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分子动力学模拟、结合自由能计算和3D-QSAR研究大麻Ⅱ型受体和其激动剂的相互作用(英文)

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药学学报 2013年第9期48卷 1436-1449页

作者：陈炯炯韩爽曹扬陈建忠浙江大学药学院浙江杭州310058

CB2是一类主要表达于人体免疫系统的G蛋白偶联受体,已成为研发治疗免疫系统疾病药物的良好靶点。本论文基于CB2同源蛋白模型,结合分子对接和分子力学/分子动力学模拟研究CB2与其激动剂复合物在磷脂双分子层膜体系DPPC/TIP3P中的三维结... 详细信息

CB2是一类主要表达于人体免疫系统的G蛋白偶联受体,已成为研发治疗免疫系统疾病药物的良好靶点。本论文基于CB2同源蛋白模型,结合分子对接和分子力学/分子动力学模拟研究CB2与其激动剂复合物在磷脂双分子层膜体系DPPC/TIP3P中的三维结构模型,分别运用MM-PBSA和MM-GBSA方法计算结合自由能和能量分解。计算结果表明,CB2与其配体的主要结合作用力是范德华力,关键性氨基酸Phe197对于结合选择性激动剂至关重要。另外,以分子动力学模拟得到的激动剂稳定构象为模板,运用CoMFA方法建立相应的三维定量构效关系模型。结合分子模拟得到的作用模式和3D-QSAR模型提供的活性结构特征将有助于指导设计新型、高效的CB2选择性激动剂。

关键词： CB2 激动剂分子动力学模拟结合自由能 3D-QSAR

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莴苣及苋菜的杂交制种方法

中国蔬菜 2014年第11期 94-95页

作者：陈炯炯华中农业大学园艺林学学院园艺植物生物学教育部重点实验室湖北武汉430070

莴苣及苋菜属于高度自交植物,莴苣由于开花时间短,一朵花有多朵小花组成,导致莴苣真杂种获得非常困难;苋菜同样存在因一个花序小、花多等因素造成的杂交困难。本文详细介绍了莴苣和苋菜的杂交过程,为莴苣和苋菜新品种的创制提供了基础。

关键词：莴苣苋菜制种方法杂交开花时间新品种自交小花

酸奶中乳酸含量测定的毛细管区带电泳方法研究

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食品科学 2004年第4期25卷 144-147页

作者：陈炯炯何进喻子牛华中农业大学生命科学技术学院湖北武汉430070

建立了测定酸奶中乳酸含量的间接紫外检测毛细管区带电泳方法。在未涂渍的石英毛细管(内径75μm,有效长度50cm)中,以10.0mmol/L的2,6-吡啶二羧酸-0.5mmol/L十六烷基三甲基溴化铵(pH3.5)为运行电解质,检测波长214nm,在-15kV分离电压下酸... 详细信息

建立了测定酸奶中乳酸含量的间接紫外检测毛细管区带电泳方法。在未涂渍的石英毛细管(内径75μm,有效长度50cm)中,以10.0mmol/L的2,6-吡啶二羧酸-0.5mmol/L十六烷基三甲基溴化铵(pH3.5)为运行电解质,检测波长214nm,在-15kV分离电压下酸奶中乳酸6min内能得到分析。方法重现性好,迁移时间和峰面积的相对标准偏差分别在1.0%和2.0%以内。在相应的浓度范围内,峰面积与样品浓度之间呈现良好的线性关系。该法简单、快速、灵敏度高,为测定酸奶中乳酸含量提供了一种高效、快速、简便的方法。

关键词：酸奶乳酸含量测定方法间接紫外检测毛细管区带电泳方法重现性

新型大麻受体CB2选择性配体的设计、合成及构效关系研究

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新型大麻受体CB2选择性配体的设计、合成及构效关系研究

作者：陈炯炯浙江大学

学位级别：硕士

免疫性疼痛和神经性疼痛严重影响人们的生活质量,而目前真正能抑制疼痛,达到理想疗效的药物为数甚少。抗抑郁药、抗惊厥药和阿片类药物仍然是一线药物,但都存在严重的中枢神经副作用。因此,研究和开发疗效好、副作用小的疼痛抑制药物任... 详细信息

