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基于电镜多克隆表位鉴定技术（EMPEM）的新冠疫苗免疫效果分析

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基于电镜多克隆表位鉴定技术（EMPEM）的新冠疫苗免疫效果分析

作者：陈坤北京化工大学

学位级别：硕士

接种疫苗是预防疾病的有效途径之一,2019年新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的全球大流行加速了多种疫苗的研发,评估疫苗有效性的其中一个方面在于机体是否产生较多的广谱中和抗体(bn Abs),这类抗体能够识别严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2... 详细信息

接种疫苗是预防疾病的有效途径之一,2019年新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的全球大流行加速了多种疫苗的研发,评估疫苗有效性的其中一个方面在于机体是否产生较多的广谱中和抗体(bn Abs),这类抗体能够识别严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型(SARS-CoV-2)不同突变株表面相对保守的区域,从而对各类突变株产生有效免疫保护作用。然而,现有的酶联免疫吸附试验(ELISA)和基于分离单克隆抗体识别表位的方法在鉴别bn Abs存在一定的局限性,ELISA不具备鉴别抗体靶向表位信息的能力,且单克隆抗体的制备过程既耗时又昂贵。基于电镜的多克隆表位鉴定技术(EMPEM)提供了一种新的途径,可以在不分离单克隆抗体的情况下,对血液中的多克隆抗体进行可视化分析,从而揭示抗体靶向表位的特异性、多样性以及抗原抗体复合物的结构生物学信息,这一技术的开发和应用,为实时快速评估机体疫苗接种后产生的多克隆抗体反应提供了新的分析方法。为应用EMPEM技术分析新冠疫苗免疫效果,我们首先对EMPEM流程进行优化,并用人源和鼠源血清验证了其可行性;其次,我们首次将EMPEM技术应用于小鼠的免疫学分析,探究了针对新冠的序贯免疫和同源强化免疫策略的免疫效果;最后,我们首次利用EMPEM探究以新型佐剂DNA水凝胶的亚单位疫苗(刺突蛋白Spike protein,受体结合区域RBD)的免疫效果。取得的研究成果如下:1.从减少血清用量和时间的角度对EMPEM流程优化,通过直接在血清中进行抗体消化、复合抗原以及电镜成像,我们提出了基于旋柱式离心EMPEM,随后我们使用了人源血清和鼠源血清验证了这种方法的可行性,并实现了时间和血清用量分别减少至传统EMPEM方法的20%和60%。2.使用EMPEM技术分析了同源强化和序贯免疫策略诱导小鼠产生多克隆抗体反应的不同。同源强化策略,如DNA疫苗和亚单位疫苗,在免疫应答上不如序贯免疫策略可以诱导机体产生较多种类和较高亲和力的抗体,在我们分析同源强化策略的结果中发现,DNA疫苗产生了靶向N端结构域(NTD)表位的多克隆抗体,而亚单位疫苗(Spike protein)产生靶向RBD表位的多克隆抗体;在DNA初免+亚单位蛋白疫苗加强的序贯免疫策略中发现了较多靶向非RBD表位的抗体,并观察到随着非RBD类抗体比例增加,中和滴度也随之增加,表明非RBD类抗体在新冠的免疫应答中扮演着关键的角色。3.使用EMPEM技术对以DNA水凝胶为佐剂亚单位疫苗的免疫效果进行评估。分别使用RBD二聚体和三聚体以及Spike蛋白全长作为免疫原,并比较不同时间点小鼠体内诱导的p Abs反应。我们发现RBD二聚体比RBD三聚体更能刺激机体产生靶向Spike蛋白的抗体,且DNA水凝胶佐剂相对于铝佐剂更能刺激机体产生保护性抗体,随后在对Spike蛋白免疫原的研究中,我们发现随着ELISA滴度的增加,更多种类和更高亲和力靶向抗原的多克隆抗体在电镜下被观察到,通过EMPEM,我们实现了对ELISA中抗体的结合滴度的具象化描述。

关键词： SARS-CoV-2 基于电镜表位定位 DNA疫苗亚单位疫苗序贯免疫 DNA水凝胶佐剂疫苗

综合干预措施对综合ICU患者导尿管相关尿路感染的影响

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中国卫生标准管理 2021年第11期12卷 122-125页

