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基于机器学习算法的土曲霉中（R）-ω-转氨酶热稳定性预测研究

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基于机器学习算法的土曲霉中（R）-ω-转氨酶热稳定性预测研究

作者：郏丽丽浙江科技学院

学位级别：硕士

手性胺是合成药品、精细化学品和农用化学品的重要组成部分。(R)-ω-转氨酶((R)-ω-transaminase,(R)-ω-TA)是合成对映体手性胺的生物催化剂,也是在自然界中存在较少的蛋白质酶,其稳定性相对较差。如何提高具有应用价值的(R)-ω-TA的... 详细信息

手性胺是合成药品、精细化学品和农用化学品的重要组成部分。(R)-ω-转氨酶((R)-ω-transaminase,(R)-ω-TA)是合成对映体手性胺的生物催化剂,也是在自然界中存在较少的蛋白质酶,其稳定性相对较差。如何提高具有应用价值的(R)-ω-TA的热稳定性,是蛋白质工程研究的热点,也是制备合成手性胺的重要前提。利用机器学习方法筛选更好的(R)-ω-TA突变体是提高其热稳定性的一种新颖途径。本文以土曲霉的(R)-ω-TA突变体库为基础,运用了一种新的序列-活性关系方法ISAR(Innovative Sequence-Activity Relationship)用以预测高热稳定性的(R)-ω-TA。本文的主要工作和成果如下:(1)针对(R)-ω-TA野生型和突变体的氨基酸序列和半衰期采用机器学习算法结合数字信号处理DSP(Digital Signal Processing)和快速傅里叶变换FFT(Fast Fourier Transform),再利用偏最小二乘回归PLSR(Partial Least-Squares Regression)获得符合该物质热稳定性的高性能模型,其中确定系数R为0.8929,最小均方根误差cvRMSE为4.89,同时预测出半衰期高于现有实验数据的组合突变体。(2)本研究提出了改进的ISAR方法,一种是将(R)-ω-TA突变体库获得排名靠前的索引进行组合连接;另一种是将排名靠前的索引与未进行FFT的索引进行组合连接。通过连接数据,将每条数据横向叠加,再利用PLSR对(R)-ω-TA突变体数据集进行建模和预测。研究发现模型的鲁棒性都有所提高,优化后的最佳模型的R和cvRMSE值分别为0.9276和3.71。结果表明,改进的ISAR方法可以通过序列空间的机器学习算法筛选出更好的模型和突变体,为当前蛋白质工程面临的序列探索和组合问题提供一个强大的解决方案。

关键词：机器学习 (R)-ω-TA 数字信号处理热稳定性

硒酵母联合左甲状腺素钠对2型糖尿病合并慢性淋巴细胞性甲状腺炎疗效的影响

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中国基层医药 2020年第2期27卷 209-212页

作者：郏丽丽叶雪卫温岭市中医院内分泌科浙江省317500

目的探讨硒酵母与左甲状腺素钠联合疗法对2型糖尿病合并慢性淋巴细胞性甲状腺炎(CLT)的临床疗效。方法选择温岭市中医院2017年6月至2018年12月治疗的2型糖尿病合并CLT患者96例为研究对象,采用随机数字表法分为研究组和对照组,每组48例... 详细信息

目的探讨硒酵母与左甲状腺素钠联合疗法对2型糖尿病合并慢性淋巴细胞性甲状腺炎(CLT)的临床疗效。方法选择温岭市中医院2017年6月至2018年12月治疗的2型糖尿病合并CLT患者96例为研究对象,采用随机数字表法分为研究组和对照组,每组48例。在血糖控制平稳的基础上,对照组患者接受左甲状腺素钠片常规治疗,研究组患者在此基础上加服硒酵母。观察记录两组患者治疗3个月内血糖、甲状腺素水平的变化及临床疗效。结果研究组总治疗有效率为95.83%(46/48),显著高于对照组的68.75%(33/48)(χ^2=12.080,P0.05)。结论硒酵母联合左甲状腺素钠治疗2型糖尿病合并CLT,可有效提高临床治疗效果。

