检索结果-南通市图书馆

基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术对非结核分枝杆菌的鉴定与分型

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中华检验医学杂志 2018年第2期41卷 109-115页

作者：李松姚妍娇屈平华陈茶张伟铮李启伟许振杰陈富广东省中医院广州中医药大学第二附属医院检验科广州510006 广州市天河区冼村街社区卫生服务中心

目的以CLSI－MM18A（病原菌DNA测序鉴定的解释指南）推荐的RPOB（利福平耐药）基因为参考标准，评价基质辅助激光解析电离飞行时间质谱（MALDI－TOF MS）技术对非结核分枝杆菌的鉴定和分型的水平的能力。方法收集2012年至2016年从临床... 详细信息

目的以CLSI－MM18A（病原菌DNA测序鉴定的解释指南）推荐的RPOB（利福平耐药）基因为参考标准，评价基质辅助激光解析电离飞行时间质谱（MALDI－TOF MS）技术对非结核分枝杆菌的鉴定和分型的水平的能力。方法收集2012年至2016年从临床分离的不同感染部位的55株NTM菌株，利用RPOB进行管家基因测序，并对测序结果进行系统发育进化分析；同时利用MALDI－TOF MS技术对菌株进行鉴定，并对蛋白指纹图谱进行聚类分析；评价两种方法对NTM鉴定和分型的一致性。结果RPOB基因对55株NTM显示了很好的鉴定（测序结果TM值均大于99%）和分型（可区分到复合群内的种或亚种）能力；法国BioMerieux MALDI－TOF MS技术对55株NTM的鉴定到属的水平为89.1%，鉴定到种的水平为78.2%，鉴定水平良好；利用SARAMS Premium软件对蛋白指纹图谱的聚类分析也显示出了良好的分型能力。结论MALDI－TOF MS技术可以有效的对非结核分枝杆菌进行鉴定和分型，其检测周期短，操作简便，在实验室中与RPOB基因联合应用有着很好的互补性。

关键词：非结核分枝杆菌光谱法质量基质辅助激光解吸电离利福平抗药性细菌聚类分析

广州地区泌尿系统感染产超广谱β-内酰胺酶肺炎克雷伯菌的耐药特征和基因分型

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现代医药卫生 2009年第13期25卷 1923-1924页

作者：张凯陈茶曾建明广州医学院护理学院广东广州510450 广东省中医院检验科广东广州510120

目的:了解本地区泌尿系统感染产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)肺炎克雷伯菌耐药特征及其基因型分布。方法:收集广州地区13家医院2001年7月～2003年8月间临床分离的尿培养阳性肺炎克雷伯菌130株,采用NCCLs规定的ESBLs初筛和确证试验方法检测E... 详细信息

目的:了解本地区泌尿系统感染产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)肺炎克雷伯菌耐药特征及其基因型分布。方法:收集广州地区13家医院2001年7月～2003年8月间临床分离的尿培养阳性肺炎克雷伯菌130株,采用NCCLs规定的ESBLs初筛和确证试验方法检测ESBLs,用K-B琼脂扩散法进行药物敏感试验,并应用聚合酶链反应(PCR)方法对所分离的产ESBLs菌株进行SHV、CTX-M基因型检测。结果:产ESBLs肺炎克雷伯菌检出率为41.5%(54株),其中66.7%(36株)携带CTX-M基因,53.7%(29株)携带SHV型基因,并有20.4%(11株)同时携带CTX-M基因和SHV型基因。产酶株的耐药率明显高于非产酶株,产ESBLs细菌对青霉素类、环丙沙星及头孢菌素类耐药率较高(高达75.9～99.7%),加酶抑制剂克拉维酸或他唑巴坦后耐药率有明显下降。结论:广州地区泌尿系统感染的产ESBLs肺炎克雷伯菌具有多重耐药的特点,其中CTX-M型是流行的基因型。

关键词：肺炎克雷伯菌超广谱β-内酰胺酶表型耐药基因分型

胎儿弯曲菌龟亚种中国分离株的种群结构、毒力基因及耐药性分析

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中华微生物学和免疫学杂志 2023年第8期43卷 582-588页

