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局灶性皮质发育不良基因表达的生物信息学及药物分析

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中风与神经疾病杂志 2020年第10期37卷 872-876页

作者：赵怡然黎银潮陈树达佘颖芳陈傲寒周列民中山大学附属第七医院神经医学中心广东深圳518107 中山大学附属第一医院神经内科广东广州510030

目的局灶性皮质发育不良(focal cortical dysplasias,FCD)的发病分子机制尚不明确,因此本研究的目的是发现潜在的基因标记及其靶向药物,为FCD的进一步研究奠定基础。方法(1)从基因芯片公共数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中搜索下... 详细信息

目的局灶性皮质发育不良(focal cortical dysplasias,FCD)的发病分子机制尚不明确,因此本研究的目的是发现潜在的基因标记及其靶向药物,为FCD的进一步研究奠定基础。方法(1)从基因芯片公共数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中搜索下载FCD相关基因芯片数据集(GSE62019),含有5例FCD患者和3例对照组的脑组织标本。筛选和鉴定FCD的差异表达基因,利用DAVID在线网站分析基因本体论以及构建DEGs间的相互作用网络,选择重要的基因模块进行深入分析并筛选出5个与周围基因高度相关的基因作为核心基因。最后,筛选以这些核心基因为靶点的现有药物。结果(1)在GSE62019筛选出777个DEGs,分别包括364下调基因和413个上调基因。筛选出DEGs中的1个核心模块以及挑选出5个核心基因(C3、SAA1、ANXA1、CXCL2和CCL25)以及这些基因相关的现有靶向药物。结论通过生物信息学分析表明FCD的发病机制错综复杂,本研究对进一步探究FCD的发病机制以及确定新的候选治疗靶点和筛选靶向药物具有重要意义。

关键词：生物信息学局灶性皮质发育不良基因芯片药物

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颞叶内侧癫痫基因表达的生物信息学分析

癫痫杂志 2020年第3期6卷 181-187页

作者：黎银潮林婉蓉赵怡然陈树达周列民中山大学附属第七医院神经医学中心深圳518107 中山大学附属第一医院神经内科广州510030

目的通过生物信息学方法分析颞叶内侧癫痫(Mesio-temporal lobe epilepsy,MTLE)模型小鼠的海马组织与正常海马组织差异表达的基因,以及其生物学功能、细胞定位、参与的信号通路等,筛选出在MTLE发生发展过程中的关键基因,并挑选关键基因... 详细信息

目的通过生物信息学方法分析颞叶内侧癫痫(Mesio-temporal lobe epilepsy,MTLE)模型小鼠的海马组织与正常海马组织差异表达的基因,以及其生物学功能、细胞定位、参与的信号通路等,筛选出在MTLE发生发展过程中的关键基因,并挑选关键基因中处于整个调控网络的核心基因(与其它基因关系最密切者),为MTLE的发病机制及其防治研究提供新思路。方法①从基因芯片公共数据库(Gene expression omnibus,GEO)中搜索下载MTLE相关基因芯片数据集(GSE88992),该芯片含有17个癫痫模型小鼠的海马标本[包括8个病例组和9个对照组,其中将通过注射海藻氨酸(Kainic acid,KA;1 nmol/50 nL)获得的MTLE小鼠模型作为病例组,注射生理盐水的小鼠作为平行对照组,在注射后6、12及24 h提取海马标本];②通过GEO2R工具筛选和鉴定出MTLE小鼠的差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs),调整后P值1作为截断值的标准;③使用Venny2.1.0对上调和下调的差异表达基因分别取交集,筛选出共同差异表达的基因;④利用DAVID在线网站及FUNRICH软件分析基因的信号通路、基因蛋白表达等信息;⑤利用STRING在线网站及Cytoscape软件分析差异基因表达蛋白的相互作用以及挑选出5个与周围基因高度相关性(度值,Degree)的中枢基因,实现蛋白相互作用的可视化及分析核心模块基因。结果①在GEO数据集GSE88992,注射后6、12和24 h的结果中筛选出688、1294和1916个DEGs,分别包括549、797和870个上调基因以及139、497和1046个下调基因;②所有DEGs中,有285个上调的DEGs和46个下调的DEGs,共有331个DEGs在3个结果中共存,提示这331个共表达DEGs具有重要意义;③筛选出DEGs中的核心模块以及挑选出10个核心基因(Il6、Fos、Stat3、Ptgs2、Ccl2、Timp1、Cd44、Icam1、Atf3、Cxcl1),生物信息学分析提示核心模块基因主要富集在细胞质膜与细胞间隙中;涉及的生物学过程集中在中性粒细胞趋化、炎症反应、正向调控ERK1和ERK2级联反应;生物分子功能集中在趋化因子活性、细胞因子活性和趋化因子受体结合等;KEGG信号通路分析DEGs主要参与趋化因子信号通路、细胞因子互作信号通路等信号通路。结论通过生物信息学分析表明MTLE的发病机制错综复杂,是多个基因相互作用的结果,多条信号通路参与了MTLE的发病,对MTLE基因表达的进一步分析有利于揭示其发病机制以及确定新的候选治疗靶点。

