词：病原微生物实验室压力蒸汽灭菌器特种设备灭菌效果

2014-2017年我国部分地区10株鸽副黏病毒的分布及其分子特征

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中国兽医学报 2018年第10期38卷 1883-1886,1931页

作者：罗瑶瑶王静静王云平魏润宇吕艳赵云玲郑东霞于松梅张乐萃刘华雷王志亮单虎青岛农业大学动物医学院山东青岛266109 中国动物卫生与流行病中心山东青岛266032 青海省动物疫病预防控制中心青海西宁810001 扬州大学江苏扬州225009

为了解我国鸽群新城疫病毒的感染情况,于2014-2017年在国内部分地区开展了基于风险的新城疫主动监测,结果从部分地区活禽市场的鸽群及环境样本中成功分离到10株新城疫病毒,并对其F基因全长进行扩增和遗传进化分析。结果显示,10株新城疫... 详细信息

为了解我国鸽群新城疫病毒的感染情况,于2014-2017年在国内部分地区开展了基于风险的新城疫主动监测,结果从部分地区活禽市场的鸽群及环境样本中成功分离到10株新城疫病毒,并对其F基因全长进行扩增和遗传进化分析。结果显示,10株新城疫病毒F基因编码区长度均为1 662bp,共编码553个氨基酸,核苷酸和氨基酸同源性分别为96.7%～99.9%、95.7%～99.6%,表明不同地区分离株之间具有较高的同源性。所有分离株F蛋白裂解位点均为112R-R-Q-K-R-F117,具有新城疫病毒强毒株典型的分子特征。遗传进化分析结果显示,10株病毒均属于ClassⅡ基因Ⅵb亚型,表明基因VIb亚型为近年来我国鸽群中流行的新城疫病毒优势基因型。

关键词：鸽副黏病毒基因VIb亚型遗传进化分析新城疫病毒

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我国新出现基因Ⅻ型新城疫病毒的分布及特性

中国动物检疫 2017年第9期34卷 1-3,18页

作者：刘华雷吕艳王静静赵云玲郑东霞戈胜强罗瑶瑶魏润宇王志亮中国动物卫生与流行病学中心山东青岛266032

2010—2012年在全国新城疫主动监测中分离并鉴定出6株基因Ⅻ型新城疫病毒。这是我国首次发现该基因型病毒。分离到的Ⅻ型新城疫病毒全部分布在我国南方地区,多为水禽分离株,仅有1株为鸡源分离株。脑内接种致病指数(ICPI)和分离株F蛋白... 详细信息

2010—2012年在全国新城疫主动监测中分离并鉴定出6株基因Ⅻ型新城疫病毒。这是我国首次发现该基因型病毒。分离到的Ⅻ型新城疫病毒全部分布在我国南方地区,多为水禽分离株,仅有1株为鸡源分离株。脑内接种致病指数(ICPI)和分离株F蛋白裂解位点的氨基酸组成证实分离株均为新城疫强毒。进一步的遗传进化分析表明,这6株分离株属于基因Ⅻb亚型,与南美地区的Ⅻ型分离株基因型不同(Ⅻa亚型)。对于国内新出现的基因Ⅻb新城疫病毒的来源,仍需要更多的监测数据来证实。目前的监测数据表明,这种在我国新出现的Ⅻ型新城疫病毒具有在当地造成地方流行和进一步扩散的风险。

关键词：新城疫病毒基因XII型进化分析风险监测

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7例犬子宫蓄脓病例的病原菌分离鉴定

中国动物检疫 2019年第12期36卷 83-87页

作者：陈诗涵魏润宇李军朝管飘萍黄紫贝王彦红张信军王海燕刘文博扬州大学兽医学院江苏省动物重要疫病与人兽共患病防控协同创新中心江苏扬州225009 江苏农牧科技职业学院江苏泰州225300

子宫蓄脓是一种常见的犬生殖系统疾病,通常由内分泌紊乱和细菌感染共同引起。为了解兽医临床子宫蓄脓病例中的常见病原菌类型,对江苏省扬州市动物医院接诊的7例子宫蓄脓病例进行病原菌分离鉴定。经实验室检测,分离出10株菌株;经序列分析... 详细信息

子宫蓄脓是一种常见的犬生殖系统疾病,通常由内分泌紊乱和细菌感染共同引起。为了解兽医临床子宫蓄脓病例中的常见病原菌类型,对江苏省扬州市动物医院接诊的7例子宫蓄脓病例进行病原菌分离鉴定。经实验室检测,分离出10株菌株;经序列分析,鉴定出5种病原菌,分别为大肠杆菌(3株)、粪肠球菌(1株)、产气肠杆菌(2株)、产酸克雷伯氏菌(1株)、铜绿假单胞菌(3株)。结果表明,该地区犬子宫蓄脓病例感染的致病菌种类较多,但以肠杆菌科细菌为主。本研究为临床犬子宫蓄脓的防治提供了参考。

关键词：子宫蓄脓犬细菌分离鉴定