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广西壮族人群HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1高分辨等位基因多态性和单倍型的研究

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中国实验血液学杂志 2020年第4期28卷 1397-1405页

作者：裴永峰余梅黄惠妮陈洁润李恒聪南宁中心血站南宁输血医学研究所广西南宁530007

目的:分析广西壮族人群人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1等位基因和单倍型的特点。方法:采用多聚酶链式反应-基于测序的分型技术(polymerase chain reaction-sequence based typing,PCR-SBT),对广西地区350名壮族非亲缘个体进行HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1测序分析,使用Arlequin软件(3.***.2.2)计算HLA等位基因频率、单倍型频率,使用MEGA v6.0软件构建系统发生树和用SPSS软件做主成分分析。结果:该人群5个位点,只有HLA-A和DRB1位点的等位基因分布偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.05)。总共检出19种HLA-A等位基因,42种HLA-B等位基因,22种HLA-C等位基因,25种HLA-DRB1等位基因和15种HLA-DQB1等位基因。等位基因频率最高的分别是A*11:01(28.57%)、B*46:01(14.00%)、C*01:02(18.43%)、DRB1*16:02(15.71%)和DQB1*05:02(35.00%),最常见的5位点单倍型是A*33:03-C*03:02-B*58:01-DRB1*03:01-DQB1*02:01(6.86%),系统发生树结果表明该人群与南方汉族人群亲缘关系较近。结论:广西壮族人群HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1等位基因和单倍型有较高的遗传多态性。

关键词：人类白细胞抗原基因频率单倍体型广西壮族多态性

2012-2013年深圳市呼吸道合胞病毒流行规律及分子变异分析

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中华微生物学和免疫学杂志 2014年第10期34卷 737-741页

作者：吴春利陈洁润阳帆黄达娜李玥张仁利深圳市疾病预防控制中心重大传染病监控重点实验室 518020

目的：初步了解深圳市呼吸道合胞病毒的流行规律及分子变异特点。方法荧光RT-PCR对流感样病例样本进行初筛后，通过巢式RT-PCR对病毒G蛋白基因C端的可变区进行扩增，利用MEGA等软件进行分子变异分析。结果呼吸道合胞病毒在深圳的流行较... 详细信息

目的：初步了解深圳市呼吸道合胞病毒的流行规律及分子变异特点。方法荧光RT-PCR对流感样病例样本进行初筛后，通过巢式RT-PCR对病毒G蛋白基因C端的可变区进行扩增，利用MEGA等软件进行分子变异分析。结果呼吸道合胞病毒在深圳的流行较为普遍，流行高峰一般出现在春季和夏秋季；流行的病毒有A、B两个亚型， NA1和BAⅨ分别是其流行株系的基因型；病毒G蛋白C端的变异位点较为散乱，少数变异导致了病毒糖基化位点消失。一株包含24个氨基酸插入序列的新型重组毒株出现在2013年，此重组株很有可能是由国外传入我国。结论呼吸道合胞病毒在深圳存在持续而广泛的流行，而且病毒仍处在不断的进化和变异之中。

关键词：呼吸道合胞病毒流行规律分子变异

广西地区8例类孟买血型个体的血清学鉴定及FUT1基因突变分析

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中国实验血液学杂志 2021年第4期29卷 1318-1324页

作者：刘金莲刘学军马婷婷陈洁润李丽兰南宁输血医学研究所南宁中心血站广西南宁530007

目的:对广西地区8例类孟买血型个体进行血清学及分子生物学背景分析。方法:采用血型血清学方法对研究标本进行血型鉴定,用分子生物学方法进行基因型分析,包括以PCR-SSP方法进行ABO基因分型和测序,对决定H抗原表达的FUT1基因进行分析。结... 详细信息

目的:对广西地区8例类孟买血型个体进行血清学及分子生物学背景分析。方法:采用血型血清学方法对研究标本进行血型鉴定,用分子生物学方法进行基因型分析,包括以PCR-SSP方法进行ABO基因分型和测序,对决定H抗原表达的FUT1基因进行分析。结果:8例类孟买血型中,4例为B_(m)^(h),4例为A_(m)^(h)。FUT1基因测序结果显示,6例为h3h3突变[c.658C>T(***220Cys)突变纯合子],1例为h^(832)h^(832)突变[c.832G>A(***278Asn)突变纯合子],1例为h^(328)h3突变[c.328G>A(***110Thr)突变杂合子合并c.658C>T(***220Cys)突变杂合子]。结论:类孟买血型存在多种分子遗传机制,在本研究中,广西地区类孟买血型个体中发现导致类孟买血型的FUT1基因突变主要包括h3、h^(328)和h^(832) 3种,其中以h3突变最多见。

