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基于位点相关概率模型的富亮氨酸重复序列预测

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中国科技论文 2015年第6期10卷 626-628,637页

作者：巩晶李雪陶超魏天迪山东大学医学院癌症研究中心济南250012 山东大学泰山学堂济南250100 山东大学生命科学学院济南250100 山东省齐鲁干细胞工程有限公司博士后工作站济南250101

富亮氨酸重复序列(leucine-rich repeat,LRR)是一种广泛存在的蛋白质结构基序,在诸多重要生命过程中起关键性作用并与诸多人类疾病紧密相关。研究LRR中各个位点之间的氨基酸分布的相关性,并基于此相关性建立概率模型,可应用于序列水平上... 详细信息

富亮氨酸重复序列(leucine-rich repeat,LRR)是一种广泛存在的蛋白质结构基序,在诸多重要生命过程中起关键性作用并与诸多人类疾病紧密相关。研究LRR中各个位点之间的氨基酸分布的相关性,并基于此相关性建立概率模型,可应用于序列水平上的LRR预测,以提高LRR预测的准确度。本文从LRRML数据库中提取已知的LRR蛋白质序列作为训练集和测试集;为LRR各个位点上氨基酸的分布数据构建4种不同的概率模型,包括位点相关和位点不相关概率模型;再通过机器学习和K-折交叉验证的方法,确定可以用于LRR预测的最佳模型。结果表明,位点相关概率模型和位点不相关概率模型以不同权重相加之后的综合模型在LRR预测中显示出高的准确度。LRR中各个位点之间的氨基酸分布存在一定的相关性,此相关性可作为重要参数应用于LRR预测。

关键词：生物信息学富亮氨酸重复序列序列算法位点相关概率模型

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混合菌修复石油污染土壤

化工环保 2014年第1期34卷 19-23页

作者：张超陈文兵武道吉魏天迪山东建筑大学市政与环境工程学院山东济南250101 山东大学微生物技术国家重点实验室山东济南250100

选取4种从石油污染土壤中分离出的石油降解菌(包括根瘤菌(A)、节细菌(B)、嗜盐菌(C)和芽孢杆菌(D)),对模拟石油污染土壤进行了微生物修复实验。考察了4种菌单独使用时的石油降解率,确定了混合菌的最佳配比和菌群的最优培养条件,并对比... 详细信息

选取4种从石油污染土壤中分离出的石油降解菌(包括根瘤菌(A)、节细菌(B)、嗜盐菌(C)和芽孢杆菌(D)),对模拟石油污染土壤进行了微生物修复实验。考察了4种菌单独使用时的石油降解率,确定了混合菌的最佳配比和菌群的最优培养条件,并对比了微生物修复前后土壤的各项性质。实验结果表明:4种菌均可提高微生物修复石油污染土壤的修复效果,使用D菌时石油降解率最高;当混合菌的w(A)∶w(B)∶w(C)∶w(D)=12∶2∶21∶65时,在培养条件为混合菌接种量122.0 mL/kg、土壤含水率14%(w)、鸡粪加入量90 g/kg、麦糠加入量150 g/kg和表面活性剂加入量22 mL/kg的情况下,土壤的修复效果最好,40 d后石油降解率达66.95%;经混合菌修复的石油污染土壤,其肥力明显升高,脱氢酶、过氧化酶和脲酶的活性均升高,微生物数量也有明显增加。

关键词：石油污染土壤微生物修复表面活性剂

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不同氮磷比对中肋骨条藻生长特性的影响

海洋湖沼通报 2002年第2期 39-44页

作者：刘东艳孙军陈宗涛魏天迪青岛海洋大学海洋生命学院山东青岛266003

本文对在不同氮磷比(1:1,4:1,16:1,80:1,160:1)的培养条件下,中肋骨条藻的生长和营养生理特征进行了研究。结果表明:中肋骨条藻生长和生理状态受氮磷比的影响比较明显。在N/P=16:1的状态下,其生长速度最快,细胞数量最高;在氮磷比大于16... 详细信息

