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大豆抗孢囊线虫3号生理小种相关基因PCR检测方法的建立与应用

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福建农林大学学报（自然科学版） 2004年第3期33卷 359-362页

作者：陈观水周以飞潘大仁福建农林大学作物科学学院福建福州350002

根据甜菜的抗线虫病基因保守序列,设计合成了4对引物,从中筛选出1对引物,对8份经抗孢囊线虫3号生理小种常规鉴定的大豆品种(6份抗病、2份感病)进行了PCR检测.结果表明,6份抗病品种出现了1条600bp的特异片段,而2份感病品种未出现任何条带... 详细信息

根据甜菜的抗线虫病基因保守序列,设计合成了4对引物,从中筛选出1对引物,对8份经抗孢囊线虫3号生理小种常规鉴定的大豆品种(6份抗病、2份感病)进行了PCR检测.结果表明,6份抗病品种出现了1条600bp的特异片段,而2份感病品种未出现任何条带.这与常规鉴定结果相一致.PCR Sothern杂交验证了所获得特异片段与抗线虫病基因的同源性,证明使用该方法检测大豆抗孢囊线虫病基因简单、快速、方便、可行.

关键词：大豆孢囊线虫病 PCR检测基因品种

干旱胁迫对巨菌草幼苗水分状况和渗透调节物质的影响

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江苏农业科学 2015年第5期43卷 344-347页

作者：艾育芳陈观水钟陈菲柯玉琴国家菌草工程技术研究中心福建福州350116 福建农林大学生命科学学院福建福州350116

为明确巨菌草幼苗对干旱胁迫的适应性,在盆栽控水条件下,对巨菌草幼苗的水分状况和渗透调节进行了干旱胁迫响应研究。结果表明,干旱胁迫后土壤含水量呈下降趋势,且各期间（胁迫4~5 d除外）差异显著（P〈0.05）。干旱胁迫过程中巨菌草幼... 详细信息

为明确巨菌草幼苗对干旱胁迫的适应性,在盆栽控水条件下,对巨菌草幼苗的水分状况和渗透调节进行了干旱胁迫响应研究。结果表明,干旱胁迫后土壤含水量呈下降趋势,且各期间（胁迫4~5 d除外）差异显著（P〈0.05）。干旱胁迫过程中巨菌草幼苗的含水量、相对含水量和水势均呈下降的趋势,可溶性蛋白含量呈现先升高后降低趋势,而游离氨基酸和脯氨酸含量则表现显著上升趋势。这些指标反映出巨菌草幼苗对干旱环境的适应性变化,是其抵御逆境的一种积极调节机制。

关键词：巨菌草幼苗干旱胁迫水分状况渗透调节物质

畲药十二时辰基源植物重瓣铁线莲的全长转录组分析

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福建农业学报 2024年

作者：何舒澜柯兰兰陈观水福建卫生职业技术学院福建医科大学基础医学院福建农林大学生命科学学院

【目的】重瓣铁线莲是畲药十二时辰基源植物，以根入药，含有丰富的活性成分，本研究旨在了解重瓣铁线莲基因注释信息，次级代谢产物代谢通路及基因功能，丰富其转录组信息，为进一步筛选和鉴定其药用成分代谢通路相关基因奠定基础。【... 详细信息

【目的】重瓣铁线莲是畲药十二时辰基源植物，以根入药，含有丰富的活性成分，本研究旨在了解重瓣铁线莲基因注释信息，次级代谢产物代谢通路及基因功能，丰富其转录组信息，为进一步筛选和鉴定其药用成分代谢通路相关基因奠定基础。【方法】利用-SMRT测序技术，对重瓣铁线莲根进行全长转录组测序，并借助生物信息学工具进行功能注释、结构分析以及萜类合成途径基因的挖掘。【结果】测序共获得高质量测序subreads数据量为62.21 Gb，通过数据处理分析，获到20 540条高质量去冗余转录本。利用NR, GO, NT, Pfam, COG/KOG, SwissProt,KEGG等7个数据库对高质量去冗余序列进行基因功能注释，共有19 909条转录本至少在1个数据库得到注释，有8 888条转录本在NR、NT、COG/KOG、KEGG、GO等5个公共数据库中均有注释。GO注释结果显示，14 911条转录本共富集在包含生物学过程、细胞组成和分子功能三大类的53个条目中。KEGG分析显示，19 701条转录本序列被富集到6条主通路和44条子通路。COG/KOG注释发现，13 204条转录本被注释，其中注释最多的功能类别为一般功能预测。对转录本结构分析发现，共预测到978个转录因子、224条LncRNA、7 167个SSR。对萜类化合物生物合成途径进行挖掘，共鉴定到48个转录本（16个关键酶候选基因）参与萜类骨架生物合成。【结论】本研究成功对畲药十二时辰基源植物重瓣铁线莲的根进行了全长转录组测序，获得了该物种的全长转录组相关基因功能信息，填补了重瓣铁线莲的基因信息缺乏的问题，为深入研究重瓣铁线莲的调控网络、生物学特征、相关代谢途径、信号通路及分子机制等提供参考。

