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基于异质网络表示学习的症状-基因关系预测模型研究

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基于异质网络表示学习的症状-基因关系预测模型研究

作者：陆必燊湖南中医药大学

学位级别：硕士

目的:自人类基因组计划完成,研究人类疾病的作用机制,破解其遗传基础是目前生物医学研究的核心课题之一。随着生物信息学与计算机技术的快速发展,为了降低传统生物实验研究时间长、成本高等问题。研究人员基于大量的生物医学数据,利用... 详细信息

目的:自人类基因组计划完成,研究人类疾病的作用机制,破解其遗传基础是目前生物医学研究的核心课题之一。随着生物信息学与计算机技术的快速发展,为了降低传统生物实验研究时间长、成本高等问题。研究人员基于大量的生物医学数据,利用计算机技术挖掘潜在的有利于疾病相关研究的信息被证明是一种非常有效的方法。当前,大多数的研究主要关注疾病致病基因的预测,对症状相关的基因预测研究相对较少。症状作为疾病最为直接可见的表征,研究其与基因之间的联系对医学理论研究和临床实践具有重要意义。基于异质网络的疾病基因关联关系预测模型是该领域的研究方向之一,然而这些模型对症状相关的基因预测存在节点特征利用不足,冗余信息处理效果差等问题。因此,设计性能优秀的症状-基因关联关系预测模型,有利于推动对疾病症状与其相关生物医学信息的研究。方法:本文提出了一种改进的基于异质网络表示学习的多关系图卷积模型（HMLP＿GCN）,用于症状-基因关联关系预测分析。首先,从HPO、Dis Ge NET、Orphanet等公开数据库和现有研究公开的数据集中,整理实验分析所需的生物医学数据。本文共整理了症状-基因关联数据、疾病-基因关联数据、症状-疾病关联数据以及蛋白质相互作用数据四个数据集。利用这四个数据集,分别构建了四个异质图网络（G1、G2、G3、G4）。由于图中节点数量与类型会影响模型最终的预测性能。本文基于R-GCN模型对四个异质图网络进行了模型测试。考虑R-GCN模型对图中节点的特征利用不足等问题,本文引入了异质多层感知器来处理同类型节点映射的问题。利用多层感知器在图卷积之前进行维度拼接,从而能够更好的处理节点的特征,使得图中同类型的节点有了聚类的特性,然后再利用R-GCN模型进行卷积操作以聚类不同类型的节点。最后,将HMLP＿GCN模型与三个基准模型在完整图G4和三个变体异质图网络上进行预测以评估模型的性能。结果:利用R-GCN模型对G1、G2、G3、G4四个异质图网络的模型测试结果表明,当图中节点数量和类型增加时,模型的预测性能提高了。但随着节点的数量和类型越来越多时,图中的冗余信息也随着增加,噪声数据变多会导致模型的预测性能下降。HMLP＿GCN模型与三个基准模型在完整图G4上的预测结果表明,HMLP＿GCN模型在AUC值、准确率、精确度、召回率以及F1-score等指标上分别取得了0.958、0.910、0.900、0.936、0.917的最优评分。与三个基准模型相比在AUC值上分别提高了4.8%、4.2%、5.8%,准确率上分别提高了3.8%、05.8%、1.3%。此外,HMLP＿GCN模型在G1、G2、G3、G4四个异质图网络上的预测结果同样取得了最优评分,实验分析表明HMLP＿GCN模型能处理节点数量和类型增多带来的信息冗余问题。结论:本文基于异质图神经网络构建了症状-基因关联关系预测模型。实验结果表明,本文的方法在症状-基因关联关系预测中与现有方法相比在节点特征和冗余信息处理方面有一定的优势之处,为症状相关生物医学研究提供了思路。

关键词：症状-基因关系预测异质网络表示学习多源生物医学数据

“双一流”建设背景下的研究生党建创新路径探索

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黑龙江教育（高教研究与评估） 2024年第7期 94-96页

作者：陆燊佳江南大学江苏无锡214122

面对国内外“两个大局”,党中央做出了建设世界一流大学和一流学科的重大战略决策,这对加快中国式高等教育现代化发展、扎实推动教育强国建设具有深远意义。加强研究生党建是落实立德树人根本任务,充分发挥研究生这一重要参与主体能动性... 详细信息

