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肺炎克雷伯菌噬菌体vB_KpnP_643的生物学特性及基因组分析

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中国兽医学报 2024年第2期44卷 298-304页

作者：路艳赵日虹徐莉冀亚路张梅梅顾敬敏韩文瑜吉林大学动物医学学院吉林长春130062 长春市动物疫病预防控制中心吉林长春130062

利用自临床分离的肺炎克雷伯菌从污水中分离得到1株新噬菌体vB_KpnP_643,并对其生物学特性和基因组进行了研究与分析。噬菌体vB_KpnP_643可在涂布有肺炎克雷伯菌平板上呈现出中心透亮且周围有晕环的噬菌斑。电镜观察结果显示,该噬菌体... 详细信息

利用自临床分离的肺炎克雷伯菌从污水中分离得到1株新噬菌体vB_KpnP_643,并对其生物学特性和基因组进行了研究与分析。噬菌体vB_KpnP_643可在涂布有肺炎克雷伯菌平板上呈现出中心透亮且周围有晕环的噬菌斑。电镜观察结果显示,该噬菌体属于短尾病毒科。一步生长曲线表明,噬菌体vB_KpnP_643的潜伏期约3 min,裂解周期约60 min。噬菌体vB_KpnP_643具有较好的热稳定性和酸碱耐受性,可适用于各种环境。此外,基于生物信息学分析,噬菌体vB_KpnP_643基因组全长43331 bp,包含编码64个开放阅读框(ORF),未发现与耐药、毒力及溶原相关的基因,DNA聚合酶的系统发育树分析表明该噬菌体在一个相对独立的分支。本研究结果表明噬菌体vB_KpnP_643有望成为抗击肺炎克雷伯菌感染的一种抗生素替代药物。

关键词：肺炎克雷伯菌噬菌体生物学特性基因组分析

鸡源和鹅源新城疫病毒在宿主细胞上的蚀斑形成特性及形态发生学比较

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病毒学报 2010年第1期26卷 58-64页

作者：冯新宋战昀邹啸环韩文瑜丁壮吉林大学畜牧兽医学院预防兽医学国家重点学科吉林长春130062 吉林出入境检验检疫局吉林长春130062 军事医学科学院军事兽医研究所吉林长春130062

通过蚀斑形成试验比较鸡源(F48E9株)和鹅源(NA-1株)新城疫病毒在不同细胞的蚀斑形成能力,结果显示F48E9、NA-1两种病毒在Vero细胞、鸡胚成纤维细胞(CEF)和鹅胚成纤维细胞(GEF)上蚀斑形成能力存在明显的差异,在GEF上NA-1株的蚀斑形成能... 详细信息

通过蚀斑形成试验比较鸡源(F48E9株)和鹅源(NA-1株)新城疫病毒在不同细胞的蚀斑形成能力,结果显示F48E9、NA-1两种病毒在Vero细胞、鸡胚成纤维细胞(CEF)和鹅胚成纤维细胞(GEF)上蚀斑形成能力存在明显的差异,在GEF上NA-1株的蚀斑形成能力强于F48E9株,而在CEF上弱于F48E9株,在Vero细胞上NA-1株的蚀斑形成能力稍强于F48E9株,表明病毒蚀斑形成特性与宿主种属特性一致。通过电镜观察两株病毒以相同感染量感染Vero细胞后的病毒形态发生过程。NA-1株和F48E9株病毒在Vero细胞中不同时段的形态发生的进程上存在区别,无论从出芽时间还是出芽后病毒囊膜的完整性上,NA-1株均优于F48E9株,提示NA-1株病毒对宿主环境的适应力较强。

关键词：新城疫病毒形态发生病毒蚀斑透射电子显微镜

基于新型佐剂的驴流产沙门菌病-兽疫链球菌病二联灭活苗的制备及其安全性和免疫原性

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中国兽医学报 2023年第6期43卷 1187-1193,1202页

作者：刘明孙长江顾敬敏董建宝韩文瑜吉林大学动物医学学院吉林长春130062 山东畜牧兽医职业学院山东潍坊261061

旨在研制预防以马流产沙门菌(S.abortus equi)和马链球菌兽疫亚种(SEZ)感染引起的孕驴流产和新生驴驹腹泻的驴流产沙门菌病-兽疫链球菌病二联灭活疫苗,并进行安全性与免疫原性评价。从山东某驴场分离和鉴定出的S.abortus equi、SEZ分离... 详细信息

