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人类线粒体转录因子B1和B2与裂殖酵母线粒体转录聚合酶Rpo41相互作用的初步研究

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复旦学报（自然科学版） 2011年第3期50卷 313-319页

作者：赵俊容陈东戎复旦大学生物医学研究院RNA生物学实验室上海200032 复旦大学化学系上海200433

由L02型人肝脏细胞cDNA通过PCR技术获取到线粒体转录因子B1和B2的ORF片段(NM_022366和NM_016020);构建表达质粒pGEX-4t-1/GST-mtTFB1及pMAL-c-2X/MBP-mtTFB2,并转化到大肠杆菌BL21(DE3)中表达,经亲和层析,分子筛和阳离子交换柱得到纯度较高的蛋白.利用体外pull-down实验证实TFB1和TFB2均与来源于裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe)的线粒体RNA聚合酶(Rpo41)存在分子间相互作用.在裂殖酵母中过表达h-TFB1和h-TFB2,利用实时荧光定量PCR检测,2个蛋白在酵母体内均对线粒体基因转录产生影响.

关键词：线粒体转录因子B 裂殖酵母裂殖酵母线粒体RNA聚合酶

介导含硫多肽类抗生素耐药的23S rRNA甲基转移酶NHR的生化功能

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复旦学报（医学版） 2011年第3期38卷 189-193,215页

作者：沈妍王哲陈东戎复旦大学生物医学研究院药物与结构生物学教研室上海200032

目的研究23S rRNA甲基转移酶-硫链丝菌肽抗药性RNA甲基转移酶(thiostrepton-resistance-RNA methyltransferase,TSR)和23S rRNA甲基转移酶-那西肽抗药性RNA甲基转移酶(nosiheptide-resistance-RNA methyltransferase,NHR)的生化功能,探讨细菌对含硫多肽类抗生素产生耐药性的分子机制。方法构建克隆,体外表达并纯化TSR和NHR蛋白;利用T7聚合酶体外转录系统体外转录生成23S rRNA底物片段;构建RNA甲基转移酶活性的体外检测体系,在14C-SAM存在的情况下,利用液体闪烁计数仪测定相应底物RNA被甲基化的程度;通过Gel shift方法观察RNA底物与TSR或NHR蛋白的体外相互结合作用。结果得到体外表达的纯化TSR、NHR蛋白及RNA底物;TSR蛋白和NHR蛋白均能将RNA底物甲基化,且NHR甲基转移酶的活性更强;TSR和NHR蛋白与RNA底物均有结合,结合强度均随蛋白浓度增加而增强。结论 TSR和NHR蛋白都能将23S rRNA的特异位点1067A甲基化,并能诱导细菌的抗生素耐药性。

关键词：抗生素耐药性 23S rRNA甲基转移酶硫链丝菌肽那西肽

等温滴定量热法研究核糖开关aac与氨基糖苷类抗生素的相互作用

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生物物理学报 2015年第3期31卷 241-250页

作者：石会刚陈东戎复旦大学生物医学研究院上海200032

核糖开关(riboswitch)是位于m RNA非编码区域的RNA元件,可与小分子配体结合导致结构转变,进而调控下游基因的表达。核糖开关aac能够特异性结合氨基糖苷类抗生素,从而调控氨基糖苷类抗生素抗性基因的表达。目前,核糖开关aac与氨基糖苷类... 详细信息

核糖开关(riboswitch)是位于m RNA非编码区域的RNA元件,可与小分子配体结合导致结构转变,进而调控下游基因的表达。核糖开关aac能够特异性结合氨基糖苷类抗生素,从而调控氨基糖苷类抗生素抗性基因的表达。目前,核糖开关aac与氨基糖苷类抗生素相互作用的位点和机制尚不清楚。作者利用等温滴定量热法对核糖开关aac与氨基糖苷类抗生素的结合亲和力及结合热力学性质进行了研究,并初步探讨了点突变对相互作用的影响。结果发现,西索米星、庆大霉素、G418、奈替霉素和巴龙霉素能够特异性结合核糖开关aac,而阿米卡星、卡那霉素A、链霉素、链丝菌素、新霉胺、新霉素及核糖霉素与核糖开关aac无特异性相互作用;核糖开关aac与氨基糖苷类抗生素的结合热力学性质表明二者通过氢键和范德华力发生相互作用。西索米星滴定核糖开关aac突变体的结果表明,U68和A18位点很可能与氨基糖苷类抗生素形成氢键,A13和A44位点对于相互作用也有影响。这些结果对进一步研究核糖开关aac与氨基糖苷类抗生素相互作用的位点和机制具有重要的参考价值。

关键词：核糖开关氨基糖苷类抗生素等温滴定量热法热力学

乙醇脱氢核酶ribox02与NAD＋／NADH结合位点的探测

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复旦学报（医学版） 2018年第5期45卷 664-670页

作者：李丹彬张静陈东戎复旦大学生物医学研究院RNA生物学实验室上海200032

目的探讨乙醇脱氢核酶ribox02与NAD^+、NADH特异性结合的位点以及结合力性质。方法通过选择性2-OH酰基化学探测法(selective 2-hydroxyl acylation analyzed by primer extension,SHAPE)探测ribox02的二级结构;利用等温滴定量热法(isothermal titratio calorimetry,ITC)进一步测定ribox02与NADH、NAD^+的亲和力强度及作用力性质;通过紫外交联法精确定位NAD^+、NADH与ribox02 RNA的特异性结合位点。结果直接解析ribox02的二级结构,并发现核酶ribox02与NADH、NAD^+的相互作用力为范德华力或氢键作用,且ribox02与NADH的相互作用力较之与NAD^+更为强烈,ribox02与NADH、NAD^+的特异性结合位点为23G、24U、25U、38U、72U、73U、74U、75G和95G。结论通过ribox02的二级结构及其与NAD^+、NADH的相互作用揭示了核酶ribox02与NAD^+/NADH特异性结合位点以及结合力性质。