关键词：重瓣铁线莲全长转录组转录因子长非编码RNA

20种中药基原植物鲨烯合酶基因的生物信息学分析

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中草药 2021年第3期52卷 838-844页

作者：王琴波王雨晴杨谨陈观水福建农林大学生命科学学院福建福州350002

目的鲨烯合酶(squalene synthase,SQS)是三萜化合物合成途径中的关键限速酶,对其蛋白特性进行分析与预测。方法利用生物信息学相关分析工具对20种《中国药典》2015年版收录中药基原植物SQS的理化性质、结构特征及功能特点进行分析。结... 详细信息

目的鲨烯合酶(squalene synthase,SQS)是三萜化合物合成途径中的关键限速酶,对其蛋白特性进行分析与预测。方法利用生物信息学相关分析工具对20种《中国药典》2015年版收录中药基原植物SQS的理化性质、结构特征及功能特点进行分析。结果20种中药基原植物有关各条SQS氨基酸序列,其在氨基酸长度、氨基酸组成、相对分子质量及平均亲水系数方面基本一致;所有的SQS均未发现信号肽;二级结构具有明显的一致性,并且α-螺旋和无规则卷曲是主要的结构元件;所有SQS蛋白均含有4个高度保守的结构域和在氨基酸的C端有1~2个跨膜结构;系统进化树结果与植物系统分类学结果基本一致。结论这20种中药基原植物的SQS的特性差别不大,进化距离也比较近,显示SQS具有较高的保守性和稳定性。分析结果为SQS的功能和作用机制研究提供依据。

关键词：基原植物三萜类鲨烯合酶生物信息学结构域

甘薯NBS类抗病基因类似物的分离与序列分析

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热带亚热带植物学报 2006年第5期14卷 359-365页

作者：陈观水周以飞林生潘大仁福建农林大学生命科学学院福州350002 福建农林大学作物科学学院福州350002

利用已克隆植物抗病基因NBS(Nucleotidebindingsite)序列中的保守模体(motif)“P-loop”和“GLPL”合成简并引物,以甘薯(Ipomoeabatatas)栽培品种青农2号基因组DNA为模板进行PCR扩增,通过T/A克隆、测序和序列分析,共得到15条具有连续OR... 详细信息

利用已克隆植物抗病基因NBS(Nucleotidebindingsite)序列中的保守模体(motif)“P-loop”和“GLPL”合成简并引物,以甘薯(Ipomoeabatatas)栽培品种青农2号基因组DNA为模板进行PCR扩增,通过T/A克隆、测序和序列分析,共得到15条具有连续ORF的抗病基因类似物(Resistancegeneanalogues,RGAs)序列,它们之间核苷酸序列间的相似性系数在41.2%-99.4%之间,而相应推测的氨基酸序列间的相似性系数在20.6%-100%之间,同时对分离的RGAs的核苷酸和氨基酸序列进行系统发育树分析,表明甘薯RGAs可分为TIR(DrosophilaTollorhumaninterleukinreceptor-like)和nonTIR两类。对甘薯RGAs和5个已克隆植物NBS的氨基酸序列进行结构分析表明,它们包括“P-loop”、“Kinase-2”、“Kinase-3a”“、GLPL”4个抗病基因所共有的保守模体。这些表明甘薯与其它物种的NBS类RGAs可能具有同样的起源和进化机制。

