检索结果-南通市图书馆

44株HIV/MAV双重感染者MAV基因分型和药敏结果分析

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中国感染控制杂志 2023年第3期22卷 275-279页

作者：李祥芳丁寿鹏高婧华吴利先大理大学基础医学院微生物与免疫学教研室云南大理671000

目的了解云南省西南地区人类免疫缺陷病毒(HIV)/鸟结核分枝杆菌(MAV)双重感染者MAV的基因型和耐药情况。方法选取12个可变数目串联重复序列(VNTR)特异性位点,采用分枝杆菌串联重复序列(MATR-VNTR)基因分型法对MAV进行基因分型;采用聚... 详细信息

目的了解云南省西南地区人类免疫缺陷病毒(HIV)/鸟结核分枝杆菌(MAV)双重感染者MAV的基因型和耐药情况。方法选取12个可变数目串联重复序列(VNTR)特异性位点,采用分枝杆菌串联重复序列(MATR-VNTR)基因分型法对MAV进行基因分型;采用聚合酶链反应(PCR)扩增菌株DNA后进行琼脂糖凝胶电泳,获得MAV的DNA指纹图谱,再应用Quantity One和BioNumerics 6.7软件对电泳图进行数字化处理并通过非加权组平均法(UPGMA)进行聚类分析。采用比例法测试44株MAV对10种不同抗菌药物的敏感性。结果各位点VNTR基因分型的Hunter-Gaston指数(HGDI)存在差异,其中MATR-5最高,为0.68,MATR-1、2、3、4、6、7、9、13、15位点的HGDI值均≥0.5;通过聚类分析,44株MAV分为6个集群。药敏试验结果显示,利福布丁对MAV的体外抗菌活性最好(耐药率为0),其次是乙胺丁醇(耐药率86.4%,38/44),所有菌株对其余8种药物均耐药。结论选取的12个位点VNTR基因分型法在云南省西南地区具有较高分辨率,来自云南省不同地区的MAV分离株耐药情况严峻。

关键词：鸟结核分枝杆菌基因分型 VNTR 药敏试验 HIV

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非结核分枝杆菌的致病机制研究进展

中国病原生物学杂志 2022年第3期17卷 352-355页

作者：李祥芳丁寿鹏高婧华吴利先大理大学基础医学院微生物与免疫教研室云南大理671000

非结核分枝杆菌(Nontuberculous mycobacteria,NTM)是除麻风分枝杆菌、结核杆菌复合群以外的分枝杆菌。近年来,NTM的感染人数逐年增多,而且NTM对治疗结核杆菌的药物大部分耐药,导致NTM病防治困难,因此NTM感染致病机制的研究备受关注。... 详细信息

非结核分枝杆菌(Nontuberculous mycobacteria,NTM)是除麻风分枝杆菌、结核杆菌复合群以外的分枝杆菌。近年来,NTM的感染人数逐年增多,而且NTM对治疗结核杆菌的药物大部分耐药,导致NTM病防治困难,因此NTM感染致病机制的研究备受关注。本文主要从生物膜的形成、感染宿主细胞和其在HIV合并感染中的致病作用等方面的致病机制做一综述,为该病的临床防治提供依据。

关键词：非结核分枝杆菌致病机制感染免疫综述

鸟分枝杆菌MAV-2052蛋白的生物信息学分析

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中国病原生物学杂志 2021年第2期16卷 150-154页

