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基于差异lncRNA的胰腺癌预后模型的构建与评估

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基于差异lncRNA的胰腺癌预后模型的构建与评估

作者：陈高齐中国人民解放军海军军医大学

学位级别：硕士

目的:胰腺癌(Pancreatic cancer,PC)是一种预后极差的消化系统肿瘤,具有早期诊断困难以及病情进展迅速等特点。当下不断精进的外科手术技术和新兴的新辅助治疗方案已经成为胰腺癌治疗的标准模式,但对患者的预后改善仍然十分有限。不同... 详细信息

目的:胰腺癌(Pancreatic cancer,PC)是一种预后极差的消化系统肿瘤,具有早期诊断困难以及病情进展迅速等特点。当下不断精进的外科手术技术和新兴的新辅助治疗方案已经成为胰腺癌治疗的标准模式,但对患者的预后改善仍然十分有限。不同治疗方案的选择已成为困扰临床决策的难点,因此我们亟待寻求新的预后评估方法以解决实际面临的临床问题。越来越多的研究表明长链非编码RNA(Long noncoding RNA,lncRNA)在胰腺癌发生发展以及治疗等方面发挥着重要的作用,具有成为预后标志物的巨大潜力。本研究通过全转录组测序以及在线数据库筛选预后相关的差异lncRNA,运用生物信息学技术分析其潜在的生物学功能,构建风险评分(Risk score)模型并绘制列线图以评估患者预后,进而为临床治疗提供指导。方法:该研究从胰腺癌临床样本出发,为保证样本质量,所有样本的采集过程均在组织离体后即刻由经验丰富的主刀医生完成。运用全转录组测序和生物信息学技术获取肿瘤组织中差异表达的lncRNA数据,并对差异表达的lncRNA进行功能富集分析。结合癌症基因组图谱(The cancer genome atlas,TCGA)数据库的RNA测序(RNA sequencing,RNA-seq)数据及临床病理信息进行联合分析,获得与胰腺癌患者预后相关的差异表达lncRNA。通过最小绝对收缩和选择算法(Least Absolute Shrinkage and Selection Operator,Lasso)回归分析和cox比例风险回归模型(Cox proportional hazards model)进一步筛选预后相关的lncRNA,根据多因素cox回归分析的系数及lncRNA的表达水平构建胰腺癌预后的风险评分模型,利用Kaplan-Meier生存曲线和受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,又称ROC曲线)对模型效能进行评估。依次计算各样本的风险评分并结合临床特征进行相关性分析。联合风险评分模型和各项临床病理特征构建列线图,并使用ROC曲线和校准曲线对其性能进行检验。之后,通过构建lncRNA-m RNA共表达网络展示lncRNA与m RNA之间潜在的调控关系。最后根据风险评分分析高低风险组之间差异基因的表达及功能富集情况,进一步揭示该风险评分模型的潜在分子机制。结果:该研究通过对20例临床样本的全转录组测序获得了2097个差异表达lncRNA,差异表达的lncRNA主要与细胞增殖、凋亡以及血管生成等信号通路相关。结合TCGA数据库的转录组数据和临床数据进行联合分析获得了214个预后相关的差异表达lncRNA。分别通过Lasso和多因素cox回归分析对其进行筛选,最终得到了6个lncRNA用于构建风险评分模型。其中,AC073896.5和PAN3-AS1是保护因素,MANCR、MECOM-AS1、LINC01322及LINC02393是危险因素。通过KaplanMeier生存曲线和ROC曲线评估该模型的预测能力和有效性。联合风险评分和胰腺癌患者的临床特征进行相关性分析,发现N分期与风险评分在统计学上存在相关性,并根据多因素cox回归分析确认了风险评分是影响胰腺癌患者预后的独立风险因素。之后,通过风险评分与患者临床特征构建预测胰腺癌患者预后的列线图,使用校准曲线与ROC曲线评估列线图的预测效能。除此之外,我们结合全转录测序结果中的m RNA表达情况构建lncRNA-m RNA共表达网络,对可能存在的lncRNA-m RNA调控关系进行可视化展示。最后,本研究通过GO/KEGG富集分析对高低风险组之间的差异基因进行功能注释,结果发现差异基因主要富集在细胞增殖、代谢等功能条目以及癌症相关信号通路。结论:本研究通过6个预后相关的差异表达lncRNA构建了胰腺癌预后的风险评分模型,该模型能够准确预测胰腺癌患者的预后情况并在临床应用中帮助医疗工作者做出相应的临床决策,同时为后续的研究奠定基础。

