检索结果-南通市图书馆

水稻NBS-LRR基因选择性剪接的全基因组检测及分析(英文)

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Journal of Genetics and Genomics 2007年第3期34卷 247-257页

作者：顾连峰郭荣发广东海洋大学农学院湛江524088

选择性剪接是促进基因组复杂性和蛋白质组多样性的一种主要机制,但是对水稻NBS-LRR序列选择性剪接的全基因组分析却未见报道。通过隐马尔柯夫模型搜索,从TIGR数据库里得到了855条编码NBS-LRR基序的序列。利用这些序列在KOME、TIGR基因... 详细信息

选择性剪接是促进基因组复杂性和蛋白质组多样性的一种主要机制,但是对水稻NBS-LRR序列选择性剪接的全基因组分析却未见报道。通过隐马尔柯夫模型搜索,从TIGR数据库里得到了855条编码NBS-LRR基序的序列。利用这些序列在KOME、TIGR基因索引及UniProt三个数据库中进行同源搜索,获得同源的完整cDNA序列、假设一致性序列和蛋白质序列。再利用Spidey和SIM4程序把完整cDNA序列和假设一致性序列联配到相应的BAC序列上来预测选择性剪接。蛋白质序列和基因组序列之间的联配使用tBLASTn。在这875个NBS-LRR基因中,119个基因具有选择性剪接现象,其中包括71内含子保留,20个外显子跳跃,25个选择性起始,16个选择性终止,12个5′端的选择性剪接和16个3′端选择性剪接。大多数选择性剪接都为两个和多个转录本所支持。可以通过访问http://***查询这些数据。进而通过生物信息学分析剪接边界发现外显子跳跃和内含子保留的‘GT…AG’的规则不如组成型的保守。这暗示了它们是通过不同的调控机制来指导剪接变构体的形成。通过分析内含子保留对蛋白质的影响,发现选择性剪接的蛋白更倾向于改变其C端氨基酸序列。最后对选择性剪接的组织分布和蛋白质定位进行分析,结果表明选择性剪接的最大类的组织分布是根和愈伤组织。超过1/3剪接变构体的蛋白质定位是质膜和细胞质。这些选择性剪接蛋白可能在抗病信号转导中起到重要作用。

关键词：选择性剪接生物信息学 NBS—LRR同源序列水稻

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林木原生质体细胞壁再生研究进展

分子植物育种 2023年第11期21卷 3719-3732页

作者：张千悦魏文桃张航晓顾连峰福建农林大学林学院基础林学与蛋白质组学中心福州350002 福建农林大学林学院福建省海峡植物应用系统生物学重点实验室福州350002

原生质体细胞壁再生不仅在细胞全能性的研究中具有重要作用,同时在研究核质基因重组和体细胞胚胎发生等方面具有重要的应用。因此本研究从植物原生质体的分离、纯化入手对原生质体细胞壁再生研究进展进行了综述,详细阐述了制备、培养及... 详细信息

原生质体细胞壁再生不仅在细胞全能性的研究中具有重要作用,同时在研究核质基因重组和体细胞胚胎发生等方面具有重要的应用。因此本研究从植物原生质体的分离、纯化入手对原生质体细胞壁再生研究进展进行了综述,详细阐述了制备、培养及植株再生过程的研究进展,分析了影响原生质体培养再生植株的相关因素,此外,还对原生质体培养的方法、方式以及原生质体再生细胞壁过程中细胞的生理生化变化进行了概述,总结了原生质体再生细胞壁得到再生植株的应用。最后对今后的应用前景进行展望,为植物原生质体细胞壁再生得到再生植株技术的发展提供参考。

关键词：植物原生质体原生质体培养细胞壁再生遗传改良

杉木愈伤组织的高效诱导和瞬时转化体系的建立

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分子植物育种 2023年第6期21卷 2007-2017页

作者：魏文桃张千悦吴季马祥庆顾连峰福建农林大学林学院福州350002

本研究参考已有的杉木(Cunninghamia lanceolata)体细胞胚胎发生系统,建立了以杉木针叶为外植体的愈伤组织高效诱导体系和原生质体瞬时转化体系,并初步探讨了细胞壁再生和以茎段为受体材料的稳定遗传转化技术。以杉木针叶为外植体,在添... 详细信息