作者：陈富陈燕陈晓慰李启伟许振杰陈茶李顺光屈平华李松广州市番禺区健康管理中心广州511490 广州中医药大学第二临床医学院广州510006 广州中医药大学第二临床医学院/广东省中医院检验医学部广州510006

目的:了解胎儿弯曲菌龟亚种( Campylobacter fetus subsp. testudinum, Cft)的分子流行病学特征。方法:对本实验室2010—2022年收集的15株胎儿弯曲菌龟亚种进行全基因组测序,结合GenBank公布的全球 Cft基因组数据进行流行病学分析;MLST... 详细信息

目的:了解胎儿弯曲菌龟亚种( Campylobacter fetus subsp. testudinum, Cft)的分子流行病学特征。方法:对本实验室2010—2022年收集的15株胎儿弯曲菌龟亚种进行全基因组测序,结合GenBank公布的全球 Cft基因组数据进行流行病学分析;MLST-GrapeTree分析 Cft的群体遗传结构;核心基因组单核苷酸多态性位点(cgSNP)构建 Cft的系统发育树,rhierBAPS确定其种群结构;CARD、ResFinder及VFDB注释 Cft的耐药及毒力基因;E-test法进行药敏试验,并参考CLSI-M45空肠/大肠弯曲菌药敏标准进行结果解释。结果:基于基因组平均核苷酸一致性(ANI)分析,共纳入全球41株 Cft基因组信息,其中人类来源24株,动物来源13株,未知来源4株。流行病学资料显示,24株人类来源菌株中,20株感染对象为黄种人,1例为白种人(配偶是亚裔),其余未知,差异分布具有统计学意义。13株动物来源菌株均分离自爬行动物,包括龟类6株、蛇类4株、蜥蜴类3株。MLST分型显示,中国分离株以ST46为主要序列型,美国则以ST15为主要序列型;Grapetree显示,中国分离株的遗传多态性高于美国分离株;通过cgSNP及BAPS重建的系统发育发现全球 Cft构成6个种群,中国分离株呈散在分布且与动物源菌株亲缘关系密切;美国分离株相对较集中(SC3),且以ST15克隆传播为主;毒力基因分析显示,与鞭毛、糖基化系统及黏附素相关的毒力基因在 Cft中携带率为100.00%,而与侵袭性相关的Ⅳ型分泌系统 virB4、 virB9、 virD4因子及 tetO外排泵基因均存在于新发现的ST74中;15株中国分离株的体外药物敏感性试验结果表明, Cft对环丙沙星耐药率为46.67%,对红霉素敏感性为100.00%。结论:全球 Cft的群体结构呈现出较高的遗传多态性且感染人群多伴有基础免疫性疾病,其感染可能与食入或接触爬行类动物有关;本次研究发现的中国临床分离株主要流行型为ST46及新发现ST74型别,应引起我们的关注。

关键词：基因组测序分型分子流行病学毒力基因

新型血细胞分析仪ADVIA 120成人静脉血参考范围调查

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国际医药卫生导报 2007年第12期13卷 127-130页

作者：陈林张莉滟陈茶广东省中医院二沙岛分院检验科广东广州510105 广东省人民医院检验科广东广州510080

目的调查广州地区成人静脉血新型血细胞分析仪ADVIA 120的参考范围。方法收集ADVIA 120血细胞分析仪在1年内检测健康成人静脉血的结果数据。结果少部分结果与常用的参考范围差异显著：明显偏高的是男LYMPH%参考上限47.9%、女LYMPH%... 详细信息

目的调查广州地区成人静脉血新型血细胞分析仪ADVIA 120的参考范围。方法收集ADVIA 120血细胞分析仪在1年内检测健康成人静脉血的结果数据。结果少部分结果与常用的参考范围差异显著：明显偏高的是男LYMPH%参考上限47.9%、女LYMPH%参考上限48.0%、男PLT（149～353）×10^9/L、男PDW（36.9～64.7）%、女PLT（155～369）×10^9/L和女PDW（31.2～64.9）%;明显偏低的是男NEUT%参考下限40.5%和女NEUT%参考下限41.3%;略偏高的是男性的WBC（4.36～10.53）×10^9/L、RBC（4.30～5.71）×10^12/L和Hb（133～171）g/L。结论不同地区的环境条件和检测手段会对参考范围产生较大影响,故应建立不同地区和不同性别的血细胞参考范围。

