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2014-2018年广西柳州市HCV的基因型和1b亚型NS5B区的序列特征

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中华疾病控制杂志 2020年第10期24卷 1228-1232页

作者：尹琦罗洲陈钦艳杨庆利广西中医药大学广西高发传染病中西医结合转化医学重点实验室南宁530200 柳州市柳铁中心医院检验科柳州545007 广西壮族自治区疾病预防控制中心广西病毒性肝炎防治研究重点实验室广西中医药大学广西高发传染病中西医结合转化医学重点实验室南宁530028

目的分析2014―2018年广西柳州市丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)的基因型分布和HCV 1b亚型NS5B区的序列特征。方法收集慢性丙型病毒性肝炎患者血清,提取HCV RNA,反转录后用巢式PCR扩增NS5B区序列,测序后构建进化树分析HCV基因型... 详细信息

目的分析2014―2018年广西柳州市丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)的基因型分布和HCV 1b亚型NS5B区的序列特征。方法收集慢性丙型病毒性肝炎患者血清,提取HCV RNA,反转录后用巢式PCR扩增NS5B区序列,测序后构建进化树分析HCV基因型和基因亲缘关系。用聚类分析法对比HCV 1b本地群、非本地群和参照株NS5B区基因和蛋白序列的差异。结果广西柳州市HCV流行的基因型包括1a、1b、2a/c、3a、3b、6a、6c/d和未分型(NT),分别占3.39%、43.01%、0.42%、13.98%、6.99%、28.81%、3.18%和0.21%;HCV 1b亚型中61.6%的病毒与各参照株进化距离均较远,其比例在2014―2018年分别占HCV 1b亚型的69.8%、78.6%、43.3%、47.6%和59.6%;该群HCV的NS5B基因有15个经常性突变位点,可导致NS5B蛋白I2682V和S2755N发生经常性变异。结论广西柳州市HCV流行的主导基因型依次为1b、6a和3a;HCV 1b亚型中的大部分属于本地亲缘性群,该群HCV的NS5B蛋白存在特征性的变异位点并可能影响直接抗病毒药的作用。

关键词：丙型肝炎病毒基因型 HCV 1b NS5B区变异

基于丙型肝炎病毒NS5B区的巢式RT-PCR和基因分型的比较研究

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中国病原生物学杂志 2016年第8期11卷 685-689,695页

作者：尹琦杨庆利方钟燎王学燕李海陈钦艳谭超罗洲广西壮族自治区疾病预防控制中心广西病毒性肝炎防治研究重点实验室广西南宁530028 柳州市柳铁中心医院南方医科大学附属柳州医院广西柳州545007

目的研究不同引物组合和病毒载量对丙型肝炎病毒（HCV）RNA逆转录和NS5B区巢式PCR反应效率,以及由于逆转录引物不同对基因分型结果的影响。方法用荧光定量PCR检测病毒载量。分别用Oligo（dT）15和随机引物pd（N）6将HCV RNA逆转录合成cD... 详细信息

目的研究不同引物组合和病毒载量对丙型肝炎病毒（HCV）RNA逆转录和NS5B区巢式PCR反应效率,以及由于逆转录引物不同对基因分型结果的影响。方法用荧光定量PCR检测病毒载量。分别用Oligo（dT）15和随机引物pd（N）6将HCV RNA逆转录合成cDNA,用针对5’-NTR区的巢式PCR进行检测;分别用针对NS5B区的简单引物和简并引物组合进行巢式PCR,比较各组扩增效率。对NS5B区第2轮PCR产物测序并比较基因分型结果的一致性。结果用Oligo（dT）15引物逆转录和随机引物逆转录合成cDNA,5’-NTR区扩增的阳性率分别为87.5%和98.4%,差异有统计学意义（χ2=17.6,P〈0.001）。用HCV1/HCV2-122S/123A简单引物组合和ENO2/ENO4-NS5S3/NS5A5简并引物组合对Oligo（dT）15逆转录cDNA产物进行NS5B区的巢式PCR扩增,阳性率分别为11.5%和35.4%,差异有统计学意义（χ2=30.7,P〈0.001）;用上述两组引物组合对随机引物逆转录cDNA进行NS5B区巢式PCR扩增,其阳性率分别为45.3%和94.3%,差异有统计学意义（χ2=109.1,P〈0.001）。随机引物在不同载量病毒组中的逆转录反应阳性率差异无统计学意义（χ2=2.00,P〉0.05）;随机引物配合简并引物组合在不同载量病毒组NS5B区扩增的阳性率差异无统计学意义（χ2=5.18,P〉0.05）。经Oligo（dT）15引物和随机引物合成cDNA,用简并引物组合对NS5B区进行巢式PCR扩增,通过核酸测序确定HCV基因型完全一致。结论使用pd（N）6随机引物进行逆转录,结合ENO2/ENO4-NS5S3/NS5A5简并引物组合可实现对不同载量HCV的基于NS5B区的高效巢式PCR扩增和基因分型。