作者：高婧华陈晓文陈越吴利先大理大学基础医学院微生物学与免疫学教研室云南大理671000

目的应用生物信息学分析软件预测鸟分枝杆菌MAV-2052蛋白的结构和功能。方法利用在线uniprot蛋白数据库、ProtParam蛋白分析网站、在线Protcale、TMHMM(TMHMM Server V 2.0)和SignalP 5.0、Softberry和PSORTⅡ Server,以及SOPMA和SWISS-MODEL等生物信息学预测软件对MAV-2052蛋白的理化性质、疏水性分析、信号肽、跨膜区、亚细胞定位及二级结构进行分析预测并对其三级结构进行模型构建;登录网站http://www.***.dtu.dk/services/netrhos/对蛋白磷酸化位点进行预测,运用uniprot蛋白数据库的Blast工具对氨基酸进行比对,采用MEGA-X软件构建进化树。结果MAV-2052基因全长933 bp,编码310个氨基酸的蛋白质。该蛋白与鸟分枝杆菌亚型起源于同一物种,与结核分枝杆菌的半胱氨酸合酶k1同源性较高。MAV-2052为稳定的疏水性蛋白,无跨膜区、无信号肽;预测该蛋白亚细胞定位在细胞质中,蛋白序列中存在13个丝氨酸磷酸化位点,二级结构以α-螺旋为主且有两个结构域;三级结构模型显示该蛋白可形成同源二聚体,但无其他配体结合空间位置。MAV-2052蛋白为半胱氨酸合酶,属于半胱氨酸合酶/半胱氨酸β合成酶家族,是调控鸟分枝杆菌生长中的重要蛋白之一。结论生物信息学预测鸟分枝杆菌MAV-2052为半胱氨酸合成酶,是调控细菌生长的重要蛋白,可为鸟分枝杆菌的靶向治疗提供新思路。

关键词：鸟分枝杆菌结构功能生物信息学分析

鸟分枝杆菌MAV2928基因编码蛋白的生物信息学分析

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中国病原生物学杂志 2021年第1期16卷 17-21页

作者：陈晓文陈越高婧华吴利先大理大学基础医学院微生物与免疫学教研室云南大理671000

目的运用生物信息学方法分析鸟分枝杆菌PPE25-MAV蛋白的结构与功能。方法从NCBI数据库获取MAV2928基因编码蛋白氨基酸序列;使用protParam和PortScale工具分析该基因编码PPE25-MAV蛋白的理化性质以及亲疏水性;分别运用SignaIP 4.1 Server... 详细信息

目的运用生物信息学方法分析鸟分枝杆菌PPE25-MAV蛋白的结构与功能。方法从NCBI数据库获取MAV2928基因编码蛋白氨基酸序列;使用protParam和PortScale工具分析该基因编码PPE25-MAV蛋白的理化性质以及亲疏水性;分别运用SignaIP 4.1 Server、TMHMM Server v.2.0和PSORT Prediction工具预测PPE25-MAV蛋白的信号肽、跨膜区、亚细胞定位;采用NetPhos 3.1 Servera预测磷酸化位点,采用NCBI-Conserved domains分析蛋白的保守域结构;采用SPOMA软件在线分析PPE25MAV蛋白二级结构,使用SWISS-MODEL建立三级结构模型。运用ABCpred软件和IEDB预测蛋白的B细胞抗原表位。结果MAV2928基因全长为1266 bp,编码蛋白PPE25-MAV含有421个氨基酸,为不稳定疏水蛋白,脂肪系数为72.66,无信号肽及跨膜区,定位于细胞质中。该蛋白含有52个磷酸位点,有1个保守域结构属于PPE超家族蛋白;二级结构以无规则卷曲为主,结构较松散。预测该蛋白含有7个B细胞优势抗原表位和24个Th细胞表位。结论PPE25-MAV蛋白含有多个磷酸化位点,参与细胞信号的转导,含有7个优势B细胞抗原表位,为该蛋白作为候选疫苗抗原提供了理论基础。

关键词：鸟分枝杆菌 MAV2928 PPE25-MAV 生物信息学分析

基于TRF-IM模型的个性化酒店评论摘要生成

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计算机工程与应用 2023年第2期59卷 135-142页

作者：高玮军朱婧赵华洋李磊兰州理工大学计算机与通信学院兰州730050

针对传统的酒店评论摘要生成模型在生成摘要过程中存在对评论的上下文理解不够充分、并行能力不足和长距离文本依赖缺陷的问题,提出了一种基于TRF-IM(improved mask for transformer)模型的个性化酒店评论摘要生成方法。该方法利用Trans... 详细信息

