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6株高致病性H5N6禽流感病毒的分离鉴定和遗传进化分析

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中华微生物学和免疫学杂志 2021年第4期41卷 254-261页

作者：常娜娜张倩张成杜菲阿木提喀日·马木提毕玉海马正海新疆大学生命科学与技术学院新疆生物资源基因工程重点实验室乌鲁木齐830046 中国科学院微生物研究所病原微生物与免疫学重点实验室流感研究与预警中心北京100101

目的对活禽市场家禽中分离的H5N6禽流感病毒(avian influenza virus,AIVs)进行遗传进化和分子特征分析。方法2018年12月于乌鲁木齐市活禽市场采集家禽双腔拭子和环境样本,通过接种鸡胚、血凝试验和RT-PCR等方法分离鉴定AIVs,以甲型流感... 详细信息

目的对活禽市场家禽中分离的H5N6禽流感病毒(avian influenza virus,AIVs)进行遗传进化和分子特征分析。方法2018年12月于乌鲁木齐市活禽市场采集家禽双腔拭子和环境样本,通过接种鸡胚、血凝试验和RT-PCR等方法分离鉴定AIVs,以甲型流感病毒通用引物扩增病毒全基因组并测序,利用BLAST、Clustal W、MEGA-X和DNAStar等软件进行序列比对、系统进化和分子特征分析。结果从家禽样品中分离到6株H5N6亚型AIVs,其各基因之间的一致性较高(99.4%~100.0%),为同一来源。BLAST分析显示除NP基因与苏州家禽中分离的H5N6毒株一致性最高(99.7%),其余7个基因片段均与2017—2018年广东环境中分离的H5N6毒株一致性最高,在99.0%~100.0%之间。遗传进化分析显示分离株的HA属于Clade2.***.4.4.C分支,HA、NA、PB1、PA、NP、MP这6个基因均与2018年自华东地区水貂中分离的H5N6病毒株聚在同一分支,PB2和NS均与2017—2018年于广东环境中分离的H5N6病毒株聚在一起。分离株HA的裂解位点含多个连续的碱性氨基酸,为高致病性AIV,HA的S137A和T160A突变可增强病毒与人源受体SAα2,6-Gal的结合。另外,NA茎部缺失、PB2的L89V、G309D、R477G、I495V、I504V、D391E和A661E以及NS1的P42S、D92E和80~84位氨基酸缺失等突变均可增强病毒对哺乳动物的毒力和致病力。结论分离的6株高致病性H5N6 AIVs与2017—2018年分离自华东地区水貂和广东环境的H5N6 AIVs的遗传关系较近,存在的多个突变可增强病毒对哺乳动物的致病性,存在较大的公共卫生风险。

关键词：禽流感病毒 H5N6 活禽市场遗传进化

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天山北麓典型水库细菌多样性分析

生态学报 2022年第7期42卷 2843-2852页

作者：常娜娜张政阿木提喀日·马木提杜菲地丽胡玛阿吉马正海新疆大学生命与科学技术学院新疆生物资源基因工程重点实验室乌鲁木齐830046

为了探讨天山北麓中段水库细菌的多样性及其功能,选取蘑菇湖水库(MGW)、奎屯/车排子水库(KCW)、安集海水库(AJW)和八一水库(BYW)为典型水库进行宏基因组学分析。多点采集水库水样,收集水样中的微生物,CTAB法提取总DNA,用细菌16S rDNA通... 详细信息

