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海南省肺部感染患者非结核分枝杆菌的菌种鉴定分析

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疾病监测 2022年第8期37卷 1054-1059页

作者：钟业腾陈灼霖王洁莹林明冠许玉妮裴华海南医学院第二附属医院海南海口570302

目的通过对海南省肺部感染患者非结核分枝杆菌(NTM)进行菌种鉴定,探讨海南省NTM肺部感染菌种的类型及人群分布情况。方法收集2016年7月至2021年6月期间就诊于海南医学院第二附属医院疑似肺结核患者的呼吸道标本进行分枝杆菌培养,对培... 详细信息

目的通过对海南省肺部感染患者非结核分枝杆菌(NTM)进行菌种鉴定,探讨海南省NTM肺部感染菌种的类型及人群分布情况。方法收集2016年7月至2021年6月期间就诊于海南医学院第二附属医院疑似肺结核患者的呼吸道标本进行分枝杆菌培养,对培养阳性标本进行对硝基苯甲酸(PNB)/噻吩-2-羧酸肼(TCH)培养菌型初步鉴定,采用DNA微阵列芯片技术进行分枝杆菌菌种鉴定,无法确定菌种的菌株进一步采用基因测序法鉴定。结果共收集8 507例疑似肺结核患者的呼吸道标本,剔除重复病例后,有318例经PNB/TCH培养初步鉴定为NTM,315例经DNA微阵列芯片技术和热休克蛋白65(hsp65)基因测序鉴定为NTM。其中308例患者为单一感染模式,6例MTB+NTM和1例2种不同NTM的混合感染模式。快速生长分枝杆菌128株占40.5%,以龟/脓肿分枝杆菌为主(占32.9%);缓慢生长分枝杆菌188株占59.5%,以胞内分枝杆菌为主(占39.6%)。女性患者多于男性且好发于中老年人,男女性别比为0.79∶1。男女性患者年龄分布差异有统计学意义(Z=2.200,P40岁的患者占91.1%。结论海南省NTM肺部感染主要以龟/脓肿分枝杆菌、胞内分枝杆菌感染为主,>40岁的女性中老年人为NTM侵袭的主要人群。

关键词：非结核分枝杆菌菌种鉴定 DNA微阵列芯片技术热休克蛋白65

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线性探针技术在海南省结核病诊断及耐药性检测中的应用

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中国热带医学 2019年第7期19卷 662-666页

作者：钟业腾林翀陈灼霖邱文华陈少文林明冠海南医学院第二附属医院

目的探讨线性探针技术在海南省结核病诊断及耐药性检测中临床应用。方法分别采用结核菌涂片、罗氏培养法、比例法药敏及线性探针技术对海南省疑似结核病患者痰液标本进行检测,并对检测结核分枝杆菌、耐药性及耐药突变特点进行分析。结... 详细信息

目的探讨线性探针技术在海南省结核病诊断及耐药性检测中临床应用。方法分别采用结核菌涂片、罗氏培养法、比例法药敏及线性探针技术对海南省疑似结核病患者痰液标本进行检测,并对检测结核分枝杆菌、耐药性及耐药突变特点进行分析。结果线性探针技术检测结核分枝杆菌阳性率(58.7%)明显高于结核菌涂片(40.2%)和罗氏培养(53.8%),线性探针法与两种传统方法比较差异有统计学意义(P<0.05);以比例法药敏为金标准,线性探针法对结核分枝杆菌耐利福平、异烟肼和耐多药结核分枝杆菌检测的特异性为89.27%、94.95%和91.45%,敏感性为94.38%、75.00%和75.68%,阴性预测值为94.62%、80.34%和5.60%,阳性预测值为85.71%、93.32%和84.85%,符合率为90.05%、85.34%和85.34%,线性探针技术与比例法药敏检测结核分枝杆菌利福平耐药性效果比较差异无统计学意义,且具有较好一致性,检测异烟肼耐药性差异有统计学意义,且两种方法之间一致性一般,检测耐多药结核分枝杆菌两种方法差异无统计学意义,但两种方法之间一致性一般;利福平耐药基因突变类型主要是 rpoB H531L,占57.14%,异烟肼耐药基因突变类型主要是katG S315T1,占91.89%,耐多药结核分枝杆菌耐药基因突变类型主要为rpoB S531L+KatG S315T1,占56.06%。结论线性探针技术可快速准确地从海南省疑似肺结核临床标本鉴定出结核分枝杆菌及耐多药结核分枝杆菌,并可直接快速检测临床标本耐药性从而指导临床用药。

