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融合位置特征与序列进化信息的磷酸化位点预测（英文）

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生物化学与生物物理进展 2017年第12期44卷 1118-1124页

作者：谭泗桥李钎陈渊彭剑湖南农业大学信息科学技术学院长沙410128 湖南省农村农业信息化工程技术研究中心长沙410128 湖南农业大学信息化建设与管理中心长沙410128 湖南农业大学植物保护学院长沙410128

磷酸化是蛋白质翻译后的主要修饰,可分为激酶特异性和非激酶特异性两种类型.以非激酶特异性磷酸化位点Dou数据集为基础,本文发展了一种基于位置的卡方差表特征χ~2-pos,融合伪氨基酸序列进化信息PsePSSM表征序列,构建正负样本均衡的支... 详细信息

磷酸化是蛋白质翻译后的主要修饰,可分为激酶特异性和非激酶特异性两种类型.以非激酶特异性磷酸化位点Dou数据集为基础,本文发展了一种基于位置的卡方差表特征χ~2-pos,融合伪氨基酸序列进化信息PsePSSM表征序列,构建正负样本均衡的支持向量机分类器,S,T,Y独立测试Matthew相关系数、ROC曲线下面积分及准确率分别达到了(0.59、0.87、79.74%),(0.55、0.85、77.68%)和(0.50、0.81、75.22%),明显优于文献报道结果.χ~2-pos、PsePSSM两种特征的融合在蛋白质磷酸化位点预测中有广泛应用前景.

关键词：磷酸化预测卡方差表特征伪氨基酸序列进化信息支持向量机

（66.98m+7×120m+66.98m）连续刚构—组合梁桥的抗震响应分析

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（66.98m+7×120m+66.98m）连续刚构—组合梁桥的抗震响应分析

作者：陈渊石家庄铁道大学

学位级别：硕士

近年来，地震频繁发生，它严重危害着人民的生命和财产的安全。在地震作用下，作为生命线工程之一的桥梁结构的破坏，将加重次生灾害的程度，导致更为严重的生命财产及经济损失。现有的桥梁结构设计规范采用的反应谱抗震分析方法，只考... 详细信息

近年来，地震频繁发生，它严重危害着人民的生命和财产的安全。在地震作用下，作为生命线工程之一的桥梁结构的破坏，将加重次生灾害的程度，导致更为严重的生命财产及经济损失。现有的桥梁结构设计规范采用的反应谱抗震分析方法，只考虑一致地震激励的影响，而实际地震过程中，由于震源、地震波传播路径等的差异导致了桥梁各支承点的实际地震动是不同的，所以有必要对桥梁结构进行考虑行波效应的多点激励分析。本文采用埃尔森特罗波沿着汾河特大桥的纵桥性、横桥向分别加载和三向正交同时加载。研究了该桥在各单向行波效应和三向正交行波效应下的内力和位移响应。结果表明，地震波的各单向行波效应和三向正交行波效应对汾河特大桥的内力和位移有着不同程度的影响。行波效应下，各墩顶的纵向位移、纵向剪力、纵向弯矩、各墩底的纵向剪力、纵向弯矩及主梁各跨跨中纵向位移在沿纵桥向和三向正交同时加载地震波时均小于一致激励下的响应值，而沿着竖向加载地震波时，多数情况下则均大于一致激励下的响应值。沿横桥向和三向正交同时加载地震波时，行波效应下，各墩顶横向位移、横向剪力、横向弯矩，各墩底的横向剪力、横向弯矩及主梁各跨跨中横向位移、横向弯矩、纵向弯矩的最大值可能小于也可能大于一致激励下的相应值，没有明显的规律性。其次，研究了考虑桩土作用时行波效应对汾河特大桥内力和位移的影响，结果表明，考虑桩土作用时行波效应对汾河特大桥内力和位移的影响较为显著。最后，研究了汾河特大桥在不同峰值加速度下的桥墩弯矩随墩高变化，分析汾河特大桥在一致激励和行波效应下的塑性铰长度及其位置。