旨在研制预防以马流产沙门菌(S.abortus equi)和马链球菌兽疫亚种(SEZ)感染引起的孕驴流产和新生驴驹腹泻的驴流产沙门菌病-兽疫链球菌病二联灭活疫苗,并进行安全性与免疫原性评价。从山东某驴场分离和鉴定出的S.abortus equi、SEZ分离株为疫苗候选菌株,经甲醛灭活,分别与氢氧化铝佐剂和角鲨烯佐剂制备驴流产沙门菌病-兽疫链球菌病二联灭活苗。首先,检测灭活疫苗对BALB/c小鼠的安全性,比较2种不同佐剂诱导免疫保护的效果;以驴流产沙门菌病-兽疫链球菌病二联角鲨烯佐剂灭活疫苗免疫驴,凝集试验检测免疫血清的总抗体水平及血清杀菌试验检测功能性抗体水平,进一步评价二联灭活疫苗的免疫原性。结果显示,以氢氧化铝佐剂二联灭活苗免疫对5倍LD_(50)S.abortus equi和SEZ攻击BALB/c小鼠的保护率分别达到62.5%(5/8)和75.0%(6/8),而角鲨烯佐剂二联灭活疫苗对2种病原的攻击保护率均达到100%(8/8);以角鲨烯佐剂制备的二联灭活疫苗免疫驴的血清中抗流产沙门菌(10^(8)CFU/mL)的抗体凝集效价几何平均值可达1∶32,功能性抗体对S.abortus equi和SEZ的血清杀菌效价为1∶16(杀菌效率68.99%)和1∶4(杀菌效率65.47%)。S.abortus equi和SEZ 2种抗原免疫不会产生免疫干扰,角鲨烯配方佐剂与抗原结合诱导的抗S.abortus equi和SEZ致死剂量攻毒产生的保护作用强于氢氧化铝佐剂,且该二联灭活疫苗在小鼠和驴体内具有较强的保护效力与免疫原性,且安全性良好。本研究为该基于新型疫苗佐剂二联疫苗的研发奠定了坚实的基础。

关键词：马流产沙门菌马链球菌兽疫亚种灭活疫苗角鲨烯佐剂免疫原性和安全性

K47型肺炎克雷伯菌噬菌体vB;pnP;K2的生物学特性及基因组分析

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中国兽医学报 2022年

作者：赵日虹贺蔚纬姜秋杰王楠孙长江冯新顾敬敏韩文瑜吉林大学动物医学学院吉林省动物疫病预防控制中心吉林省畜牧兽医科学研究所

肺炎克雷伯菌（Klebsiella pneumoniae）是一种常见的人兽共患病原菌,也是目前耐药问题最严重的革兰阴性菌之一。其中K47型是我国耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌（carbapenem-resistant K.pneumoniae,CRKP）最主要的血清型之一,本研究利用K47...

肺炎克雷伯菌（Klebsiella pneumoniae）是一种常见的人兽共患病原菌,也是目前耐药问题最严重的革兰阴性菌之一。其中K47型是我国耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌（carbapenem-resistant K.pneumoniae,CRKP）最主要的血清型之一,本研究利用K47型CRKP从污水中分离得到噬菌体vB;pnP;K2（缩写为ZK2）,对其生物学特性和基因组信息进行研究。通过电镜观察其形态显示ZK2属于短尾病毒科（Podoviridae）,其最佳感染复数为0.00000001;一步生长曲线分析表明,ZK2的潜伏期2 min,裂解周期约50 min,爆发大小为186 PFU/cell,表明ZK2能够高效杀菌。生物信息学分析显示ZK2基因组全长40 946 bp,包含编码48个开放阅读框（ORF）,其中,ORF42与NCBI数据库中已被证实为解聚酶的序列高度同源,预测ORF42为噬菌体解聚酶。本研究表明噬菌体ZK2有作为治疗CRKP感染药物的潜力。

关键词：

高效薄层层析-病毒覆盖结合法比较细胞表面神经节苷脂与不同动物源性新城疫病毒结合特性

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微生物学报 2010年第2期50卷 263-269页

作者：冯新宋战昀韩文瑜丁壮吉林大学畜牧兽医学院预防兽医学国家重点学科长春130062 吉林出入境检验检疫局长春130062

【目的】神经节苷脂是新城疫病毒入侵宿主细胞的受体,但不同动物源性的新城疫病毒利用受体的特性是否存在差异尚不明确。以鹅源新城疫病毒NA-1株和鸡源新城疫病毒F48E9株为研究对象,比较两株病毒受体结合特性的差异。【方法】提取鸡胚... 详细信息

【目的】神经节苷脂是新城疫病毒入侵宿主细胞的受体,但不同动物源性的新城疫病毒利用受体的特性是否存在差异尚不明确。以鹅源新城疫病毒NA-1株和鸡源新城疫病毒F48E9株为研究对象,比较两株病毒受体结合特性的差异。【方法】提取鸡胚和鹅胚成纤维细胞新城疫病毒受体成分——神经节苷脂,用高效薄层层析法比较两种细胞所含神经节苷脂的类型和含量;通过高效薄层层析-病毒覆盖结合法比较两种病毒与不同细胞神经节苷脂的结合特性,最后通过病毒红细胞吸附抑制试验进一步验证神经节苷脂与病毒之间的相互作用关系。【结果】鸡胚和鹅胚成纤维细胞所含的神经节苷脂成分存在明显差异;高效薄层层析-病毒覆盖结合实验结果显示NA-1和F48E9与神经节苷脂的结合模式不同,NA-1主要与神经节苷脂GD1a结合,即包含双SAα2,3Gal末端的神经节苷脂,而F48E9可与更多类型的神经节苷脂结合,从单唾液酸到三唾液酸形式的神经节苷脂如GM1、GD1a、GD1b、GT1b等。【结论】鹅源新城疫病毒NA-1株和鸡源新城疫病毒F48E9株在入侵靶细胞时优先选择利用的受体不同。