本文对在不同氮磷比(1:1,4:1,16:1,80:1,160:1)的培养条件下,中肋骨条藻的生长和营养生理特征进行了研究。结果表明:中肋骨条藻生长和生理状态受氮磷比的影响比较明显。在N/P=16:1的状态下,其生长速度最快,细胞数量最高;在氮磷比大于16状态下的生长速度要优于氮磷比小于16的营养状态,说明其生长主要受到氮的限制。叶绿素a浓度受氮磷比的影响与细胞的生长基本相一致。相反,藻细胞内碳水化合物和蛋白质的合成和积累量在氮磷比≤16的状态下高于氮磷比大于16的状态。

关键词：氮磷比中肋骨条藻蛋白质碳水合物生长速率赤潮浮游硅藻营养生理特性

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利用废弃物原料生产燃料乙醇的研究进展

氨基酸和生物资源 2013年第2期35卷 35-40页

作者：张超陈文兵王静魏天迪山东建筑大学市政与环境工程学院山东济南250101 山东大学微生物技术国家重点实验室山东济南250100

乙醇是一种十分重要的工业用途的化工原料。目前国内外学者纷纷采用不同的方法和手段对乙醇发酵进行研究,目前,利用废弃物为原料生产乙醇是热点。本文阐述了利用各种废弃原料生产乙醇的必要性,并分别论述了利用纤维质废弃物、淀粉质废... 详细信息

乙醇是一种十分重要的工业用途的化工原料。目前国内外学者纷纷采用不同的方法和手段对乙醇发酵进行研究,目前,利用废弃物为原料生产乙醇是热点。本文阐述了利用各种废弃原料生产乙醇的必要性,并分别论述了利用纤维质废弃物、淀粉质废弃物、糖质废弃物等生产乙醇的研究进展,着重论述了利用纤维质废弃物的生产情况,提出了需进一步研究和解决的问题。

关键词：乙醇废弃物发酵

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石峡村的长城情

求是 2024年第20期 72-73页

作者：魏天舒不详

清晨,站在北京市延庆区八达岭镇石峡村村口,抬头远望,就是陡峭山脊上婉蜓而上的长城。饱尝岁月风霜的砖石,仿佛连接起一道道时光隧道,串联起古今文明。早在山脚下等着的,是石峡村长城保护员刘红岩大姐。看到记者畏难,大姐笑着说,这只是... 详细信息

清晨,站在北京市延庆区八达岭镇石峡村村口,抬头远望,就是陡峭山脊上婉蜓而上的长城。饱尝岁月风霜的砖石,仿佛连接起一道道时光隧道,串联起古今文明。早在山脚下等着的,是石峡村长城保护员刘红岩大姐。看到记者畏难,大姐笑着说,这只是开始。

关键词：时光隧道长城保护石峡延庆区八达岭镇北京市

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山东大学生物类拔尖人才培养模式的探索

高校生物学教学研究（电子版） 2013年第4期3卷 3-6页

作者：王明钰沈煜徐孝刚邵明魏天迪方诩山东大学生命科学学院济南250100 山东大学泰山学堂济南250100

2009年,为了回应钱学森先生所提出的“为什么我们的大学总是培养不出杰出人才”的“钱学森之问”[1],教育部在全国部分高校开展实施了“基础学科拔尖学生培养试验计划”[2,3],力图通过对数学、物理、化学、生物和计算机五个学科拔尖学... 详细信息

2009年,为了回应钱学森先生所提出的“为什么我们的大学总是培养不出杰出人才”的“钱学森之问”[1],教育部在全国部分高校开展实施了“基础学科拔尖学生培养试验计划”[2,3],力图通过对数学、物理、化学、生物和计算机五个学科拔尖学生培养的模式创新、资源倾斜和教学方法方式改革,提高这些学生的科研水平和能力,并最终培养出跻身世界一流的科学家.作为“基础学科拔尖学生培养试验计划”的一部分,山东大学于2010年设立了“泰山学堂”,并于2010年9月招收了包括生物学科(称为“生命取向”)学生15名在内的共75名拔尖学生按照新的模式进行培养[4].