为了探讨天山北麓中段水库细菌的多样性及其功能,选取蘑菇湖水库(MGW)、奎屯/车排子水库(KCW)、安集海水库(AJW)和八一水库(BYW)为典型水库进行宏基因组学分析。多点采集水库水样,收集水样中的微生物,CTAB法提取总DNA,用细菌16S rDNA通用引物扩增V3-V4区,扩增产物进行高通量测序,使用BLAST、USEARCH、QIIME等软件和在线工具分析水库细菌的多样性,使用PICRUSt软件和KEGG数据库预测细菌功能基因组成。结果表明,水库细菌分属18个门、38个纲和181个属,其中AJW的操作分类单元(Operational taxonomic units, OTUs)数量和多样性指数较高。4个水库菌群组成有一定的共性,在门分类阶元上优势菌为变形菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes);在纲分类阶元上优势菌为黄杆菌纲(Flavobacteriia);在属分类阶元上优势菌为黄杆菌属(Flavobacterium)。然而各水库菌群组成也存在较大差异,在变形菌门中,γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)的相对丰度在MGW和BYW较高,α-变形菌纲(Alphaproteobacterial)和β-变形菌纲(Betaproteobacteria)分别于AJW和KCW具有较高丰度;芽孢杆菌纲(Bacilli)在AJW和MGW具有较高丰度;相对丰度较高的菌属还包括AJW的动性杆菌属(Planomicrobium)、KCW的马赛菌属(Massilia)、MGW的不动杆菌属(Acinetobacter)和动性杆菌属以及BYW的假单胞菌属(Pseudomonas)和嗜冷杆菌属(Psychrobacter);另外,AJW特有多种丰度较高的菌纲和菌属,其中微小杆菌属(Exiguobacterium)和CL500-29_marine_group均有利于水质和菌群多样性的维持。PICRUSt功能预测分析表明,4个水库菌群的多种代谢以及遗传信息处理、信号传递和细胞生长相关功能基因丰度较高,并含有环境异生物降解代谢相关基因,其中苯甲酸、氨基苯甲酸酯、氯烷烃和氯烯烃以及萘降解相关基因的相对丰度较高。以上结果提示,天山北麓中段不同水库菌群组成存在差异,其与水源、周边环境和人类活动等因素相关。水库菌群含有芳香族和有机氯等化合物降解相关基因,其可在污染物的降解和生物修复中发挥作用。

关键词：天山北麓水库细菌多样性环境异生物降解

乌鲁木齐市活禽市场环境源H5N8亚型高致病性禽流感病毒的遗传进化分析

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中国兽医学报 2021年第12期41卷 2391-2398页

作者：贠丰泽阿木提喀日·马木提张成常娜娜苏斌杰毕玉海马正海新疆大学生命科学与技术学院/新疆生物资源基因工程重点实验室新疆乌鲁木齐830046 中国科学院微生物研究所/病原微生物与免疫学重点实验室/流感研究与预警中心北京100101

为分析新疆乌鲁木齐市活禽市场外环境中禽流感病毒(avian influenza virus,AIV)的遗传特征,于乌鲁木齐市某活禽市场采集环境样品,经接种鸡胚、血凝试验和RT-PCR等方法分离鉴定AIV,病毒全基因组扩增、测序后进行系统进化和分子特征分析... 详细信息

为分析新疆乌鲁木齐市活禽市场外环境中禽流感病毒(avian influenza virus,AIV)的遗传特征,于乌鲁木齐市某活禽市场采集环境样品,经接种鸡胚、血凝试验和RT-PCR等方法分离鉴定AIV,病毒全基因组扩增、测序后进行系统进化和分子特征分析。结果显示,从2016年外环境样品分离到2株H5N8 AIVs,其各基因的一致性为85.9%~100.0%,除NA和NS之外的6个基因均聚在不同分支,2株病毒存在差异。同时,2株病毒也存在明显共性,除1株病毒的PB2与山东野鸭中分离的H5N1 AIVs一致性最高并与华东地区家鸭中分离的H5N8 AIVs聚在同一分支之外,其余基因均与2016年底至2017年初自西藏、内蒙古和江苏等地外环境中分离的H5N8 AIVs的相应基因遗传距离最近,并有多个基因与2010-2012年华东地区家鸭中分离的H5N8 AIVs的遗传距离较近。2株分离病毒的HA裂解位点均含5个连续的碱性氨基酸,为高致病性,病毒基因发生的多个突变可增强病毒的毒力和致病力。结果表明,分离的2株高致病性H5N8 AIVs与2016-2017年国内多地外环境以及2010-2012年华东家鸭中分离的H5N8 AIVs的遗传关系较近。