关键词：丙型肝炎病毒 NS5B区 RT-PCR 病毒载量

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隆安县农村居民乙型肝炎病毒感染现况研究

现代预防医学 2010年第8期37卷 1547-1548+1552页

作者：陈钦艳董柏青杨进业黄坚方孔雄王学燕方钟燎广西壮族自治区疾病预防控制中心广西隆安县疾病预防控制中心

[目的]了解2004年隆安县农村居民的乙型肝炎病毒(HBV)感染现况。[方法]以分层抽样方法对广西隆安县12个乡镇108个自然村30～55岁农村居民进行调查,抽取静脉血,及时分离血清,用酶联免疫吸附试验(ELISA法)检测HBsAg,用赖氏法检测受试者丙... 详细信息

[目的]了解2004年隆安县农村居民的乙型肝炎病毒(HBV)感染现况。[方法]以分层抽样方法对广西隆安县12个乡镇108个自然村30～55岁农村居民进行调查,抽取静脉血,及时分离血清,用酶联免疫吸附试验(ELISA法)检测HBsAg,用赖氏法检测受试者丙氨酸氨基转移酶(ALT)。[结果]调查人群HBsAg阳性率为14.51%,ALT异常率为7.05%,HBsAg阳性且ALT异常率为2.87%。男性HBsAg阳性率和/或ALT异常率(16.66%、9.18%、3.61%)均明显高于女性(12.60%、5.16%、2.21%)(均P﹤0.05),各年龄组HBsAg阳性率、ALT异常率、HBsAg阳性且ALT异常率均有统计学差异(均P﹤0.01)。HBsAg阳性率随年龄增长下降(P﹤0.01)。HBsAg阳性人群ALT异常率(19.77%)高于HBsAg阴性人群(4.89%)(P﹤0.01)。[结论]广西隆安县仍是乙型肝炎高发区,应切实做好肝病防治工作。

关键词：乙型肝炎病毒(HBV) 表面抗原(HBsAg) 血清丙氨酸氨基转移酶(ALT) 现况研究

不同临床类型乙型肝炎患者HBV血清标志物与HBV DNA含量关系的研究

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广西医学 2012年第10期34卷 1279-1281页

作者：李生陈钦艳广西中医药大学第一附属医院检验科南宁市530023 广西壮族自治区疾病预防控制中心病毒所南宁市530021

目的探讨不同临床类型乙型肝炎患者HBV血清标志物及HBV DNA含量关系,为乙肝防治提供依据。方法 306例乙肝患者中,慢性肝炎104例、肝硬化126例、肝癌76例,采用酶联免疫吸附试验(ELISA)法检测血清HBV标志物(HBsAg、抗-HBs、HBeAg、抗-HBe... 详细信息

目的探讨不同临床类型乙型肝炎患者HBV血清标志物及HBV DNA含量关系,为乙肝防治提供依据。方法 306例乙肝患者中,慢性肝炎104例、肝硬化126例、肝癌76例,采用酶联免疫吸附试验(ELISA)法检测血清HBV标志物(HBsAg、抗-HBs、HBeAg、抗-HBe、抗-HBc),用荧光定量PCR(FQ-PCR)检测HBV DNA,分析两者的关系。结果 306例患者小三阳(HBsAg阳性、抗-HBe阳性、抗-HBc阳性)检出率为47.06%(144/306),大三阳(HBsAg阳性、HBeAg阳性、抗-HBc阳性)检出率为20.26%(62/306);慢性肝炎组大三阳检出率、HBV DNA含量均高于肝硬化组、肝癌组(P均<0.01);慢性肝炎组小三阳检出率均低于肝硬化组、肝癌组(P均<0.01)。62例大三阳组患者HBV DNA含量高于144例小三阳组患者(P<0.05)。结论慢性肝炎患者HBV血清标志物以大三阳表现为主,肝硬化、肝癌患者以小三阳表现为主,慢性肝炎患者HBV DNA含量高于肝硬化、肝癌患者,HBV血清标志物及HBV DNA联合检测对乙型肝炎患者的临床诊断及治疗具有重要意义。

