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亲虾营养需求的研究进展

中国饲料 2022年第22期 52-59页

作者：王宁邓康裕邓登马迎飞中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学工程研究中心广东深圳518055 深圳市澳华集团股份有限公司广东深圳518054

营养对亲虾的繁育性能具有重要作用,亲虾的繁殖能力和幼体质量与饲料中营养物质的来源和含量密切相关。本文从蛋白质、脂类、碳水化合物、类胡萝卜素和维生素等方面综述了近年来国内外营养素对亲虾性腺发育、繁殖和幼体质量的影响,旨在... 详细信息

营养对亲虾的繁育性能具有重要作用,亲虾的繁殖能力和幼体质量与饲料中营养物质的来源和含量密切相关。本文从蛋白质、脂类、碳水化合物、类胡萝卜素和维生素等方面综述了近年来国内外营养素对亲虾性腺发育、繁殖和幼体质量的影响,旨在探究不同营养素对亲虾繁育性能的影响,为亲虾的营养学研究及优质配合饲料的开发提供借鉴。

关键词：亲虾营养繁育性能

软颗粒饲料中替代鱼粉对选育中间养成阶段的凡纳滨对虾生长性能、体组成和免疫的影响

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中国饲料 2023年第23期 114-120页

作者：王宁邓登马迎飞邓康裕深圳市澳华集团股份有限公司广东深圳518054 中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学工程研究中心广东深圳518055

试验旨在探究软颗粒饲料中添加新鲜饵料和海洋性动物水解蛋白替代鱼粉对选育中间养成阶段的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)生长性能、体组成和免疫的影响。对照组为凡纳滨对虾商业配合软颗粒饲料,分别以酶解鱼浆(FPH)、酶解虾浆(SPH... 详细信息

试验旨在探究软颗粒饲料中添加新鲜饵料和海洋性动物水解蛋白替代鱼粉对选育中间养成阶段的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)生长性能、体组成和免疫的影响。对照组为凡纳滨对虾商业配合软颗粒饲料,分别以酶解鱼浆(FPH)、酶解虾浆(SPH)、鲢鱼(LY)以及鱿鱼(YY)替代FM组15%鱼粉蛋白配制成4组等氮等脂的软颗粒饲料。饲喂初始体重(25.0±0.33)g的凡纳滨对虾8周。结果显示:各组间凡纳滨对虾的存活率无显著性差异(P>0.05);LY和YY组相比于FM组增重率分别显著提高16.1%和21.3%(P0.05);各组间全虾的水分、粗脂肪和灰分均无显著性差异(P>0.05),SPH、LY和YY组的全虾粗蛋白质含量相比FM组分别显著提高7.6%、8.4%和9.5%(P0.05),相比于FM组,FPH和SPH组血清中碱性磷酸酶(AKP)活力显著提高13.0%和12.7%(P<0.05),LY和YY组血清中AKP、酸性磷酸酶(ACP)、超氧化物歧化酶(SOD)和溶菌酶(LZM)的活力均显著高于FM组(LY组分别提高20.6%、16.3%、25.0%、16.0%,YY组分别提高21.1%、18.8%、23.9%、22.5%)(P<0.05)。综上所述,在软颗粒饲料中添加FPH、SPH、LY以及YY替代一定比例的鱼粉可以显著提高饲料的投喂效果,其中以LY和YY效果最佳。

关键词：凡纳滨对虾软颗粒饲料选育生长性能饲料利用免疫

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2株海洋石油降解细菌的降解能力

环境科学 2004年第5期25卷 133-137页

作者：邵宗泽许晔马迎飞郭庆国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室厦门361005

为实施海洋石油污染的生物治理 ,从厦门储油码头油污水中分离得到了 2株石油降解菌 .它们能够在以柴油、萘或芘为唯一碳源的培养基中生长 ,并适应于海洋环境的温度、pH和盐度 .它们对萘都有很强的降解能力 ,3d内降解率可达 87 5 3%和84 ... 详细信息