关键词：禽流感病毒 H5N8 活禽市场外环境遗传进化

Aurora B表达水平与宫颈癌发生的相关性

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基因组学与应用生物学 2020年第5期39卷 2367-2373页

作者：彭瑞娟宋丹玛依热·努尔艾合麦提阿木提喀日·马木提玛依努尔·尼牙孜马正海新疆大学生命科学与技术学院乌鲁木齐830046 昌吉回族自治州第一中学昌吉831100 新疆维吾尔自治区人民医院乌鲁木齐830001

探究Aurora B在宫颈癌组织中的表达水平以及抑制Aurora B对宫颈癌细胞增殖、侵袭及迁移能力的影响,采集未经放疗和化疗的宫颈癌组织和子宫肌瘤组织(对照),提取总RNA,实时荧光定量PCR(RFQ-PCR)检测Aurora B在宫颈癌组织中的表达水平,分析... 详细信息

探究Aurora B在宫颈癌组织中的表达水平以及抑制Aurora B对宫颈癌细胞增殖、侵袭及迁移能力的影响,采集未经放疗和化疗的宫颈癌组织和子宫肌瘤组织(对照),提取总RNA,实时荧光定量PCR(RFQ-PCR)检测Aurora B在宫颈癌组织中的表达水平,分析Aurora B与宫颈癌发生的相关性。以不同量的Aurora B抑制剂AZD1152-HQPA处理SiHa、HeLa和293FT(对照)细胞,CCK-8细胞增殖检测法检测对细胞增殖的抑制率,Transwell小室侵袭和Transwell迁移实验检测细胞侵袭和迁移能力。Aurora B mRNA在宫颈癌中的表达(0.00388±0.000560)极显著高于(p提高,其可能通过促进癌细胞增殖、侵袭和迁移来促进肿瘤的发生,是宫颈癌诊断和治疗的潜在靶标之一。

关键词：宫颈癌 Aurora B AZD1152-HQPA 细胞增殖细胞侵袭

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新疆不同栖息地赤麻鸭肠道菌群多样性研究

微生物学报 2022年第1期62卷 1-9页

作者：杜菲王瑞红曹建彭鹏阿木提喀日·马木提常娜娜初冬孙贺廷马正海毕玉海新疆大学生命科学与技术学院新疆生物资源基因工程重点实验室新疆乌鲁木齐830046 中国动物疫病预防控制中心北京100125 中国科学院微生物研究所病原微生物与免疫学重点实验室北京100101 国家林业和草原局野生动物疫源疫病监测总站辽宁沈阳110034 中国科学院大学北京101408

【目的】探讨天山北麓赤麻鸭肠道细菌多样性及其与栖息地环境之间的关系。【方法】于2017年秋季在天山北麓5个栖息地随机采取新鲜的赤麻鸭粪便,用细菌16S rDNA通用引物扩增V3–V4区并进行高通量测序,使用BLAST、USEARCH和QIIME等软件和... 详细信息

【目的】探讨天山北麓赤麻鸭肠道细菌多样性及其与栖息地环境之间的关系。【方法】于2017年秋季在天山北麓5个栖息地随机采取新鲜的赤麻鸭粪便,用细菌16S rDNA通用引物扩增V3–V4区并进行高通量测序,使用BLAST、USEARCH和QIIME等软件和在线工具分析各栖息地样品菌群组成与差异。【结果】从赤麻鸭粪便样本中共获得16S rDNA有效序列408036条,聚类产生1014个操作分类单元(operational taxonomic unit,OTU)。样品中的细菌分属25个门和397个属。在门分类阶元上,变形菌门和厚壁菌门在所有样品中均为优势菌,相对丰度较高的还包括拟杆菌门、梭杆菌门、放线菌门、蓝藻细菌、螺旋体门、Saccharibacteria和迷踪菌门,但以上细菌在各栖息地样品中的相对丰度存在差异。在属分类阶元上,各栖息地样品的菌群组成差异显著,艾比湖、安集海水库、奎屯水库、蘑菇湖水库和八一水库样品的优势菌分别为鲸杆菌属、巨单胞菌属、假单胞菌属、乳酸菌属和链球菌属。对不同样品菌群组成和差异分析表明,赤麻鸭胃肠道菌群组成受环境和食源的影响较大。【结论】新疆5个栖息地赤麻鸭肠道细菌多样性较为丰富,菌群组成有一定的共性,同时也存在明显的差异性,其主要与赤麻鸭所处环境和食源结构有关。