关键词：线性探针结核分枝杆菌耐药性利福平异烟肼

肉汤微量稀释法对耐多药结核分枝杆菌敏感性检测的评价

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中国感染控制杂志 2024年第7期23卷 840-846页

作者：钟业腾王洁莹陈灼霖许玉妮邱文华裴华海南医学院第二附属医院检验科海南海口570216

目的评价肉汤微量稀释(BMD)法在耐多药结核分枝杆菌(MDR-MTB)敏感性检测中的应用效果。方法采用罗氏比例法和BMD法对海南省108株MDR-MTB及11株非MDR-MTB菌株进行药敏试验,并对两种药敏方法检测结果不一致菌株进行全基因组测序(WGS)。结... 详细信息

目的评价肉汤微量稀释(BMD)法在耐多药结核分枝杆菌(MDR-MTB)敏感性检测中的应用效果。方法采用罗氏比例法和BMD法对海南省108株MDR-MTB及11株非MDR-MTB菌株进行药敏试验,并对两种药敏方法检测结果不一致菌株进行全基因组测序(WGS)。结果罗氏比例法和BMD法药敏结果平均判读时间分别为28.0、8.5 d。罗氏比例法检测异烟肼、利福平、乙胺丁醇、卡那霉素和卷曲霉素的耐药率高于BMD法(均P<0.001);BMD法检测丙硫异烟胺和对氨基水杨酸的耐药率高于罗氏比例法(均P<0.001)。以罗氏比例法药敏结果为金标准,BMD法检测耐药性的灵敏度和特异度分别为50.00%~100%、95.69%~100%,除EMB(87.39%)、INH(94.96%)外,BMD法检测其他药物的耐药性符合率均≥95%。罗氏比例法药敏结果与WGS总符合率为76.19%(32/42),BMD法药敏结果与WGS总符合率为23.81%(10/42),差异具有统计学意义(χ^(2)=23.048,P<0.001)。两种药敏方法检测结果不一致的MTB共34株,罗氏比例法耐药+BMD法敏感的26株MTB中,22株(84.62%)相关耐药基因发生突变;罗氏比例法敏感+BMD法耐药的11株MTB中,5株(45.45%)相关耐药基因发生突变。结论BMD法是一种准确、快速的MDR-MTB敏感性检测方法,但仍需要进一步改进和优化,耐药性与相关耐药基因的突变密切相关。

关键词：耐多药结核分枝杆菌罗氏比例法肉汤微量稀释法最低抑菌浓度药物敏感试验

海南地区疑似肺结核患者非结核分枝杆菌感染特征

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中国感染控制杂志 2019年第8期18卷 701-707页

作者：钟业腾林明冠林翀陈灼霖郑文鑫裴华海南医学院第二附属医院检验科海南海口570311 海南医学院第二附属医院放射科海南海口570311

目的了解海南地区疑似肺结核患者非结核分枝杆菌(NTM)的菌种分布、耐药性及临床感染特征。方法收集2015年1月-2018年8月海南省某院疑似肺结核患者痰、肺泡灌洗液等呼吸道标本进行培养、菌种鉴定,对NTM感染情况、药敏结果,以及NTM肺部感... 详细信息

