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水稻转录因子基因SUSIRI的过表达及RNA干扰对水稻分子及表型效应的分析

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分子植物育种 2013年第1期11卷 8-13页

作者：陈坚连肖华杨志敏陈彬郑斯平朱炳耀福建省农业科学院生物技术研究所福州350003

在克隆到水稻转录因子基因SUSIRI的基础上,构建其过表达及RNA干扰载体进行水稻的遗传转化。由潮霉素筛选及分子检测得到的T0代植株经大田栽植,共有34株过表达及46株RNA干扰植株获得T1代转基因种子。继续种植T1植株收获T2代种子,同时用... 详细信息

在克隆到水稻转录因子基因SUSIRI的基础上,构建其过表达及RNA干扰载体进行水稻的遗传转化。由潮霉素筛选及分子检测得到的T0代植株经大田栽植,共有34株过表达及46株RNA干扰植株获得T1代转基因种子。继续种植T1植株收获T2代种子,同时用半定量RT-PCR分析苗期及穗期野生型水稻中SUSIRI基因的时空表达谱并比较过表达及RNA干扰植株的SUSIRI基因在叶片及幼穗中的表达状况,发现过表达植株与野生型对照的基因表达基本相同,但RNA干扰植株的表达受到明显抑制。对过表达及RNA干扰植株稻穗性状考察表明:与野生型对照相比,无论是过表达还是RNA干扰,转基因植株的穗粒数、结实率降低,RNA干扰植株表现得尤为严重(P0.05)。SUSIRI基因的过表达未出现使稻穗性状明显改良的株系,而RNA干扰会导致水稻的结实能力严重降低。

关键词：水稻 WRKY 转录因子 RNA 干扰基因表达结实率

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免疫调节细胞影响特发性肺纤维化的研究进展

国际呼吸杂志 2022年第8期42卷 618-622页

作者：魏婷涂名进郑斯平伍俊广东医科大学附属医院呼吸疾病研究所湛江524000

免疫细胞如巨噬细胞、中性粒细胞、嗜酸粒细胞和淋巴细胞等是机体抵御外来病原体入侵的先行军,在早期急性炎症和后期损伤修复中均发挥了重要的调节作用。近年研究发现免疫细胞的聚集、生长增殖和活化会加重慢性肺泡微损伤,导致损伤修复... 详细信息

免疫细胞如巨噬细胞、中性粒细胞、嗜酸粒细胞和淋巴细胞等是机体抵御外来病原体入侵的先行军,在早期急性炎症和后期损伤修复中均发挥了重要的调节作用。近年研究发现免疫细胞的聚集、生长增殖和活化会加重慢性肺泡微损伤,导致损伤修复功能持续失调。这一系列免疫调节对特发性肺纤维化有驱动作用。因此,本文旨在回顾各种免疫细胞在特发性肺纤维化发病机制中的作用以及针对免疫细胞调节治疗特发性肺纤维化的最新研究报道。

关键词：特发性肺纤维化免疫调节细胞成纤维细胞

Cyanovirin-N蓝藻的筛选及其分子鉴定

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生物技术 2010年第6期20卷 54-57页

作者：郑斯平陈彬郑伟文福建省农业科学院生物技术研究所福建福州350003

目的:从实验室培养的自生蓝藻中筛选出含有能编码抗病毒蛋白(cyanovirin-N,CV-N)基因的藻株并对其进行分子鉴定。方法:应用PCR技术和自行设计的特异性引物从80株蓝藻中筛选目标藻株,通过克隆、测序后,进行blast比对,经在线生物信息学软... 详细信息

目的:从实验室培养的自生蓝藻中筛选出含有能编码抗病毒蛋白(cyanovirin-N,CV-N)基因的藻株并对其进行分子鉴定。方法:应用PCR技术和自行设计的特异性引物从80株蓝藻中筛选目标藻株,通过克隆、测序后,进行blast比对,经在线生物信息学软件预测该抗病毒蛋白CV-N的一级,二级,三级结构,并推测该基因序列编码的蛋白的抗病毒潜能。结果:筛选出藻株RZHA4,其所含的CV-N基因与已报道的CV-N基因有97%的相似性。结论:经16S rRNA-PCR和序列分析,该藻株与蓝藻Nostocaceae有99%的相似性,为一在实验室常规培养条件下生长良好的念珠藻(Nostoc),有可能成为新的CV-N生产藻株。