关键词：类孟买血型血型血清学 FUT1基因基因突变

苯丙酸诺龙促进胰岛NIT-1细胞Nampt表达和胰岛素分泌

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基础医学与临床 2014年第1期34卷 68-71页

作者：陈洁润吴雅婷冯乔沈旺冯乐平桂林医学院生物技术学院广西桂林541004

目的探讨雄性激素苯丙酸诺龙在氧化应激条件下对胰岛细胞的作用,为2型糖尿病治疗提供理论依据。方法将培养的NIT-1细胞按不同葡萄糖浓度(5.6、11.1、16.7和27.6 mmol/L)分为4组,分别用10μg/mL苯丙酸诺龙处理48 h,之后用流式细胞仪检测... 详细信息

目的探讨雄性激素苯丙酸诺龙在氧化应激条件下对胰岛细胞的作用,为2型糖尿病治疗提供理论依据。方法将培养的NIT-1细胞按不同葡萄糖浓度(5.6、11.1、16.7和27.6 mmol/L)分为4组,分别用10μg/mL苯丙酸诺龙处理48 h,之后用流式细胞仪检测细胞周期;用Western blot检测Nampt和FOXO1蛋白表达和用放射免疫法测定细胞胰岛素分泌。结果用苯丙酸诺龙处理48 h后,1)低糖条件下细胞G0/G1期阻滞明显改善(P<0.01);2)高糖条件下细胞G2/M期阻滞得到缓解(P<0.01);3)高糖氧化应激状态下,苯丙酸诺龙促进胰岛细胞Nampt表达(P<0.05)和抑制非磷酸化的FOXO1蛋白表达(P<0.01),细胞分泌胰岛素增加。结论苯丙酸诺龙能够在高浓度葡萄糖条件下改善胰岛细胞生存状况和促进胰岛素分泌,这些效应可能与促进细胞内Nampt表达和抑制FOXO1密切相关。

关键词：胰岛NIT-1细胞苯丙酸诺龙 Nampt FOXO1 细胞周期

广西汉族人群HLA-A、-B、-DRB1高分辨等位基因和单倍型多态性的初步分析

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免疫学杂志 2017年第8期33卷 645-654页

作者：裴永峰黄惠妮李恒聪陈洁润吴国光南宁中心血站南宁输血医学研究所组织相容性与免疫遗传实验室 530007

目的分析广西汉族人群人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)-A、-B、-DRB1等位基因和单倍型的分布特征。方法采用多聚酶链式反应-基于测序的分型技术(polymerase chain reaction-sequence based typing,PCR-SBT)对广西地区1 644名汉族无关个体进行HLA-A、-B、-DRB1等位基因和单倍型多态性的分型,使用Arlequin软件(3.***.2.2)计算HLA等位基因频率、单倍型频率和连锁不平衡参数。使用MEGA v6.0软件构建系统发生树,并与其他部分中国汉族人群的基因频率进行比较。结果该人群HLA-A、-B、-DRB1等位基因分布均偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.05),3个位点分别检出37种HLA-A,70种HLA-B和37种HLA-DRB1等位基因。其中,等位基因频率分布最高的分别是A~*11∶01(28.86%)、B~*46∶01(14.26%)和DRB1~*15∶01(13.32%),最常见的单倍型是A~*33:03-B~*58∶01-DRB1~*03∶01(6.12%),A~*02∶07-B~*46∶01、A~*11∶01-DRB1~*15∶01和B~*58∶01-DRB1~*03∶01呈现最强的连锁不平衡。该人群与广西壮族人群亲缘关系最近,其多态性最接近的汉族是中国南方汉族。结论广西汉族人群HLA-A、-B、-DRB1等位基因和单倍型有较高的遗传多态性,将为中国人群在临床寻找HLA匹配的无关亲缘供者、法医学研究以及人类学研究等提供有价值的遗传学依据。

关键词：基因频率广西汉族单倍体型人类白细胞抗原多态性

位于CD36基因剪切位点的2个新突变及其导致CD36缺失的分子基础

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中国实验血液学杂志 2020年第6期28卷 2056-2065页

作者：李丽兰陈洁润蒋丽红钟周琳黎海燕周燕卢芳吴国光南宁输血医学研究所广西南宁530003 南宁中心血站广西南宁530003

目的:对在广西人群中发现的2个位于CD36剪切位点的新基因突变,以及它们导致CD36缺失的分子基础和在人群中的发生率进行研究。方法:对在广西人群中发现的2例CD36缺失个体(HHC和WGM)使用DNA测序和cDNA克隆测序,检测他们的CD36外显子序列及... 详细信息

