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嵴病毒(Kobuvirus)研究进展

中国预防兽医学报 2012年第12期34卷 1006-1009页

作者：杨德全葛菲菲鞠厚斌刘健王建周锦萍上海市动物疫病预防控制中心上海201103

嵴病毒（Kobuvirus）属于小RNA病毒科家族，迄今为止，嵴病毒属存在两个公认的种：人爱知病毒（Aichivirus，AiV）和牛嵴病毒（Bovinekobuvirus，BKV）；另有一个候选种，猪嵴病毒（PorcineKobuvirus，PKV）。AiV可能是导致人胃肠炎的... 详细信息

嵴病毒（Kobuvirus）属于小RNA病毒科家族，迄今为止，嵴病毒属存在两个公认的种：人爱知病毒（Aichivirus，AiV）和牛嵴病毒（Bovinekobuvirus，BKV）；另有一个候选种，猪嵴病毒（PorcineKobuvirus，PKV）。AiV可能是导致人胃肠炎的病因之一，BKV可能造成牛和猪的腹泻。近年来，病毒学界对嵴病毒关注较高，不断有学者发现嵴病毒新的种，使嵴病毒的成员不断扩大，同时对嵴病毒的研究更加深入。为此，笔者对嵴病毒的研究进展作一综述，以期了解嵴病毒的分类地位、基因组结构特征、流行病学及其病原学检测等方面的最新进展，增加对嵴病毒的认识。

关键词：小RNA病毒分类地位结构特征流行病学胃肠炎 AiV 病毒学基因组

5株H9N2禽流感病毒HA和NA基因遗传演化分析

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畜牧与兽医 2016年第10期48卷 76-81页

作者：葛菲菲毛旭刘健杨德全鞠厚斌李鑫周锦萍上海市动物疫病预防控制中心上海201103 扬州大学生物科学与技术学院江苏扬州225000

为了解2014年上海地区鸡群中5株H9N2亚型禽流感病毒HA和NA基因的遗传变异特征,以及与疫苗株A/Chicken/Shandong/6/1996和A/Chicken/Shanghai/F/1998之间的遗传距离与血凝特性,对HA和NA进行了测序,结合Gen Bank中的相关序列进行遗传进化... 详细信息

为了解2014年上海地区鸡群中5株H9N2亚型禽流感病毒HA和NA基因的遗传变异特征,以及与疫苗株A/Chicken/Shandong/6/1996和A/Chicken/Shanghai/F/1998之间的遗传距离与血凝特性,对HA和NA进行了测序,结合Gen Bank中的相关序列进行遗传进化分析。结果表明:5株H9N2亚型毒株的HA蛋白裂解位点的氨基酸组成为RSSRGLF,符合低致病性禽流感病毒特征,5株毒株均属于经典的H9N2 Ck/Bei群系;其NA基因均属于Y280系;这5株病毒的HA1基因与疫苗株A/Chicken/Shandong/6/1996和A/Chicken/Shanghai/F/1998之间的遗传距离均大于7%。此外这5株病毒与以往上海地区分离的H9N2病毒的HA和NA基因同源性,以及HA基因上的关键位点,均存在一定的变化。F3代的HA基因与F1代相比较,均存在糖基化位点的缺失。由此可见,H9N2亚型禽流感病毒毒株在不断变异,而且现有疫苗对分离株的保护性需要进一步的研究,HA上糖基化位点的变化会引起宿主特异性的改变。

关键词：禽流感病毒 H9N2亚型遗传距离血凝特性糖基化位点宿主特异性

H9N2亚型禽流感病毒上海分离株生物学特性鉴定

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中国家禽 2011年第21期33卷 55-56页

作者：刘健葛菲菲鞠厚斌张维谊杨德全周锦萍上海市动物疫病预防控制中心上海201103

本研究采用HA试验、HI试验、EID50试验及抗原差异R值的测定比较分析了上海地区2002-2008年间分离的7株H9N2亚型禽流感病毒（AIV）的抗原性，探讨H9N2亚型AIV上海分离株的抗原性变化和进化关系，为流感疫苗株的合理选择、流感疫情的扑灭... 详细信息

本研究采用HA试验、HI试验、EID50试验及抗原差异R值的测定比较分析了上海地区2002-2008年间分离的7株H9N2亚型禽流感病毒（AIV）的抗原性，探讨H9N2亚型AIV上海分离株的抗原性变化和进化关系，为流感疫苗株的合理选择、流感疫情的扑灭提供理论上的指导。