关键词：蓝藻抗病毒蛋白-N 蛋白质结构聚合酶链式反应

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多操作系统共存的实现与故障排除

计算机与农业 2003年第4期 36-38页

作者：郑斯平福建省农科院生物中心福州350003

随着微软操作系统的更新换代和Linux系统登陆中国,如何在一台微机上安装多个操作系统以实现不同的应用目的已受到普遍关注.本文试图以一个的实例来阐述多系统共存的实现技巧与常见问题的排除方法.

关键词：操作系统 Linux 逻辑分区硬盘分区计算机故障排除

含几丁质酶基因的粪产碱菌工程菌(BC2007)的构建

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江西农业大学学报 2008年第5期30卷 894-897,926页

作者：陈彬郑斯平郑伟文福建省农业科学院生物技术研究所福建福州350003

从苏云金杆菌(Bacillus thuringiensis)中扩增出几丁质酶全长基因,通过克隆,测序得到2025 bp的序列。通过再线生物信息学软件,得到该几丁质酶的一级、二级、三级结构。将该基因通过电转化导入原核表达载体pET29 a,筛选到含该几丁质酶基... 详细信息

从苏云金杆菌(Bacillus thuringiensis)中扩增出几丁质酶全长基因,通过克隆,测序得到2025 bp的序列。通过再线生物信息学软件,得到该几丁质酶的一级、二级、三级结构。将该基因通过电转化导入原核表达载体pET29 a,筛选到含该几丁质酶基因的BC2007。初步研究表明BC2007在含胶体几丁质的平板上产生了透明圈。

关键词：几丁质酶基因粪产碱菌原核表达载体pET29a

结合态氮对满江红内生细菌群落组成和结构的影响

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水生生物学报 2020年第6期44卷 1287-1296页

作者：陈坚陈彬郑斯平郑益平朱炳耀郑伟文福建省农业科学院生物技术研究所福州350003

研究从超微结构和分子水平上探讨结合态氮对满江红(Azolla)叶腔中以共生藻占优势的微生物群落的影响。为排除外源污染并保留其内生菌的多样性,采用茎尖组织培养并添加结合态氮等方法,取得了表面无菌的含藻满江红(AmA)和无藻满江红(AmB)... 详细信息

研究从超微结构和分子水平上探讨结合态氮对满江红(Azolla)叶腔中以共生藻占优势的微生物群落的影响。为排除外源污染并保留其内生菌的多样性,采用茎尖组织培养并添加结合态氮等方法,取得了表面无菌的含藻满江红(AmA)和无藻满江红(AmB)。电镜观察揭示,AmB较AmA的萍体表型有某种程度的修饰。AmA的微生物群落结构以共生藻、内生菌和宿主腺毛及其分泌物组成的生物被膜和藻囊为主要特征,而AmB的叶腔几乎中空。基于16S rRNA基因和nifH基因的高通量测序结果显示,生长于无氮培养液的AmA样品的微生物群落有相当高的多样性,共有17个可操作分类单元(OTU),分属4个细菌门,并有一个以Nostoc azollae为优势的固氮微生物亚群包括草螺菌、根瘤菌和Niveispirillum等。而生长于富含结合态氮培养液的AmB样品的群落多样性明显降低,仅有8个OTU,且以Nostoc azollae为优势的上述固氮微生物亚群全部消失。研究结果表明,通过调整氮素营养,可改变宿主植物的微生物群落组成与结构,进而改良植物的生长发育。

关键词：满江红蓝细菌满江红念珠藻微生物群落高通量测序电子显微镜

小叶满江红内生细菌多样性的PCR-DGGE及电子显微镜分析

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农业生物技术学报 2008年第3期16卷 508-514页

作者：郑斯平陈彬关雄郑伟文福建省农业科学院生物技术研究所 2. 福建农林大学教育部生物农药与化学生物重点实验室

用16SrDNA-PCR-DGGE技术、电子显微镜和平板培养的方法系统地揭示了小叶满江红(Azolla microphylla)中内生细菌的遗传多样性和表型多样性。16SrDNA-PCR-DGGE的指纹图谱分析表明,在小叶满江红!蓝藻共生体内存在一个以蜡质芽胞杆菌(Bacill... 详细信息