目的了解海南地区疑似肺结核患者非结核分枝杆菌(NTM)的菌种分布、耐药性及临床感染特征。方法收集2015年1月-2018年8月海南省某院疑似肺结核患者痰、肺泡灌洗液等呼吸道标本进行培养、菌种鉴定,对NTM感染情况、药敏结果,以及NTM肺部感染患者临床资料进行分析。结果共有833份疑似肺结核患者阳性呼吸道标本,其中126份初步鉴定为NTM,经菌种鉴定,检出结核分枝杆菌3株,检出非分枝杆菌属细菌3株,检出的4株NTM无法鉴定至种,最终116份标本中检出NTM118株。109例为单一NTM感染,7例为混合感染。有8种NTM菌种类型,主要以龟/脓肿分枝杆菌(41.5%)和胞内分枝杆菌(37.3%)为主。8种NTM菌种对8种一、二线抗结核药物呈不同程度的耐药,总耐药率最高的为异烟肼(96.6%),对8种抗结核药物全部耐药的比率高达32.2%。NTM肺部感染患者中男性少于女性,主要好发于中老年人,患者主要以海南沿海地区为主。NTM肺部感染患者主要临床表现为咳嗽咳痰、胸闷气促、血痰或咯血、食欲减退及体重下降,基础疾病既往有结核病史、支气管扩张、肺部感染及咯血,影像学表现为继发型肺结核、肺部空洞、胸膜肥厚、支气管扩张伴有肺气肿及肺部感染。结论海南地区NTM肺部感染主要是以龟/脓肿分枝杆菌和胞内分枝杆菌为主,NTM对常用的抗结核药物均具有较高的耐药性,NTM肺部感染与肺结核应依据病原学检查进行鉴别。

关键词：非结核分枝杆菌菌种鉴定耐药性临床特征

海南省某医院2014—2021年脓肿拟分枝杆菌分离鉴定及药物敏感性分析

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中国热带医学 2023年第9期23卷 947-953页

作者：王洁莹陈灼霖许玉妮余纯纯孔繁蓉陈琼钟业腾海南医学院第二附属医院海南海口570311

目的通过对海南医学院第二附属医院肺部感染患者脓肿拟分枝杆菌复合群(Mycobacteroides abscessus complex,MABC)进行菌种鉴定,探讨海南地区MABC肺部感染菌种类型、药物敏感性及人群分布情况。方法收集2014—2021年期间就诊于海南医... 详细信息

目的通过对海南医学院第二附属医院肺部感染患者脓肿拟分枝杆菌复合群(Mycobacteroides abscessus complex,MABC)进行菌种鉴定,探讨海南地区MABC肺部感染菌种类型、药物敏感性及人群分布情况。方法收集2014—2021年期间就诊于海南医学院第二附属医院疑似肺结核患者的呼吸道标本并进行分枝杆菌分离培养,通过对硝基苯甲酸/噻吩-2-羧酸肼(PNB/TCH)培养基与DNA微阵列芯片法初步鉴定出非结核分枝杆菌(non-tuberculous mycobacteria,NTM)菌株,再采用hsp65及rpoB基因测序法鉴定MABC及其亚种,并采用微量肉汤稀释法进行体外药敏试验。结果研究期间共收集3 025例疑似肺结核患者呼吸道标本,从123例患者呼吸道标本中分离培养鉴定出124株MABC菌株,包括脓肿拟分枝杆菌脓肿亚种(Mycobacteroides abscessus ***)74株,脓肿拟分枝杆菌马赛亚种(Mycobacteroides abscessus ***)38株,脓肿拟分枝杆菌博莱亚种(Mycobacteroides abscessus ***)12株,其中118例患者为单一MABC亚种感染,1例为2种MABC亚种混合感染,2例为MABC与其他NTM混合感染,2例为MABC与结核分枝杆菌混合感染。患者女多于男,比例为1∶0.64,50岁以上患者占76.42%(94/123,95%CI:67.93%~83.61%),不同性别患者年龄分布差异无统计学意义(Z=-0.944,P=0.347)。药敏结果显示,所有MABC菌株对替加环素(tigecycline,TGC)敏感,对阿米卡星(amikacin,AK)耐药率为0.81%(1/124),对头孢西丁(cefoxitin,FOX)、利奈唑胺(linezolid,LZD)和亚胺培南(imipenem,IPM)耐药率分别为为6.45%(8/124)、32.26%(40/124)、74.19%(92/124)。对于克拉霉素(clarithromycin,CLR),MABC存在诱导耐药,且3个亚种之间的CLR(14 d)耐药率差异有统计学意义(χ^(2)=66.335,P80%。结论海南省MABC肺部感染主要以脓肿亚种为主,对CLR诱导耐药率较高,及时准确地将MABC鉴定到亚种并进行药敏试验,对临床决策具有重要意义。

关键词：脓肿拟分枝杆菌复合群非结核分枝杆菌菌种鉴定药敏实验

DNA微阵列芯片法检测结核分枝杆菌耐异烟肼基因的研究

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中国热带医学 2017年第3期17卷 270-273,288页