关键词： H9N2亚型禽流感病毒上海地区分离株特性鉴定生物学 HA试验 EID50 抗原性

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猪流行性腹泻病毒研究现状

畜牧与兽医 2013年第8期45卷 110-113页

作者：杨德全鞠厚斌葛菲菲宁昆刘健王建周锦萍上海市动物疫病预防控制中心上海201103

概括了猪流行性腹泻病毒的基因分型和流行病学,阐述了猪流行性腹泻病毒与机体免疫系统的相互作用,在哺乳动物细胞中的增殖特点,以及毒力相关基因的预测,分析了病毒的遗传变异特点,讨论了控制猪流行性腹泻所面临的问题。

关键词：猪流行性腹泻病毒生物学特性流行病学

猫传染性鼻气管炎病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用

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中国畜牧兽医 2016年第5期43卷 1182-1187页

作者：刘健徐锋杨显超李鑫邓波杨德全鞠厚斌葛杰龚国华周锦萍上海市动物疫病预防控制中心上海201103

猫传染性鼻气管炎(FIR)病毒是引起猫传染性鼻气管炎的病原,属于猫疱疹病毒1型(FHV-1)。选择FHV-1 gD基因设计1对引物FHV-1F、FHV-1R和探针FHV-1Probe,建立FHV-1实时荧光定量PCR检测方法。结果表明,该方法可以特异地检测出FHV-1的DNA,敏... 详细信息

猫传染性鼻气管炎(FIR)病毒是引起猫传染性鼻气管炎的病原,属于猫疱疹病毒1型(FHV-1)。选择FHV-1 gD基因设计1对引物FHV-1F、FHV-1R和探针FHV-1Probe,建立FHV-1实时荧光定量PCR检测方法。结果表明,该方法可以特异地检测出FHV-1的DNA,敏感性达到75fg/μL,反应效率达到107%,R2值为0.9965,Ct值的变异系数低于2%。FHV-1实时荧光定量PCR检测方法敏感性高于普通PCR,特异性好、稳定性好,适用于FHV-1的临床诊断、检测和流行病学调查。利用该方法对上海地区宠物门诊送检的疑似FHV-1感染的样品进行检测,其阳性率达到27.78%,表明上海地区宠物猫FHV-1的发病率处于较高水平。

关键词：猫传染性鼻气管炎病毒实时荧光定量PCR 检测

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上海地区猪2型圆环病毒病的流行病学调查和病毒基因型分析

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畜禽业 2015年第5期26卷 68-69页

作者：孙泉云刘键鞠厚斌夏炉明卢军上海市动物疫病预防控制中心上海201103

为了解上海地区猪2型圆环病毒病的流行现状,于2010-2014年间开展了流行病学调查和分离毒株的基因型分析,结果表明发病场户构成比例中,规模猪场占62.1%,专业养猪户占37.9%;PCV2引发的临床病症中,PMWS比例最高,占58.6%;PDNS次之,占24.1%,... 详细信息

为了解上海地区猪2型圆环病毒病的流行现状,于2010-2014年间开展了流行病学调查和分离毒株的基因型分析,结果表明发病场户构成比例中,规模猪场占62.1%,专业养猪户占37.9%;PCV2引发的临床病症中,PMWS比例最高,占58.6%;PDNS次之,占24.1%,其它病症占17.2%;经对不同季节发病情况的统计,冬季发病比例最高,达44.8%,夏季次之,占27.6%,春季和秋季则分别占17.2%和10.4%。经对29个PCV2感染病例的病原学检测结果分析,平均混合感染率达到53.1%。经对病原学阳性样本的基因型分析,以PCV-2b感染为主,所占比例为93.1%;其次为PCV-2a,占6.9%。

关键词：猪 2型圆环病毒流行病学调查基因型分析

2004年~2012年上海地区猪繁殖与呼吸综合征流行情况调查

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中国预防兽医学报 2015年第3期37卷 190-193页

作者：王建张维谊鞠厚斌杨德全刘健周锦萍袁世山刘佩红上海市动物疫病预防控制中心上海201103 中国农业科学院上海兽医研究所上海200232

为调查上海及周边地区猪繁殖与呼吸综合征（PRRS）流行情况,本研究对2004~2012年上海及周边地区的健康猪内脏、血清以及发病猪病例进行了回顾调查、病料收集及检测。结果显示,130份屠宰场健康猪内脏样品中PRRSV阳性率为4.62%,1 499份发... 详细信息