关键词：乙醇脱氢核酶 ribox02 NAD+/NADH RNA二级结构 SHAPE ITC UV交联耦合

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石蒜碱对裂殖酵母生长的抑制作用

复旦学报（医学版） 2010年第6期37卷 642-646页

作者：汪洋王哲沈妍陈东戎复旦大学生物医学研究院药物与结构生物学教研室上海200032

目的研究石蒜碱对裂殖酵母生长周期的影响,分析石蒜碱的抗肿瘤机制,推测用裂殖酵母作为模型筛选抗肿瘤药物的可行性。方法在不同浓度石蒜碱条件下培养裂殖酵母,测量生长曲线;流式细胞术检测细胞周期分布;光学显微镜观察形态,DAPI及Calco... 详细信息

目的研究石蒜碱对裂殖酵母生长周期的影响,分析石蒜碱的抗肿瘤机制,推测用裂殖酵母作为模型筛选抗肿瘤药物的可行性。方法在不同浓度石蒜碱条件下培养裂殖酵母,测量生长曲线;流式细胞术检测细胞周期分布;光学显微镜观察形态,DAPI及Calcofluor染色观察细胞核、细胞间隔变化;Real-time PCR检测细胞周期相关基因的表达。结果在试验条件下,石蒜碱显著抑制裂殖酵母生长,并呈现时间浓度依赖性,作用20.5 h后IC50值为212μmol/L;酵母细胞变长、细胞核及细胞间隔增多,G2/M期细胞比例增加,部分细胞周期相关基因在mRNA水平有所变化。结论石蒜碱对裂殖酵母生长具有明显抑制作用,可引起细胞表型变化,影响部分细胞周期相关基因的表达。

关键词：裂殖酵母细胞周期石蒜碱抗肿瘤

应用体外转录法和荧光素制备RNA探针的技术

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药物生物技术 2008年第1期15卷 28-30页

作者：宁俊红孙文夏陈东戎复旦大学生物医学研究院药物与结构生物学研究所上海200032

为建立一种快速制备RNA探针的方法,以研究不同的RNA与RNA之间的相互作用,介绍一种用体外转录法制备RNA,然后用聚丙烯酰胺凝胶电泳法(PAGE)纯化得到纯化的RNA,最后用荧光素标记得到RNA探针的新方法,用该方法制备RNA探针简便、高效、安全... 详细信息

为建立一种快速制备RNA探针的方法,以研究不同的RNA与RNA之间的相互作用,介绍一种用体外转录法制备RNA,然后用聚丙烯酰胺凝胶电泳法(PAGE)纯化得到纯化的RNA,最后用荧光素标记得到RNA探针的新方法,用该方法制备RNA探针简便、高效、安全,尤其适合小剂量RNA探针的制备。

关键词：体外转录法荧光素 RNA探针制备技术

黑磷/黑砷异质结纳米器件热电性质应力调控研究

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原子与分子物理学报 2025年第1期42卷 69-74页

作者：戎杙邱乙峰张蓓新疆大学物理科学与技术学院乌鲁木齐830046

探索新型高性能低维热电纳米材料已成为国家重大发展策略.论文采用密度泛函理论结合非平衡态格林函数方法研究了由黑磷、黑砷纳米带构建异质结构在2%、4%、6%和8%四种拉伸应变作用下热电性能调控机理.研究结果表明,6%拉伸应变较其他情形... 详细信息

探索新型高性能低维热电纳米材料已成为国家重大发展策略.论文采用密度泛函理论结合非平衡态格林函数方法研究了由黑磷、黑砷纳米带构建异质结构在2%、4%、6%和8%四种拉伸应变作用下热电性能调控机理.研究结果表明,6%拉伸应变较其他情形,能够更有效抑制声子输运行为;与此同时,拉伸应变对于器件的电子输运的调控效果并不明显.在费米能附近,黑磷/黑砷异质结纳米器件在6%拉伸应变调控下热电优值达到最大值2.31.

关键词：黑磷黑砷异质结应力热电性质

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增强免疫功能的营养补剂

健与美 2025年第1期 72-74页

作者：陈东丽

人体的免疫系统由一系列复杂的细胞和化学物质组成，可以保护身体免受病原体的入侵，包括病毒、细菌和毒素。保持免疫系统健康是预防感染和避免患上疾病的关键。缺乏某些维生素和矿物质，如维生素和锌，会削弱免疫系统的功能。一些研究...

人体的免疫系统由一系列复杂的细胞和化学物质组成，可以保护身体免受病原体的入侵，包括病毒、细菌和毒素。保持免疫系统健康是预防感染和避免患上疾病的关键。缺乏某些维生素和矿物质，如维生素和锌，会削弱免疫系统的功能。一些研究表明，补充某些维生素、矿物质和药草，有助于提高免疫系统的功能。然而，在尝试服用一种新的营养补充剂之前，要先咨询医生的意见，因为某些补充剂会与药物发生相互作用。以下13种营养补充剂可以增强免疫系统的功能。

关键词：

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稀疏图的邻和可区别全列表染色

浙江师范大学学报(自然科学版) 2025年第1期48卷 30-35页

作者：童思鹏陈东浙江师范大学数学科学学院浙江师范大学行知学院

通过分析极小反例的结构，运用权转移方法，证明了最大度Δ(G)≥8且最大平均度小于3.2的图G的邻和可区别全选择数不超过Δ(G)+2.

关键词：稀疏图邻和可区别列表全染色最大平均度权转移

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