关键词：胰腺癌长链非编码RNA 预后预测模型列线图

黔中喀斯特型铝土矿的可见光-近红外反射光谱特征研究

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黔中喀斯特型铝土矿的可见光-近红外反射光谱特征研究

作者：高齐云贵州师范大学

学位级别：硕士

随着高光谱遥感技术的不断发展,利用地物光谱仪测试的岩矿光谱数据开展遥感勘查已成为地质勘探中的重要技术之一,同时也可为岩矿快速识别与智能矿山建设提供关键的光谱基础数据。铝土矿是生产金属铝的主要来源,铝土矿主要分为喀斯特型... 详细信息

随着高光谱遥感技术的不断发展,利用地物光谱仪测试的岩矿光谱数据开展遥感勘查已成为地质勘探中的重要技术之一,同时也可为岩矿快速识别与智能矿山建设提供关键的光谱基础数据。铝土矿是生产金属铝的主要来源,铝土矿主要分为喀斯特型铝土矿和红土型铝土矿,其中喀斯特型铝土矿在中国分布广泛。目前有关铝土矿的反射光谱基础数据还非常匮乏,为了探究喀斯特型铝土矿的反射光谱典型特征及其内在机制,本文选取贵州省黔中地区典型的喀斯特型铝土矿剖面作为研究对象,采用ASD Field Spec-4地物光谱仪测试不同自然类型铝土矿和铝土岩、铝土质粘土岩等块样和不同颗粒度的粉末样品,获取其可见光-近红外反射光谱曲线,并结合主量元素含量和矿物组成探究铝土矿（铝土岩）的反射光谱特征及其影响因素和内在机制。本论文获得的主要研究结论如下:（1）采集于牛洞剖面、长冲剖面和斗篷山剖面的铝质岩段主要为铝土矿、铝土岩、铝土质粘土岩与黏土岩;铁质岩段可见钛磁铁矿、黄铁矿等含铁矿物;顶板和底板分别为灰岩和白云岩。所采集样品的主量元素分析结果表明,这三个剖面地层由老到新Al2O3含量逐渐增大,Si O2含量逐渐降低,呈负相关线性关系,Al2O3含量与Fe2O3含量相关性较弱,并且根据铝质岩段的主量元素含量,进一步划分为铝土矿（Al2O3>40%,Al/Si>1.8）与铝土岩（Al2O3>40%,Al/Si振动谱带所致。以一水软铝石为主要矿物成分的铝土矿在1400nm、1900nm、2200nm波长附近的吸收深度比一水硬铝石为主要矿物的铝土矿强,由于H2O和羟基振动所致。铝土岩的主要矿物组成是高岭石,其属于粘土矿物,由于OH倍频合频和H2O的振动谱带导致在1400nm和1900nm出现特征光谱,高岭石因较强的Al-OH键,其主要吸收位置为2160nm、2200nm波长附近,由于Al-OH的基团拉伸和弯曲振动的合频所致。碳质黏土岩的主要组成矿物为石英,由该矿物引起的反射光谱特征较弱,没有显著的波谷特征。（4）以一水硬铝石为主要矿物成分的铝土矿特征波长为1400nm、1800nm,铝土岩的特征波长为1400nm、1900nm、2200nm和2160nm,在快速鉴别铝土矿与铝土岩时,可通过小颗粒度的粉末样品在1800nm、1900nm、2200nm和2160nm波长处的特征光谱进行区分。对铝土矿样品的反射光谱曲线进行包络线去除处理,分析Al2O3、Fe2O3、Ti O2含量与光谱吸收深度的相关性,其相关性较差。进一步利用皮尔逊相关性分析,得出Al2O3、Fe2O3、Ti O2含量以及Al/Si比值的敏感波段对铝土矿比铝土岩更显著,Al/Si比值对铝土矿光谱波段敏感最大,其相关系数最高为0.912。