面对国内外“两个大局”,党中央做出了建设世界一流大学和一流学科的重大战略决策,这对加快中国式高等教育现代化发展、扎实推动教育强国建设具有深远意义。加强研究生党建是落实立德树人根本任务,充分发挥研究生这一重要参与主体能动性,推动“双一流”建设的必然要求。必须以辩证的态度把握政治属性和学术属性、主体权利和责任担当、硬性实力和软性力量几对关系,加强“双一流”建设背景下研究生党建工作与事业发展的深度融合,为一流学科高质量发展提供条件,为培养拔尖创新人才、实现高水平科技自立自强和服务经济社会高质量发展提供保障。

关键词：双一流研究生党建辩证创新路径

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莫扎特歌剧咏叹调《再一次见到你》演唱分析

莫扎特歌剧咏叹调《再一次见到你》演唱分析

作者：陆建燊云南艺术学院

学位级别：硕士

咏叹调《再一次见到你》选自奥地利古典主义作曲家沃尔夫冈·阿玛多伊斯·莫扎特的三幕德语歌剧《后宫诱逃》,这部歌剧是莫扎特在维也纳创作的第一部歌剧,开创了德语歌剧的先河。莫扎特用其先进的音乐语言,给剧中男主角贝尔蒙特注入了... 详细信息

咏叹调《再一次见到你》选自奥地利古典主义作曲家沃尔夫冈·阿玛多伊斯·莫扎特的三幕德语歌剧《后宫诱逃》,这部歌剧是莫扎特在维也纳创作的第一部歌剧,开创了德语歌剧的先河。莫扎特用其先进的音乐语言,给剧中男主角贝尔蒙特注入了独特的人物形象;用其独一无二的写作手法,为男主角贝尔蒙特创作出极具欣赏与演唱价值的咏叹调。本文以歌剧《后宫诱逃》中男主角贝尔蒙特的咏叹调《再一次见到你》为例,分析贝尔蒙特的人物形象与演唱。本文分三个部分展开研究。第一部分,对莫扎特歌剧《后宫诱逃》的创作背景与创作特征进行阐述;第二部分,介绍歌剧《后宫诱逃》的剧本和主要人物,分析男主角贝尔蒙特的人物形象;第三部分,咏叹调《再一次见到你》的演唱分析,研究语言风格、曲式、演唱技巧和人物形象的塑造,为声乐学习者演唱与解读这部作品提供一些参考。

关键词：莫扎特《再一次见到你》贝尔蒙特演唱分析

《20多岁的年轻人能做的事、应该做好的事》（节选）翻译实践报告

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《20多岁的年轻人能做的事、应该做好的事》（节选）翻译实践报告

作者：陆燊梅辽宁师范大学

学位级别：硕士

随着社会经济飞速发展,生活节奏加快,每个人都负重前行。特别是20多岁的年轻人,初入社会即面临各种选择,受到来自四面八方的压力,对未来更是迷茫不安。所以大家对自我的要求也不断提高,如何完善自我,充实自我成为当今热门话题。译者以... 详细信息

随着社会经济飞速发展,生活节奏加快,每个人都负重前行。特别是20多岁的年轻人,初入社会即面临各种选择,受到来自四面八方的压力,对未来更是迷茫不安。所以大家对自我的要求也不断提高,如何完善自我,充实自我成为当今热门话题。译者以日本作家松原惇子所著的自我提升类书籍《20多岁的年轻人能做的事、应该做好的事》为对象,进行了翻译研究。该书的作者是日本女性心灵导师,出版了很多励志作品为年轻人带来勇气。作者以自己的视角出发,结合20多岁时自己经历的种种,在寻找自我、工作、婚姻、生活、人际关系这几个方面进行分析、讨论出现的问题,并给出相应的一些实用性建议,满足了众多年轻读者的需要,具有极高的社会价值。本次翻译实践报告中,译者主要以劳伦斯?韦努蒂提出的归化理论为基础进行翻译分析。翻译实践报告由以下几个部分构成:第1章主要介绍了该翻译项目,包括选材背景、文本特点及翻译意义;第2章记录了该项目的翻译过程。包括本次翻译实践的译前准备、翻译理论依据和具体翻译流程;第3章为案例分析。译者选取了翻译过程中遇到的典型问题进行分析,探讨翻译技巧及解决策略;第4章译者总结了本次翻译实践的心得体会、翻译实践中的不足以及今后的研究方向。通过此次翻译实践,译者也获益良多。不仅从作品中得到了很多启示,同时也掌握了自我提升类书籍的基本翻译技巧,希望通过本次实践为相关类型书籍的翻译提供一定的参考。