关键词：乙型肝炎临床分型乙型肝炎病毒血清标志物 HBV DNA

广西农村乙型病毒性肝炎病毒血清流行病学调查

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现代预防医学 2013年第17期40卷 3280-3283页

作者：陈钦艳杨进业方钟燎杨益超蒙晓宇杨庆利黎军林康明广西壮族自治区疾病预防控制中心

目的了解广西农村人群乙型病毒性肝炎病毒(HBV)血清学流行现状,为乙肝防治工作提供科学依据。方法以分层抽样方法对广西东部、西部、南部、北部、中部5个人口约1000的自然村人群进行调查,抽取空腹静脉血,用酶联免疫吸附试验(ELISA法)检... 详细信息

目的了解广西农村人群乙型病毒性肝炎病毒(HBV)血清学流行现状,为乙肝防治工作提供科学依据。方法以分层抽样方法对广西东部、西部、南部、北部、中部5个人口约1000的自然村人群进行调查,抽取空腹静脉血,用酶联免疫吸附试验(ELISA法)检测HBV血清标志物。结果人群HBsAg阳性率、乙肝病毒表面抗体(抗-HBs)阳性率、乙肝病毒核心抗体(抗-HBc)阳性率分别为8.80%、58.70%、59.93%。男性HBsAg阳性率高于女性(P﹤0.001)。不同年龄组、不同地区HBsAg、抗-HBs及抗-HBc阳性率差异均有统计学意义(P均﹤0.001),不同民族HB-sAg、抗-HBc阳性率差异也均有统计学意义(P均﹤0.001)。1～4岁及5～14岁儿童的抗-HBs阳性率分别为55.48%,46.05%。1～14岁儿童HBsAg阳性率低于15～89岁人群(P﹤0.001)。30岁前HBsAg阳性率呈上升趋势,30～35岁达最高峰,35岁后HBsAg阳性率呈下降趋势。结论广西农村仍然是乙型肝炎高度流行区,加强儿童乙肝疫苗接种仍是乙肝防控的重点。

关键词：乙型病毒性肝炎(HBV) 乙肝表面抗原血清流行病学血清学标志物

IFNG基因DNA甲基化与乙型肝炎疫苗免疫应答水平的关联

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中华预防医学杂志 2022年第7期56卷 926-931页

作者：李嘉铃苏永健董柏青吴琪俊杨庆利陈钦艳陈世艺谭超居昱李海广西中医药大学公共卫生与管理学院流行病学教研室南宁530200 广西中医药大学广西高发传染病中西医结合转化医学重点实验室南宁530200 广西壮族自治区疾病预防控制中心广西病毒性肝炎防治研究重点实验室南宁530028 桂林医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室桂林541000 广西壮族自治区疾病预防控制中心急性传染病防制所南宁530028

目的分析广西汉族儿童IFNG基因DNA甲基化与乙型肝炎(乙肝)疫苗(HepB)免疫应答水平的关联性。方法采用非匹配病例对照方法,招募广西3家医院就诊的263名已完成HepB免疫程序的8~9月龄汉族儿童作为研究对象,将乙肝表面抗体浓度(抗-HBs)<100 ... 详细信息

目的分析广西汉族儿童IFNG基因DNA甲基化与乙型肝炎(乙肝)疫苗(HepB)免疫应答水平的关联性。方法采用非匹配病例对照方法,招募广西3家医院就诊的263名已完成HepB免疫程序的8~9月龄汉族儿童作为研究对象,将乙肝表面抗体浓度(抗-HBs)<100 mIU/ml设为病例组,≥100 mIU/ml设为对照组。采用多重PCR技术、重亚硫酸盐测序、使用Illumina平台对IFNG基因目标区域及其CpG位点进行DNA甲基化高通量测序。采用非条件logistic回归模型分析IFNG基因18个位点胞嘧啶-磷酸-鸟苷酸 DNA甲基化情况与HepB免疫应答水平的关联。结果病例组(104名)和对照组(159名)抗-HBs[M(Q1,Q3)]分别为62.34(30.06,98.88)mIU/ml和1 089.10(710.35,1 233.45)mIU/ml。病例组IFNG_(1)基因44和93位点甲基化水平差异高于对照组(P<0.05),非条件logistic回归模型显示,IFNG_(1)基因44位点(OR=1.18,95%CI:1.03~1.35)和93位点(OR=1.21,95%CI:1.07~1.38)DNA甲基化水平与HepB应答水平具有相关性。结论 IFNG_(1)基因44和93位点DNA甲基化水平改变可能是影响广西汉族儿童HepB应答水平的相关因素。