关键词：喀斯特型铝土矿铝土岩可见光-近红外光谱相关分析

颗粒度对喀斯特型铝土矿可见光-近红外光谱特征的影响

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岩矿测试 2024年第2期43卷 234-246页

作者：高齐云周丽易泽邦陈正山贵州师范大学地理与环境科学学院贵州贵阳550025 贵州省喀斯特山地生态环境国家重点实验室培育基地贵州贵阳550025 桂林理工大学地球科学学院广西桂林541006

岩矿反射光谱是智能矿山岩矿智能感知技术以及遥感信息识别的重要参考依据,由于地物表面粗糙度对反射光谱的影响取决于粗糙高度值与波长关系对电磁波传播的影响,因此颗粒度是影响岩石和矿物反射光谱特征的重要因素之一。喀斯特型铝土矿... 详细信息

岩矿反射光谱是智能矿山岩矿智能感知技术以及遥感信息识别的重要参考依据,由于地物表面粗糙度对反射光谱的影响取决于粗糙高度值与波长关系对电磁波传播的影响,因此颗粒度是影响岩石和矿物反射光谱特征的重要因素之一。喀斯特型铝土矿在中国分布广泛,目前有关铝土矿的反射光谱基础数据还非常匮乏。为了探究颗粒度对喀斯特型铝土矿反射光谱的影响规律,本文选取贵州省修文县小山坝喀斯特型铝土矿为研究对象,采用地物光谱仪测试不同颗粒度铝土矿(铝土岩)样品的可见光-近红外反射光谱,并结合铝土矿(铝土岩)主量元素和矿物组成分析讨论铝土矿与铝土岩的光谱差异。结果表明:小山坝铝土矿(铝土岩)由于矿物组成的不同而呈现显著不同的光谱特征,其中铝土矿的反射光谱特征主要与一水硬铝石一致,在1400nm和1800nm波长处有明显的波谷特征,由OH振动谱带所致;铝土岩的反射光谱特征主要与高岭石一致,在1400nm、1900nm、2160nm和2200nm波长处有显著的波谷特征,分别由OH倍频合频、H_(2)O的振动谱带以及Al-OH基团拉伸和弯曲振动的合频所致,且在2160~2200nm波段呈双吸收峰特征。此外,不同颗粒度铝土矿(铝土岩)的整体反射率均较高,最高超过28%,且变化趋势基本相同。随着颗粒度从<0.04mm增加到3mm,铝土矿和铝土岩的反射率均逐渐减小,且铝土矿特征波谷的整体吸收强度相对稳定,而铝土岩特征波谷的吸收强度呈逐渐增大的趋势。本文研究认为可采用小颗粒度的粉末样品在1800nm、1900nm、2160nm和2200nm波长处的特征光谱进行铝土矿和铝土岩的区分。

关键词：铝土矿铝土岩颗粒度可见光-近红外光谱反射光谱特征

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食品样品制备信息化系统的实施与应用

轻工科技 2024年第1期40卷 90-93页

作者：邵基伦高齐张绍振李延秋沈峰广东省食品检验所(广东省酒类检测中心) 广东广州510435

食品样品制备是开展食品检测的重要前提,制备所得的样品必须具有代表性才能真实反映样品的基本属性,其流程涵盖范围广、涉及面多、繁琐度高,包括样品接收、制备、贮存、调取和交接等主要环节。传统实验室的样品制备登记多数是依靠人工... 详细信息