目的:对在广西人群中发现的2个位于CD36剪切位点的新基因突变,以及它们导致CD36缺失的分子基础和在人群中的发生率进行研究。方法:对在广西人群中发现的2例CD36缺失个体(HHC和WGM)使用DNA测序和cDNA克隆测序,检测他们的CD36外显子序列及mRNA蛋白编码区序列,对所发现的CD36 mRNA异常转录本建立真核表达细胞株并用Western blot实验验证异常转录本对CD36表达的影响。对所发现的新突变基因建立DNA PCR-SSP基因分型方法,在广西地区的110名CD36缺失个体群和广西地区随机的296名人群间展开人群分布调查。结果:在HHC和WGM个体中,发现了CD36剪切位点新突变CD36 c.430-1G>C,且在WGM个体中还发现了CD36 c.1006+2T>G的剪切位点新突变。cDNA克隆测序显示,CD36 c.430-1G>C可导致c.429_430ins[430-17_430-2;C](***144fsTer1)和c.430_609del(***144_Pro203del,GenBank注册号:HM217023.1)2种CD36 mRNA异常转录本的产生,而CD36 c.1006+2T>G可导致c.819_1006del(***274GlufsTer16)(GenBank注册号:HM217025.1)CD36 mRNA异常转录本的产生。通过建立的真核表达细胞株及Western blot实验验证了以上3种异常转录本均可导致CD36表达缺失。对所发现的2个剪切位点突变基因展开的人群发生率的研究显示,在110名CD36缺失个体群和随机的296名人群中,CD36 c.430-1G>C突变发生率分别为10.91%(12/110)和1.35%(4/296),而CD36 c.1006+2T>G突变的发生率分别为2.73%(3/110)和0(0/296)。结论:本研究发现了2个位于CD36基因剪切位点的新突变,初步阐明了它们导致CD36缺失的分子基础及在广西人群中的分布特征,为中国人群CD36缺失的分子机制及特征研究提供了实验和理论依据。

关键词： CD36缺失剪切位点突变分子机制及特征人群分布

带毒蚕卵中家蚕微孢子虫高丰度蛋白NBO＿76g0007的鉴定和单克隆抗体制备

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蚕业科学 2024年

作者：吴宗润穆明新陈洁孟宪志潘国庆周泽扬西南大学微孢子虫感染与防控重庆市重点实验室西南大学资源昆虫高效养殖与利用全国重点实验室重庆师范大学生命科学学院

家蚕微孢子虫（Nosema bombycis）感染家蚕后可通过蚕卵垂直传播，是蚕种生产中的唯一法定检疫对象。鉴定被感染的蚕卵中N. bombycis的高丰度蛋白，可为该病原的检测提供潜在靶点。制备带毒蚕卵，进而利用RIPA强裂解液提取催青后不同时... 详细信息

家蚕微孢子虫（Nosema bombycis）感染家蚕后可通过蚕卵垂直传播，是蚕种生产中的唯一法定检疫对象。鉴定被感染的蚕卵中N. bombycis的高丰度蛋白，可为该病原的检测提供潜在靶点。制备带毒蚕卵，进而利用RIPA强裂解液提取催青后不同时间点的蚕卵总蛋白并开展非标记蛋白定量质谱鉴定，根据蛋白表达水平筛选到了高丰度病原蛋白NBO＿76g0007。生物信息学分析表明NBO＿76g0007由211个氨基酸组成，预测蛋白分子量约为23 kD，等电点约为8.63，存在一个跨膜结构域，推测它是一种膜蛋白。利用原核表达的NBO＿76g0007免疫Balb/c小鼠，制备了其单克隆抗体。Western blot显示单抗特异性识别带毒蚕卵以及N. bombycis中的NBO＿76g0007蛋白。免疫定位结果表明，在成熟孢子中NBO＿76g0007主要定位于极膜层和后极泡；在孢原质中NBO＿76g0007集中定位于膜上；此外，孢子发芽后，NBO＿76g0007可定位于极管。综上，本研究系统性的分析了所制备的带毒蚕卵中家蚕微孢子虫蛋白类型和丰度，所鉴定到的高丰度蛋白NBO＿76g0007及其特异性单抗为带毒蚕卵中家蚕微孢子虫的抗原检测奠定了基础。

