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基于稀疏组Lasso的微阵列数据分析

基于稀疏组Lasso的微阵列数据分析

作者：金玲芳中南大学

学位级别：硕士

DNA微阵列技术的发展使得从基因层面对疾病进行研究成为了可能,然而微阵列数据的特点给传统的数据分析方法带来了挑战,如何构建准确的分类模型是疾病研究领域中一个重要的问题。首先,本文综述了疾病分类模型、分组策略及加权基因共表达... 详细信息

DNA微阵列技术的发展使得从基因层面对疾病进行研究成为了可能,然而微阵列数据的特点给传统的数据分析方法带来了挑战,如何构建准确的分类模型是疾病研究领域中一个重要的问题。首先,本文综述了疾病分类模型、分组策略及加权基因共表达网络分析(WGCNA)的研究发展情况和研究现状,详细介绍了WGCNA和稀疏逻辑回归模型的知识,并选择稀疏组Lasso作为本文研究的基础模型。其次,针对WGCNA存在的不足,提出了一个新的模块划分方法(new WGCNA),在WGCNA的基础上,增加一个新的步骤,将基因划分到离它距离最近的模块。四个微阵列数据和模拟数据的实验结果显示,在Dunn指数、模块质量等各种指标上,new WGCNA均比WGCNA表现得更好,即新增步骤的实施有利于改善WGCNA的模块划分结果。然后,针对微阵列数据中类别不平衡以及稀疏组Lasso模型中组权重不合适的问题,提出了计算样本权重和组权重的新方法,并构建了MSGL模型。此外,给出了求解MSGL模型的块坐标下降算法。最后,将new WGCNA的模块划分结果用于基因的分组,形成了用于疾病分类的new WGCNA-MSGL模型。结肠炎数据的实验结果显示,与其它六种分类模型相比,该模型能够在较少的特征基因下实现较高的预测准确率,且具有较好的鲁棒性。模拟数据的实验结果则证明了new WGCNA-MSGL模型在变量选择方面的优势。图10幅,表8个,参考文献80篇

关键词： DNA微阵列技术稀疏组Lasso 加权基因共表达网络分析疾病分类

Magnetic Properties and Nanostructures of FePtCu：C Thin Films with FePt Underlayers

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Chinese Physics Letters 2007年第9期24卷 2628-2630页

作者：金玲芳阎明朗 Department of Physics Ningxia University Yinchuan 750021 Department of Physics and Astronomy and Center for Materials Research and Analysis University of Nebraska Lincoln NE 68588 USA

Magnetic properties and nanostructures of FePtCu：C thin films with FePt underlayers （ULs） are studied. The effect of FePt ULs on the orlentation and magnetic properties of the thin films are investigated by adjusting FePt UL thicknesses from 2nm to 14nm. X-ray diffraction （XRD） scans reveal that the orientation of the films is dependent on FePt UL thickness. For a 5-nm FePtCu：C nanocomposite thin film with a 2-nm FePt UL, the coercivity is 6.S KOe, the correlation length is 59 nm, the desired face-centred-tetragonal （fct） ordered structure [Llo phase] is formed and the c axis normal to the film plane [（001） texture] is obtained. These results indicate that the beffer orientation and magnetic properties of the films can be tuned by decreasing the thockness of the FePt UL.

关键词： L1(0) FEPT

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浅谈类比法在电磁学教学中的应用

宁夏工学院学报（自然科学版） 1996年第3期8卷 94-96页

作者：金玲芳宁夏工学院基础部

本文从教学角度出发，探讨了类比法在电磁学教学中的具体应用，并总结出了采用此方法的优越性。

关键词：类比法电磁学教学静电场

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复值函数用复变量表示的充要条件

纺织基础科学学报 1991年第3期4卷 255-256页

作者：金玲芳苏州丝绸工学院苏州215005

在复变量函数的运算中,常常会遇到需要把以二元函数u(x,y),v(x,y)为实部与虚部构成的复变量函数f(x+iy)=u(x,y)+iv(x,y)化成以复数z=x+iy为变量的函数,f(z),一般常用的方法是:

关键词：复值函数复变量表示复变函数

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浅论普通物理学的教学改革

宁夏工学院学报 1997年第S1期 9-10页

作者：金玲芳

本文介绍了作者在普通物理学教学改革过程中所做的工作和体会，提出了今后教学改革的目标和建议．

关键词：普通物理教学改革

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激发想象感悟诗情——浅谈小学古诗教学

阅读 2013年第8期 18-19页

作者：金玲芳昆山市新城域小学

古诗是我国古典文学中的精华。古代思想家、教育家孔子曾说过:"不学诗,无以言。"古诗的文字读来让人回味无穷,对于培养学生的想象力,发展思维能力,陶冶情感,都具有十分重要的意义。在小学语文教学中,古诗还是阅读教学的重要组成部分。... 详细信息

古诗是我国古典文学中的精华。古代思想家、教育家孔子曾说过:"不学诗,无以言。"古诗的文字读来让人回味无穷,对于培养学生的想象力,发展思维能力,陶冶情感,都具有十分重要的意义。在小学语文教学中,古诗还是阅读教学的重要组成部分。培养学生的想象力和情感则是小学古诗教学的重点。

关键词：古诗教学小学生

“读书破万卷,下笔如有神”——论小学阅读教学中的三个注意点

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全国优秀作文选(写作与阅读教学研究) 2014年第1期 55-56页

作者：金玲芳昆山市新城域小学

阅读教学是小学语文教学的一项基本功,当学生能用拼音识字时,就意味着阅读的开始。《语文课程标准》总目标第七条指出:"具有独立阅读能力,注重情感体验,有较丰富的语言积累,形成良好的语感。能初步理解、鉴赏文学作品,受到高尚情操与趣... 详细信息

阅读教学是小学语文教学的一项基本功,当学生能用拼音识字时,就意味着阅读的开始。《语文课程标准》总目标第七条指出:"具有独立阅读能力,注重情感体验,有较丰富的语言积累,形成良好的语感。能初步理解、鉴赏文学作品,受到高尚情操与趣味的熏陶,发展个性,丰富自己的精神世界。"这几句话不但提出了义务教育阶段学生阅读能力的总体

关键词：小学生读书破万卷阅读能力小学阅读教学略读课文注意点