针对传统的酒店评论摘要生成模型在生成摘要过程中存在对评论的上下文理解不够充分、并行能力不足和长距离文本依赖缺陷的问题,提出了一种基于TRF-IM(improved mask for transformer)模型的个性化酒店评论摘要生成方法。该方法利用Transformer译码器结构对评论摘要任务进行建模,通过改进其结构中的掩码方式,使得源评论内容都能够更好地学习到上下文语义信息;同时引入了用户类型的个性化词特征信息,使其生成高质量且满足用户需求的个性化酒店评论摘要。实验结果表明,该模型相比传统模型在ROUGE指标上取得了更高的分数,生成了高质量的个性化酒店评论摘要。

关键词：个性化酒店评论生成式摘要 Transformer 掩码方式语言模型

鸟分枝杆菌MAV_2927基因编码蛋白质的生物信息学分析

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大理大学学报 2022年第8期7卷 41-45页

作者：李祥芳丁寿鹏高婧华吴利先大理大学基础医学院云南大理671000

目的:用生物信息学分析鸟分枝杆菌(Mycobacterium avium,MAV)致病基因MAV_2927编码的蛋白质。方法:从NCBI数据库获取MAV_2927基因编码蛋白质的基因、氨基酸序列;ProtParam tool、SOPMA、SWISS-MODEL软件分析蛋白质的理化性质及二、三级... 详细信息

目的:用生物信息学分析鸟分枝杆菌(Mycobacterium avium,MAV)致病基因MAV_2927编码的蛋白质。方法:从NCBI数据库获取MAV_2927基因编码蛋白质的基因、氨基酸序列;ProtParam tool、SOPMA、SWISS-MODEL软件分析蛋白质的理化性质及二、三级结构;PortScale、SignalP 4.0 Server、TMHMM Server 2.0软件分析蛋白质的亲疏水性、信号肽、跨膜区。结果:MAV_2927基因编码蛋白质含43个氨基酸,相对分子量4.213 kDa,等电点4.72,分子式C_(183)H_(284)N_(48)O_(62)S_(2)。结论:MAV_2927编码蛋白质含多个T细胞、B细胞抗原表位,表明其可能是感染过程中与宿主相互作用有关的潜在致病因子,可为研究MAC的致病性和临床治疗提供基础。

关键词：鸟分枝杆菌 MAV_2927 生物信息学分析致病机制

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融合多模态特征的深度强化学习推荐模型

数据分析与知识发现 2023年第4期7卷 114-128页

作者：潘华莉谢珺高婧续欣莹王长征太原理工大学信息与计算机学院晋中030600 太原理工大学电气与动力工程学院太原030024 山西同方知网数字出版技术有限公司太原030000

【目的】利用多模态特征融合和深度强化学习缓解数据稀疏性和用户兴趣偏好动态变化问题。【方法】使用预训练模型和注意力机制分别实现模态内表征和三模态间融合,同时建模用户-项目交互,并利用深度强化学习算法实时捕捉用户兴趣漂移和... 详细信息

【目的】利用多模态特征融合和深度强化学习缓解数据稀疏性和用户兴趣偏好动态变化问题。【方法】使用预训练模型和注意力机制分别实现模态内表征和三模态间融合,同时建模用户-项目交互,并利用深度强化学习算法实时捕捉用户兴趣漂移和长短期奖励实现个性化推荐。【结果】较对比模型中最高值,所提模型在MovieLens-1M、MovieLens-100K和Douban数据集上的Precision@5分别提高11.8%、16.5%和11.4%,NDCG@5分别提高5.3%、8.0%和6.4%。【局限】Douban数据集的用户交互历史较少,所提模型在训练过程中无法学习到更准确的用户偏好,与在MovieLens数据集上的实验相比,推荐结果受限。【结论】所提模型融合项目多模态信息重构深度强化学习的状态表示网络,改善了推荐效果。