本研究参考已有的杉木(Cunninghamia lanceolata)体细胞胚胎发生系统,建立了以杉木针叶为外植体的愈伤组织高效诱导体系和原生质体瞬时转化体系,并初步探讨了细胞壁再生和以茎段为受体材料的稳定遗传转化技术。以杉木针叶为外植体,在添加有1.0 mg/L 2,4-二氯苯氧乙酸(2,4-D)、2.0 mg/L 6-苄氨基嘌呤(6-BA)、1.0 mg/L 6-糠基氨基嘌呤(KT)以及0.5 mg/L萘乙酸(NAA)的MS培养基诱导愈伤组织,愈伤组织形成率可以达到87.5%;对分离得到的杉木次生木质部原生质体采用40%PEG-4000介导法进行原生质体瞬时转化,外源基因的转化率达到30%,并实现了原生质体多次分裂形成细胞团;以上结果表明,以杉木针叶作为外植体可高效诱导形成愈伤组织,且在增殖培养基上生长状态良好。本研究建立了杉木原生质体瞬时转化体系并实现了原生质体的细胞壁再生和分裂。

关键词：杉木(Cunninghamia lanceolata) 针叶叶片体细胞胚胎发生原生质体瞬时转化遗传转化

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改良式子宫全切术的临床应用和体会

医学理论与实践 2011年第20期24卷 2469-2470页

作者：顾连峰江苏省徐州市苏塘卫生院 221200

子宫全切除术是妇产科的一种常见手术,传统的手术方法手术时间长、损伤的组织多、容易引起并发症,我院自2006年1月-2010年12月对需要进行子宫全切除术的手术术式进行了改进,有效的缩短了手术时间,减少了并发症的发生,

关键词：改良式子宫全切术临床应用

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环状RNA的产生、研究方法及功能

遗传 2019年第6期41卷 469-485页

作者：刘旭庆高宇帮赵良真蔡宇晨王汇源苗苗顾连峰张航晓福建农林大学林学院基础林学与蛋白质组学中心福州350002 福建农林大学生命科学学院福州350002

随着高通量测序技术的发展,环状RNA(circular RNAs,circRNAs)逐渐成为非编码RNA研究领域的热点。本文系统综述了环状RNA侧翼内含子自身互补配对驱动、RNA结合蛋白驱动以及套索驱动这3种环状RNA形成模型,并从高通量文库构建、生物信息学... 详细信息

随着高通量测序技术的发展,环状RNA(circular RNAs,circRNAs)逐渐成为非编码RNA研究领域的热点。本文系统综述了环状RNA侧翼内含子自身互补配对驱动、RNA结合蛋白驱动以及套索驱动这3种环状RNA形成模型,并从高通量文库构建、生物信息学鉴别和常用的实验验证等3个方面对环状RNA的研究方法进行了介绍。同时,本文详细归纳了环状RNA作为microRNA(miRNA)或蛋白的海绵体、调控宿主基因的选择性剪接和表达、翻译成多肽等多种功能。最后通过系统综述植物环状RNA的特征及最新研究进展,为环状RNA在植物学中的进一步研究提供了新的视野。

关键词：环状RNA 反向剪接选择性剪接海绵体

植物CRISPR/Cas技术研究进展及其在林业科学研究中的应用

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福建农林大学学报（自然科学版） 2021年第3期50卷 289-300页

作者：胡凯强廖家凯席飞虎高鹏飞陈凯魏文桃丁家治苗苗顾连峰福建农林大学林学院福建福州350002 福建农林大学生命科学学院福建福州350002

近年来,CRISPR/Cas系统在基因编辑领域展现出强大的定点编辑能力,在植物基础研究和分子育种等方面发挥了不可替代的作用.本文综述了CRISPR/Cas系统的发展历程,及其在植物研究应用中的遗传转化方法和鉴定方法等;同时还介绍了这种基因编... 详细信息

近年来,CRISPR/Cas系统在基因编辑领域展现出强大的定点编辑能力,在植物基础研究和分子育种等方面发挥了不可替代的作用.本文综述了CRISPR/Cas系统的发展历程,及其在植物研究应用中的遗传转化方法和鉴定方法等;同时还介绍了这种基因编辑技术在植物领域的多种研究新方向;并详细概述了CRISPR/Cas系统在林木基因功能分析鉴定等基础科研方面的应用情况;最后展望了该技术在林业科学研究中的应用前景,以期为后续相关的林木遗传改良等研究提供参考.