食品样品制备是开展食品检测的重要前提,制备所得的样品必须具有代表性才能真实反映样品的基本属性,其流程涵盖范围广、涉及面多、繁琐度高,包括样品接收、制备、贮存、调取和交接等主要环节。传统实验室的样品制备登记多数是依靠人工通过纸质化将各环节串联和记录下来,这种方式的缺点是工作效率低、出错率高、管理记录方式繁琐、消耗人力多,无法实时掌握和了解各环节及不同部门间样品流转的状况。因此,开发出基于实验室信息管理系统(Laboratory Information Management System,LIMS)的样品制备信息化流程能够使得实验室管理更为智能精确、规范灵活,可显著提升实验室工作效率。本文以笔者所在检验机构基于LIMS开发和设计的样品制备信息化系统为研究对象,分析LIMS在样品制备全流程管理中的实施和应用,从而为服务于大市场的相关第三方食品检验检测机构提供样品制备信息化的相关管理经验。

关键词：样品制备实验室信息管理系统制备信息化全流程管理管理经验

南沙链霉菌来源细胞色素P450酶CYP154C34的表征及生物转化

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微生物学报 2024年第2期64卷 502-515页

作者：高齐霖杨建李蓉赖刚许莲花浙江理工大学生命科学与医药学院浙江杭州310018

【目的】P450酶作为一种多功能生物催化剂,可在温和条件下高区域和立体选择性地催化复杂化合物中未活化的C-H键,因此P450酶在化工原料合成、环境污染物降解及药物合成等领域都具有重要作用。本文对南沙链霉菌基因组中的一个新颖的P450酶... 详细信息

【目的】P450酶作为一种多功能生物催化剂,可在温和条件下高区域和立体选择性地催化复杂化合物中未活化的C-H键,因此P450酶在化工原料合成、环境污染物降解及药物合成等领域都具有重要作用。本文对南沙链霉菌基因组中的一个新颖的P450酶CYP154C34进行研究,通过构建异源表达和全细胞生物转化重组菌探究其功能。【方法】构建2种全细胞生物转化BL21(DE3)重组菌(含p ET28a-CYP154C34-RhFRED和pET28a-CYP154C34+pACYCDuet-Pdx/PdR)和1种异源表达BL21(DE3)重组菌(含pET28a-CYP154C34)。通过全细胞生物转化的方式筛选底物,分析催化功能及产物结构。比较2种全细胞生物转化重组菌和体外酶反应对底物的转化率。分析CYP154C34和不同底物及底物类似物的亲和力。【结果】通过底物筛选和产物鉴定发现CYP154C34可催化包括孕酮、睾酮、雄烯二酮在内的9种甾体化合物16α位羟基化。通过2种不同还原伴侣的全细胞体系及体外酶反应对底物转化率的比较,发现含有pET28a-CYP154C34-RhFRED的BL21(DE3)重组菌的转化率最高,可对孕酮、睾酮、雄烯二酮等7种底物实现超过90%的转化率。通过亲和力分析发现CYP154C34对底物化合物的亲和力比类似物高。【结论】本研究构建了2种CYP154C34的全细胞生物转化重组菌并鉴定其功能。CYP154C34催化的底物谱宽并且具有极高的区域和立体选择性及较高的转化率,具有良好的工业应用前景。

关键词： P450 CYP154C34 南沙链霉菌生物转化甾体雌二醇

信息化沟通路径在班主任德育管理工作中的应用

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中文科技期刊数据库（引文版）教育科学 2024年第10期 0079-0082页

作者：高齐泰安市岱岳区岳峰中学山东泰安271000

信息化技术正在迅速改变教育管理的方式,尤其在德育管理领域,班主任作为学生成长的引导者,在信息化工具的帮助下能够更加高效地进行沟通和管理。这篇论文探讨了信息化沟通路径在班主任德育管理中的具体应用,通过对信息化技术及其分类的... 详细信息