为实施海洋石油污染的生物治理 ,从厦门储油码头油污水中分离得到了 2株石油降解菌 .它们能够在以柴油、萘或芘为唯一碳源的培养基中生长 ,并适应于海洋环境的温度、pH和盐度 .它们对萘都有很强的降解能力 ,3d内降解率可达 87 5 3%和84 0 1 % ;7d内对芘降解率分别为 8 35 %、5 37% .经 1 6SrDNA同源性分析表明 2菌株之间及其与施氏假单胞菌的同源性皆为 99% ;Biolog生化鉴定也表明它们为不同的菌株 .通过兼并PCR扩增 ,序列分析发现 2种菌编码完全相同的萘双加氧酶基因 ,该基因与其它假单胞菌的萘双加氧酶大亚基有

关键词：海洋石油污染生物降解假单胞菌 16S rDNA 双加氧酶基因

一株铅黄肠球菌噬菌体的生物学特性和全基因组分析

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微生物学报 2022年第10期62卷 4008-4018页

作者：张洁琼沈俊涛莫洛菲马迎飞尤晓颜河南科技大学河南省食品微生物工程技术研究中心河南洛阳471023 中国科学院深圳先进技术研究院深圳合成生物学创新研究院中国科学院定量工程生物学重点实验室广东深圳518055 中国科学院深圳理工大学(筹) 合成生物学院广东深圳518055 中国科学院大学北京100049

【目的】铅黄肠球菌是医源感染的机会致病菌,可引起危及生命的败血症、脑膜炎等,但针对其噬菌体的研究尚属空白。噬菌体作为细菌病毒,具有宿主特异性。本研究首次分离到可培养的铅黄肠球菌烈性噬菌体,对其基因组序列的分析和其他特征研... 详细信息

【目的】铅黄肠球菌是医源感染的机会致病菌,可引起危及生命的败血症、脑膜炎等,但针对其噬菌体的研究尚属空白。噬菌体作为细菌病毒,具有宿主特异性。本研究首次分离到可培养的铅黄肠球菌烈性噬菌体,对其基因组序列的分析和其他特征研究为进一步探讨噬菌体与宿主的作用机制及治疗应用提供参考。【方法】噬菌体Ecf_virus_SZ01以健康人粪便中分离的铅黄肠球菌(DO55)作为宿主菌,分离自深圳市南山区未经处理的生活污水样本,利用透射电镜观察噬菌体形态并对其生物学特征和基因组特点进行研究。【结果】透射电镜显示,噬菌体Ecf_virus_SZ01头部直径约为106 nm,尾部直径约为150 nm,尾长且无伸缩性尾鞘,属长尾噬菌体科;该噬菌体的最佳感染复数为0.01;一步生长曲线显示,潜伏期约为30 min,每个受感染细胞产生子代的平均数量为50 PFU/cell;抑菌曲线显示MOI=0.01时对宿主菌具有很好的抑制效果;宿主特异性强,不能实现跨属侵染;测序结果显示其基因组为dsDNA,长度为59409 bp,GC含量为43.2%;该噬菌体共有102个开放阅读框,BLASTn比对显示该噬菌体与NCBI数据库中其他噬菌体相似性极低。【结论】首次分离到宿主为铅黄肠球菌的噬菌体,具有潜伏期短、裂解能力强、宿主专一的特征,基因组与数据库中现有噬菌体相比十分新颖,并对其生物学特性和基因组进行了分析。

关键词：铅黄肠球菌噬菌体生物学特性基因组分析比较基因组学分类学

噬菌体微生态疗法与一体化健康:现状、挑战与机遇

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中国科学：生命科学 2023年第5期53卷 698-710页

作者：韦中王孝芳马迎飞叶茂徐阳春沈其荣朱永官南京农业大学资源与环境科学学院江苏省固体有机废弃物资源化高技术研究重点实验室国家有机类肥料工程技术研究中心江苏省有机固体废弃物资源化协同创新中心南京210095 中国科学院深圳先进技术研究院深圳合成生物学创新研究院中国科学院定量工程生物学重点实验室广东省合成基因组学重点实验室深圳市合成基因组学重点实验室深圳518055 中国科学院南京土壤研究所/中国科学院土壤环境与污染修复重点实验室南京210008 中国科学院生态环境研究中心城市与区域生态国家重点实验室北京100085 中国科学院城市环境研究所城市环境与健康重点实验室厦门361021