关键词：基因编辑林木分子育种遗传转化

植物VIGS技术及其在林业科学中的研究进展

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生物技术通报 2021年第5期37卷 141-153页

作者：高鹏飞席飞虎张泽宇胡凯强陈凯魏文桃丁家治顾连峰福建农林大学林学院基础林学与蛋白质组学中心福州350002 福建农林大学生命科学学院福州350002

随着基因组序列信息的激增,生物科学研究进入大数据时代,但如何对基因组信息进行功能注释成为了一个重要的研究目标。病毒诱导的基因沉默(virus-induced gene silencing,VIGS)技术作为一种强大的工具,可以针对缺乏稳定遗传转化体系的林... 详细信息

随着基因组序列信息的激增,生物科学研究进入大数据时代,但如何对基因组信息进行功能注释成为了一个重要的研究目标。病毒诱导的基因沉默(virus-induced gene silencing,VIGS)技术作为一种强大的工具,可以针对缺乏稳定遗传转化体系的林木物种进行基因功能分析,已经被用来研究了多个植物生长发育过程中的关键基因。该技术利用植物先天抗病毒防御机制,通过把目的基因片段插入病毒载体中进而在植物体内产生小干扰RNA,使该植物内源基因的转录物成为被降解的靶标,从而导致目的基因的表达量下调。系统综述了VIGS技术的优势、局限性、以及相应的解决方案,同时还讨论了VIGS在林木科学研究中的应用,最后探究了VIGS作为探究和表征植物基因功能的有力工具的最新改进方案和未来前景。

关键词：病毒诱导的基因沉默功能基因组学病毒载体林业

选择性多聚腺苷酸化调控拟南芥开花的分子机制

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选择性多聚腺苷酸化调控拟南芥开花的分子机制

第六届全国小麦基因组学及分子育种大会

作者：张勇顾连峰侯毅枫张宪省张翼刘春艳曹晓风中科院遗传与发育生物学研究所山东农业大学生命科学学院武汉生命之美科技有限公司

选择性多聚腺苷酸化(Alternative Polyadenylation,APA)是真核生物中广泛存在的一种基因表达调控机制,极大地增加了真核生物转录组以及蛋白组的多样性和复杂性。开花是拟南芥从营养生长向生殖生长转变过程中的重要事件,受到极为复杂而... 详细信息

选择性多聚腺苷酸化(Alternative Polyadenylation,APA)是真核生物中广泛存在的一种基因表达调控机制,极大地增加了真核生物转录组以及蛋白组的多样性和复杂性。开花是拟南芥从营养生长向生殖生长转变过程中的重要事件,受到极为复杂而精细的调控。此前有研究表明植物开花与APA调控有关,但机制尚不明确。我们发现了拟南芥中一个新的RNA结合蛋白HLP1(属于hnRNP A/B家族)通过调控mRNA 3’端加工来控制植物开花的分子机制。hlp1突变体中的开花抑制因子FLC表达量显著上升,呈晚花表型。通过在植物体内建立HITS-CLIP(High-throughputsequencing of RNAs isolated by the cross-linking immunoprecipitation)技术,在全基因组范围构建了HLP1-RNA的互作图谱,发现HLP1结合到许多参与RNA代谢以及开花调控基因的转录本上,其结合位点显著富集在mPNA的内含子以及3’UTR中的多聚腺苷酸化位点附近(A-rich以及-rich元件上),提示它在mRNA 3’端形成过程中起作用。进一步在基因组水平检测hlp1突变体中APA的变化发现HLP1调控了数千个转录本poly(A)位点的选择,其中包括了FCA(开花促进因子,抑制FLC的表达)。HLP1可以直接结合到FCA转录本的两个poly(A)位点上,并促进远端poly(A)位点的使用,从而产生有生物学功能的全长FCA转录本来抑制FLC的表达。该研究在植物中首次成功建立了大规模鉴定RNA结合蛋白所结合的靶位点的新方法(HITS-CLIP/CLIP-seq技术)对于研究RNA结合蛋白参与调控植物生长发育具有重要的指导意义

关键词： Alternative polyadenylation 拟南芥开花 RNA结合蛋白 FCA

来源： cnki会议评论

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中西医结合治疗急性乳腺脓肿20例体会

临床合理用药杂志 2011年第2期4卷 67-67页

作者：顾连峰江苏省睢宁县苏塘医院 221200

笔者自2007年以来采取中西医结合治疗急性乳腺脓肿患者20例,取得了满意效果。现报道如下。1资料与方法1.1一般资料急性乳腺脓肿患者20例,均为哺乳期妇女,脓腔直径〉10cm 6例,5～10cm 14例。

关键词：乳腺脓肿,急性中西医结合