关键词：糖尿病,2型甲状腺炎淋巴细胞硒化合物甲状腺素血糖 C肽

利拉鲁肽治疗新诊断2型糖尿病合并动脉粥样硬化性心血管疾病及肾病1例

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中华糖尿病杂志 2023年第S2期15卷 219-221页

作者：郏丽丽金奕叶雪卫浙江省温岭市中医院内分泌科温岭317500

回顾性分析1例在温岭市中医院内分泌科就诊的新诊断的合并动脉粥样硬化性心血管疾病(ASCVD)的2型糖尿病(T2DM)患者使用利拉鲁肽治疗的诊疗过程。患者为40岁男性,因“头晕、发现血糖升高1周”入院,入院后完善相关辅助检查,明确诊断为T2D... 详细信息

回顾性分析1例在温岭市中医院内分泌科就诊的新诊断的合并动脉粥样硬化性心血管疾病(ASCVD)的2型糖尿病(T2DM)患者使用利拉鲁肽治疗的诊疗过程。患者为40岁男性,因“头晕、发现血糖升高1周”入院,入院后完善相关辅助检查,明确诊断为T2DM合并ASCVD及慢性肾病。既往曾行经皮冠状动脉介入治疗。给予利拉鲁肽(0.6 mg,1次/d)联合达格列净(10 mg,1次/d)及降脂、抗血小板等治疗,血糖控制良好,达到综合管理目标。现患者在坚持标准治疗基础上应用利拉鲁肽1.5年,最终调整剂量为1.8 mg每天1次,患者身体、精神状态明显改善,各项代谢指标正常,没有再发生大血管事件,取得了良好的心血管获益。

关键词：糖尿病,2型动脉粥样硬化性心血管疾病肾病利拉鲁肽

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健康管理在内分泌科的应用

中医药管理杂志 2020年第11期28卷 197-198页

作者：郏丽丽温岭市中医院浙江温岭317500

健康管理是指对危及生命健康的因素进行全面或对某一项指标进行监测、分析与评估,以便得出相应的评估结果,从而进行健康教育和健康服务。文章就健康管理在内分泌科的应用进行分析和探讨,以促进进一步做好健康管理工作。

关键词：健康管理内分泌科应用

水稻碱性亮氨酸拉链(bZIP)蛋白家族功能研究进展

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中国水稻科学 2023年第4期37卷 436-448页

作者：韩聪何禹畅吴丽娟郏丽丽王磊鄂志国中国水稻研究所杭州310006

碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper,bZIP)是一类重要的转录调控因子,广泛存在于真核生物中,因含有高度保守的bZIP结构域而得名。bZIP结构域由紧密相邻的碱性区域和亮氨酸拉链区域两部分组成。粳稻基因组中注释有89个bZIP基因,其中45... 详细信息

碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper,bZIP)是一类重要的转录调控因子,广泛存在于真核生物中,因含有高度保守的bZIP结构域而得名。bZIP结构域由紧密相邻的碱性区域和亮氨酸拉链区域两部分组成。粳稻基因组中注释有89个bZIP基因,其中45个已得到功能验证,它们参与调节水稻生长发育、生物与非生物胁迫应答,包括种子休眠和萌发、成花转变、光形态建成,以及胁迫和激素信号通路等。

关键词：水稻碱性亮氨酸拉链蛋白 bZIP转录因子基因功能

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地尔硫卓联合曲美他嗪治疗不稳定心绞痛的疗效分析

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中西医结合心血管病电子杂志 2015年第15期 97-98页

作者：钟超伶郏丽丽温岭市中医院

目的分析地尔硫卓联合曲美他嗪治疗不稳定心绞痛的疗效。方法选取2013年3月;015年3月我院收治的不稳定心绞痛患者96例,按照抽签法平均分为对照组和观察组。对照组给予常规方法诊治,观察组给予地尔硫卓结合曲美他嗪诊治,对两组患者的临... 详细信息