作者：钟业腾林明冠林翀陈灼霖海南医学院第二附属医院海南海口570311

目的采用DNA微阵列芯片法检测结核分枝杆菌INH耐药基因,为临床诊治提供实验依据。方法应用DNA微阵列芯片法和改良罗氏培养加比例法药敏试验对疑似结核病患者的150份痰液标本进行检测,并对检测的结果进行比较分析。结果 150份痰液标本的... 详细信息

目的采用DNA微阵列芯片法检测结核分枝杆菌INH耐药基因,为临床诊治提供实验依据。方法应用DNA微阵列芯片法和改良罗氏培养加比例法药敏试验对疑似结核病患者的150份痰液标本进行检测,并对检测的结果进行比较分析。结果 150份痰液标本的涂阳率为60.0%(90/150),DNA微阵列芯片法检测到结核分枝杆菌阳性率为62.7%(94/150),改良罗氏培养法阳性率为60.0%(90/150),比例法药敏试验异烟肼的耐药率为43.9%(36/82),异烟肼的kat G/inh A基因总突变率为35.1%(33/94);以改良罗氏培养加比例法药敏试验为标准,DNA微阵列芯片法检测结核分枝杆菌阳性、异烟肼耐药性和敏感性的符合率分别为97.7%、86.1%和100.0%。结论 DNA微阵列法可快速准确地检测大部分疑似结核病临床标本的kat G和inh A基因突变,可用于临床耐药性的检测从而指导临床用药,也可用于临床诊断中的推广。

关键词： DNA微阵列耐药性异烟肼结核分枝杆菌 katG/inhA基因

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交叉引物恒温扩增技术在结核病中的诊断价值及其影响因素

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中国热带医学 2023年第3期23卷 240-245页

作者：余黄林翀欧阳范献陈灼霖陈林陈小娟许玉妮陈少文海南医学院第二附属医院海南海口570311

目的分析交叉引物恒温扩增技术(cross-primer isothermal amplification technology,CPA)在临床筛查、诊断结核病中的价值及其影响因素。方法收集2018年1月1日—2021年12月31日在海南医学院第二附属医院的住院患者543例,其中结核患者17... 详细信息

目的分析交叉引物恒温扩增技术(cross-primer isothermal amplification technology,CPA)在临床筛查、诊断结核病中的价值及其影响因素。方法收集2018年1月1日—2021年12月31日在海南医学院第二附属医院的住院患者543例,其中结核患者179例、肺炎患者187例,其他疾病患者177例。对患者的痰液、肺泡灌洗液、胸水和中段尿等进行CPA检测、涂片镜检、培养法和基因检测,评估CPA检测对结核病诊断的价值及其影响因素分析,统计学分析采用SPSS 26.0进行。结果CPA检测总阳性率为14.4%(78/543),其中痰液标本阳性率29.1%(39/134),在78例CPA检测阳性病人的分布中,结核组占首位69.2%(54/78),其次为肺炎组21.8%(17/78),其他疾病组占最低位9.0%(7/78);以CPA检测为参照方法,涂片镜检“灵敏度”低于基因检测和培养法,而“特异度”高于培养法和基因检测,涂片镜检“漏诊率”高于基因检测和培养法;CPA检测阳性与性别、血沉和肺炎均有关;CPA检测与培养法和基因检测具有较好的一致性(Kappa>0.9),CPA检测与涂片镜检也具有中等程度的一致性(Kappa=0.616)。结论痰标本是CPA检测的最佳首选对象,而胸水检测的价值相对有限,筛查和诊断“结核组与其他疾病组”时可选用痰液、肺泡灌洗液和中段尿等作为CPA检测的临床标本,而筛查和诊断“结核组与肺炎组”时可选用痰液;性别、血沉和肺炎是CPA阳性患者的影响因素,因此,CPA检测值得在临床推广,但需要更多的临床研究数据。

关键词：交叉引物恒温扩增技术结核诊断价值

DNA微阵列芯片法在海南地区结核病诊断及耐药性检测中的应用

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国际检验医学杂志 2021年第4期42卷 416-420页