关键词：生物信息学颞叶癫痫海马基因芯片

HCN基因多态性与内侧颞叶癫痫遗传易感性研究

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癫痫杂志 2016年第4期2卷 322-328页

作者：秦家明倪冠中方子研陈树达蔡晓东周列民中山大学附属第一医院神经内科广州510000 广州市脑科医院神经内科广州510000 广州市第一人民医院广州510000 中山大学附属第六医院广州510000

目的应用Sequenom iPEX体系分析超极化激活环核苷酸门控通道(Hyperpolarization-activated cyclic nucleotide gated channel,HCN)基因多态性位点与内侧颞叶癫痫遗传易感性相关性.方法研究对象为2013年12月-2016年4月就诊于中山大学... 详细信息

目的应用Sequenom iPEX体系分析超极化激活环核苷酸门控通道(Hyperpolarization-activated cyclic nucleotide gated channel,HCN)基因多态性位点与内侧颞叶癫痫遗传易感性相关性.方法研究对象为2013年12月-2016年4月就诊于中山大学附属第一医院癫痫门诊诊断为内侧颞叶癫痫患者共143例,同期纳入120名医院体检中心年度体检的健康人群为对照组.人组标准为ILAE 2004年诊断依据:①患者年龄12 ~55岁;②部分性发作或者继发强直-阵挛发作,有典型的颞叶起源的症状,如胃气上升感、似曾相识感、口咽部和手部自动症;③伴或不伴有中枢神经系统感染史和热性惊厥病史;④脑电图提示单侧或双侧颞区尖波、尖慢、棘慢等癫痫样波;⑤头颅MRI提示海马硬化.排除标准为:①肿瘤;②MRI提示局部皮质发育不良.对上述研究对象提取外周血基因组DNA,使用Sequenom iPEX体系进行HCN基凶SNP位点检测HCN1和HCN2共10个多态性位点.采用SPSS 16.0进行统计分析.结果所选HCN1和HCN2 10个SNP位点均满足Hardy-Weinberg遗传平衡定律.HCN1多肽性位点rs17344896 C/T,rs6451973A/G和HCN2多态性位点rs12977194A/G差异有统计学意义(P<0.05).结论 HCN1多态性位点rs17344896 C/T,rs6451973A/G和HCN2多态性位点rs12977194A/G与内侧颞叶癫痫遗传易感性相关.

关键词：内侧颞叶癫痫基因多态性遗传易感 HCN

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三年癫痫无发作患者减药后复发危险因素分析

癫痫杂志 2016年第3期2卷 193-198页

作者：秦家明倪冠中方子研陈树达蔡晓东周列民中山大学附属第一医院神经内科广州510000 广州市脑科医院神经内科广州510000 广州市第一人民医院神经内科广州510000 中山大学附属第六医院神经内科广州510000

目的回顾性总结并分析抗癫痫药物(AEDs)治疗3年无发作癫痫患者逐渐减药及停药后复发的相关危险因素.方法选取中山大学附属第一医院癫痫专科门诊随诊的癫痫患者,AEDs治疗至少3年无发作;在减药过程中或者停药的患者,每2个月随诊一次.入... 详细信息

目的回顾性总结并分析抗癫痫药物(AEDs)治疗3年无发作癫痫患者逐渐减药及停药后复发的相关危险因素.方法选取中山大学附属第一医院癫痫专科门诊随诊的癫痫患者,AEDs治疗至少3年无发作;在减药过程中或者停药的患者,每2个月随诊一次.入组标准:①确诊为癫痫,定义为间隔24 h以上的至少2次无明显诱发因素的癫痫发作;②在稳定的AEDs治疗下,连续3年达到完全无发作;③有减药的意愿,并能够按时回访;④脑电图(EEG)没有尖波、棘波、尖慢和棘慢复合波等癫痫波发放.癫痫复发及相关危险因素采用生存分析,包括:性别、起病年龄、癫痫发作次数、减药前癫痫无发作的时间、减药时间、减药后无发作时间(复发时间)、颅脑磁共振成像结果、癫痫控制前后EEG表现、发作类型(根据病史、长程视频脑电图分为全面性、部分性和多种发作形式)、病情稳定时AEDs的数量.Log-rank检验用于独立因素分析,Cox比例风险回归模型用于多因素回归分析.结果共收集68例癫痫患者,其中男39例,女29例;复发率为23.5%.单因素分析和多重回归分析提示:多药治疗,海马硬化和减药时间与癫痫复发相关,为独立的危险因素,其风险系数为:0.861、2.223和2.137.结论研究中复发率与其他报道一致.多药、海马硬化和减药时间,这3个危险因素在决定减药时需慎重考虑.因此推荐3年完全无发作的癫痫患者可以考虑减药,但如有海马硬化、多药治疗需慎重启动停药计划.