关键词：翻译技巧归化翻译论 20多岁实用性自我提升

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2023时装周一起探索时尚新趋势

时尚北京 2023年第5期 13-16,18-20页

作者：杜燊陆杨郭嘉不详

要说三、四月份最流行的词汇,除了时装周再无其他。巴黎、米兰、伦敦、纽约这几大时装周,叠加国内明星出国看秀,堪称近年来国内社交媒体上热度最大的一届,品牌的全新系列无疑也为全面回归的实体秀构建了丰富的叙事语境,重新激发了城市... 详细信息

要说三、四月份最流行的词汇,除了时装周再无其他。巴黎、米兰、伦敦、纽约这几大时装周,叠加国内明星出国看秀,堪称近年来国内社交媒体上热度最大的一届,品牌的全新系列无疑也为全面回归的实体秀构建了丰富的叙事语境,重新激发了城市的风采与活力。

关键词：时装周社交媒体叙事语境全面回归

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陈栩旧体诗词创作与教育研究

陈栩旧体诗词创作与教育研究

作者：陆燊佳武汉大学

学位级别：硕士

陈栩(1879-1940)生于晚清杭州的儒医世家,自小接受良好的传统文化教育,在那中西交汇、古今转型的社会时代,他身兼文学家、办报人、翻译家、实业家等多重身份。本文以其旧体诗词创作与教育为切入口,回溯这位一个世纪前文坛与实业界的风... 详细信息

陈栩(1879-1940)生于晚清杭州的儒医世家,自小接受良好的传统文化教育,在那中西交汇、古今转型的社会时代,他身兼文学家、办报人、翻译家、实业家等多重身份。本文以其旧体诗词创作与教育为切入口,回溯这位一个世纪前文坛与实业界的风云人物。绪论介绍陈栩人生的主要经历,阐明选题的国内外研究现状,并指出陈栩旧体诗词创作与教育研究的必要性。第一章分阶段梳理陈栩结集出版的诗词文献,并结合有关材料指出其“遵守诗词格律的传统体式”和“推崇以明畅之语书写性灵”的诗词创作主张。第二章分类详析陈栩旧体诗词创作的内容与特色。他的艳体诗词以“情”为根本,艺术风格流转多变,融入小说笔法,形成独特风貌。其涉商诗词描述自身从商经历、反映社会经济现象、传达民族经济思想,不仅丰富了文学作品中商人形象、商业文化的构建,同时也是千年来儒商伦理精神高度发展的体现,极具时代性。其时事诗词流露出关怀人世与忠信爱国之精神,但面对国事蜩螗、人世艰难,他也生出归隐桃源、钦羡仙佛的意向,这种意向可看作面对时局困厄而无力挽狂澜的悲剧基调下的补偿性放达。此外,其题画、描景状物、说理等诗词也各具特色。第三章论述陈栩的旧体诗词教育。在回溯函授社开办经过和《文苑导游录》《文艺丛编》等刊物编辑出版情况的基础上,阐明陈栩的诗词函授既有体系化的知识传授又有散点式的具体指导,体现出现代转型期新旧融合的品格和以创作实践为导向的特色。陈栩从事诗词函授蕴含着他对传统文化命运的关注与传承传统文化的使命感,其贡献不仅在于培养了为数不少的杰出弟子,还在于传统文化命脉通过一代代的传播而延绵生长。

关键词：陈栩晚清民国旧体诗词创作教育文脉传承

基于语义框架的电网缺陷文本挖掘技术及其应用

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电网技术 2017年第2期41卷 637-643页

作者：曹靖陈陆燊邱剑王慧芳应高亮张波浙江大学电气工程学院浙江省杭州市310027 国网浙江金华供电公司浙江省金华市321017

电网企业拥有大量蕴含着重要可靠性信息的设备缺陷文本,依靠人工进行挖掘不仅效率低而且准确性因人而异。以变压器缺陷文本为研究对象,通过分析文本的特点,建立了基于语义框架的电网缺陷文本挖掘模型,解决了缺陷文本句子成分难以划分、... 详细信息