作者：冯所远陈灼霖符史健钟业腾海口市第四人民医院重症医学科海南海口571100 海南医学院第二附属医院检验科海南海口570311

目的探讨DNA微阵列芯片法在海南地区结核病诊断及耐药性检测中的应用。方法采用抗酸杆菌涂片法、罗氏培养法、比例法药敏试验及DNA微阵列芯片法对海南地区的2069例疑似结核病患者痰标本进行检测,并对结核分枝杆菌检出率、耐药性及耐药... 详细信息

目的探讨DNA微阵列芯片法在海南地区结核病诊断及耐药性检测中的应用。方法采用抗酸杆菌涂片法、罗氏培养法、比例法药敏试验及DNA微阵列芯片法对海南地区的2069例疑似结核病患者痰标本进行检测,并对结核分枝杆菌检出率、耐药性及耐药基因突变特征进行分析。结果DNA微阵列芯片法检测结核分枝杆菌检出率为明显高于罗氏培养法和抗酸杆菌涂片法(P<0.05)。以比例法药敏试验为金标准,DNA微阵列芯片法与比例法药敏试验检测耐利福平、耐异烟肼结核分枝杆菌及耐多药结核分杆菌的效果比较,差异有统计学意义(P<0.05),但均有较好的一致性(Kappa≥0.75)。耐利福平基因突变类型主要为rpoB531(C→T),占56.3%;耐异烟肼基因突变类型主要为KatG315(G→C),占84.6%;耐多药结核分杆菌基因突变类型主要为rpoB531+KatG315占54.6%。结论DNA微阵列芯片法可快速、准确地对海南地区疑似结核病患者的痰标本进行结核分枝杆菌及其耐药性检测,从而指导临床用药。

关键词： DNA微阵列芯片结核分枝杆菌异烟肼利福平基因突变

基因芯片法与线性探针法对痰标本中结核分枝杆菌检测的应用价值

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中国感染控制杂志 2019年第4期18卷 283-288页

作者：钟业腾吕志辉林翀林明冠陈灼霖苏应仙陈少文裴华海南医学院第二附属医院检验科海南海口570311 海南省临高县疾病预防控制中心检验科海南临高571800

目的探讨基因芯片法与线性探针法检测痰标本中结核分枝杆菌(MTB)的应用价值。方法海南医学院第二附属医院2018年3—7月门诊和住院的106例疑似肺结核患者纳入研究,采用基因芯片法、线性探针法对患者送检的痰进行检测,并与改良罗氏培养法... 详细信息

目的探讨基因芯片法与线性探针法检测痰标本中结核分枝杆菌(MTB)的应用价值。方法海南医学院第二附属医院2018年3—7月门诊和住院的106例疑似肺结核患者纳入研究,采用基因芯片法、线性探针法对患者送检的痰进行检测,并与改良罗氏培养法进行比较;以比例法药敏试验为金标准,分析上述两种方法检测利福平和异烟肼耐药性的效能。结果对106份痰标本进行改良罗氏培养,阳性率为52.83%(56/106),经鉴定其中46份标本为MTB阳性。基因芯片法和线性探针法分别检出MTB46、53株,基因芯片法、线性探针法与改良罗氏培养法检测MTB结果比较,差异均无统计学意义(均P>0.05)。基因芯片法、线性探针法与比例法检测MTB对利福平的耐药性比较,差异均无统计学意义,且具有较好一致性(均P>0.05,均Kappa>0.75)。对利福平的耐药性检测,基因芯片法的灵敏度、特异度分别为84.62%、90.00%,线性探针法分别为84.62%、85.00%。基因芯片法、线性探针法与比例法检测MTB对异烟肼的耐药性比较,差异均无统计学意义,但一致性一般(均P>0.05、均Kappa<0.75)。对异烟肼的耐药性检测,基因芯片法的灵敏度、特异度分别为69.23%(18/26)、95.00%(19/20),线性探针法分别为65.38%(17/26)、85.00%(17/20)。结论基因芯片法和线性探针法均可准确、快速地从大部分疑似结核病患者的痰标本中鉴定出MTB,也适用于利福平和异烟肼耐药结果的快速检测,从而指导临床用药,值得临床推广。

关键词：基因芯片线性探针比例法结核分枝杆菌利福平异烟肼罗氏培养