关键词： ADVIA 120血细胞分析仪血细胞参考范围

STAT5诱骗寡核苷酸下调K562细胞周期相关基因的研究

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国际检验医学杂志 2007年第6期28卷 486-488,491页

作者：曾建明陈茶张秀明彭智马季广东省中医院检验科广州510120 广州中医药大学附属第一医院检验科广州510120

目的采用基因芯片技术筛选信号转导和转录活化因子5（STAT5）诱骗寡核苷酸作用下K562细胞差异表达的周期相关分子，探讨其对K562细胞周期的影响。方法合成STAT5诱骗寡核苷酸，在脂质体介导下转染K562细胞，采用人14K基因表达谱cDNA芯片... 详细信息

目的采用基因芯片技术筛选信号转导和转录活化因子5（STAT5）诱骗寡核苷酸作用下K562细胞差异表达的周期相关分子，探讨其对K562细胞周期的影响。方法合成STAT5诱骗寡核苷酸，在脂质体介导下转染K562细胞，采用人14K基因表达谱cDNA芯片检测差异表达基因，逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）验证芯片筛选到的部分基因的表达情况。结果两张cDNA芯片检测重复性良好（r-0．9799）。在13824个标记的基因中检出多个下调基因，其中包括cyclin D1、cyc-linD2、S100钙结合蛋白P和E2F-5等在内的周期相关基因；RT-PCR实验证实STAT5诱骗寡核苷酸引起cyclinD2和E2F-5mRNA表达下调。进一步分析发现，这些基因的启动子区域均含有STAT5结合的一致性序列。结论STAT5诱骗寡核苷酸抑制K562细胞G-／s转换而影响细胞周期进程的作用机制，可能与cyclin D2和E2F-5等基因的表达下调相关。

关键词： K562细胞寡核苷酸类信号传导细胞周期基因

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基于SL811的USB主机系统的设计

微计算机应用 2008年第7期29卷 75-79页

作者：陈茶红补家武唐叔进中国地质大学机械与电子工程学院武汉430074

系统采用USB主/从控制器SL811作为USB主机、遵守适用于USB大容量存储设备的USB Bulk_Only传输协议和UFI命令集,支持FAT16和FAT32文件系统,实现了在系统中用普通U盘进行数据的存储,使系统可以方便的运用在需要与计算机进行交互的数据采... 详细信息

系统采用USB主/从控制器SL811作为USB主机、遵守适用于USB大容量存储设备的USB Bulk_Only传输协议和UFI命令集,支持FAT16和FAT32文件系统,实现了在系统中用普通U盘进行数据的存储,使系统可以方便的运用在需要与计算机进行交互的数据采集系统中。本文详细论述了USB主机系统部分硬件和软件的设计。

关键词： SL811 USB主机 USB设备海量存储

广州低保老年患者非发酵菌感染的分布与耐药趋势

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实用老年医学 2009年第2期23卷 104-107页

作者：罗强易四维陈茶徐宁杨嶽鑫广东省中医院芳村分院检验科广东省广州市510370 广东省中医院大学城分院检验科广东省广州市510006

目的分析低保老年患者非发酵菌的感染分布特点、耐药率及其变化,为临床合理选择和更换抗生素提供依据。方法以本院2004年7月至2007年7月间≥60岁老年患者标本分离的非发酵菌作为分析对象,分析非发酵菌的检出阳性率、耐药率及其多重耐药... 详细信息

