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膜蛋白原核表达的基因序列优化

生物技术通报 2015年第12期31卷 50-55页

作者：王世山陈艳可杨俊中国科学院武汉物理与数学研究所武汉磁共振中心波谱与原子分子物理国家重点实验室武汉430071

膜蛋白的结构与功能研究是当前的热点之一。目前获取膜蛋白的最主要途径是通过原核系统进行表达。但是膜蛋白在原核系统中表达水平相对较低,通过对基因序列进行优化促使膜蛋白正确高效表达是一项非常重要的技术手段。归纳了近些年来膜... 详细信息

膜蛋白的结构与功能研究是当前的热点之一。目前获取膜蛋白的最主要途径是通过原核系统进行表达。但是膜蛋白在原核系统中表达水平相对较低,通过对基因序列进行优化促使膜蛋白正确高效表达是一项非常重要的技术手段。归纳了近些年来膜蛋白原核表达技术在基因序列优化研究上的最新进展,并从稀有密码子的优化、m RNA的稳定性与翻译起始、m RNA与核糖体行为、翻译的效率与膜蛋白的折叠4个方面对基因序列上影响膜蛋白表达的因素进行了总结,旨在为膜蛋白的原核表达提供一定的思路和参考。

关键词：膜蛋白超量表达基因序列优化密码子优化 mRNA稳定性翻译速率膜蛋白折叠

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去垢剂在膜蛋白研究中的应用

生物技术通报 2010年第2期26卷 205-212页

作者：谢浩陈艳可孙恩杰王宏炜武汉理工大学生物科学与技术系武汉430070 武汉理工大学资源与环境工程学院武汉430070

去垢剂是同时具有亲水极性基团和疏水非极性基团的双极性分子,能够使脂膜解体释放膜蛋白,并在溶液中为去膜状态下的膜蛋白提供疏水环境,维持和保护膜蛋白的疏水跨膜结构,在膜蛋白的结构和功能研究中有重要的意义。去垢剂的双极性和理化... 详细信息

去垢剂是同时具有亲水极性基团和疏水非极性基团的双极性分子,能够使脂膜解体释放膜蛋白,并在溶液中为去膜状态下的膜蛋白提供疏水环境,维持和保护膜蛋白的疏水跨膜结构,在膜蛋白的结构和功能研究中有重要的意义。去垢剂的双极性和理化特性,如临界胶束浓度能够极大影响去垢剂和膜蛋白间的相互作用。在膜蛋白研究中,需要充分利用去垢剂的结构和特性:一方面,需要利用去垢剂代替脂质分子支持和稳定去膜状态下膜蛋白的结构和功能;另一方面,需要控制去垢剂和膜蛋白的相互作用,以满足膜蛋白结构研究如蛋白质结晶试验的要求。简要介绍了去垢剂在膜蛋白研究中的最新应用进展,涉及去垢剂在膜蛋白离体表达、分离和纯化、以及结构研究中的应用。

关键词：去垢剂膜蛋白离体表达纯化蛋白质结构

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病毒孔道蛋白的超量表达研究

病毒孔道蛋白的超量表达研究

第十八届全国波谱学学术年会

作者：陈艳可杨俊中国科学院武汉物理与数学研究所波谱与原子分子国家重点实验室武汉磁共振中心

＜正＞病毒孔道蛋白是一种小分子量的膜蛋白,一般由50-120个氨基酸残基组成,包含至少一个疏水跨膜区域[1],多以寡聚体的形式插入细胞膜中。疏水氨基酸残基朝向磷脂双分子层,亲水氨基酸残基朝向孔道内部,从而形成亲水孔道[2-5],增强细胞...