关键词：行波效应多跨连续刚构桥塑性铰时程分析

TNT在中国针对合同研究组织的冷链物流发展战略研究

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TNT在中国针对合同研究组织的冷链物流发展战略研究

作者：陈渊上海外国语大学

学位级别：硕士

近年,随着在日本及新加坡TNT临床实验、生命科学领域冷链物流业务的成功发展。凭借其在冷链物流方面先进管理理念、一流设备和丰富操作经验,TNT正向其在中国国内的合作研究组织,简称："CRO (Contract Research Organization)"类型的客户... 详细信息

近年,随着在日本及新加坡TNT临床实验、生命科学领域冷链物流业务的成功发展。凭借其在冷链物流方面先进管理理念、一流设备和丰富操作经验,TNT正向其在中国国内的合作研究组织,简称："CRO (Contract Research Organization)"类型的客户,推出以临床实验、生命科学领域为行业背景的冷链物流高端服务,以满足此类客户在中国日益增长的高端冷链物流服务需求。目前中国正成为即日、新之后CRO机构着重开发的全球性新阵地,发展前景乐观、市场相对广阔。然而,不可回避的是中国政府、市场在政策体制、贸易合规以及管理理念上的滞后已在很大程度上导致了为合作研究组织提供冷链物流服务的供应商之间无序、恶性的竞争。这对于物流企业尤其是象TNT这样的外资物流企业在中国临床实验、生命科学领域的业务发展提出了新的要求与挑战。显然外资物流企业相较于其在本土竞争对手们不仅要在战术上开拓创新领先一步,更要在战略上未雨绸缪探索一个新的商业模式,为自身在中国市场的长远生存与良性发展制定全新发展战略,而非简单地生搬硬套其在国外同类客户中的成功经验和商业模式。本文将运用波特五力模型、营销学4P、4C和SWOT分析等理论多维度、全方位地解析TNT在日本、新加坡的冷链物流成功案例,提炼其中的成功要义,通过比较的方法总结出基于中国国内市场、相关政策环境、限定目标客户以及主要竞争对手等因素影响下,TNT应如何制定其冷链物流发展战略来应对未来的竞争与挑战。通过运用战略管理相关理论,并适当借鉴前人的研究成果来加强本文的论点,为TNT度身定制其冷链物流业务在中国市场针对合同研究组织的发展战略。使得TNT在该细分市场中运用此战略能够取得更多市场份额、获得更多效益并保持其在该行业的领先地位。同时也希望该发展战略能为其它外资物流企业在中国的冷链物流业务发展带来一定借鉴意义及参考价值。

关键词： TNT CRO 冷链物流中国市场发展战略

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大豆有效营养面积研究

中国油料作物学报 2002年第4期24卷 33-37页

作者：韩秉进陈渊金剑中国科学院东北地理与农业生态研究所黑龙江哈尔滨150040

提出作物有效营养面积新概念,并用回归理论对此进行试验研究。通过试验,建立大豆植株个体营养面积与产量关系的模型,优化解析出大豆单株有效营养面积为2209.9cm2,即有效株行距为47.0cm。大豆最佳营养面积为546.9cm2,即最佳株行距为23.4c... 详细信息

提出作物有效营养面积新概念,并用回归理论对此进行试验研究。通过试验,建立大豆植株个体营养面积与产量关系的模型,优化解析出大豆单株有效营养面积为2209.9cm2,即有效株行距为47.0cm。大豆最佳营养面积为546.9cm2,即最佳株行距为23.4cm。据此阐明目前生产上广泛采用67～70cm的垄作,已超过大豆的有效株行距,造成了土壤资源等的浪费。垄作区采用45～50cm的垄距,平作区采用23×23cm的株行距种植,将会更有利于大豆群体产量的提高。

关键词：大豆有效营养面积个体群体产量

基于氮氧烯丙基正离子与不饱和醛、靛红和烯丙基亚胺反应研究

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基于氮氧烯丙基正离子与不饱和醛、靛红和烯丙基亚胺反应研究

作者：陈渊西华师范大学

学位级别：硕士

本文综述了近年来噁唑烷-4-酮的合成方法。噁唑烷-4-酮骨架普遍存在于天然产物和药物分子中,具有很好的生物活性和药用价值,其合成方法引起了化学家们的普遍关注。文献报道了下面几种方法:1)氧吖丙烷与烯酮,吖内酯,胺内酯化合物的环加... 详细信息