目的分析低保老年患者非发酵菌的感染分布特点、耐药率及其变化,为临床合理选择和更换抗生素提供依据。方法以本院2004年7月至2007年7月间≥60岁老年患者标本分离的非发酵菌作为分析对象,分析非发酵菌的检出阳性率、耐药率及其多重耐药率等。结果3年内共检出非发酵菌496株,其中≥60岁患者(老年组)占71%,老年组阳性率7.6%远高于非老年患者(对照组)的3.4%,检出菌中以铜绿假单胞菌(55.0%)、鲍曼不动杆菌(33.8%)、嗜麦芽窄食单胞菌(9.7%)3种为主;耐药分析显示,除对于碳青霉烯类、部分氨基糖苷类和部分复合酶抑制剂的β内酰胺类抗生素保持相对较高的敏感率外,对其他抗生素的耐药率都很高;耐药趋势大体呈阶梯状逐渐上升;多重耐药的比率铜绿假单胞菌达29.5%,鲍曼不动杆菌达48.7%,其中老年组泛耐药的铜绿假单胞菌的比率达到2.4%。结论低保老年患者非发酵菌感染阳性率高,耐药率高,耐药率增高变化快,多重耐药和泛耐药的比例增加明显。

关键词：非发酵菌低保人群老年人耐药分析

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类鼻疽伯克霍尔德菌误鉴定1例

临床检验杂志 2018年第4期36卷 319-320页

作者：郑敏玲王丽娜陈茶屈平华广州中医药大学广州510006 广州中医药大学第二附属医院/广东省中医院检验医学部广州510006

伯克霍尔德菌（Burkholderia）是一种革兰阴性非发酵菌,其中与人类疾病相关的病原菌主要包括洋葱伯克霍尔德菌复合群（*** complex）、类鼻疽伯克霍尔德菌复合群（*** complex）等。而类鼻疽伯克霍尔德菌复合群可进一步分为类鼻疽伯克... 详细信息

伯克霍尔德菌（Burkholderia）是一种革兰阴性非发酵菌,其中与人类疾病相关的病原菌主要包括洋葱伯克霍尔德菌复合群（*** complex）、类鼻疽伯克霍尔德菌复合群（*** complex）等。而类鼻疽伯克霍尔德菌复合群可进一步分为类鼻疽伯克霍尔德菌、鼻疽伯克霍尔德菌（***）、泰国伯克霍尔德菌（***）、俄克拉何马伯克霍尔德菌（***）和汉普蒂社伯克霍尔德菌（***）5个种.

关键词：类鼻疽伯克霍尔德菌尿路感染

OrthoANI联合MALDI-TOF MS在胎儿弯曲菌鉴定与分型中的应用

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中华检验医学杂志 2018年第8期41卷 583-588页

作者：李松屈平华姚妍娇陈茶李启伟邓光远许振杰陈富广东省中医院广州中医药大学第二附属医院检验科 510006 广州市天河区冼村街社区卫生服务中心

目的建立新型弯曲菌—＂胎儿弯曲菌龟亚种（*** ***）＂质谱超级图谱库,为临床提供新的检测平台.方法对收集的建库菌株采用Illumina二代测序平台2000/miSeq进行高通量全基因组测序,JAVA 8运行环境,进行直系同源基因的全基因组平均核... 详细信息

目的建立新型弯曲菌—＂胎儿弯曲菌龟亚种（*** ***）＂质谱超级图谱库,为临床提供新的检测平台.方法对收集的建库菌株采用Illumina二代测序平台2000/miSeq进行高通量全基因组测序,JAVA 8运行环境,进行直系同源基因的全基因组平均核苷酸一致性（average nucleotide identity,OrthoANI）分析;对收集的实验菌株、标准菌株及对照菌株进行质谱分析,建立＂*** ***＂的超级图谱并验证.结果 OrthoANI分析得出：建库菌株与模式菌株*** ***03-427的OrthoANI值为：99.30%~99.96%,而其与*** ***10354、*** ***82-40的OrthoANI值在91.05%~92.26%.参考OrthoANI≥95%作为同一菌种的判定依据,故将建库菌株最终鉴定为＂胎儿弯曲菌龟亚种＂.新建的超级图谱库鉴定准确率100%（与基因测序一致）,可信度区间为：82.3%~99.9%,同一菌株鉴定重复性100%.结论基于高通量测序及全基因组学分析的微生物分类新＂金标准＂为实验室质谱自建库提供了理想的参考价值,而建立准确、客观的＂*** ***＂质谱超级参考图谱,为临床快速诊断胎儿弯曲菌感染提供了新的平台.

关键词：胎儿弯曲杆菌菌血症基因组学高通量核苷酸序列分析光谱法质量基质辅助激光解吸电离细菌分型技术