信息化技术正在迅速改变教育管理的方式,尤其在德育管理领域,班主任作为学生成长的引导者,在信息化工具的帮助下能够更加高效地进行沟通和管理。这篇论文探讨了信息化沟通路径在班主任德育管理中的具体应用,通过对信息化技术及其分类的介绍,分析了当前班主任德育管理的现状,并提出如何通过选择合适的信息化沟通工具和优化沟通路径来提升德育管理的工作质量。研究表明,信息化沟通路径不仅能提升德育管理的效率,还能增强师生互动,提高学生的道德修养和综合素质,为德育管理注入了新的活力和可能性。

关键词：信息化沟通路径德育管理工作质量

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自动驾驶中的情感化设计

应用心理学 2024年

作者：陈晓皎方可王博凡纪翔刘艳芳高齐浙江大学艺术与考古图像数据实验室浙江大学心理与行为科学系华为技术有限公司

自动驾驶技术迅速发展，如何应对自动驾驶功能下的人车关系成为新的挑战，而情感化设计是改善人车关系、提升驾驶体验的重要手段。本文回顾了情感化设计的理论发展脉络，从应用发展、评估方法对自动驾驶中情感化设计的研究现状进行了综... 详细信息

自动驾驶技术迅速发展，如何应对自动驾驶功能下的人车关系成为新的挑战，而情感化设计是改善人车关系、提升驾驶体验的重要手段。本文回顾了情感化设计的理论发展脉络，从应用发展、评估方法对自动驾驶中情感化设计的研究现状进行了综述，并总结出自动驾驶中的情感化设计原则，包括美学、个性化、拟人化、交互礼仪和情绪修正，以应对自动驾驶中人机交互挑战。最后对自动驾驶汽车情感化设计未来的发展方向做出展望。

关键词：自动驾驶情感化设计人车交互

排列角度对高氮钢双丝GMAW熔滴过渡行为及成形特性的影响

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机械工程学报 2024年第16期60卷 171-179页

作者：杨东青谢高齐郭顺彭勇王克鸿黄俊南京理工大学受控电弧智能增材技术工业和信息化部重点实验室南京210094

为了实现高效稳定的高氮钢熔化极气体保护焊接(Gas metal arc welding,GMAW),着重研究双丝排列角度对高氮钢熔滴过渡行为、电信号特征及焊缝成形特性的影响。结果表明:随着双丝排列角的减小,熔池的铺展性变差,熔池重叠部分的高度增加,... 详细信息

为了实现高效稳定的高氮钢熔化极气体保护焊接(Gas metal arc welding,GMAW),着重研究双丝排列角度对高氮钢熔滴过渡行为、电信号特征及焊缝成形特性的影响。结果表明:随着双丝排列角的减小,熔池的铺展性变差,熔池重叠部分的高度增加,熔滴过渡的不稳定性增加;当排列角度不小于45°,熔池铺展性好,双丝的熔滴过渡相互作用影响减小。双丝焊接电流和电弧电压的峰值随排列角度的增加由相互重叠变为错峰出现,双丝熔滴过渡平稳;单丝焊接相比,双丝焊接在送丝总量相同条件下双丝飞溅小、成形更好。在双丝共熔池条件下,随着排列角度的增大,焊缝成形变好。

关键词：高氮钢熔化极气体保护焊接双丝排列角度熔滴过渡成形特性

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巴拿马因海平面上升而疏散民众

中学生英语 2024年第33期 10-11页

作者：高齐云

海平面上升导致巴拿马疏散了该国其中一个岛上的居民。巴拿马加勒比海沿岸的加尔蒂·苏格杜布小岛上的居民将生活在巴拿马大陆上。然而，巴拿马政府表示，一些人不想离开他们的家，他们会一直待到最后一刻。

关键词：