在全球化和气候变化的背景下,病原细菌跨区域乃至全球性的广泛传播和危害加剧成为当前农业、环境和健康领域的重大共性难题,威胁土壤-植物-动物-环境一体化健康(One Health).滥用农药和抗生素所带来的生态环境和卫生安全风险成为国际共... 详细信息

在全球化和气候变化的背景下,病原细菌跨区域乃至全球性的广泛传播和危害加剧成为当前农业、环境和健康领域的重大共性难题,威胁土壤-植物-动物-环境一体化健康(One Health).滥用农药和抗生素所带来的生态环境和卫生安全风险成为国际共识,靶向阻控病原细菌的噬菌体疗法重新引起人们的重视.本文梳理了农业种植和养殖领域中应用噬菌体阻控病原细菌的现状;从改变病原细菌的生态与进化,调控土著微生物群落结构与功能以及激发病原细菌真核宿主的免疫系统等三方面总结噬菌体疗法的微生态机制;从病原细菌基因、生理和生态型的变异性,噬菌体与病原菌互作博弈的局限性,噬菌体生产应用的复杂性等方面论述噬菌体疗法发展应用的挑战;从一体化健康的需求、噬菌体疗法技术突破和多技术协同等方面探讨噬菌体疗法在一体化健康中的发展机遇.

关键词：病原细菌微生态微生物群系噬菌体疗法一体化健康

南极土壤中多环芳烃（PAHs）降解菌的研究：分离、鉴定和降解基因的检测

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南极土壤中多环芳烃（PAHs）降解菌的研究：分离、鉴定和降解基因...

作者：马迎飞山东农业大学

学位级别：硕士

认识在南极特殊条件下降解污染物的细菌,对于我们了解人类活动对南极环境的影响以及在寒冷地区环境污染的生物修复的实际应用都有着十分重要和积极的意义。本文对南极及常温环境的多环芳烃降（polycyclic aromatichydrocarbons,PAHs）... 详细信息

认识在南极特殊条件下降解污染物的细菌,对于我们了解人类活动对南极环境的影响以及在寒冷地区环境污染的生物修复的实际应用都有着十分重要和积极的意义。本文对南极及常温环境的多环芳烃降（polycyclic aromatichydrocarbons,PAHs）降解菌进行了研究,结果表明南极地区假单胞菌是 PAHs 的主要降解菌,并且存在明显的降解酶基因水平转移现象。主要研究结果如下: 1. 降解菌的获得在低温条件下以萘或菲为唯一碳源通过富集作用,从南极不同地区的土壤中分离到了 22 株 PAHs 的降解菌,同时,作为对照,从常温环境中分离到了两株菲的降解菌。 2.降解菌的鉴定通过 16S rDNA 测序和系统进化分析,从常温得到降解菌WSCII 和 WSCIII 分别为鞘氨醇单胞菌属和假单胞菌属;而从南极分离到降解菌只有一株同 R.aquatilis 有 97%的相似性而属于 Rahnella 菌属,其它 21 株均属于假单胞菌属;其中大部分降解菌同一些已报导的低温菌处于一个较大的分枝上,只有四株菌同 WSCIII 及一些常温菌同在一个较小的分枝上。从低温菌的分枝上随机选取 6 株菌测得其最适生长温度为 16℃0℃。 3.降解效率的分析 HPLC 方法测定了两株常温菌对菲的降解能力,降解曲线显示,4 天内培养基中有 70%的菲被降解。在 4℃时,所有的 22 株南极降解菌都能够高效地降解萘,而且其中的一些菌株还可以降解菲,但效率相对较低。此外,所得到的菌都不能降解烷烃类有机物。 4.降解途径关键酶基因的检测与降解酶基因的水平转移 PCR 方法从 16 株南极降解菌和一株常温降解菌（假单胞菌属）中克隆到双加氧酶基因片段,测序及比对结果表明,这 17 个双加氧酶基因可以分为两组,在这两组内基因的同源性均超过 99%以上,但两组间的基因同源性只有 94%。分别以细菌的双加氧酶基因片段及其 16S rDNA 构建的系统进化树显示,即使 16S rDNA 相差很大的细菌,也可能拥有相近的双加氧酶基因,这表明基因在南极地发生了水平转移。 5.双加氧酶的活性分析在不同碳源的培养条件下,测定了降解菌 WSCII和 WSCIII 的双加氧酶的比活力,其结果是经菲诱导的酶比活力最高,这说明该酶具较强的底物特异性。在不同的温度下,分别测定了低温菌 LCY12、LCY16 以及常温菌 WSCIII 在不同温度下的双加氧酶比活力,结果显示这三株菌双加氧酶的最高活力温度并无明显的差别,均为 30℃左右,这表明南极这一低温环境下 IV