为调查上海及周边地区猪繁殖与呼吸综合征（PRRS）流行情况,本研究对2004~2012年上海及周边地区的健康猪内脏、血清以及发病猪病例进行了回顾调查、病料收集及检测。结果显示,130份屠宰场健康猪内脏样品中PRRSV阳性率为4.62%,1 499份发病猪内脏样品中PRRSV阳性率为38.76%,阳性率较高的月份相对集中在5~9月份,占全年56.59%。2006年检测到变异株（HP-PRRSV）,并呈逐年上升趋势,自2009年,PRRS阳性病例中HP-PRRSV超过50%,成为PRRS中的优势病毒株,至2012年已达到64%。上海地区PRRS病例中88.8%为混合感染,并且病征复杂,主要表现为高热、食欲下降、呼吸困难、部分妊娠母猪流产。此外,还存在神经症状、腹泻等消化道症状。自2009年上海地区猪场开始普遍使用HP-PRRS弱毒疫苗,PRRSV在临床病例中的检出率由2009年的53.69%逐年下降,2012年已下降至22.3%。本研究为PRRS的科学防控提供了数据支持。

关键词：猪经典猪繁殖与呼吸综合征高致病性繁殖与呼吸综合征病毒流行情况

2007-2008年上海市H9N2亚型禽流感病毒的遗传演化

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中国人兽共患病学报 2011年第8期27卷 696-699页

作者：葛菲菲刘健鞠厚斌张维谊周锦萍上海市动物疫病预防控制中心上海201103

目的对分离自上海活禽批发市场的11株H9N2亚型AIV(2007年5株、2008年6株)进行了PB2,PB1,HA,NP和NA的测序,以阐明2007年至2008年上海地区H9N2亚型禽流感病毒分离株的遗传变异及分子特征。方法采集鸡气管和泄殖腔样品,将H9亚型荧光RT-PCR... 详细信息

目的对分离自上海活禽批发市场的11株H9N2亚型AIV(2007年5株、2008年6株)进行了PB2,PB1,HA,NP和NA的测序,以阐明2007年至2008年上海地区H9N2亚型禽流感病毒分离株的遗传变异及分子特征。方法采集鸡气管和泄殖腔样品,将H9亚型荧光RT-PCR试剂盒检测的阳性样品处理后,经鸡胚尿囊腔接种分离病毒,HI进一步确定HA亚型,通过RT-PCR方法分别扩增了这11个毒株的PB2,PB1,HA,NP和NA并进行了序列测定。结果对HA基因进行遗传发生关系分析,这11株分离株均属于Ck/Bei/1/94系。这11个毒株的5个片段的组成有两种方式。结论上海活禽批发市场的11株H9N2亚型AIV毒株中已包含了H5的片段,所以在今后的工作中加强H9N2亚型禽流感流行病学监测是非常必要的。

关键词： H9N2亚型禽流感测序遗传发生关系

1株H3N8亚型马流感病毒的分离鉴定及全基因进化分析

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中国兽医学报 2015年第9期35卷 1435-1440,1467页

作者：葛菲菲刘健鞠厚斌杨德全周锦萍上海市动物疫病预防控制中心上海201103

2013年8月某养马厂出现疑似马流感疫情,经分离鉴定为H3N8亚型马流感病毒。为了了解该H3N8马流感分离株(A/equine/Xuzhou/01/2013(H3N8))的基因进化情况,本试验比较了该病毒株,我国已报道的H3N8马流感毒株以及目前全球所使用的疫苗株的... 详细信息

2013年8月某养马厂出现疑似马流感疫情,经分离鉴定为H3N8亚型马流感病毒。为了了解该H3N8马流感分离株(A/equine/Xuzhou/01/2013(H3N8))的基因进化情况,本试验比较了该病毒株,我国已报道的H3N8马流感毒株以及目前全球所使用的疫苗株的病毒基因型,也比较了与抗原性相关的氨基酸的变化情况,为科学防控马流感提供参考依据。采集病死马的内脏样本,进行了A型禽流感病毒通用荧光RT-PCR检测,将荧光RT-PCR检测阳性样品处理后接种鸡胚尿囊腔,检测分离毒尿囊液血凝性及HA效价。参照已发表的扩增H3N8马流感病毒全基因引物,经RT-PCR扩增出该H3N8亚型马流感病毒(A/equine/Xuzhou/01/2013(H3N8))的8个基因片段,对其测序构建基因进化树,并进行分子特征分析。经过比较分析,该病毒株的HA基因在遗传进化上属于佛罗里达Ⅱ型马流感病毒,其余7个片段都属于马流感病毒中的美洲型。在5个公认的抗原位点中,A/equine/Xuzhou/01/2013与我国2007年的分离株(A/donkey/Xinjiang/2007),目前的疫苗株(Miami/63,Kentucky/81,Suffolk/89,Newmarket/2/93和Avesta/93)相比均发生了一些位点的变异。我国H3N8亚型马流感病毒存在抗原变异,需要进一步对其致病性、免疫原性等特性进行研究,同时还需加强马流感病毒分子流行病学监测。

关键词： H3N8马流感基因进化树抗原位点