本文综述了近年来噁唑烷-4-酮的合成方法。噁唑烷-4-酮骨架普遍存在于天然产物和药物分子中,具有很好的生物活性和药用价值,其合成方法引起了化学家们的普遍关注。文献报道了下面几种方法:1)氧吖丙烷与烯酮,吖内酯,胺内酯化合物的环加成反应;2)α-酮酰胺的光催化反应;3)烯醇醚类与N-羟基-α-溴代酰胺的克莱森缩合反应;4)α-羟基酰胺与羰基化合物的缩合反应。本文研究了α-卤代酰胺与α,β-不饱和醛高区域选择性发生环加成反应,高效地得到了噁唑烷-4-酮类衍生物。在碱的作用下,α-卤代酰胺原位产生氮氧烯丙基正离子,氮氧烯丙基正离子与α,β-不饱和醛反应,得到噁唑烷-4-酮类衍生物,收率达到以(90-95%)。在最优条件下,对底物进行了拓展,通过单晶衍射,确定了产物的相对构型。本文还研究了氮氧烯丙基正离子与靛红的[3+2]环加成反应,以高达96%的收率得到螺环结构的噁唑烷-4-酮类化合物。通过筛选碱、温度和溶剂等,获得最优反应条件。在最优条件下,对底物进行了拓展,底物具有较宽的普适性。通过单晶衍射确定了产物的相对构型。除此之外,本文还研究了氮氧烯丙基正离子与α,β-不饱亚胺的反应。以高达93%的收率得到3-吲哚甲酰胺类衍生物。通过筛选碱、温度和溶剂等,获得了最优反应条件。在最优条件下,对底物进行了拓展,底物具有较宽的普适性,以高收率得到了3-吲哚甲酰胺类化合物。通过单晶衍射确定了产物的相对构型。

关键词：噁唑烷-4-酮 α-卤代酰胺 [3+2]环加成反应 3-吲哚甲酰胺类衍生物

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概念与表达—建筑设计中的模型

概念与表达—建筑设计中的模型

作者：陈渊天津大学

学位级别：硕士

这是一个信息交换非常讲求效率的时代,在建筑设计领域,需要设计师对建筑方案能够有清晰的认识,熟悉方案概念推衍的过程,同时还要能够准确的表达自己的设计意图,将信息进行合理的组织。建筑模型作为建筑设计重要的工具,作为最接近建筑实... 详细信息

这是一个信息交换非常讲求效率的时代,在建筑设计领域,需要设计师对建筑方案能够有清晰的认识,熟悉方案概念推衍的过程,同时还要能够准确的表达自己的设计意图,将信息进行合理的组织。建筑模型作为建筑设计重要的工具,作为最接近建筑实际状态的三维表达,在概念演化的过程中受到广泛应用。不同于以往对于模型在建筑设计过程中应用的研究,本文着重凸显的是模型与建筑概念相互对应的表达关系,从设计理论和案例分析中总结出用模型表达概念的方式方法以及概念、模型、表达之间内含的转换关系。用模型表达概念主要是指对概念演化过程中模型是如何表达建筑中所蕴含的信息,其落脚点在于过程性的研究。本论文主要分为三个部分:第一部分是对“模型”、“表达”、“概念”这三个论文的关键词进行释义,包括对三个词的定义进行限定和每个词的特性进行解释;第二部分是本论文研究的重点,探讨了“概念”演进过程中模型的表达,分为概念提取、概念组织、概念发展和概念综合以及各个阶段所对应的模型表达这几个板块,综合了解到概念演化每个阶段所要获得的信息和应该具有的模型表达方式;第三部分是基于第一部分和第二部分的论述,得出用模型进行概念表达的线索,并用这条线索去解读经典案例,将理论论证落到实际项目的介绍上,主要以库哈斯设计的达拉斯韦利剧院和伊东丰雄设计的仙台媒质中心为案例,解读他们的设计思想以及他们对于用模型表达概念的应用,同时也区分了他们在这个过程中所表现出来的不同的设计手段。在论文的最后,对论文的写作做出总结,并对用模型表达概念的方法有一个展望。