作者：张湘湘陈坤影洪寒萍张小茹陈素芬福建省厦门市第五医院医院感染管理科福建厦门361101 福建省厦门市思明区疾病预防控制中心检验科福建厦门361001

目的分析综合干预措施对综合ICU患者导尿管相关尿路感染情况的影响。方法采用回顾性调查,收集干预前综合ICU病房2018年7月1日—2019年6月30日留置导尿管患者相关资料,2019年7月1日—2020年6月30日开展综合干预,比较干预前后导尿管相关... 详细信息

目的分析综合干预措施对综合ICU患者导尿管相关尿路感染情况的影响。方法采用回顾性调查,收集干预前综合ICU病房2018年7月1日—2019年6月30日留置导尿管患者相关资料,2019年7月1日—2020年6月30日开展综合干预,比较干预前后导尿管相关尿路感染患者的住ICU天数、留置导尿管天数、导尿管相关的手卫生依从率及导尿管相关尿路感染(catheter-associated urinary tract infections,CAUTI)发生率的变化。结果实施综合干预措施后,综合ICU留置导尿管患者的住ICU时间、留置导尿管时间均降低,手卫生依从率从70.10%上升至90.93%(P<0.05),导尿管相关尿路感染发生率从4.170‰下降至0.575‰(P<0.05)。结论综合干预措施的实施,能降低综合ICU留置导尿管患者的住ICU天数及留置导尿管使用时间,提高医务人员的手卫生依从率,且降低患者导尿管相关尿路感染的发生率,从而节约患者的住院成本,提高了患者的生命质量。

关键词：综合干预措施综合ICU 留置导尿管导尿管相关尿路感染手卫生依从率评估

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政治安全中的意识形态安全风险防范化解

南昌大学学报（人文社会科学版） 2024年第4期55卷 21-32页

作者：陈坤王睿琦哈尔滨工程大学马克思主义学院黑龙江哈尔滨150001

中西方社会制度的差异使意识形态安全一直处于政治安全的前沿。新时代意识形态对立引起的冲突越来越凸显,领域不断扩展,从政治领域不断延伸到经济、科技等更多的领域,对政治安全构成重大的风险挑战。西方敌对势力不断加大在意识形态领... 详细信息

中西方社会制度的差异使意识形态安全一直处于政治安全的前沿。新时代意识形态对立引起的冲突越来越凸显,领域不断扩展,从政治领域不断延伸到经济、科技等更多的领域,对政治安全构成重大的风险挑战。西方敌对势力不断加大在意识形态领域的输出和渗透力度,社会转型的大变革也使意识形态领域变得空前复杂,这些都使意识形态领域面临着严峻的风险挑战。意识形态安全直接关乎国家政治安全,必须坚定理想信念和加强党对意识形态工作的领导,牢牢把握意识形态工作的主导权和话语权,增强对网络意识形态传播的主动权和管控能力,健全意识形态安全风险预警机制,提升防范化解意识形态安全风险的政治能力。确保意识形态安全,对于保障政治安全、顺利推进中国式现代化进程、实现中华民族伟大复兴都具有重要的战略意义。

关键词：政治安全意识形态风险前沿性挑战政治能力防范化解

基于选择性注意力神经网络的木薯叶病害检测算法

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农业机械学报 2024年第5期55卷 254-262,272页

作者：张家瑜朱锐邱威陈坤杰南京农业大学工学院南京210031

为了实现在复杂非结构环境下对木薯叶4种主要病害的高精度检测,提出一种基于选择性注意力机制的木薯叶病害神经网络检测改进算法MAISNet(Multiattention IBN Squareplus neural network)。以V2-ResNet-101为基础网络,先使用多重注意力... 详细信息

为了实现在复杂非结构环境下对木薯叶4种主要病害的高精度检测,提出一种基于选择性注意力机制的木薯叶病害神经网络检测改进算法MAISNet(Multiattention IBN Squareplus neural network)。以V2-ResNet-101为基础网络,先使用多重注意力算法优化加权系数,调整特征通道的语义表达,在特征图中初步构建显著性特征;然后在残差单元之后采用实例批归一化方法来抑制特征表达中的协变量偏移,在特征图中构建出显著性语义特征,实现高质量语义特征表达;最后在残差分支中采用Squareplus激活函数替代ReLU激活函数,保持语义特征在负数域的数值分布,减少特征拟合过程中的截断误差。对比试验结果显示,经过上述改进后构建出的MAISNet-101神经网络,对4种常见木薯叶病害检测的平均准确率达到95.39%,明显优于目前主流算法EfficientNet-B5和RepVGG-B3g4等。网络提取特征的可视化分析结果表明,高质量木薯叶病害显著性语义特征,是提高木薯叶病害检测准确率的关键。所提出的MAISNet神经网络模型可以完成实际场景下木薯叶病害高精度检测。