关键词：癫痫减药复发海马硬化

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痫性发作为首发症状的急性脑血管病

中国医药指南 2014年第11期12卷 12-13页

作者：黄华锰陈树达李泽潘小平广州市第一人民医院神经内科广东广州510080

目的探讨以痫性发作为首发症状的急性脑血管病的临床特点。方法回顾性分析我院2010年3月至2013年3月收治的55例首发症状为痫性发作的急性脑血管病患者的临床资料。结果是否以痫性发作为首发症状与急性脑血管病类型无明显关系(P>0.05);... 详细信息

目的探讨以痫性发作为首发症状的急性脑血管病的临床特点。方法回顾性分析我院2010年3月至2013年3月收治的55例首发症状为痫性发作的急性脑血管病患者的临床资料。结果是否以痫性发作为首发症状与急性脑血管病类型无明显关系(P>0.05);以痫性发作为首发症状的急性脑血管病病变多累及皮层或为多灶病变;以痫性发作为首发症状死亡5例,病死率为9.09%,未以痫性发作为首发症状的患者死亡47例,病死率为1.99%;差异具有统计学意义(P<0.05)。结论各种急性脑血管病患者均可以痫性发作作为首发症状,且这部分患者病死率较普通脑血管病更高。

关键词：痫性发作脑出血蛛网膜下腔出血脑血栓脑栓塞

育龄女性癫痫患者的生殖内分泌紊乱相关危险因素分析

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中山大学学报（医学科学版） 2010年第2期31卷 302-305,308页

作者：陈柳静周列民周珏倩王倩方子妍陈子怡陈树达杨丽白戴启鳞中山大学附属第一医院神经科广东广州510080

【目的】了解中国育龄女性癫痫患者发生生殖内分泌紊乱的相关危险因素,为临床决策提供依据。【方法】收集符合研究标准的102例女性癫痫患者的临床资料,将癫痫起病年龄、发作类型、发作频率、癫痫病程、抗癫痫药物(AED)种类、开始服用AE... 详细信息

【目的】了解中国育龄女性癫痫患者发生生殖内分泌紊乱的相关危险因素,为临床决策提供依据。【方法】收集符合研究标准的102例女性癫痫患者的临床资料,将癫痫起病年龄、发作类型、发作频率、癫痫病程、抗癫痫药物(AED)种类、开始服用AED的年龄、用药持续时间7个因素分组,分析各因素与月经稀发/闭经、多囊卵巢(PCO)、高雄激素血症(HA)、多囊卵巢综合征(PCOS)的关系。【结果】癫痫起病年龄≤14岁者较起病年龄>14岁者HA高发并具统计学意义;服用丙戊酸钠的患者月经稀发/闭经、PCO、HA、PCOS发生率分别达40.63%、50.00%、15.65%和34.38%,显著高于未用药组及其他用药组。Logistics回归分析结果表明:服用丙戊酸钠是发生生殖内分泌紊乱及PCOS的危险因素。癫痫起病年龄≤14岁是HA的危险因素。【结论】服用丙戊酸钠是中国育龄女性癫痫患者发生生殖内分泌紊乱乃至PCOS的危险因素,癫痫起病年龄≤14岁是HA的危险因素。

关键词：癫痫女性生殖内分泌紊乱危险因素育龄抗癫痫药物丙戊酸钠

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苯妥英钠耐药性颞叶内侧癫痫大鼠模型的构建

癫痫杂志 2019年第1期5卷 21-25页

作者：方子妍吴逢春陈树达秦家明宁玉萍周列民广州医科大学附属脑科医院(广州市惠爱医院)神经科广州510370 广东省精神疾病转化医学工程技术研究中心广州510370 中山大学附属第七医院神经科深圳518107 中山大学附属第一医院神经科广州510080

目的验证锂-匹罗卡品化学诱导及抗癫痫药物(AEDs)筛选构建的苯妥英钠耐药性颞叶内侧癫痫大鼠模型脑中AEDs浓度及多药转运蛋白表达。方法实验选取雌性6～8周SD大鼠30只,体重160～180 g(广东省实验动物研究所),采用锂-匹罗卡品化学诱导大... 详细信息