＜正＞病毒孔道蛋白是一种小分子量的膜蛋白,一般由50-120个氨基酸残基组成,包含至少一个疏水跨膜区域[1],多以寡聚体的形式插入细胞膜中。疏水氨基酸残基朝向磷脂双分子层,亲水氨基酸残基朝向孔道内部,从而形成亲水孔道[2-5],增强细胞膜的通透性。病毒孔道在病毒的复制期起着很重要的作用,当新病毒离开被感染的细胞进入新的宿主细胞时,它们会打破宿主细胞的离子平衡,允许离子进出,做好释放自己基因组的准备,因此也被称作离子通道蛋白。它们是一种全新的抗病毒治疗的药物靶点。研究病毒孔道膜蛋白的结构与功能,将有助于人们更加了解其特性与致病机理,对筛选治疗药物有非常重要的指导

关键词：

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膜蛋白HCV-P7的MAS-NMR研究

膜蛋白HCV-P7的MAS-NMR研究

第十七届全国波谱学学术会议

作者：陈艳可陶玲杨俊中国科学院武汉物理与数学研究所波谱与原子分子国家重点实验室武汉磁共振中心

＜正＞目前丙肝病毒感染了全球3%的人口,导致严重肝病如肝硬化和肝癌的发生。当今的治疗药物IFN-α和Rib只对50%的患者有效且价格昂贵而难以被患者接受。因此,寻找丙肝病毒新的药物靶点和抑制剂是当前研究的焦点。P7是一个包括63个氨基...

＜正＞目前丙肝病毒感染了全球3%的人口,导致严重肝病如肝硬化和肝癌的发生。当今的治疗药物IFN-α和Rib只对50%的患者有效且价格昂贵而难以被患者接受。因此,寻找丙肝病毒新的药物靶点和抑制剂是当前研究的焦点。P7是一个包括63个氨基酸残基的小疏水蛋白,定位在内质网膜上,形成亲水型离子通道。其在丙肝病毒释放过程起关键作用[1,2],体

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基于GPS-RTK技术的第二次农村土地调查新增地物补测探讨——以武汉市蔡甸区农村土地调查为例

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科学与管理 2008年第6期28卷 13-14页

作者：张展飞陈艳可中国地质大学资源学院湖北武汉430074 武汉理工大学资环学院湖北武汉430070

探讨采用WHCORS在进行图根控制点布设的前提下，利用GPS-RTK技术对第二次土地调查的新增地物进行补测，在高精度获取补测地物点三维坐标的情况下，高效率、高质量的将新增地物标绘在DOM底图上。

关键词：第二次土地调查 GPS-RTK技术 WHCORS

用于研究膜蛋白中柔性残基的固体核磁共振方法

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用于研究膜蛋白中柔性残基的固体核磁共振方法

第十九届全国波谱学学术会议

作者：张正逢陈艳可杨俊中国科学院生物磁共振分析重点实验室波谱与原子分子物理国家重点实验室武汉磁共振中心(中国科学院武汉物理与数学研究所)

基于偶极耦合的交叉极化(Cross polarization,CP)是生物固体核磁共振中最重要的技术,被广泛用于膜蛋白的信号归属实验和结构约束实验。在膜蛋白中,氨基酸残基通常存在着一定的运动性,以行使其相应的生物功能。当该运动的相关时间接近微...

基于偶极耦合的交叉极化(Cross polarization,CP)是生物固体核磁共振中最重要的技术,被广泛用于膜蛋白的信号归属实验和结构约束实验。在膜蛋白中,氨基酸残基通常存在着一定的运动性,以行使其相应的生物功能。当该运动的相关时间接近微秒尺度时,这些氨基酸残基的T将明显变短。根据CP动力学,T的长短决定了CP效率的高低。因此,微秒尺度的运动性会极大地降低CP的实验效率,从而使我们难以观测到与膜蛋白功能相关

关键词：

用魔角旋转固体核磁共振解析膜蛋白DAGK三维结构

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用魔角旋转固体核磁共振解析膜蛋白DAGK三维结构

第十八届全国波谱学学术年会

作者：李建平陈艳可杨俊中国科学院武汉物理与数学研究所生物磁共振分析重点实验室波谱与原子分子国家重点实验室武汉磁共振中心

＜正＞膜蛋白是生物体内一类非常重要的蛋白,它参与了生物体内各种代谢活动,大量新型药物的开发和研制与膜蛋白结构密切相关。大肠杆菌中的膜蛋白-甘油二脂激酶（DAGK）是一种很重要的生物酶,它具有121个氨基酸,功能单位是三聚体,生物...