关键词：模型表达概念设计过程

界定概念,掌握体系,搞好“企业经济”分类——兼谈对分类法的改进建议

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四川图书馆学报 1999年第2期 44-48页

作者：陈渊斐大连市图书馆

文章对Ｆ２７（企业经济）现有文献数据存在的诸多归类问题从分类体系及概念上进行了分析，提出了建议。

关键词：企业经济文献分类标引分类法

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农业服务外包及农产品交易系统的设计与实现

农业服务外包及农产品交易系统的设计与实现

作者：陈渊兰州大学

学位级别：硕士

农业服务外包和农产品网上交易是现有农业信息化进程中不可缺少的环节,可以拓展网络信息资源服务,降低农业生产成本,提高农民获得服务的成功率,扩大农产品销售渠道。本课题基于现代网络技术和计算机技术,设计实现了农业服务外包及农产... 详细信息

农业服务外包和农产品网上交易是现有农业信息化进程中不可缺少的环节,可以拓展网络信息资源服务,降低农业生产成本,提高农民获得服务的成功率,扩大农产品销售渠道。本课题基于现代网络技术和计算机技术,设计实现了农业服务外包及农产品交易信息平台。主要包括农业信息发布、农业服务外包、农产品电子交易、科技服务外包、专家在线几个栏目。课题研究根据甘肃农业信息化建设的实际现状,对农业服务外包包括农业科技服务外包以及农产品市场信息需求进行了分析,构建了以农业专家服务信息资源库、特色农产品信息资源库和农产品交易资源库为核心的、可扩展的甘肃农业服务外包及农产品交易信息资源库。本系统采用Visual Studio2005作为系统开发环境,数据库建模工具使用Power Designer,数据库使用SQL Server2005,基于.NET技术实现的。在系统的实现过程中,采用了软件工程的思想,运用了目前比较流行的RUP开发模式,成功地将平台搭建完成。系统经过一段时间的测试,证明本平台的搭建是可行的。

关键词：农业服务外包交易系统

基于ARM和GPRS的水文测报系统的设计与研究

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基于ARM和GPRS的水文测报系统的设计与研究

作者：陈渊太原理工大学

学位级别：硕士

水文测报系统是利用传感器、测控技术、通信技术、计算机网络技术对水文信息进行处理的系统。水文测报系统实时采集、分析以及处理水情数据,为防洪防汛和水资源的合理分配提供了支持,是水利工程向信息化、网络化、智能化方向发展的基础... 详细信息

水文测报系统是利用传感器、测控技术、通信技术、计算机网络技术对水文信息进行处理的系统。水文测报系统实时采集、分析以及处理水情数据,为防洪防汛和水资源的合理分配提供了支持,是水利工程向信息化、网络化、智能化方向发展的基础。本文分析目前水文测报系统的特点,结合天古崖水库的实际情况,研究了以ARM芯片LPC2142为核心,利用其他芯片和外围电路,设计了基于GPRS无线传输的水文测报系统的硬件系统和软件系统,并利用组态王开发了水文测报系统的实时监控系统。具体分别完成了电源模块、数据采集模块、A/D转换模块、通信模块、存储电路及IAP硬件等的开发和设计,并提出了软件设计的总体思路,其中包括数据采集、键盘显示、IAP软件等相关软件功能模块;之后从GPRS网络结构、数据传输过程及相关协议等对GPRS无线网络技术进行了详细的阐述;利用组态王开发了上位机管理软件,分别实现了主监控界面、实时趋势曲线、数据报表、报警记录等界面的设计本文的主要特点包括两个方面：一是在硬件设计时分别采用了低功耗微处理器、接口芯片以及分区供电的方式来降低系统功耗;二是详细介绍了如何利用ISP/IAP功能设计出具有IAP功能的水文测报系统,分别探讨了IAP原理、设计方法以及实现技术,而且对IAP软件编程系统工作的状态作了详细论述,本系统终端的远程无线升级较好的解决了测报系统终端的升级难和分布广等问题。整个系统以实用、稳定、可靠为目标,在保证实现基本功能的基础上,优化了硬件和软件设计,并充分利用了GPRS无线通讯技术作为水情信息传输方式的优势,实现了水文信息的实时监控。

关键词： LPC2142 GPRS 水文测报系统数据采集