关键词：乙型肝炎疫苗 DNA甲基化表观遗传学免疫应答水平

2004—2015年广西甲型肝炎流行病学特征分析

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应用预防医学 2016年第3期22卷 232-234页

作者：谭超李海王学燕陈钦艳杨庆利广西壮族自治区疾病预防控制中心广西病毒性肝炎防制研究重点实验室

目的了解广西甲型肝炎(简称甲肝)的流行病学特征。方法采用描述性流行病学方法对广西2004—2015年甲肝疫情监测资料进行分析。结果广西2004—2015年甲肝发病率呈下降趋势,由2004年的4.56/10万,下降至2015年的1.53/10万,平均发病率2.90/1... 详细信息

目的了解广西甲型肝炎(简称甲肝)的流行病学特征。方法采用描述性流行病学方法对广西2004—2015年甲肝疫情监测资料进行分析。结果广西2004—2015年甲肝发病率呈下降趋势,由2004年的4.56/10万,下降至2015年的1.53/10万,平均发病率2.90/10万。发病率排前5位的城市为贺州市、河池市、防城港市、桂林市、百色市。全年均有发病,5月、6月是发病高峰。15~50岁人群病例较多,男女性别比2.23∶1,病例职业构成主要为农民、学生等。结论广西2004—2015年甲肝发病率呈下降趋势,但仍需重视甲肝疫情,采取以切断传播途径为主的综合防控措施,有效遏制甲肝流行。

关键词：甲型肝炎发病趋势流行病学特征

2004—2015年广西丙型病毒性肝炎流行病学特征分析

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应用预防医学 2016年第4期22卷 321-323页

作者：谭超王学燕陈钦艳杨庆利李海广西壮族自治区疾病预防控制中心

目的探讨广西丙型病毒性肝炎的发病趋势及流行病学特征。方法采用描述性流行病学方法对广西2004—2015年丙肝疫情监测资料进行分析。结果广西2004—2015年丙肝平均发病率为15.27/10万,2004—2011年丙肝发病率持续上升,2011年为发病高峰... 详细信息

目的探讨广西丙型病毒性肝炎的发病趋势及流行病学特征。方法采用描述性流行病学方法对广西2004—2015年丙肝疫情监测资料进行分析。结果广西2004—2015年丙肝平均发病率为15.27/10万,2004—2011年丙肝发病率持续上升,2011年为发病高峰,发病率为21.84/10万,2011—2015年发病率呈下降趋势。发病率居前五位的地区为防城港市、柳州市、梧州市、桂林市、贵港市。全年均有发病,无明显季节性分布。30~、35~及85岁以上年龄组发病率较高,男女性别比1.91∶1,病例职业构成主要为农民、家政、家务及待业等。结论广西属丙肝高流行地区,应继续采取加强重点人群的防控,加强输血和血液制品管理,规范医疗操作,加大丙肝防治宣传力度等综合防控措施,进一步控制疫情。

关键词：丙型肝炎发病趋势流行病学特征

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华枝睾吸虫感染家庭聚集性分布的调查

应用预防医学 1995年第5期 288-289页

作者：李树林何刚韦美璧陈钦艳朱群友广西寄生虫病防治研究所

华枝睾吸虫感染家庭聚集性分布的调查李树林，何刚，韦美璧，陈钦艳，朱群友１９９４年２～４月份，我们在武鸣县城厢镇大皇后村及武宣县桐岭乡大祥村进行华枝睾吸虫病普查，采用二项分布概率模型将其资料作了家庭聚集性分析，并按不同... 详细信息

华枝睾吸虫感染家庭聚集性分布的调查李树林，何刚，韦美璧，陈钦艳，朱群友１９９４年２～４月份，我们在武鸣县城厢镇大皇后村及武宣县桐岭乡大祥村进行华枝睾吸虫病普查，采用二项分布概率模型将其资料作了家庭聚集性分析，并按不同类型的家庭华枝睾吸虫感染情况作分类...

关键词：华枝睾吸虫吸虫感染肝吸虫蠕虫病聚集性武鸣县城厢镇华支睾吸虫病华枝睾吸虫病