关键词：木薯病害检测多重注意力算法显著性语义特征 Squareplus激活函数

以伟大建党精神涵养时代新人的核心要义、价值意蕴与实践路径

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学校党建与思想教育 2024年第19期 61-63页

作者：王启帆陈坤哈尔滨工程大学马克思主义学院黑龙江哈尔滨150006 黑龙江中医药大学第二临床医学院

认知维度的科学性品格、行动维度的实践性品格、意志维度的斗争性品格以及情感维度的人民性品格,共同构成以伟大建党精神涵养时代新人的核心要义;以伟大建党精神涵养时代新人的价值意蕴在于引领时代新人肩负“社会主义合格建设者与接班... 详细信息

认知维度的科学性品格、行动维度的实践性品格、意志维度的斗争性品格以及情感维度的人民性品格,共同构成以伟大建党精神涵养时代新人的核心要义;以伟大建党精神涵养时代新人的价值意蕴在于引领时代新人肩负“社会主义合格建设者与接班人”的时代使命,激励时代新人建构“堪当民族复兴重任”的历史担当,启迪时代新人厚植“大国青年”的家国情怀;以伟大建党精神涵养时代新人要优化课程教学渠道、筑牢学校教育前沿阵地,营造积极文化氛围、完善学习践行集成环境,用好网络媒介平台、整合网络宣传教育载体。

关键词：伟大建党精神时代新人实践路径

透明土试验技术在滑坡降雨入渗中的研究与应用

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煤炭学报 2024年第7期49卷 3051-3062页

作者：王櫹橦陈盟唐莹影袁仁茂桂林理工大学地球科学学院广西桂林541004 桂林理工大学环境科学与工程学院广西桂林541004 中国地震局地质研究所北京100029

由于滑坡体内部结构的复杂性和不可视性,使得滑坡降雨入渗及其渗流过程无法直观观测,从而难于查明滑坡灾变演化全阶段中降雨入渗的具体作用过程,导致降雨诱发滑坡成灾机制的认识存在不确定性,因此,发展可以观测滑坡内部降雨入渗灾变过... 详细信息

由于滑坡体内部结构的复杂性和不可视性,使得滑坡降雨入渗及其渗流过程无法直观观测,从而难于查明滑坡灾变演化全阶段中降雨入渗的具体作用过程,导致降雨诱发滑坡成灾机制的认识存在不确定性,因此,发展可以观测滑坡内部降雨入渗灾变过程的新技术手段,对深入理解降雨诱发滑坡灾变机理具有重要意义。而透明土试验技术则使岩土体内部非介入式、连续、无损、可视化测量得以实现。从透明土材料特性、岩土工程性质、试验设备与图像处理解析技术等方面,总结透明土试验技术发展现状及其在不同领域的应用,重点概述该技术在边坡工程领域的应用和渗流过程可视化模拟中的实践,并讨论将其应用于滑坡渗流直观观测的可行性。在此基础上,针对透明土材料进行筛选和对制备方法进行优化,利用透明土替代传统土工模型材料建立适用于渗流过程观测的滑坡透明土物理模型,开展降雨条件下滑坡渗流物理模拟试验,获取降雨入渗诱发滑坡灾变全过程信息,确定滑坡体内部地下水渗流过程及其变化特征。该模型试验是透明土试验技术在滑坡渗流可视化观测领域一次有效的应用实践,拓展了滑坡灾害可视化模拟新途径,进一步确定地下水渗流对滑坡的复杂影响,有利于揭示降雨诱发滑坡演化规律、深入探索滑坡滑动机制,为降雨滑坡灾害防治和灾害规划提供科技支撑。

关键词：滑坡透明土试验技术降雨入渗可视化室内物理模拟

经胫骨低位骨隧道联合减张线改良后交叉韧带重建术的临床疗效

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中国修复重建外科杂志 2024年

作者：陈坤豪黄锡豪李棋李箭四川大学华西医院骨科

目的比较经胫骨低位骨隧道联合减张线改良后交叉韧带（posterior cruciate ligament,PCL）重建与单纯经胫骨低位骨隧道PCL重建治疗PCL损伤的临床疗效。方法回顾分析2014年1月—2022年2月收治且符合选择标准的83例单纯PCL损伤患者临床... 详细信息