免疫性疼痛和神经性疼痛严重影响人们的生活质量,而目前真正能抑制疼痛,达到理想疗效的药物为数甚少。抗抑郁药、抗惊厥药和阿片类药物仍然是一线药物,但都存在严重的中枢神经副作用。因此,研究和开发疗效好、副作用小的疼痛抑制药物任重道远。最新药理研究发现CB2选择性配体具有治疗该类疾病的潜在价值,且不存在严重的中枢神经副作用,已有化合物进入临床研究。因此研发用于治疗免疫性疼痛和神经性疼痛的CB2选择性配体具有重要意义。本文第一部分以已完成临床Ⅱ期试验的GW842166X为先导化合物,结合我们前期利用计算机辅助药物设计方法对其进行的理论研究结果和基于生物电子等排的骨架迁跃药物设计方法,用哒嗪环代替先导化合物中的嘧啶环,并对哒嗪环上的取代基进行了研究,考察其对CB2激动活性的影响。共合成了32个未见文献报道的目标化合物,并采用了1HNMR、MS进行了结构确证。体外活性研究表明,所合成的化合物对CB2表现出了良好的选择性激动作用,其中化合物c1对CB2的激动活性其EC50为11.3μM,而文献中基于同一药理活性测试方法测得先导化合物GW842166X的ECso为7.78μM。因此化合物C1具有作为先导化合物进行进一步结构改造从而合成出活性更好的CB2选择性激动剂的潜在价值,同时所得的构效关系研究结果可用于指导结构修饰。本文第二部分从最新报道的1,4-高哌嗪类化合物出发,采用以优势结构为导向进行骨架变换的药物设计理念,用哌嗪环代替先导化合物的中间连接部分1,4-高哌嗪环,并对哌嗪环两边的取代进行了研究,综合考察取代基的变化对CB2激动活性的影响。根据上述设计思路,共合成了32个全新的目标化合物,并采用了1HNMR、MS进行结构确证。体外CB2活性研究表明,所合成的化合物对CB2表现出了良好的选择性激动作用,其中化合物F2对CB2的激动活性EC50为0.87μM,这为进一步研究CB2选择性激动剂提供了思路和帮助。本文第三部分以吡唑亚胺类衍生物为先导化合物,用苯并咪唑代替先导化合物的吡唑环,得到了一类结构新颖的CB2选择性配体。虽然这系列化合物目前只合成了6个,但从体外活性测试结果来看,化合物G2和G3具有良好的CB2拮抗活性,说明这一设计思路的合理性。同时得到的简单构效关系可用于指导后续的结构改造,以得到更具有潜力的CB2选择性拮抗剂。

关键词： CB2 选择性激动剂哒嗪类衍生物哌嗪类衍生物苯并咪唑类衍生物生理活性

同方学位论文库评论

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莴苣叶裂性状的遗传定位

园艺学报 2017年第8期44卷 1496-1504页

作者：袁焕然潘江鹏陈炯炯华中农业大学园艺植物生物学教育部重点实验室武汉430070

以叶片全缘(entire)莴苣PI491070和叶裂(lobed)莴苣PI536760为亲本构建F_2代分离群体,F_2代性状分离调查结果显示叶裂性状为单基因显性性状。利用BSR-seq方法对莴苣叶裂性状进行快速遗传定位,将控制叶裂性状的基因定位在3号染色体的60~1... 详细信息

以叶片全缘(entire)莴苣PI491070和叶裂(lobed)莴苣PI536760为亲本构建F_2代分离群体,F_2代性状分离调查结果显示叶裂性状为单基因显性性状。利用BSR-seq方法对莴苣叶裂性状进行快速遗传定位,将控制叶裂性状的基因定位在3号染色体的60~140 Mb之间。通过1 159株F_2群体的隐性单株进行分析最终将目的基因定位在116.24~118.15 Mb之间,物理距离大约为1.91 Mb。该区域包括24个候选基因,其中基因LG3316063编码锌指蛋白,在两亲本中有1个碱基的差异并导致了氨基酸的改变。从莴苣资源库中随机挑选5种叶裂植株检测该基因差异SNP位点都为G,7种无叶裂植株该基因SNP都为T,推测该基因可能是控制叶裂形成的候选基因。

关键词：莴苣叶裂 BSR-seq 基因定位

内含子序列在甘蓝MAGIC亲本间亲缘关系分析中的应用

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华中农业大学学报 2017年第1期36卷 16-21页

作者：安光辉严承欢张维奕彭丽莹陈炯炯华中农业大学园艺林学学院/园艺植物生物学教育部重点实验室武汉430070

为探究甘蓝多亲本高级世代互交系(multiparent advanced generation inter-cross,MAGIC)亲本间的亲缘关系和遗传多样性,以便对MAGIC杂交亲本的选择提供依据,采用生物信息学的方法对单拷贝基因进行全基因组鉴定,并采用其内含子序列分析对... 详细信息

