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PPI网络中功能模块识别算法研究

PPI网络中功能模块识别算法研究

作者：韩悦悦安徽农业大学

学位级别：硕士

研究蛋白质复合物和蛋白质功能模块,已成为更进一步认知生命活动的作用机制和组织原理的重要途径。研究分析蛋白质-蛋白质相互作用(Protein-Protein Interaction)网络中包含的信息所用的聚类等计算方法是发掘蛋白质功能模块特性的有效... 详细信息

研究蛋白质复合物和蛋白质功能模块,已成为更进一步认知生命活动的作用机制和组织原理的重要途径。研究分析蛋白质-蛋白质相互作用(Protein-Protein Interaction)网络中包含的信息所用的聚类等计算方法是发掘蛋白质功能模块特性的有效方式。本文从PPI网络的拓扑特性出发,针对蛋白质功能模块重叠结构的识别效率较低和存在噪声等问题进行较为深入的研究与分析。本文的主要内容如下:(1)提出了一种基于链路相似性聚类的蛋白质功能模块识别方法MLS(Markov Clustering of Protein-Protein Interaction Networks based on Link Similarity)。PPI网络具有模块性,且对已知的功能模块进行拓扑特征分析,得出模块间存在重叠结构。该算法可以有效检测出PPI网络中功能模块间的重叠结构。在酵母蛋白的多个PPI网络数据集中进行实验,聚类实验结果显示MLS算法较MCL、LC、MCODE、Newman等算法具有更好的性能。通过进一步的实例分析表明该算法检测到的功能模块,更具有生物学意义。(2)提出了一种结合拓扑特征和基因表达数据的蛋白质功能模块识别方法ECTG(Evolutionary Clustering Algorithm Based on Topological Features and Gene expression data for Protein Complex Identification)。通过分析已知蛋白质功能模块的拓扑结构,发现其中存在噪声数据,可见蛋白质相互作用数据并不能全面的反映出功能模块内蛋白质之间的关系。因此,在引入基因表达数据的基础上,结合PPI网络的拓扑特征对PPI网络进行聚类分析。该算法的实验结果表明,ECTG算法可以更好的检测蛋白质功能模块。(3)设计并开发了PPI网络聚类方法综合性分析系统ClusterA。该平台目前已集成了当前主流PPI网络数据集,实现了MLS、ClusterONE、ECTG等8个聚类算法和Avg.F等7个评估方法。ClusterA为相关领域的研究者提供了一个快速有效的多功能注释模块以及方法评估的对比平台,可方便的将各种算法结果可视化,可以帮助研究者快速直观的认知各种算法流程,并通过可视化的角度直观了解各算法的性能及差异。以上为本文的主要工作,得到的阶段性成果可作为检测PPI网络中蛋白质功能模块的有效方法。

关键词： PPI网络蛋白质功能模块聚类算法拓扑特征基因表达数据

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供电企业电力营销管理的现状与对策分析

中文科技期刊数据库（全文版）经济管理 2021年第12期 171-172页

作者：辛云山韩悦悦袁江聪国网新疆电力公司乌苏市供电公司新疆乌苏833000 国网新疆电力有限公司奎屯供电公司营销服务中心新疆奎屯833200

在现目前的电力企业管理中,传统的营销管理模式已经无法满足企业的发展需求,要想朝着更好的方式发展,供电企业应当不断探索当前的新形势,分析企业自身存在的不足,并发现自身的理念是否符合当下形式,并针对自身企业存在的问题制定相应的... 详细信息

在现目前的电力企业管理中,传统的营销管理模式已经无法满足企业的发展需求,要想朝着更好的方式发展,供电企业应当不断探索当前的新形势,分析企业自身存在的不足,并发现自身的理念是否符合当下形式,并针对自身企业存在的问题制定相应的应对措施。利用现目前新能源发展的契机,加强新能源发电的推广力度,倡导环保节能的理念,同时要提高电力企业工作人员的专业技能和综合素养,在电力企业中贯穿节能减排的意识,加强新能源发展力度,建立相应的监督管理机制,完善企业的内部结构,从而进一步促进新能源发电企业的发展,提高企业的核心竞争力。

关键词：供电企业电力营销管理现状与对策

关于新形势下如何做好电力企业电力营销及优质服务

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中文科技期刊数据库（全文版）经济管理 2021年第11期 161-163页