目的比较经胫骨低位骨隧道联合减张线改良后交叉韧带（posterior cruciate ligament,PCL）重建与单纯经胫骨低位骨隧道PCL重建治疗PCL损伤的临床疗效。方法回顾分析2014年1月—2022年2月收治且符合选择标准的83例单纯PCL损伤患者临床资料。其中44例采用经胫骨低位骨隧道联合减张线改良重建PCL（减张线组），39例采用单纯经胫骨低位骨隧道重建PCL（对照组）。两组患者性别、年龄、身体质量指数、手术侧别、致伤原因及术前胫骨后移双侧差异（side-to-side difference,SSD）、疼痛视觉模拟评分（VAS）、膝关节活动度（range of motion,ROM）、Tegner评分、Lysholm评分和国际膝关节文献委员会（IKDC）评分（包括膝关节症状评分、日常活动评分、膝关节功能评分）等基线资料比较差异均无统计学意义（P>0.05）。记录并比较两组患者手术时间和术中出血量；采用术前及末次随访时Lysholm评分、IKDC各评分、Tegner评分、VAS评分、膝关节ROM、胫骨后移SSD以及末次随访时患者满意度评价临床疗效；采用MRI评估术后移植物恢复情况。结果两组患者手术时间和术中出血量比较差异无统计学意义（P>0.05）。所有患者均获随访，随访时间12～60个月，两组随访时间比较差异无统计学意义（P>0.05）。术后两组患者MRI均显示移植物情况良好，重建PCL移植物信号好，连续性及张力好。随访期间两组均未出现再断裂、移植物供区不适等相关并发症。末次随访时，两组Lysholm评分、IKDC各评分、Tegner评分、VAS评分、膝关节ROM及胫骨后移SSD均较术前显著改善，差异有统计学意义（P0.05）。结论与单纯经胫骨低位骨隧道重建PCL相比，经胫骨低位骨隧道联合减张线改良PCL重建能有效改善重建术后PCL再松弛，膝关节功能恢复更好。

关键词：后交叉韧带韧带重建胫骨低位骨隧道减张线

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社会科学研究的方法自觉--谢宇教授访谈

学术月刊 2024年第3期56卷 212-216页

作者：谢宇竹影美国艺术与科学院中国台湾“中央研究院” 美国国家科学院普林斯顿大学社会学和国际研究Bert G.Kerstetter'66大学《学术月刊》

谢老师,您好!近年来您一直关注实证社会学研究在中国的推广,同时培养了大批优秀的学生,请问您是从什么时候下决心从事社会学研究的?

关键词：实证社会学社会科学研究社会学研究方法自觉教授访谈老师

面向高质量开行的中欧班列开行方案动态优化方法研究

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铁道科学与工程学报 2024年第1期21卷 70-81页

作者：罗君培王莹胡梦影北京交通大学交通运输学院北京100091

为满足中欧班列高质量发展的目标要求,将运力优先释放给高质量货物,基于分类货物对班列开行质量的贡献程度对中欧班列开行方案的优化方法进行研究。首先,将货物按照货物价值、来源班列运营平台、时效性不同进行分类,并设置货物运输效益... 详细信息

为满足中欧班列高质量发展的目标要求,将运力优先释放给高质量货物,基于分类货物对班列开行质量的贡献程度对中欧班列开行方案的优化方法进行研究。首先,将货物按照货物价值、来源班列运营平台、时效性不同进行分类,并设置货物运输效益系数,计算出包含经济效益及社会效益在内的不同品类货物的综合货物运输效益,用于反映货物运输特性对班列开行质量的影响。其次,根据线路现状选择备选城市作为集结中心,设计出“混合轴辐式”中欧班列开行模式,并加入时间因素构建出时空网络。然后,以货流平衡、班列接续、编组限制、集结中转作业及口岸作业限制等能力为约束条件,建立了以班列开行综合运输效益最优为目标的开行方案优化模型。结合模型特点,进一步设计列生成算法对优化模型进行求解,并利用Gurobi软件对限制主问题和原整数规划问题进行了求解。算例表明,基于“混合轴辐式”网络的“直达+中转”模式,使得运输需求满足率提升了3.56%,优化后的中欧班列开行方案实现了在口岸能力有限的情况下对运营质量较好班列公司的货物以及高价值时间敏感货物进行优先运输,并使其均衡到达口岸以缓解口岸拥堵,顺应中欧班列高质量运输的发展需求。研究可以为中欧班列日常运输计划的制定提供支撑。

关键词：中欧班列时空网络时间成本高质量运输