用16SrDNA-PCR-DGGE技术、电子显微镜和平板培养的方法系统地揭示了小叶满江红(Azolla microphylla)中内生细菌的遗传多样性和表型多样性。16SrDNA-PCR-DGGE的指纹图谱分析表明,在小叶满江红!蓝藻共生体内存在一个以蜡质芽胞杆菌(Bacillus cereus)为优势种群的复杂、多样的细菌区系;内生细菌在体内呈现各异的超微结构特征,体外培养生成不同大小、形态和色素的菌落。应用16SrDNA-PCR-DGGE技术能较全面地揭示满江红内生细菌的遗传多样性。

关键词：满江红内生细菌多样性 16SrDNA-PCR-DGGE

闽江流域不同断面大肠杆菌SepA基因序列及耐药性分析

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安徽农业科学 2011年第5期39卷 2554-2555,2558页

作者：陈彬郑斯平黄文文郑伟文福建省农业科学院生物技术研究所福建福州350003

[目的]分析闽江流域不同断面大肠杆菌(Escherichia coli)SepA基因序列,并对其抗生素耐药性进行比较。[方法]对分离自福建闽江流域不同断面的大肠杆菌的SepA基因进行测序比对,并对该菌株进行耐药性分析。[结果]不同断面分离的大肠杆菌Sep... 详细信息

[目的]分析闽江流域不同断面大肠杆菌(Escherichia coli)SepA基因序列,并对其抗生素耐药性进行比较。[方法]对分离自福建闽江流域不同断面的大肠杆菌的SepA基因进行测序比对,并对该菌株进行耐药性分析。[结果]不同断面分离的大肠杆菌SepA基因序列和抗生素的耐药性均存在一定的差异。[结论]该研究可为今后进行闽江流域污染源的追踪、风险评估和开发特异性探针提供依据。

关键词：大肠杆菌 SepA基因序列抗药性闽江流域

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满江红内生细菌的培养及其抗生素抗性基因的检测

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福建农业学报 2021年第6期36卷 706-712页

作者：陈坚郑益平陈彬郑斯平郑伟文福建省农业科学院生物技术研究所福建福州350003

【目的】水产养殖中广泛使用抗生素会导致抗生素抗性基因在水环境中的传播。水生植物满江红含有丰富的内生菌,建立满江红内生细菌群落及所含有的抗生素抗性基因的检测方法,可以为水环境中抗性基因的监测提供参考。【方法】用3种不同的... 详细信息

【目的】水产养殖中广泛使用抗生素会导致抗生素抗性基因在水环境中的传播。水生植物满江红含有丰富的内生菌,建立满江红内生细菌群落及所含有的抗生素抗性基因的检测方法,可以为水环境中抗性基因的监测提供参考。【方法】用3种不同的培养基对小叶满江红的内生细菌进行培养并对培养物进行宏基因组测序及生物信息学分析。【结果】共得到高质量的序列数据量48.66 G,预测出54180个基因(ORFs)。通过分类学信息数据库NR共注释出1712种微生物物种,在总门水平上属38个门,其中3种培养物中变形菌门(Proteobacteria)的物种丰度均占全部门类的99.14%以上。在总属水平,草螺菌属(Herbaspirillum)的丰度为91%左右,伯克霍尔德菌属(Burkholderia)可达1.2%左右。比对抗生素抗性基因数据库ARDB,3个样品共注释到10个与抗生素有关基因ARG,主要针对杆菌肽(bacitracin)和氯霉素(chloramphenicol)产生抗性。与综合抗生素抗性基因数据库CARD进行比对,获得212抗生素相关基因ARO。按照抗性机制分类,其中对抗生素起直接作用的抗性类基因AR的丰度占88%以上;对抗生素有敏感作用的抗性基因AS的丰度均在7%左右;抗生素靶标类抗性基因AT占4%~6%。【结论】通过3种不同的培养基获得的满江红内生细菌的群落结构,抗生素抗性基因类型基本一致。

关键词：满江红内生菌抗生素抗性基因宏基因组