关键词：甘薯 NBS 抗病基因类似物基因分离序列分析

黄花倒水莲毛状根诱导及其愈伤组织总皂苷的测定

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中药材 2020年第9期43卷 2099-2102页

作者：翁颖妮朱婧王琴波陈观水福建农林大学生命科学学院福建福州350002 浙江省瑞安市瑞祥高级中学浙江瑞安325200

目的:建立黄花倒水莲毛状根及其愈伤组织的诱导体系,测定毛状根愈伤组织总皂苷含量。方法:利用发根农杆菌ATCC11325、LBA9402、R1000、A4、R1601感染黄花倒水莲叶片和茎段产生毛状根,考察不同菌株对黄花倒水莲叶片和茎段诱导毛状根能力... 详细信息

目的:建立黄花倒水莲毛状根及其愈伤组织的诱导体系,测定毛状根愈伤组织总皂苷含量。方法:利用发根农杆菌ATCC11325、LBA9402、R1000、A4、R1601感染黄花倒水莲叶片和茎段产生毛状根,考察不同菌株对黄花倒水莲叶片和茎段诱导毛状根能力;同时,以叶片诱导获得的毛状根为外植体诱导愈伤组织,并测定愈伤组织总皂苷的含量。结果:5种农杆菌均能诱导出毛状根,黄花倒水莲叶片诱导率高于茎段,其致根能力大小顺序依次为LBA9402>A4>ATCC11325>R1000>R1601;培养基MS+2.0 mg/L 6-BA+0.2 mg/L NAA对于毛状根愈伤组织的诱导能力最好。ATCC11325农杆菌侵染产生的毛状根获得的愈伤组织总皂苷含量高于自然根。结论:成功诱导黄花倒水莲毛状根及其愈伤组织,为进一步建立黄花倒水莲毛状根培养体系及再生体系奠定了基础。

关键词：黄花倒水莲发根农杆菌毛状根愈伤组织皂苷

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《指向固定直线上的某点》教学设计

贵州教育 2008年第23期 33-35页

作者：陈观水贵州省实验中学

　　教材分析:authorware 是一个多媒体集成软件.其最大特点是可以集成各种形式的信息,还可以实现人机的交互.本节课是学习authorware中移动图标的最后一种运动类型--指向同定直线上的某点.这节课和上节课的内容有几分相似,但也使学生... 详细信息

　　教材分析:authorware 是一个多媒体集成软件.其最大特点是可以集成各种形式的信息,还可以实现人机的交互.本节课是学习authorware中移动图标的最后一种运动类型--指向同定直线上的某点.这节课和上节课的内容有几分相似,但也使学生们对两课的内容极其容易混淆,不容易理解两者的差别.……

关键词：移动图标值传递运动类型教学设计

基于无人机环境下的高中信息技术项目化学习教学实践——以“算法与程序设计”为例

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高考 2023年第33期 138-140页

作者：陈观水贵州省实验中学贵州贵阳550002

在高中信息技术教学中,《算法与程序设计》主要涉及python语言的学习。Python具有较强的可读性、简洁性以及可拓展性,是比较适合高中生学习的一种编程语言。但是由于大部分学生是第一次接触编程,缺乏编程基础和思想,因此传统的教学方法... 详细信息

在高中信息技术教学中,《算法与程序设计》主要涉及python语言的学习。Python具有较强的可读性、简洁性以及可拓展性,是比较适合高中生学习的一种编程语言。但是由于大部分学生是第一次接触编程,缺乏编程基础和思想,因此传统的教学方法很难达到预想的效果,也比较难以培养学生核心素养。所以,笔者对教材进行了重构,加入了实物无人机,增强课堂的趣味性和可操作性。并且通过项目化学习的方式,让学生在完成项目的过程中,学习知识,促进学生解决问题能力的提升。这样能够较好地提升教学的有效性,并达成核心素养培养目标。文中介绍了如何基于无人机来重构教学,希望能够带给大家一点启迪。

关键词：项目化学习信息技术无人机

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优化实践操作环节,提高信息技术教学有效性

贵州教育 2012年第13期 42-42,45页

作者：陈观水贵州省实验中学

实践操作是信息技术教学中的基本环节,由于信息技术课实践性的特点决定了实践操作在信息技术教学中的重要性。但在当前的信息技术课堂实践操作环节中经常出现这样的现象：

关键词：信息技术教学操作优化信息技术课