关键词：赤麻鸭肠道菌群多样性高通量测序栖息地

重组溶瘤单纯疱疹病毒抑制小鼠结肠癌肺转移瘤的实验研究

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新疆大学学报（自然科学版） 2020年第3期37卷 294-300页

作者：张政彭瑞娟阿木提喀日·马木提刘晓娟王雪莹马正海新疆大学生命科学与技术学院新疆乌鲁木齐830046

探讨携载p53和IL-12的重组溶瘤单纯疱疹病毒(Oncolytic Herpes Simplex Virus-1,oHSV)MH1004和MH1006对小鼠结肠癌皮下移植瘤和肺转移瘤的治疗作用.蚀斑法和MTT法分析重组oHSV对结肠癌细胞CT26的感染和溶瘤特性;小鼠背部皮下注射CT26建... 详细信息

探讨携载p53和IL-12的重组溶瘤单纯疱疹病毒(Oncolytic Herpes Simplex Virus-1,oHSV)MH1004和MH1006对小鼠结肠癌皮下移植瘤和肺转移瘤的治疗作用.蚀斑法和MTT法分析重组oHSV对结肠癌细胞CT26的感染和溶瘤特性;小鼠背部皮下注射CT26建立皮下移植瘤模型,瘤内注射重组oHSV后分析小鼠血清中IL-12含量,观察肿瘤大小和小鼠生存率;小鼠尾静脉注射CT26建立肺转移模型,尾静脉注射重组oHSV后显微观察肺组织中肿瘤细胞浸润,观察肺脏肿瘤结节和小鼠生存率.重组oHSV能够感染CT26并高效复制和抑制肿瘤细胞.皮下移植瘤小鼠治疗12 d后观察到抑瘤效应,MH1004和MH1006组21 d时肿瘤体积(2477.31±2017.02 mm3和1414.36±1639.19 mm3)均极显著小于Mock组(7682.92±2648.74 mm3)(P提供了新的思路.

关键词：溶瘤单纯疱疹病毒 IL-12 p53 结肠癌肺转移瘤

细胞增殖相关基因Nek2的表达与宫颈癌发生的相关性研究

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生物技术 2018年第3期28卷 230-235,222页

作者：玛伊热.努尔艾合麦提宋丹彭瑞娟阿木提喀日.马木提玛依努尔.尼牙孜马正海新疆大学生命科学与技术学院新疆乌鲁木齐830046 新疆维吾尔自治区人民医院新疆乌鲁木齐830001

[目的]探究细胞增殖过程中中心体分离相关基因Nek2(NIMA-related kinase 2,Nek2)的表达水平以及抑制Nek2对宫颈癌细胞的增殖、侵袭及迁移能力的影响。[方法]采集未经放疗或化疗的正常宫颈组织50例,宫颈癌组织40例,提取标本组织总RNA,实... 详细信息