为探究甘蓝多亲本高级世代互交系(multiparent advanced generation inter-cross,MAGIC)亲本间的亲缘关系和遗传多样性,以便对MAGIC杂交亲本的选择提供依据,采用生物信息学的方法对单拷贝基因进行全基因组鉴定,并采用其内含子序列分析对7个甘蓝亚种共12个MAGIC亲本构建系统发育树。全基因组鉴定共获得7 930个单拷贝基因,每条染色体上随机挑选1条单拷贝基因,采用PCR方法进行内含子扩增并测序,最终获得3 427bp内含子长序列。运用邻接法构建系统发育树,可将甘蓝类蔬菜分为3大类型:花椰菜与西兰花类(CladeⅠ)、羽衣甘蓝类(CladeⅡ)以及结球甘蓝、抱子甘蓝、苤蓝与芥蓝类(CladeⅢ),表明内含子序列适于甘蓝亚种亲缘关系聚类;同时也表明,芥蓝属于甘蓝亚种,西兰花与花椰菜具有较近的亲缘关系;利用单拷贝基因内含子序列分析的方法可以较好地显示甘蓝MAGIC亲本间的亲缘关系,为MAGIC群体的构建提供参考。

关键词：甘蓝单拷贝基因内含子系统进化树

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体验动感中国共享创新风采

科学24小时 2016年第7期 64-65页

作者：陈炯炯

今年3月,应英国政府＂中国学习项目＂的请求,浙江省科协为80名来浙江短期学习的英国大学生组织了一场国外大学生看浙江创新创业的主题活动。按照智能制造、＂互联网＋＂创新创业、智慧医疗、特色小镇等专题,国外大学生们分4组到杭州大... 详细信息

今年3月,应英国政府＂中国学习项目＂的请求,浙江省科协为80名来浙江短期学习的英国大学生组织了一场国外大学生看浙江创新创业的主题活动。按照智能制造、＂互联网＋＂创新创业、智慧医疗、特色小镇等专题,国外大学生们分4组到杭州大江东产业集聚区、梦想小镇、互联网医院（卓健科技）、歌斐颂巧克力小镇进行了专业参观和交流。

关键词：国外大学生浙江省科协学习项目大学生组织智能制造大江东皇后大学传统教育根特大学青年科学家

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建筑工程管理中常见问题及对策的综合探讨

中文科技期刊数据库（引文版）工程技术 2022年第12期 62-64页

作者：陈炯炯杭州萧山交通投资集团有限公司浙江杭州310000

由于建筑工程的工作量太大,施工环境也比较复杂,所以施工质量很难保证。而造成这一现象的根源在于施工期间的管理工作不到位。因此有关施工单位一定要全面地对工程实际问题进行全面的分析,对不合理的地方进行强制优化,尽量减少此类事故... 详细信息

由于建筑工程的工作量太大,施工环境也比较复杂,所以施工质量很难保证。而造成这一现象的根源在于施工期间的管理工作不到位。因此有关施工单位一定要全面地对工程实际问题进行全面的分析,对不合理的地方进行强制优化,尽量减少此类事故的发生,确保工程质量,提高企业在市场上的竞争力。在这一背景下,本文着重从建筑工程管理的角度出发,讨论了在施工中存在的诸多问题,并相应对策进行了深入的剖析,以期能为有关人员提供有益的建议。

关键词：建筑工程常见问题对策建议

“植物基因组学”在园艺专业的课程设置与教学改革

维普期刊数据库评论

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现代园艺 2021年第15期44卷 187-188页

作者：陈炯炯华中农业大学园艺林学学院湖北武汉430070

“植物基因组学”课程是华中农业大学园艺林学学院为园艺专业开设的专业特色课程,旨在培养学生掌握植物基因组学研究的方法,了解基因组学领域的研究概况,为从事园艺基因组学研究奠定相关理论基础。植物基因组学课程将研究案例、科学问... 详细信息

“植物基因组学”课程是华中农业大学园艺林学学院为园艺专业开设的专业特色课程,旨在培养学生掌握植物基因组学研究的方法,了解基因组学领域的研究概况,为从事园艺基因组学研究奠定相关理论基础。植物基因组学课程将研究案例、科学问题引入到教学中,激发学生对科学学习的热情和培养学生的科学思维。本研究从教学内容、课程资源、教学方法和考核方法等方面进行探索与总结,以期全面提高教学质量,拓展学生思维,提高实际解决科学问题能力,同时也给其他院校园艺专业相应的植物基因组学教学提供参考。

关键词：植物基因组学案例教学科学思维研究方法