＜正＞膜蛋白是生物体内一类非常重要的蛋白,它参与了生物体内各种代谢活动,大量新型药物的开发和研制与膜蛋白结构密切相关。大肠杆菌中的膜蛋白-甘油二脂激酶（DAGK）是一种很重要的生物酶,它具有121个氨基酸,功能单位是三聚体,生物功能是促使甘油二脂磷酸化。它的三维（3D）结构先后被液体核磁共振和X射线晶体衍射解析出来,液体核磁共振解析出来的DAGK结构是在去垢剂DPC胶束的环境中,而X射线晶体衍射解析出来的DAGK结构是在LCP（lipidic cubic phases）的环境中,由于两种手段解析DAGK的环境有

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固体核磁共振中膜蛋白双交叉极化效率与动力学参数相关的定量分析

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波谱学杂志 2017年第3期34卷 257-265页

作者：孙毅陈艳可李建平赵永祥杨俊波谱与原子分子物理国家重点实验室武汉磁共振中心(中国科学院武汉物理与数学研究所)湖北武汉430071 中国科学院大学北京100049

固体核磁共振(NMR)中双交叉极化(DCP)是用于膜蛋白信号指认的多维异核相关实验的基本技术模块.DCP的效率在很大程度上决定了多维异核相关实验的效率.本文分析了3种典型的膜环境中的膜蛋白(AQPZ、DAGK和EV71 2B)的DCP效率及其影响因素.... 详细信息

固体核磁共振(NMR)中双交叉极化(DCP)是用于膜蛋白信号指认的多维异核相关实验的基本技术模块.DCP的效率在很大程度上决定了多维异核相关实验的效率.本文分析了3种典型的膜环境中的膜蛋白(AQPZ、DAGK和EV71 2B)的DCP效率及其影响因素.结果显示,在相同的实验条件下,3种蛋白样品的DCP效率存在明显差异:其中AQPZ的DCP效率最高(31%),DAGK的效率次之(23%),EV71 2B的效率最低(14%).通过测量它们在旋转坐标下的自旋-晶格弛豫时间(T_(1ρ))和偶极耦合常数(DHN),发现膜蛋白的运动会明显缩短T_(1ρ),但对DHN的影响较小.在实验的基础上,建立了T_(1ρ)与DCP效率相关的模型,并基于DCP动力学的定量分析,证明了运动导致的T_(1ρ)缩短是降低DCP效率的主要原因.因此,可以通过定量分析未知样品的T_(1ρ)来预测其DCP的最优效率,为DCP实验的优化提供依据.

关键词：固体核磁共振(NMR) 魔角旋转(MAS) 膜蛋白双交叉极化(DCP) 旋转坐标下的自旋-晶格弛豫时间(T1ρ)

磷脂膜环境对膜蛋白以及纤维化蛋白结构的影响:魔角旋转固体核磁共振研究

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磷脂膜环境对膜蛋白以及纤维化蛋白结构的影响:魔角旋转固体核磁...

第十八届全国波谱学学术年会

作者：陈艳可牛铮张正逢赵伟静唐新启李建平杨俊中国科学院生物磁共振分析重点实验室波谱与原子分子国家重点实验室武汉磁共振中心中国科学院武汉物理与数学研究所

＜正＞磷脂膜环境对膜蛋白结构的影响是一个倍受关注的问题。在膜蛋白所处的天然膜环境下来测定膜蛋白的三维结构对常用的结构研究手段如X-射线晶体学和液体核磁共振的方法是一个巨大的挑战。目前这两种结构研究手段都只能在模拟膜的环...

＜正＞磷脂膜环境对膜蛋白结构的影响是一个倍受关注的问题。在膜蛋白所处的天然膜环境下来测定膜蛋白的三维结构对常用的结构研究手段如X-射线晶体学和液体核磁共振的方法是一个巨大的挑战。目前这两种结构研究手段都只能在模拟膜的环境下测定膜蛋白的三维结构。最常用的一种模拟膜是由去垢剂所组成的胶束。在PBD里所收录的膜蛋白的三维结构绝大部分都是在去垢剂的环境下测定的。去垢剂所形成的胶束和磷脂双分子膜在结构和性质上有一些差别,因此在去垢剂的环境下所测定得到的膜蛋白三维结构与磷脂膜里真实结构是

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