[目的]探究细胞增殖过程中中心体分离相关基因Nek2(NIMA-related kinase 2,Nek2)的表达水平以及抑制Nek2对宫颈癌细胞的增殖、侵袭及迁移能力的影响。[方法]采集未经放疗或化疗的正常宫颈组织50例,宫颈癌组织40例,提取标本组织总RNA,实时荧光定量PCR检测Nek2在病样组织中的表达水平,以正常宫颈组织作为对照分析Nek2与宫颈癌发生的相关性。以Nek2 siRNA转染Si Ha、He La和293FT(对照)细胞,CCK-8细胞增殖检测法分析细胞数量和对细胞增殖的抑制率,Transwell小室侵袭和Transwell迁移实验检测细胞侵袭和迁移能力。[结果]Nek2 mRNA在宫颈癌的相对拷贝数(0.0119±0.00601)极显著高于(P提高,其通过促进癌细胞增殖、侵袭和迁移来促进肿瘤的发生,可作为宫颈癌治疗的候选靶标。

关键词： Nek2 宫颈癌细胞增殖细胞迁移细胞侵袭候选靶标

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数字医疗在糖尿病管理中的应用进展

中华糖尿病杂志 2024年第3期16卷 352-355页

作者：热孜完古力·阿木提杨兵全东南大学医学院南京210009 东南大学附属中大医院内分泌科南京210009

数字医疗是基于大数据和人工智能的诊疗方法,为患者提供基于其数据或基于人工智能原理的机器学习模式,来预防、管理或治疗疾病。数字医疗在糖尿病管理中的应用越来越广泛,包括患病风险及并发症风险预测、临床决策支持、运动、饮食管理... 详细信息

数字医疗是基于大数据和人工智能的诊疗方法,为患者提供基于其数据或基于人工智能原理的机器学习模式,来预防、管理或治疗疾病。数字医疗在糖尿病管理中的应用越来越广泛,包括患病风险及并发症风险预测、临床决策支持、运动、饮食管理及患者教育等方面。虽然数字医疗在糖尿病管理中面临着信息安全、数据标准化、设备和网络建设等挑战,但随着人工智能和机器深度学习的发展,数字医疗将在糖尿病预测、并发症风险预测、诊疗方案制定等方面发挥更大的作用。

关键词：数字医疗糖尿病管理大数据

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含氟涂料与光固化窝沟封闭剂的防龋效果观察

中文科技期刊数据库（文摘版）医药卫生 2024年第6期 0066-0069页

作者：日孜瓦古力·阿木提木尼拉·赛力木新疆维吾尔自治区人民医院口腔科新疆乌鲁木齐830001 塔城地区人民医院口腔科新疆塔城834700

评估氟涂料与光固化窝沟封闭剂在预防儿童龋病方面的成效。方法本研究选取了120名于2023年3月至2024年3月期间在本院牙科就医的儿童作为研究样本,分别对他们施以含氟涂料处理和光固化窝沟封闭的治疗。大约3000颗牙齿进行了窝沟封闭,而... 详细信息

评估氟涂料与光固化窝沟封闭剂在预防儿童龋病方面的成效。方法本研究选取了120名于2023年3月至2024年3月期间在本院牙科就医的儿童作为研究样本,分别对他们施以含氟涂料处理和光固化窝沟封闭的治疗。大约3000颗牙齿进行了窝沟封闭,而大约500位儿童进行了涂氟处理。运用随机化分配与双盲评定的方法对比两批口腔检测成果、龋齿发病频率的数据及相关生化指数。结果与光固化窝沟封闭剂相较,含氟涂料在抵御龋病形成上展现了更加突出的功效。含氟组的龋病发作频率显然低于光固化组(P 值小于 0.05)。再者,含氟涂料组的牙齿硬度和酸蚀抵抗能力亦优于光固化窝沟封闭剂组。结论在预防儿童龋病方面含氟漆料相较于光固化型窝沟封闭材料展现了更为卓越的成效。鉴于含氟涂层在增强牙齿耐酸性和减少龋病风险方面具有明显的益处,建议在口腔预防治疗中将其作为首选方案。后续的探究应当深入研究这两种物质在各个年龄层及多样口腔健康情况中的表现差异。

关键词：含氟涂料光固化窝沟封闭剂儿童龋病预防