关键词： PAHs 南极降解菌双加氧酶基因水平转移

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人体肠道病毒组学研究进展

微生物学报 2017年第6期57卷 822-828页

作者：漆亚樊继强马迎飞中国科学院深圳先进技术研究院生物医药与技术研究所合成生物学工程研究中心广东深圳518055

人体微生物组计划开展近10年来,大量的研究显示人体微生物通过各种方式深刻地影响着人体健康。人体肠道内丰富多样的病毒构成了肠道病毒组,是人体微生物组的重要组成部分,和人体健康密切相关。本文综述了近些年国际上人体肠道病毒组研... 详细信息

人体微生物组计划开展近10年来,大量的研究显示人体微生物通过各种方式深刻地影响着人体健康。人体肠道内丰富多样的病毒构成了肠道病毒组,是人体微生物组的重要组成部分,和人体健康密切相关。本文综述了近些年国际上人体肠道病毒组研究的最新进展,分别从人体肠道病毒组的组成特征、肠道病毒组-细菌组-人体间的相互作用及其对人体健康的影响、病毒组研究的技术策略及挑战等方面进行了论述,探讨了肠道病毒组在人体疾病预防和治疗领域应用的可行性。

关键词：人肠道病毒组噬菌体人感染病毒人体健康

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菲降解菌的筛选鉴定及其降解酶基因的研究

应用与环境生物学报 2005年第2期11卷 218-221页

作者：马迎飞刘训理邵宗泽国家海洋局第三海洋研究所海洋所海洋生物遗传资源重点实验室福建厦门361005 山东农业大学林学院山东泰安271018

经过富集从活性污泥中筛选出两株菲降解菌WSCII和WSCIII,经16SrDNA鉴定,它们分别属于鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonassp. )和假单胞菌属(Pseudomonassp. ),在28℃下4d内对菲( 0. 6g/L)的降解率分别达到了70. 9%和78. 1%;在LB、萘和菲为碳... 详细信息

经过富集从活性污泥中筛选出两株菲降解菌WSCII和WSCIII,经16SrDNA鉴定,它们分别属于鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonassp. )和假单胞菌属(Pseudomonassp. ),在28℃下4d内对菲( 0. 6g/L)的降解率分别达到了70. 9%和78. 1%;在LB、萘和菲为碳源的培养条件下,测得菌体的双加氧酶比活力不同.在菲的诱导下,两株菌的双加氧酶比活力最高,而以LB和萘为碳源时酶的比活力较低,其中WSCII在萘中不能生长;这表明该酶在两菌中皆为底物诱导表达.以其它菌的萘双加氧酶基因大亚基片段做模板制备异源探针,与两菌总DNA进行斑点杂交;结果表明,这两株菌可能含有不同的菲双加氧酶基因.利用简并引物进行PCR扩增菲双加氧酶,结果仅能从WSCIII的总DNA中扩增得到目的片段,序列分析证明,该基因与已报道的(P. putidaNCIB9816 -4, AF491307 )双加氧酶同源性最高为98%.

关键词：菲生物降解 16S rDNA 双加氧酶斑点杂交

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噬菌体:微小却不简单

微生物学通报 2021年第9期48卷 3106-3108页

作者：马迎飞王冉童贻刚中国科学院深圳先进技术研究院深圳合成生物学创新研究院中国科学院定量工程生物学重点实验室广东省合成基因组学重点实验室深圳市合成基因组学重点实验室广东深圳518055 江苏省农业科学院江苏南京210014 北京化工大学生命科学与技术学院北京100029

噬菌体是专一感染细菌等微生物的病毒,是地球上多样性最高和最丰富的生物体,是生物学研究中重要的模式生物,同时是抗生素耐药菌的天然抗菌剂。噬菌体研究的相关成果极大地推动了生物学各个领域的发展。

关键词：噬菌体噬菌体疗法噬菌体合成生物学