关键词：拔尖学生泰山学学堂学校学生培养模式教学制度导师制山东

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水产养殖中水质与鱼类行为双向映射模型研究

农业机械学报 2024年第3期55卷 290-299页

作者：魏天娇胡祝华范习禹海南大学信息与通信工程学院海口570228

在水产养殖中,水质参数与鱼类活动之间有着密不可分的相互映射关系。过去的监测更多偏向于单向映射,一般都是通过鱼类的行为表明水质的情况。针对仅仅通过鱼类行为反映水质情况会产生误判和滞后的问题,本文构建一种基于随机森林的鱼类... 详细信息

在水产养殖中,水质参数与鱼类活动之间有着密不可分的相互映射关系。过去的监测更多偏向于单向映射,一般都是通过鱼类的行为表明水质的情况。针对仅仅通过鱼类行为反映水质情况会产生误判和滞后的问题,本文构建一种基于随机森林的鱼类行为与水质情况双向映射模型。双向映射模型不仅可以提供更多的信息从而提高预测的准确性,而且也可以通过相互验证提高模型的可靠性。首先,通过引入可变形卷积模块对YOLO v7进行改进,利用改进模型检测出视频中鱼类的位置再通过前后帧的坐标量化出鱼的游动参数。随后,将采集到的鱼类游动参数及对应的水质参数作为输入,使用随机森林模型进行分类、回归,分别完成鱼类游动参数和水质参数具体数值的预测以及指标异常级别的预测,从而得到双向映射关系。为了表明模型的泛化能力,分别在黎安港和新村港渔场2个数据集下进行实验。实验结果表明:提出的方法可以较好地实现鱼类行为与水质关系的双向映射,其中,分类实验平均准确率可以达到90.947%,回归实验决定系数R^(2)的平均值可以达到0.801。

关键词：智慧养殖鱼类行为水质深度学习随机森林双向映射模型

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1990—2020年黄土高原典型县域植被覆盖变化及影响因素

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干旱区研究 2024年第1期41卷 147-156页

作者：赵雨琪魏天兴北京林业大学水土保持学院水土保持国家林业局重点实验室林业生态工程教育部工程研究中心山西吉县森林生态系统国家野外科学观测研究站北京100083

为探究吉县近30 a植被动态演变规律及其影响因素,本研究基于Landsat影像,结合气象、土地利用、夜间灯光等数据,采用趋势分析、偏相关分析、随机森林、残差分析等方法探究吉县植被覆盖度时空变化特征及气候和人为因素对植被变化的影响。... 详细信息

为探究吉县近30 a植被动态演变规律及其影响因素,本研究基于Landsat影像,结合气象、土地利用、夜间灯光等数据,采用趋势分析、偏相关分析、随机森林、残差分析等方法探究吉县植被覆盖度时空变化特征及气候和人为因素对植被变化的影响。结果显示:(1)1990—2020年研究区植被覆盖度(FVC)整体呈显著上升趋势,FVC年均增长速率约为0.49%,植被质量明显改善。(2)吉县FVC具有明显的“低值-高值”交错分布的空间特征。1990—2020年FVC显著增加区占51%,FVC显著减少区占7%。(3)气候因素对部分FVC高值区和建筑区植被生长起抑制作用,对其余地区植被覆盖起促进作用。将人类活动作为全域影响因素考虑时气候和人类活动对植被动态的贡献率分别为53.43%、46.57%,将其作为局域变量时相对贡献率减少至13.07%。人类活动在特定地区如吉县中部和东部是植被退化的重要影响因素,西侧和南部的植被恢复也与之相关。研究结果可为区域生态修复工作进一步开展提供科学依据。

关键词：植被覆盖度 Google Earth Engine 气候变化人类活动黄土高原

稳慎推进农村宅改政策导向下非农就业对农户“两闲”处置意愿的影响研究 ——基于江西实证

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稳慎推进农村宅改政策导向下非农就业对农户“两闲”处置意愿的影...

作者：魏天知江西农业大学

学位级别：硕士