目的分析地尔硫卓联合曲美他嗪治疗不稳定心绞痛的疗效。方法选取2013年3月;015年3月我院收治的不稳定心绞痛患者96例,按照抽签法平均分为对照组和观察组。对照组给予常规方法诊治,观察组给予地尔硫卓结合曲美他嗪诊治,对两组患者的临床诊疗效果进行统计学处理和分析。结果经过临床诊治,两组患者的心绞痛发作时间、发作次数以及血压、心率水平较之治疗前均有显著下降,观察组明显优于对照组,差异有统计学意义（P<0.05）。观察组临床总有效率为97.92%,明显高于对照组的83.33%,差异有统计学意义（P<0.05）。结论给予不稳定心绞痛患者地尔硫卓结合曲美他嗪进行临床诊疗,疗效显著,能够有效控制病情发展,降低体征指标水平。

关键词：不稳定心绞痛地尔硫卓曲美他嗪疗效

倍他乐克结合通心络胶囊治疗冠心病合并心绞痛临床观察

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按摩与康复医学 2015年第18期6卷 55-56页

作者：郏丽丽钟超伶温岭市中医院

目的：分析倍他乐克结合通心络胶囊治疗冠心病合并心绞痛患者的临床效果.方法：100例冠心病合并心绞痛患者按临床意愿平分为治疗及对照组,对照组采取临床基础性治疗,治疗组在对照组基础上采取倍他乐克及通心络胶囊联合治疗,比较两组治... 详细信息

目的：分析倍他乐克结合通心络胶囊治疗冠心病合并心绞痛患者的临床效果.方法：100例冠心病合并心绞痛患者按临床意愿平分为治疗及对照组,对照组采取临床基础性治疗,治疗组在对照组基础上采取倍他乐克及通心络胶囊联合治疗,比较两组治疗效果.结果：治疗组好转率为96%,显著高于对照组的76%（P=0.0033＜0.05）.结论：倍他乐克联合通心络胶囊治疗冠心病合并心绞痛患者效果明显,可减少毒副作用,值得推广。

关键词：冠心病心绞痛倍他乐克通心络胶囊疗效

复方丹参滴丸结合阿司匹林治疗28例冠心病的临床研究

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按摩与康复医学 2015年第17期6卷 62-63页

作者：钟超伶郏丽丽温岭市中医院

目的：分析复方丹参滴丸结合阿司匹林治疗冠心病患者的临床效果。方法：56例冠心病患者随机平分为医治组及对照组，医治组予复方丹参滴丸及阿司匹林，对照组仅予阿司匹林，比对两组患者的临床效果。结果：医治组好转率为96.4%，显著高... 详细信息

目的：分析复方丹参滴丸结合阿司匹林治疗冠心病患者的临床效果。方法：56例冠心病患者随机平分为医治组及对照组，医治组予复方丹参滴丸及阿司匹林，对照组仅予阿司匹林，比对两组患者的临床效果。结果：医治组好转率为96.4%，显著高于对照组的78.6%（P=0.0277〈0.05）。结论：复方丹参滴丸结合阿司匹林治疗冠心病患者效果明显，可提高临床好转率，值得推广。

关键词：冠心病复方丹参滴丸阿司匹林疗效

参麦注射液结合曲美他嗪治疗冠心病的疗效观察

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中西医结合心血管病电子杂志 2015年第14期 67-67页

作者：郏丽丽钟超伶温岭市中医院

目的观察应用参麦注射液结合曲美他嗪治疗冠心病的疗效和意义。方法选取2013年12月;015年6月我院内科收治的冠心病患者104例,根据数字表法将其分为对照组（应用曲美他嗪进行诊治）和观察组（应用参麦注射液结合曲美他嗪进行诊治）,各52... 详细信息

目的观察应用参麦注射液结合曲美他嗪治疗冠心病的疗效和意义。方法选取2013年12月;015年6月我院内科收治的冠心病患者104例,根据数字表法将其分为对照组（应用曲美他嗪进行诊治）和观察组（应用参麦注射液结合曲美他嗪进行诊治）,各52例。对比、分析和统计两组患者的临床治疗情况和疗效。结果经过治疗统计,观察组患者的临床总有效率为92.31%,显著高于对照组的76.92%,差异有统计学意义（P0.05）。结论在冠心病的临床诊治中采用参麦注射液结合曲美他嗪,其疗效良好,不良反应低,是一种科学、有效的临床诊疗方法。

关键词：冠心病参麦注射液曲美他嗪疗效