关键词：推荐深度强化学习多模态特征融合用户-推荐系统交互

粗颗粒—壁面碰撞试验分析及随机反弹模型构建

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海洋工程 2023年

作者：王华昆刘方舟高婧余杨李彦豪水利工程仿真与安全国家重点实验室(天津大学) 厦门大学建筑与土木工程学院福建省滨海土木工程数字仿真重点实验室(厦门大学)

为了揭示深海采矿水力输送过程中不规则粗颗粒与壁面碰撞的特征，建立了相应的随机反弹概率模型，为颗粒与壁面相互作用的数值分析提供了基础模型。采用粗颗粒自由落体试验和图像识别技术，对不同入射速度和入射角下粗颗粒的随机反弹过... 详细信息

为了揭示深海采矿水力输送过程中不规则粗颗粒与壁面碰撞的特征，建立了相应的随机反弹概率模型，为颗粒与壁面相互作用的数值分析提供了基础模型。采用粗颗粒自由落体试验和图像识别技术，对不同入射速度和入射角下粗颗粒的随机反弹过程进行了试验研究。通过自定义MATLAB程序实现了粒子运动参数的自动提取与分析。基于概率统计分析和非线性回归，建立了不同入射速度和冲击角度下粗颗粒随机反弹的解析预测模型。最后进行数值模拟，获得特定撞击条件下颗粒的随机反弹信息，并将模型预测与现有模型给出的预测进行了比较。研究表明：正态分布和广义极值分布均可较好的描述粗颗粒随机反弹运动特征；粗颗粒在低入射角碰撞下除反弹模式外还有滑移—偏转的模式，随入射角的增加，随机反弹角的均值先略有下降，然后逐渐增加，而反弹角的离散度随入射角增加呈指数增加；对于速度恢复系数，随着入射角的增加，能量耗散增加，速度恢复系数减小，恢复系数的离散略有增加；随着入射角的增加，角速度变化的均值遵循半正弦波函数，当入射角为45°时旋转最显著，旋转角速度的标准差先增大后减小。此外，数值重构时，应使用截断值以避免不合理的样本数据。

关键词：粗颗粒随机反弹图像识别概率模型深海采矿

鸟分枝杆菌MAV-4563蛋白的生物信息学分析

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中国病原生物学杂志 2022年第9期17卷 1015-1019页

作者：马枫茜陈瑞枫丁寿鹏李祥芳高婧华吴利先大理大学基础医学院微生物与免疫学教研室云南大理671000

目的应用生物信息学方法预测分析鸟结核分枝杆菌MAV-dalidaxue4563基因编码蛋白的结构功能和生物学特性。方法采用Protparam、ProtScaleon Expasy,TMHMM Server v 2.0,SignalP4.1,PSORT,NetPhos 3.1,BLAST,SOPMA,Phyre2,ABCpred,SYFPEITHI等生物信息学软件分析MAV4563蛋白的理化性质、亲疏水性、跨膜区、信号肽、亚细胞定位、磷酸化位点、保守域、二结构及三级结构同源建模、B细胞和T细胞表位等生物学特征。结果MAV4563基因全长756 bp,编码251个氨基酸的蛋白。该蛋白分子质量为28 ku,等电点为9.23,分子式(formula)为C_(1264)H_(2013)N_(385)O_(353)S_(7),为不稳定的疏水性蛋白。该蛋白无跨膜区,无信号肽,预测亚细胞定位于细胞质中,有13个磷酸化位点;蛋白二级结构中无规则卷曲占41.83%;预测该蛋白含多个B细胞和T细胞表位,其中MHC-I型和MHC-II型表位集中在蛋白C端的后90个氨基酸区域。结论预测MAV-4563蛋白含多个B细胞和T细胞表位,其中B细胞表位和MHC-I型表位集中在C端的后90个氨基酸区域,该区域可激活NTM特异性CTL和Th免疫应答,可作为非结核病的靶向疫苗抗原,为进一步研究该蛋白的治疗性T细胞疫苗奠定了基础。

关键词：鸟结核分枝杆菌 MAV-4563蛋白 T细胞疫苗