作者：韩悦悦袁江聪辛云山国网新疆电力公司乌苏市供电公司新疆乌苏833000 国网新疆电力有限公司奎屯供电公司营销服务中心新疆奎屯833200

随着时代的变迁,人们的生活水平也在不断的提高,而新时期的电力企业也在不断的运用各种各样的方式将企业的营销做好,以便可以为客户提供更加优秀的服务,将人们的需求不断满足,只有将顾客服务好才能不断的让电力企业在如今竞争非常激烈... 详细信息

随着时代的变迁,人们的生活水平也在不断的提高,而新时期的电力企业也在不断的运用各种各样的方式将企业的营销做好,以便可以为客户提供更加优秀的服务,将人们的需求不断满足,只有将顾客服务好才能不断的让电力企业在如今竞争非常激烈的环境中不断发展,同时也可以保证其企业的增长力。

关键词：电力营销优质服务电力企业

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信息技术在电力营销服务的应用

中文科技期刊数据库（文摘版）工程技术 2021年第12期 117-118页

作者：袁江聪辛云山韩悦悦国网新疆电力有限公司奎屯供电公司营销服务中心新疆奎屯833200 国网新疆电力公司乌苏市供电公司新疆乌苏833000

将大数据应用在电力营销管理中是势在必行的事情,随着时代的变迁,电力企业也要进行改革创新,更需要跟上时代的发展,而大数据则可以满足电力企业发展的需求。通过营销管理理念的完善,可以将节能减排目标更加具体化,还可以让电力企业与市... 详细信息

将大数据应用在电力营销管理中是势在必行的事情,随着时代的变迁,电力企业也要进行改革创新,更需要跟上时代的发展,而大数据则可以满足电力企业发展的需求。通过营销管理理念的完善,可以将节能减排目标更加具体化,还可以让电力企业与市场的发展趋势更近甚至一样,同时也为电力行业在大数据的时代打下坚实的创新基础。

关键词：数据电力营销管理电力资源电力供应

鹌鹑IGF-I、MyoD基因多态性与其肉质性状的关联分析

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中国家禽 2019年第1期41卷 5-8页

作者：王强朱梦婷郑炜王晓路韩悦悦赵宗胜朔州职业技术学院山西朔州036002 石河子大学动物科技学院新疆石河子832003

为探讨不同基因型与肉质性状的相关性,为鹌鹑的分子标记辅助选择积累理论资料,选择150只8周龄的优质朝鲜鹌鹑为试验对象,采用PCR-SSCP技术检测基因多态性,分析不同基因型与肉质性状的相关性。结果显示:IGF-I(胰岛素1号增长因子)基因检... 详细信息

为探讨不同基因型与肉质性状的相关性,为鹌鹑的分子标记辅助选择积累理论资料,选择150只8周龄的优质朝鲜鹌鹑为试验对象,采用PCR-SSCP技术检测基因多态性,分析不同基因型与肉质性状的相关性。结果显示:IGF-I(胰岛素1号增长因子)基因检测到多态性,发现了AA、GG两种不同的基因型,在A36127G处存在碱基突变,在肌内脂肪含量上AA与GG基因型之间差异显著(P<0.05);MyoD(成肌分化抗原)基因也具有多态性,发现了CC、CT、TT三种基因型,在T22453C处存在碱基突变,在肌内脂肪含量上CT与TT基因型之间差异显著(P<0.05)。结果表明,IGF-I、MyoD基因可以作为鹌鹑肉质性状辅助选择分子标记的候选基因。

关键词：鹌鹑基因多态性 PCR-SSCP 肉质性状

综合性口腔护理干预方案在重度鼾症患者围术期中的应用

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国际感染病学（电子版） 2020年第2期9卷 330-330页

作者：宁琳张银花朱六妹于金凤韩悦悦王敏安徽医科大学第一附属医院耳鼻喉科安徽合肥230000

目的对在重度鼾症患者围术期中应用综合性口腔护理干预效果分析。方法将我科的60例男性重度鼾症患者随机分为对照组和观察组各30例,对照组采用传统口腔护理方法及传统宣教模式,观察组采用综合性口腔护理干预方案。比较两组患者护理干预... 详细信息