关键词：蚕卵家蚕微孢子虫高丰度蛋白单克隆抗体

CD36 c.C275T基因突变导致CD36缺失的研究

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现代医药卫生 2023年第5期39卷 730-734页

作者：陈洁润蒋丽红李丽兰南宁输血医学研究所/南宁中心血站广西南宁530003

目的研究在广西CD36缺失个体中检测到的CD36基因突变c.C275T,是否可导致CD36缺失和在人群中的发生率。方法采用血小板抗原单克隆抗体特异性免疫固定试验(MAIPA)和流式细胞技术检测确定广西地区1位汉族男性个体(XXX)的CD36表型,应用CD36... 详细信息

目的研究在广西CD36缺失个体中检测到的CD36基因突变c.C275T,是否可导致CD36缺失和在人群中的发生率。方法采用血小板抗原单克隆抗体特异性免疫固定试验(MAIPA)和流式细胞技术检测确定广西地区1位汉族男性个体(XXX)的CD36表型,应用CD36外显子测序、cDNA克隆测序对其CD36缺失的分子基础展开研究,构建真核表达细胞株及应用蛋白免疫印迹试验(Western blot)验证所检测到的CD36突变基因对CD36表达的影响。应用所建立的针对该突变基因的DNA PCR-SSP基因分型方法,在随机的无血缘关系的1026名广西地区人群中进行人群分布调查。结果经MAIPA和流式细胞技术检测鉴定XXX的CD36表型为Ⅱ型CD36缺失。CD36外显子测序发现其具有CD36 c.C275T(***92Met)突变,为突变杂合子,CD36 cDNA克隆测序发现该个体具有c.275C>T(***92Met)突变型和CD36野生型2种CD36 mRNA转录本。通过建立的真核表达细胞株及Western blot验证结果显示CD36 c.275C>T异常转录本可导致CD36表达缺失。该基因突变在人群的发生率研究显示,在随机的1026名广西人群中,CD36 c.275C>T突变的人群发生率为0。结论CD36基因突变c.275C>T(***92Met)可导致CD36缺失,并初步阐明了其导致CD36缺失的分子基础及在广西地区人群中的分布特征,为了解中国人群CD36缺失的分子基础和特征提供了实验和理论依据。

关键词： CD36缺失基因突变分子机制及特征人群分布

伟晶岩锂同位素研究进展及其对锂成矿过程的指示

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地质学报 2024年第5期98卷 1600-1614页

作者：陈洁李建康自然资源部成矿作用与资源评价重点实验室中国地质科学院矿产资源研究所北京100037 北京大学地球与空间科学院造山带与地壳演化教育部重点实验室北京100871

花岗伟晶岩是最重要的硬岩型锂资源来源,近年来前人应用锂同位素对伟晶岩成岩成矿过程开展较多的研究工作。本文在综述伟晶岩锂同位素研究进展的基础上,重点分析了伟晶岩的锂同位素在指示伟晶岩熔体源区、指示伟晶岩熔体分离、结晶和流... 详细信息

花岗伟晶岩是最重要的硬岩型锂资源来源,近年来前人应用锂同位素对伟晶岩成岩成矿过程开展较多的研究工作。本文在综述伟晶岩锂同位素研究进展的基础上,重点分析了伟晶岩的锂同位素在指示伟晶岩熔体源区、指示伟晶岩熔体分离、结晶和流体出溶中的研究思路,为揭示伟晶岩的锂成矿过程提供了启示。前人研究表明,伟晶岩熔体结晶分异和流体出溶过程均会产生较明显的锂同位素分馏:(1)结晶分异使残余伟晶岩熔体富集^(7)Li;(2)流体出溶使熔体富集^(6)Li;(3)扩散分馏使快速迁移的^(6)Li累积在熔体远端。全球伟晶岩(包括甲基卡伟晶岩)的Li含量与δ^(7)Li之间均有明显的负相关关系,甲基卡伟晶岩分异程度的增高与δ^(7)Li呈负相关关系。前人研究表明,高分异伟晶岩体系中锂同位素变轻可能是云母和锂辉石等富^(6)Li矿物的大量结晶、富^(7)Li流体出溶丢失或动力分馏作用等原因造成的。另一方面,不平衡结晶分异作用会产生显著的动力分馏,热液蚀变作用会产生强烈的低温分馏,这些过程产生的同位素分馏效应会模糊锂的来源信息,给同位素示踪带来困难。因此,伟晶岩锂同位素组成可能对于指示锂的来源作用有限,但可以较好地指示熔体结晶分异和流体出溶等地质过程,有助于揭示伟晶岩熔体-流体的演化过程,指示锂矿化机制。

关键词：锂同位素伟晶岩成矿作用结晶分异流体出溶