目的验证锂-匹罗卡品化学诱导及抗癫痫药物(AEDs)筛选构建的苯妥英钠耐药性颞叶内侧癫痫大鼠模型脑中AEDs浓度及多药转运蛋白表达。方法实验选取雌性6～8周SD大鼠30只,体重160～180 g(广东省实验动物研究所),采用锂-匹罗卡品化学诱导大鼠发生慢性颞叶内侧癫痫,视频脑电图(VEEG)监测苯妥英钠筛选期治疗效果,将颞叶内侧癫痫大鼠分成耐药性及不耐药性模型。采用活体微透析技术验证耐药性及不耐药性模型鼠脑中AEDs的浓度差异,免疫组织化学方法检测两组模型鼠脑中P糖蛋白的表达。结果有16只大鼠成功构建为慢性颞叶内侧癫痫模型,筛选出耐药模型大鼠6只(6/16)。苯妥英钠耐药性模型大鼠脑/血浆的时间药物浓度曲线的曲线下面积比值显著低于不耐药性模型大鼠(0.15±0.03 vs. 0.28±0.05,P达明显增高(P达有关。

关键词：锂-匹罗卡品颞叶内侧癫痫耐药性癫痫微透析苯妥英钠 P糖蛋白

维拉帕米对慢性颞叶内侧癫痫模型大鼠抗癫痫药物分布的影响

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癫痫杂志 2019年第3期5卷 165-169页

作者：方子妍吴逢春陈树达秦家明宁玉萍周列民广州医科大学附属脑科医院(广州市惠爱医院)神经科广州510370 广东省精神疾病转化医学工程技术研究中心广州510370 中山大学附属第七医院神经内科深圳518107 中山大学附属第一医院神经内科广州510080

目的观察添加P-糖蛋白抑制剂维拉帕米(Verapamil, VPM)对抗癫痫药物苯妥英钠(Phenytoin,PHT)在慢性颞叶内侧癫痫(Mesial temporal lobe epilepsy, MTLE)大鼠模型体内浓度分布的影响。方法锂-匹罗卡品诱导构建MTLE大鼠模型,分成两组,分别... 详细信息

目的观察添加P-糖蛋白抑制剂维拉帕米(Verapamil, VPM)对抗癫痫药物苯妥英钠(Phenytoin,PHT)在慢性颞叶内侧癫痫(Mesial temporal lobe epilepsy, MTLE)大鼠模型体内浓度分布的影响。方法锂-匹罗卡品诱导构建MTLE大鼠模型,分成两组,分别予PHT(n=6)及PHT+VPM(n=9)治疗,比较两组大鼠血、脑、肝、肾中PHT浓度分布情况。活体微透析采集脑微透析液检测病灶中药物浓度,高效液相色谱法检测PHT浓度。运用t检验(或Wilcoxon秩和检验)方法进行统计分析。结果添加VPM治疗的9只模型大鼠中4只在给药后30 min内死亡,有效入组5只。添加VPM治疗的模型大鼠的脑/血PHT时间药物浓度曲线的曲线下面积(Area under the curve, AUC)比值降低,差异具有统计学意义[PHT组(0.21±0.02)>VPM+PHT组(0.11±0.06),t=3.237,P=0.025],而肝/血[PHT组(1.12±0.37) vs. VPM+PHT组(0.99±0.27),Z=-0.490,P=0.624]及肾/血[PHT组(0.74±0.16)vs. VPM+PHT组(0.49±0.26),t=1.872,P=0.103]的PHT药物浓度比值差异无统计学意义。结论 P-糖蛋白抑制剂VPM会显著降低PHT在MTLE模型大鼠脑中的分布。

关键词：颞叶内侧癫痫维拉帕米苯妥英钠 P糖蛋白耐药性癫痫微透析大鼠

丙戊酸单药治疗癫痫患者疗效的生物信息学分析

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中风与神经疾病杂志 2021年第8期38卷 756-759页

作者：陈傲寒(综述) 黎银潮陈树达刘贤岳许晓伟赵轲王诚蔗周列民(审校) 中山大学附属第七医院神经医学中心广东深圳518107 中山大学附属第一医院神经内科广东广州510030

癫痫是最常见的慢性神经元性疾病之一,以神经元持续性的异常放电导致中枢神经系统功能失常为特征。任何年龄均会发病,全世界约7000万患者,其反复发作影响患者的身体健康,对患者及其家人的生活、心理及经济等方面造成负担[1]。使用抗癫... 详细信息

癫痫是最常见的慢性神经元性疾病之一,以神经元持续性的异常放电导致中枢神经系统功能失常为特征。任何年龄均会发病,全世界约7000万患者,其反复发作影响患者的身体健康,对患者及其家人的生活、心理及经济等方面造成负担[1]。使用抗癫痫药物(antiepileptic drugs,AEDs)是控制癫痫发作最基础、最有效的治疗方式,但是临床上仍有30%的患者在足量、足疗程治疗后复发[2]。

关键词：生物信息学丙戊酸癫痫基因芯片