目的对在重度鼾症患者围术期中应用综合性口腔护理干预效果分析。方法将我科的60例男性重度鼾症患者随机分为对照组和观察组各30例,对照组采用传统口腔护理方法及传统宣教模式,观察组采用综合性口腔护理干预方案。比较两组患者护理干预前后Beck评分对比。结果观察组的Beck评分得到明显降低,差异有统计学意义(P<0.05)。结论综合性口腔护理干预方案应用于重度鼾症患者围术期护理中效果满意,值得推广应用。

关键词：综合性口腔护理重度鼾症患者围术期

小黄鱼低温贮藏过程中内源性蛋白酶活性及其水分变化

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食品与发酵工业 2023年第9期49卷 252-258页

作者：马新悦韩悦邓尚贵郑斌张小军杨最素许丹浙江海洋大学食品与药学学院浙江舟山316022 浙江省海洋水产研究所浙江舟山316021 浙江省海洋渔业资源可持续利用技术研究重点实验室浙江舟山316021

以小黄鱼(Larimichthys polyactis)为研究对象,测定组织蛋白酶、α-葡萄糖苷酶(α-glucosidase,AG)和β-乙酰基氨基葡萄糖苷酶(β-acetylglucosaminidase,NAG)的酶活力,利用低场核磁共振(low-field nuclear magnetic resonance,LF-NMR)技术测定水分迁移,以质构、持水力为指标,探讨小黄鱼肉在-18、-25、-45℃冻藏(0~200 d)过程中酶活力和水分迁移以及品质变化规律。结果表明,随着冻藏时间的延长,3种温度下鱼肉的硬度、弹性和咀嚼性均出现大幅度下降趋势;组织蛋白酶B、H和L呈先下降后上升的变化趋势,-45℃组酶活性始终显著低于其他2组;AG和NAG活性显著上升;鱼肉总体水分含量(A)、结合水含量(A 21)、不易流动水含量(A 22)均减少,而自由水含量(A 23)增加;-45℃组鱼肉持水力下降速率最缓慢。该研究结果显示,小黄鱼在长期冻藏过程中超低温(-45℃)下能更好地保持鱼肉品质。

关键词：小黄鱼组织蛋白酶水分迁移超低温低场核磁共振

不同冻藏温度对小黄鱼贮藏期间品质变化的影响

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现代食品科技 2023年第4期39卷 118-125页

作者：马新悦韩悦邓尚贵郑斌张小军杨最素许丹浙江海洋大学食品与药学学院浙江舟山316022 浙江省海洋水产研究所浙江省海洋渔业资源可持续利用技术研究重点实验室浙江舟山316021

为探究超低温条件下的小黄鱼品质变化,该实验通过冻结曲线、总挥发性盐基氮(TVB-N)含量、持水力、Ca^(2+)-ATPase(Ca^(2+)-腺苷三磷酸酶)活性含量、羰基含量、总巯基含量以及冰晶形态等指标,综合表征-18、-25和-45℃等3种冻藏温度对小... 详细信息

为探究超低温条件下的小黄鱼品质变化,该实验通过冻结曲线、总挥发性盐基氮(TVB-N)含量、持水力、Ca^(2+)-ATPase(Ca^(2+)-腺苷三磷酸酶)活性含量、羰基含量、总巯基含量以及冰晶形态等指标,综合表征-18、-25和-45℃等3种冻藏温度对小黄鱼品质变化的影响。结果表明-18、-25和-45℃组通过最大冰晶生成区域时间分别为230、95和60 min,超低温(-45℃)组用时最短;且-45℃冻藏下小黄鱼组织中的冰晶面积和直径比其他两组小、分布更均匀,150 d时,肌肉组织间隙均增大,而-18和-25℃两组间隙远大于-45℃组;冻藏200 d,-45℃组的小黄鱼TVB-N含量与羰基含量最小,分别为7.96 mg/100 g与30.60 nmol/mg prot;持水力、总巯基含量与Ca^(2+)-ATPase活性含量最高,分别为74.62%、0.36 mmol/g prot与4.78μmol/mg,显著优于-18和-25℃组(P<0.05)。随着贮藏时间的延长,各温度下的小黄鱼品质均变化,但超低温(-45℃)下的小黄鱼品质变化最缓。因此,超低温冻藏对长期贮藏小黄鱼的品质劣变有延缓作用,能更有效保持其食用价值。

关键词：超低温小黄鱼冻藏冰晶形态品质变化

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乙肝病毒免疫逃逸机制有新解 002