电网企业拥有大量蕴含着重要可靠性信息的设备缺陷文本,依靠人工进行挖掘不仅效率低而且准确性因人而异。以变压器缺陷文本为研究对象,通过分析文本的特点,建立了基于语义框架的电网缺陷文本挖掘模型,解决了缺陷文本句子成分难以划分、数字量无法精确提取等问题,为电网领域的非结构化数据挖掘提供了新技术。首先在建立本体词库基础上,对缺陷文本进行分词、词汇特征提取等预处理;然后定义了电力语义框架与语义槽,提出了槽填充和语义框架构建流程,并通过词串合并实现了本体字典自动完善;最后对缺陷文本挖掘结果在可靠性统计中的应用进行了研究。算例表明,所提出的挖掘技术应用于电网缺陷自动分类与统计中,具有可行性和有效性。

关键词：文本挖掘语义框架可靠性统计缺陷文本

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中国品牌自信稳健地走出去

时尚北京 2024年第3期 15-18,20-22,24-26页

作者：杜燊董潇陆杨不详

中国品牌走出“国门”,一直都是令国人自豪的一件事。随着自身产品力的提升和全球经贸格局的变化,越来越多的中国品牌开始抓住机遇,制定符合自身发展要求的“走出去”战略,以全球化视野看待发展,因地制宜,稳步推进海外市场的拓展。中国... 详细信息

中国品牌走出“国门”,一直都是令国人自豪的一件事。随着自身产品力的提升和全球经贸格局的变化,越来越多的中国品牌开始抓住机遇,制定符合自身发展要求的“走出去”战略,以全球化视野看待发展,因地制宜,稳步推进海外市场的拓展。中国自古以来就拥有丰富的文化遗产和传统文化,这些文化元素在当今全球化的背景下越来越受到世界各地人们的关注和欣赏,我们可以创造出具有高附加值和国际竞争力的产品,让中国品牌更好地为世界所知晓和喜爱。

关键词：稳步推进全球化视野经贸格局国际竞争力文化遗产因地制宜品牌高附加值

食管鳞状细胞癌关键基因筛选与生物学途径分析

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生命科学研究 2022年第2期26卷 165-174页

作者：陆必燊晏峻峰湖南中医药大学信息科学与工程学院中国湖南长沙410208

利用生物信息方法筛选食管鳞状细胞癌的关键基因,并分析相关生物学途径。从GEO数据库下载GSE20347、GSE29001、GSE33426、GSE45168和GSE70409基因芯片表达谱,利用RobustRankAggreg方法对数据进行整合分析,得到差异表达基因。应用DAVID... 详细信息

利用生物信息方法筛选食管鳞状细胞癌的关键基因,并分析相关生物学途径。从GEO数据库下载GSE20347、GSE29001、GSE33426、GSE45168和GSE70409基因芯片表达谱,利用RobustRankAggreg方法对数据进行整合分析,得到差异表达基因。应用DAVID数据库对筛选的基因进行GO功能注释和KEGG通路富集分析,利用STRING数据库构建差异表达基因的蛋白质相互作用网络识别功能模块。最后,基于Cytoscape软件,利用Degree、MCC、MNC、EPC 4种算法筛选关键节点基因,并在GEPIA数据库中对关键节点基因进行验证。结果显示:共筛选出373个差异表达基因,包括154个表达上调基因和219个表达下调基因,主要涉及细胞外基质组成、细胞质、蛋白质结合、氧化还原过程、细胞外泌体、钙离子结合、阿米巴病、PI3K-Akt信号通路、ECM-受体相互作用、黏着斑及蛋白质消化与吸收等功能和通路。蛋白质相互作用网络和韦恩图分析得到两个主要功能模块和7个关键基因CDK1、KIF20A、TTK、CDC45、CCNB2、TPX2、KIF4A,其中KIF20A、KIF4A在食管鳞状细胞癌中的相关研究较少。验证结果显示,7个关键基因在食管鳞状细胞癌中均表达增高。本研究分析得到的关键基因和生物学途径有望为食管鳞状细胞癌的诊断及治疗提供生物信息学依据。

关键词：食管鳞状细胞癌(ESCC) GEO数据库差异表达基因生物学途径生物信息学