关键词：新城疫病毒病毒受体神经节苷脂薄层色谱病毒覆盖结合实验

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把握学科规律培育学科文化促进学科发展

中国高等教育 2011年第7期 22-24页

作者：韩文瑜梅士伟吉林大学

经过自20世纪90年代以来的体制调整和重点建设，我国大部分高校完成了阶段性的学科布局调整，学科结构规模基本确定。今后5到10年成为大力提高学科建设质量、培育学科特色、形成学科优势、促进学科发展的关键阶段。

关键词：学科文化培育 20世纪90年代以来规律体制调整学科布局结构规模学科建设

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复杂非均质体参数化模型的切片及支撑点求解

机械工程学报 2019年第15期55卷 99-108页

作者：陈龙韩文瑜何文彬徐岗上海理工大学机械工程学院上海200093 杭州电子科技大学计算机学院杭州310018

针对复杂非均质NURBS体参数化模型(以下简称HNURBS体)的三维打印,给出切片及支撑点求解算法。首先构建复杂HNURBS体,实现材料信息连续可视化表达。对HNURBS体进行六面体单元采样,并和一系列切平面进行求交运算,通过截面边界轮廓的提取,... 详细信息

针对复杂非均质NURBS体参数化模型(以下简称HNURBS体)的三维打印,给出切片及支撑点求解算法。首先构建复杂HNURBS体,实现材料信息连续可视化表达。对HNURBS体进行六面体单元采样,并和一系列切平面进行求交运算,通过截面边界轮廓的提取,得到单连通和多连通截面区域轮廓及内部材料信息的参数化表达。对相邻的两切片轮廓进行布尔运算,得到三维打印模型的支撑点添加位置。实例结果表明,算法能准确高效地生成复杂HNURBS体的切片数据及支撑点位置,从而为多材料实体三维打印提供技术支持。

关键词：三维打印复杂非均质模型切片支撑点

非均质NURBS体参数化模型的AMF通用文件生成方法

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系统仿真学报 2019年第10期31卷 2010-2018页

作者：陈龙韩文瑜徐岗上海理工大学机械工程学院上海200093 杭州电子科技大学计算机学院浙江杭州310018

针对非均质NURBS (Heterogeneous Non-Uniform Rational B-spline,简称HNURBS)体参数化模型的三维打印技术,给出了三维打印通用AMF(Additive Manufacturing File Format)文件生成方法。用灰度值代表材料信息,通过含有灰度信息的控制点构建HNURBS体参数化模型,实现材料信息连续可视化表达;根据NURBS体参数模型细分方法得到等参线网格单元,对等参线网格单元进行三角网格划分和材料插值计算,得到用于AMF文件生成所需的三角形网格单元。结果表明,输出的AMF格式文件可供三维打印软件AMFtools读取和显示。

关键词：非均质产品三维打印 HNURBS体参数化 AMF文件

深度测序技术分析小鼠巨噬细胞感染布鲁菌16M株的转录组学变化

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中国兽医学报 2012年第12期32卷 1808-1814页

作者：刘倩宏韩文瑜吉林农业科技学院动物科学学院吉林吉林市132101 吉林大学畜牧兽医学院吉林长春130062

布鲁菌病是由布鲁菌引起的一种人兽共患性传染病,曾被用作生物恐怖战剂。本研究利用深度测序技术对布鲁菌感染小鼠巨噬细胞RAW264.7的转录组学轮廓进行了描述。在感染后4 h,筛选出差异表达基因3 576个,其中58%的基因表现上调;在感染后24... 详细信息

布鲁菌病是由布鲁菌引起的一种人兽共患性传染病,曾被用作生物恐怖战剂。本研究利用深度测序技术对布鲁菌感染小鼠巨噬细胞RAW264.7的转录组学轮廓进行了描述。在感染后4 h,筛选出差异表达基因3 576个,其中58%的基因表现上调;在感染后24 h,筛选出差异表达基因3 962个,其中45%的基因表现上调。并且在感染后24 h内,变化显著的基因都是与炎症、免疫、吞噬、凋亡紧密相关的。进而我们分析了在感染后24 h内显著变化的代谢途径,这些代谢途径包括内质网代谢途径、溶酶体代谢途径、及与凋亡相关的代谢途径;及被显著富集的信号通路,这些信号通路包括凋亡通路、NOD受体信号通路、FcγR介导的吞噬通路、溶酶体信号通路、p53信号通路、内质网相关蛋白的通路;并且发现B细胞受体和toll样受体信号通路在感染后24 h与感染后4 h相比被显著富集。本研究建立的巨噬细胞感染布鲁菌后差异表达基因数据库,将为布鲁菌致病机制的逐步阐述奠定基础。

关键词：深度测序转录组学布鲁菌感染